Protein
- Genbank accession
- QPB12359.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber proximal subunit
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MAENKSFRATYGLDASNQKVINVAKADKTVLTDGVNVDFFIEENTIQKYDETRGYSKDFAVIFEGRVYFANRDIPKPAGTFDPVKWTHVRVDPKWISVINTPQDGYNLESGNFITADTNSNELLFNLPKTPKDGDTIAIKDIGGYVGYKSLRVKKSIHDIKWNDLYRDEIYITRPYSQTYFIFSRGLWNALVLENEDSAKIVSSQPIKQKLSSGDRVYRRSSTGKIDLVLPKYAMHGDLIEFYDIDSLTPINHMTVEVSEDSGHSVELLGQTSVTVRTSGSGRLAFDGSENIWRVWEGDLRTRLKLITENYKILPNEAILVFGANNSEKKTITIDLPKDVELGDTVEISLNYMRKGQKVNIKASTGDTISTSKSLLQFPKRSEYPPETAWVTVPNIEFDGTLDYVPYIRLSYVLQNGKTTWIIQEVNPTVERVDSTARERLGVIALASQAQANVDKEKNPEKELAITPETLANRVALETRRGIARIATTAEVNKLSVDSYDDDTIITPKKLNGRSATETRRGLAELATQEKTNKGEDDLTIVTPKKLHNRKASETLTGIAKIVASKGTPGTQRDVPGTGVYSFNNNTDIVTPAALHENLATKTALGTVFLATETEVIEAPVMDPKFPVVVTPVELHKKTATESRIGFAKIATQDETNKGAIDNAIVTPKKLNDRKASETLTGIARIATQTEFNQGTLNDVISSPLKVKTYFNSTARIQTNTATGIKHTGTLWENFKLEILPASELQVGSAKIATKALVDAGTDDTTIVTPKKLHDKKSTETSEGIIKVSTYEQTIAGTSANTAISPKNFVLAIRTEKNGLEATTTNRGFVRITQDASIWTGDDVVGSTGTYEHDGYAVSPRELNKALSHYLPIKATAVNSALLNGIKSDQFIRRDINQEVNGILTMNKETVMKAPLNSTSTGKFTTLDLTSTGISLKLGNSTGWSGLHILGQGGWSLFSASDTNFKIQPIDAQNPDNIEMFSINRTSGNVDIAKNLNVGGVLNAFSVQVRSKDAIRLNGTRILYGNNTTPLQFATPNASDIVVSEAVDQYKVITTKNLVEESNKTYLRKGGDTATGTINFSKPIFVRRAPVANSKQSPENGIFVSEVVDKSMYDTYPGIAVPQYDDQNKITEYKYVKGPGTLIQIGDSKDFTFRIWVPKALDKTANHNNHSIWMQTYNTAKGELEDWGRVFTTQSPPTAADVGAVSESGSSINNITVREWMQVGNLRLVPNPVTKTVDYIWVD
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1243 AA molecular weight: 136941,54410 Da isoelectric point: 6,79251 aromaticity: 0,07401 hydropathy: -0,40306
Domains
Domains [InterPro]
IPR048391
1101–1191
1101–1191
1
1243
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Providencia phage PSTCR6 [NCBI] |
2783548 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QPB12359.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW057858
[NCBI]
CDS location
range 68931 -> 72662
strand -
strand -
CDS
