Protein

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Genbank accession
QKE55319.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,85
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MALKTKIIVQQILNIDDTTTTASKYPKYTVVLGNSISSITAGELTAAVEAAAGSAAAAKGSEIAAKDSENKAKDSEIQAGIHADASEASATQSAASATESEKQAGLAQSSADNSAASAQESKGFRDSAELAAQNAEQSRLLAEQAKIAAQTAQTGAEAAEKRTASSEIKAANSATTAGEHAAAAKQSELNAKTSEINAAASEGEATNQAGNATTEANRAKAEADRAAQIVDTKLDKEDISGFIKVYKTKAEADADVSSRVLGEKILVWNQTDSKYGWYKVAGTAETPVLELVETEQKLVSINNVRADDAGNVQITLPGGNPSLWLGEVTWFPYDKDSGVGYPGVLPADGREVLRVDYPDTWEAIEAGLIPSVTEEQWQAGATLYFSTGNGTTTFRLPDMMQGQAFRAPTKGEEDAGAIKEQIPYITTVNGISPADDTGAIKLPYVAMVNGAIIPDENGNLALGNVVTKNAWNGTDGEVLLRGAFGLGGAGITLNEPDLVSFFKAMRAFGSGYYRNDTGFDGLPSYSAGFYSRVADTNSFICAGYGSAAVFVAAINDAGLDSENPIVHTNILYGTVNKPDLNGDTNGVLSVGKGGTGATTVSAAKKALEVGGVFCNDSPADAAFNSLQSPAGINEFRITNDGTWGVWKKGEETVAALPIASGGTGATDKVAVRDNFGLGYHNTPRFTGVDLSNPESLPHSGVLNLNRLKESDQNVITQGRIYHEMQSGLAKITLHINNTLNSANRYIQFVENGDLTGLQNVHAVNYLASGYVTAQGWIKGGEKIYIQQTGGGNREISMAVPTPNNDPGAGSWVNLLHGNWYNGYWQVGGIRGSGLDLDCFRIGVNNAGTDWKEFNFYNSFGGHITAQRGFRGQCIQGSWGLEWNYMGAPFFAESVTNNDGGWSPFVSGGTVSTGGYSLRVGLGCISNGNAAWPDAALKLNGDGQFHRSFNFRTNGSMYTWGHDPWGGNYDIAMNPSSDRDIKRDINYDDGLASYENIKQFKPTTFIYKLDKYNRVRRGVIAQDLYKIDPEYVKLIPGSPIIEIPEHHCCNGEAENAEGKIIGYNDDTLALDINPIAIDTALAVRYLSIKFEESQEELKTVKAELAELRALVATLVNK
Physico‐chemical
properties
protein length:1116 AA
molecular weight: 118631,87430 Da
isoelectric point:4,87345
aromaticity:0,08244
hydropathy:-0,33002

