Protein

Genbank accession
QKE55319.1 [GenBank]
Protein name
fibers protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,85
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MALKTKIIVQQILNIDDTTTTASKYPKYTVVLGNSISSITAGELTAAVEAAAGSAAAAKGSEIAAKDSENKAKDSEIQAGIHADASEASATQSAASATESEKQAGLAQSSADNSAASAQESKGFRDSAELAAQNAEQSRLLAEQAKIAAQTAQTGAEAAEKRTASSEIKAANSATTAGEHAAAAKQSELNAKTSEINAAASEGEATNQAGNATTEANRAKAEADRAAQIVDTKLDKEDISGFIKVYKTKAEADADVSSRVLGEKILVWNQTDSKYGWYKVAGTAETPVLELVETEQKLVSINNVRADDAGNVQITLPGGNPSLWLGEVTWFPYDKDSGVGYPGVLPADGREVLRVDYPDTWEAIEAGLIPSVTEEQWQAGATLYFSTGNGTTTFRLPDMMQGQAFRAPTKGEEDAGAIKEQIPYITTVNGISPADDTGAIKLPYVAMVNGAIIPDENGNLALGNVVTKNAWNGTDGEVLLRGAFGLGGAGITLNEPDLVSFFKAMRAFGSGYYRNDTGFDGLPSYSAGFYSRVADTNSFICAGYGSAAVFVAAINDAGLDSENPIVHTNILYGTVNKPDLNGDTNGVLSVGKGGTGATTVSAAKKALEVGGVFCNDSPADAAFNSLQSPAGINEFRITNDGTWGVWKKGEETVAALPIASGGTGATDKVAVRDNFGLGYHNTPRFTGVDLSNPESLPHSGVLNLNRLKESDQNVITQGRIYHEMQSGLAKITLHINNTLNSANRYIQFVENGDLTGLQNVHAVNYLASGYVTAQGWIKGGEKIYIQQTGGGNREISMAVPTPNNDPGAGSWVNLLHGNWYNGYWQVGGIRGSGLDLDCFRIGVNNAGTDWKEFNFYNSFGGHITAQRGFRGQCIQGSWGLEWNYMGAPFFAESVTNNDGGWSPFVSGGTVSTGGYSLRVGLGCISNGNAAWPDAALKLNGDGQFHRSFNFRTNGSMYTWGHDPWGGNYDIAMNPSSDRDIKRDINYDDGLASYENIKQFKPTTFIYKLDKYNRVRRGVIAQDLYKIDPEYVKLIPGSPIIEIPEHHCCNGEAENAEGKIIGYNDDTLALDINPIAIDTALAVRYLSIKFEESQEELKTVKAELAELRALVATLVNK
Physico‐chemical
properties
protein length:1116 AA
molecular weight: 118631,87430 Da
isoelectric point:4,87345
aromaticity:0,08244
hydropathy:-0,33002