ATGGCCGAGAATAAATCTTTCCGAGCTACGTATGGCTTGGATGCTTCAAATCAAAAAGTAATTAACGTTGCAAAGGCAGACAAAACTGTTCTCACCGATGGTGTTAACGTTGATTTCTTTATTGAAGAAAATACAATACAAAAATATGATGAAACACGTGGTTATTCAAAAGACTTCGCAGTTATATTTGAAGGGCGTGTGTATTTCGCCAACAGGGATATTCCTAAACCAGCCGGAACGTTTGATCCGGTTAAATGGACCCACGTTCGTGTTGACCCAAAATGGATTTCTGTAATTAATACCCCACAAGACGGGTATAATTTAGAATCAGGTAACTTTATCACGGCCGATACGAATTCAAATGAATTATTATTTAATTTACCAAAAACACCAAAAGACGGCGATACAATCGCAATCAAAGATATCGGTGGCTACGTAGGGTATAAATCTCTCAGAGTTAAAAAATCTATCCACGATATAAAGTGGAACGATTTATACAGAGATGAAATATATATTACTCGCCCGTATTCGCAAACTTACTTCATTTTTAGTCGAGGACTTTGGAATGCCTTGGTTCTCGAAAATGAAGATTCAGCTAAAATTGTATCATCTCAGCCGATTAAGCAGAAACTTTCATCTGGGGATCGTGTTTATAGAAGATCATCTACAGGTAAAATTGATTTGGTTCTACCTAAATATGCAATGCATGGTGATCTGATTGAATTTTATGACATAGATTCTTTGACGCCTATTAATCATATGACCGTTGAAGTTTCTGAAGATTCAGGGCATTCAGTAGAATTATTGGGTCAAACATCTGTAACTGTCCGTACTTCTGGTTCTGGTAGATTAGCCTTTGATGGTTCAGAAAATATTTGGCGTGTCTGGGAAGGCGATTTAAGAACCAGGCTTAAATTAATTACTGAAAACTATAAAATTCTCCCTAACGAGGCTATTTTAGTTTTTGGTGCAAATAATTCTGAAAAGAAAACTATTACTATTGATCTACCTAAAGATGTTGAATTAGGGGACACTGTAGAAATTTCTCTTAATTACATGAGAAAAGGTCAAAAGGTTAATATTAAAGCATCAACCGGAGACACAATTTCTACTAGTAAGTCATTGTTGCAGTTCCCTAAAAGATCTGAATATCCACCCGAGACAGCCTGGGTCACAGTACCTAATATCGAATTTGACGGGACTTTGGACTATGTTCCTTATATCAGATTATCTTATGTTCTCCAAAATGGTAAAACAACTTGGATTATCCAAGAAGTTAATCCTACTGTAGAACGTGTCGATTCGACGGCTAGAGAACGTCTTGGTGTTATTGCTTTAGCGTCCCAGGCCCAAGCTAATGTCGATAAAGAAAAAAATCCAGAGAAAGAACTAGCGATAACGCCGGAAACATTAGCTAATCGAGTGGCTTTAGAAACTCGGCGTGGTATTGCTAGAATTGCAACAACAGCCGAAGTTAATAAACTGAGCGTTGATTCTTATGATGACGATACTATTATCACGCCTAAGAAACTTAATGGGCGTTCTGCAACGGAAACTCGTCGTGGGCTGGCCGAACTAGCGACACAAGAGAAAACTAATAAAGGCGAAGACGATTTAACTATTGTTACGCCTAAAAAGCTGCATAATAGAAAAGCATCCGAGACTTTAACAGGTATTGCTAAGATAGTAGCCTCTAAGGGCACACCAGGGACCCAACGTGACGTTCCGGGAACAGGGGTTTATAGTTTCAATAACAATACGGACATAGTCACTCCTGCGGCGTTACACGAAAACCTGGCAACTAAAACTGCACTCGGGACAGTGTTTTTAGCTACAGAAACCGAAGTTATCGAAGCACCGGTAATGGATCCTAAGTTCCCGGTTGTTGTTACACCTGTAGAACTTCATAAAAAGACGGCAACAGAATCTAGGATCGGATTCGCTAAAATTGCGACACAAGACGAAACTAATAAAGGGGCAATTGATAACGCGATTGTTACGCCTAAAAAGTTAAATGACCGAAAAGCTTCCGAGACTTTAACCGGTATCGCTAGAATTGCAACGCAAACGGAGTTCAACCAAGGAACTTTAAATGACGTGATTTCTTCACCGCTTAAAGTCAAAACTTATTTTAACTCGACTGCTAGAATTCAAACAAACACGGCGACTGGTATTAAACACACCGGGACTTTGTGGGAAAACTTTAAATTAGAAATTTTGCCTGCGTCAGAACTTCAAGTTGGGTCTGCTAAAATAGCAACTAAAGCTTTAGTTGATGCTGGAACAGACGATACGACTATTGTTACCCCTAAAAAGTTGCATGATAAAAAATCAACCGAAACATCAGAAGGTATCATCAAAGTTTCTACCTATGAGCAAACAATCGCAGGAACTTCGGCCAATACGGCTATTTCGCCTAAGAACTTTGTCTTAGCAATAAGAACAGAGAAAAATGGACTAGAAGCTACGACTACAAATCGTGGATTCGTCAGAATAACCCAAGATGCTTCTATTTGGACTGGTGACGACGTTGTAGGTTCCACCGGAACTTACGAGCATGACGGTTACGCTGTTTCTCCAAGAGAATTAAACAAAGCATTAAGTCATTATTTACCGATCAAGGCCACAGCAGTTAATTCAGCATTATTGAATGGTATTAAATCGGACCAATTTATTCGTAGAGATATAAACCAAGAAGTTAATGGTATATTAACTATGAATAAAGAAACTGTTATGAAAGCACCTTTGAATTCAACTTCAACAGGTAAATTCACAACACTAGATTTAACGTCTACTGGTATTTCACTAAAACTTGGTAACAGTACTGGTTGGAGTGGTTTACATATTCTAGGACAAGGCGGTTGGTCTTTATTTAGTGCTTCTGATACCAACTTTAAGATTCAGCCAATCGATGCACAGAATCCTGATAATATCGAAATGTTCAGTATTAACAGGACTTCCGGTAATGTTGACATTGCAAAAAATCTTAATGTCGGCGGTGTTTTAAATGCATTTAGTGTCCAAGTTCGTTCTAAAGATGCTATCCGGTTAAATGGAACCCGGATATTATACGGTAATAATACAACTCCATTACAGTTTGCTACTCCTAATGCCAGTGACATTGTTGTTAGTGAAGCAGTGGACCAGTATAAGGTTATTACAACTAAAAACTTGGTCGAAGAATCGAATAAAACATATTTGAGAAAAGGTGGAGATACTGCTACAGGAACTATCAATTTTAGTAAACCTATTTTTGTTAGAAGAGCTCCTGTTGCTAATAGCAAGCAATCCCCTGAAAACGGTATTTTTGTTTCTGAGGTCGTGGATAAATCGATGTATGATACTTATCCAGGTATCGCGGTTCCTCAATATGACGATCAGAATAAAATTACCGAATACAAATATGTTAAAGGGCCGGGTACGTTAATTCAAATTGGTGATTCTAAAGACTTTACTTTTAGAATCTGGGTTCCAAAAGCTCTTGATAAAACTGCTAACCACAATAACCATTCTATTTGGATGCAGACCTATAACACGGCTAAAGGCGAATTGGAAGATTGGGGACGAGTTTTCACAACCCAAAGTCCTCCAACTGCTGCTGATGTTGGTGCGGTTTCGGAATCAGGTTCATCCATTAACAATATAACAGTTAGAGAATGGATGCAAGTGGGCAATTTAAGGCTTGTTCCTAATCCAGTTACTAAAACTGTTGACTATATTTGGGTAGACTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
0a76696c5bddd5d9722627d21611a9e6253ff656bb446d58b593460b5d7c90c8
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Novel bacteriophages targeting Providencia spp. as potential agents for phage therapy | Rakov,C., Alkalay-Oren,S., Coppenhagen-Glazer,S. and Hazan,R. | 2021-04-02 | — | GenBank |