Domains

Domains [InterPro]
IPR030392
976–1032
IPR030392 Coil
IPR030392
976–1096
IPR030392
QKE55319.1
1 1116
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage ECOP18
[NCBI] 		2713223 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QKE55319.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT080103 [NCBI]
CDS location
range 107411 -> 110761
strand -
CDS
ATGGCACTTAAAACTAAAATTATTGTACAGCAGATTCTGAACATAGATGATACTACAACTACTGCTAGTAAGTATCCTAAATATACAGTAGTTTTAGGTAATTCTATTAGTTCTATTACTGCTGGTGAATTAACTGCTGCTGTAGAGGCCGCTGCAGGATCCGCTGCTGCTGCTAAAGGTTCTGAAATAGCAGCTAAAGACTCTGAAAATAAAGCTAAAGATTCAGAGATTCAGGCAGGTATTCATGCTGATGCTTCCGAAGCTTCAGCAACTCAATCTGCTGCCTCTGCTACTGAGTCAGAAAAACAGGCGGGATTAGCCCAGAGCAGTGCAGATAATTCTGCAGCTTCTGCGCAAGAATCAAAGGGATTTAGAGACTCTGCCGAATTGGCAGCGCAGAATGCTGAACAAAGTCGTTTATTAGCTGAACAGGCTAAAATAGCTGCACAGACAGCCCAAACTGGTGCAGAAGCTGCTGAGAAAAGAACCGCCTCTTCCGAAATAAAAGCTGCTAATTCTGCTACAACTGCTGGAGAACATGCTGCTGCTGCTAAGCAATCGGAATTAAATGCTAAAACGTCTGAGATTAATGCTGCTGCATCTGAGGGTGAAGCCACTAATCAGGCAGGAAATGCAACTACTGAGGCTAATCGCGCTAAAGCAGAAGCTGATCGTGCTGCTCAAATAGTAGACACTAAACTTGATAAAGAAGATATTTCTGGATTTATCAAAGTATATAAAACTAAAGCTGAAGCTGATGCAGATGTATCTAGTCGTGTATTAGGTGAAAAGATTTTAGTATGGAATCAAACTGATTCAAAGTACGGTTGGTACAAAGTAGCTGGAACTGCTGAGACTCCAGTATTAGAGTTAGTAGAGACAGAGCAAAAGCTAGTTTCTATTAACAACGTTCGTGCAGATGACGCAGGTAACGTACAGATTACTCTTCCTGGTGGTAACCCCTCTTTATGGCTGGGTGAAGTTACTTGGTTCCCTTATGATAAAGATTCAGGTGTTGGCTACCCTGGTGTTCTTCCTGCTGATGGTCGTGAAGTTCTTCGTGTAGACTACCCAGATACTTGGGAAGCTATTGAGGCTGGCTTAATCCCTTCTGTTACCGAAGAACAATGGCAAGCAGGTGCAACTCTCTATTTCTCCACTGGTAATGGTACTACTACTTTCCGTCTACCAGATATGATGCAGGGACAGGCATTCCGTGCACCAACTAAGGGTGAAGAAGATGCTGGTGCTATCAAAGAACAAATTCCTTATATTACCACTGTGAATGGGATTAGTCCTGCTGATGATACTGGAGCTATTAAGCTCCCTTATGTGGCTATGGTTAATGGTGCTATTATACCTGATGAGAATGGTAACCTAGCACTAGGTAACGTTGTTACTAAGAATGCTTGGAACGGTACTGATGGAGAAGTTCTACTTCGTGGTGCTTTTGGCTTAGGTGGTGCTGGTATTACGTTAAATGAGCCGGATCTAGTATCCTTCTTTAAAGCTATGAGAGCCTTTGGTTCTGGGTATTATCGCAATGATACTGGATTTGATGGTTTGCCCTCGTATTCTGCAGGTTTCTACTCTAGGGTAGCAGATACTAACTCATTTATCTGCGCTGGGTATGGTAGTGCCGCAGTATTTGTAGCTGCAATCAATGATGCTGGTTTAGATAGTGAAAACCCTATTGTTCATACTAATATTCTTTATGGTACTGTTAATAAGCCAGATCTAAATGGTGATACTAATGGAGTTCTTAGTGTTGGTAAAGGTGGTACTGGAGCTACCACAGTTAGTGCTGCTAAGAAAGCTTTAGAAGTTGGTGGAGTTTTCTGTAATGATAGTCCCGCTGATGCTGCTTTCAATTCCCTCCAGAGCCCTGCTGGTATTAATGAGTTTAGAATAACTAATGATGGAACATGGGGTGTCTGGAAGAAGGGTGAAGAAACGGTAGCTGCGTTGCCTATAGCCTCTGGTGGTACAGGAGCTACTGATAAAGTTGCGGTGCGTGATAACTTTGGATTGGGGTATCATAATACTCCTAGATTTACTGGGGTAGATCTATCTAATCCCGAAAGCCTACCCCATAGTGGTGTCCTTAATCTAAACAGGCTAAAGGAATCTGATCAAAATGTTATTACTCAGGGTAGAATCTATCATGAGATGCAATCAGGCTTGGCTAAAATTACCCTTCATATTAACAATACTTTAAATAGTGCAAACCGTTATATACAGTTTGTAGAAAATGGTGATTTAACTGGGCTACAGAATGTACATGCAGTTAACTACCTTGCAAGTGGTTATGTTACAGCCCAGGGATGGATCAAAGGTGGGGAAAAAATCTATATACAGCAAACAGGTGGTGGCAACAGGGAAATTAGTATGGCTGTACCTACTCCTAATAATGACCCTGGTGCTGGTTCTTGGGTTAACTTACTACATGGTAACTGGTATAACGGTTACTGGCAAGTAGGTGGTATCCGTGGTAGTGGACTGGACTTAGACTGCTTCCGTATTGGAGTTAACAACGCTGGTACAGATTGGAAAGAGTTTAACTTCTATAACTCTTTCGGTGGGCACATAACTGCTCAAAGAGGTTTTCGTGGTCAGTGTATCCAAGGATCTTGGGGCTTAGAGTGGAATTACATGGGCGCCCCATTTTTTGCAGAGTCTGTAACAAATAATGATGGTGGTTGGTCTCCATTTGTTTCTGGTGGTACTGTATCTACAGGAGGCTACTCACTACGTGTTGGGCTTGGATGTATTTCTAATGGTAACGCTGCATGGCCTGATGCTGCTCTTAAGTTAAATGGGGATGGCCAGTTCCACCGTTCATTCAACTTTAGAACAAATGGTAGCATGTATACTTGGGGTCATGATCCTTGGGGAGGTAACTATGACATTGCTATGAACCCTTCTTCAGATAGAGATATCAAAAGAGATATTAATTATGATGATGGGTTAGCCTCCTATGAGAATATAAAGCAATTTAAACCTACCACATTTATCTATAAACTAGATAAGTATAATCGTGTACGCCGTGGTGTTATTGCTCAAGATCTTTATAAAATTGACCCCGAATATGTCAAGTTAATACCTGGTTCTCCTATTATAGAAATCCCAGAACATCATTGCTGTAATGGTGAAGCTGAGAATGCAGAAGGTAAGATCATTGGTTATAATGATGATACTCTAGCCTTAGATATCAACCCAATTGCTATTGATACTGCTTTAGCAGTTCGCTACTTATCTATTAAGTTTGAAGAGTCACAGGAAGAACTGAAAACAGTCAAGGCAGAGCTGGCAGAGTTAAGAGCTCTAGTAGCTACTCTAGTTAACAAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
34f47cd824356eed989324417cdf959543d151351921556955b7f55ff537460b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2607
Evidence 0,2607
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterization and genomic study of ECOP18 phage Lee,J.-H. and Yoo,B.-E. 2023-05-12 — GenBank