Domains

Domains [InterPro]
DC_0608
ATT
2–592
DC_0608 IPR030392 Coil
DC_0195
STR
416–1116
DC_0195
IPR030392
CHP
976–1096
IPR030392
QKE55319.1
1 1116
Architecture
ATT
STR
ATT 2-592 | STR 593-1116
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage ECOP18
[NCBI] 		2713223 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QKE55319.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT080103.1 [NCBI]
CDS location
range 107411 -> 110761
strand -
CDS
ATGGCACTTAAAACTAAAATTATTGTACAGCAGATTCTGAACATAGATGATACTACAACTACTGCTAGTAAGTATCCTAAATATACAGTAGTTTTAGGTAATTCTATTAGTTCTATTACTGCTGGTGAATTAACTGCTGCTGTAGAGGCCGCTGCAGGATCCGCTGCTGCTGCTAAAGGTTCTGAAATAGCAGCTAAAGACTCTGAAAATAAAGCTAAAGATTCAGAGATTCAGGCAGGTATTCATGCTGATGCTTCCGAAGCTTCAGCAACTCAATCTGCTGCCTCTGCTACTGAGTCAGAAAAACAGGCGGGATTAGCCCAGAGCAGTGCAGATAATTCTGCAGCTTCTGCGCAAGAATCAAAGGGATTTAGAGACTCTGCCGAATTGGCAGCGCAGAATGCTGAACAAAGTCGTTTATTAGCTGAACAGGCTAAAATAGCTGCACAGACAGCCCAAACTGGTGCAGAAGCTGCTGAGAAAAGAACCGCCTCTTCCGAAATAAAAGCTGCTAATTCTGCTACAACTGCTGGAGAACATGCTGCTGCTGCTAAGCAATCGGAATTAAATGCTAAAACGTCTGAGATTAATGCTGCTGCATCTGAGGGTGAAGCCACTAATCAGGCAGGAAATGCAACTACTGAGGCTAATCGCGCTAAAGCAGAAGCTGATCGTGCTGCTCAAATAGTAGACACTAAACTTGATAAAGAAGATATTTCTGGATTTATCAAAGTATATAAAACTAAAGCTGAAGCTGATGCAGATGTATCTAGTCGTGTATTAGGTGAAAAGATTTTAGTATGGAATCAAACTGATTCAAAGTACGGTTGGTACAAAGTAGCTGGAACTGCTGAGACTCCAGTATTAGAGTTAGTAGAGACAGAGCAAAAGCTAGTTTCTATTAACAACGTTCGTGCAGATGACGCAGGTAACGTACAGATTACTCTTCCTGGTGGTAACCCCTCTTTATGGCTGGGTGAAGTTACTTGGTTCCCTTATGATAAAGATTCAGGTGTTGGCTACCCTGGTGTTCTTCCTGCTGATGGTCGTGAAGTTCTTCGTGTAGACTACCCAGATACTTGGGAAGCTATTGAGGCTGGCTTAATCCCTTCTGTTACCGAAGAACAATGGCAAGCAGGTGCAACTCTCTATTTCTCCACTGGTAATGGTACTACTACTTTCCGTCTACCAGATATGATGCAGGGACAGGCATTCCGTGCACCAACTAAGGGTGAAGAAGATGCTGGTGCTATCAAAGAACAAATTCCTTATATTACCACTGTGAATGGGATTAGTCCTGCTGATGATACTGGAGCTATTAAGCTCCCTTATGTGGCTATGGTTAATGGTGCTATTATACCTGATGAGAATGGTAACCTAGCACTAGGTAACGTTGTTACTAAGAATGCTTGGAACGGTACTGATGGAGAAGTTCTACTTCGTGGTGCTTTTGGCTTAGGTGGTGCTGGTATTACGTTAAATGAGCCGGATCTAGTATCCTTCTTTAAAGCTATGAGAGCCTTTGGTTCTGGGTATTATCGCAATGATACTGGATTTGATGGTTTGCCCTCGTATTCTGCAGGTTTCTACTCTAGGGTAGCAGATACTAACTCATTTATCTGCGCTGGGTATGGTAGTGCCGCAGTATTTGTAGCTGCAATCAATGATGCTGGTTTAGATAGTGAAAACCCTATTGTTCATACTAATATTCTTTATGGTACTGTTAATAAGCCAGATCTAAATGGTGATACTAATGGAGTTCTTAGTGTTGGTAAAGGTGGTACTGGAGCTACCACAGTTAGTGCTGCTAAGAAAGCTTTAGAAGTTGGTGGAGTTTTCTGTAATGATAGTCCCGCTGATGCTGCTTTCAATTCCCTCCAGAGCCCTGCTGGTATTAATGAGTTTAGAATAACTAATGATGGAACATGGGGTGTCTGGAAGAAGGGTGAAGAAACGGTAGCTGCGTTGCCTATAGCCTCTGGTGGTACAGGAGCTACTGATAAAGTTGCGGTGCGTGATAACTTTGGATTGGGGTATCATAATACTCCTAGATTTACTGGGGTAGATCTATCTAATCCCGAAAGCCTACCCCATAGTGGTGTCCTTAATCTAAACAGGCTAAAGGAATCTGATCAAAATGTTATTACTCAGGGTAGAATCTATCATGAGATGCAATCAGGCTTGGCTAAAATTACCCTTCATATTAACAATACTTTAAATAGTGCAAACCGTTATATACAGTTTGTAGAAAATGGTGATTTAACTGGGCTACAGAATGTACATGCAGTTAACTACCTTGCAAGTGGTTATGTTACAGCCCAGGGATGGATCAAAGGTGGGGAAAAAATCTATATACAGCAAACAGGTGGTGGCAACAGGGAAATTAGTATGGCTGTACCTACTCCTAATAATGACCCTGGTGCTGGTTCTTGGGTTAACTTACTACATGGTAACTGGTATAACGGTTACTGGCAAGTAGGTGGTATCCGTGGTAGTGGACTGGACTTAGACTGCTTCCGTATTGGAGTTAACAACGCTGGTACAGATTGGAAAGAGTTTAACTTCTATAACTCTTTCGGTGGGCACATAACTGCTCAAAGAGGTTTTCGTGGTCAGTGTATCCAAGGATCTTGGGGCTTAGAGTGGAATTACATGGGCGCCCCATTTTTTGCAGAGTCTGTAACAAATAATGATGGTGGTTGGTCTCCATTTGTTTCTGGTGGTACTGTATCTACAGGAGGCTACTCACTACGTGTTGGGCTTGGATGTATTTCTAATGGTAACGCTGCATGGCCTGATGCTGCTCTTAAGTTAAATGGGGATGGCCAGTTCCACCGTTCATTCAACTTTAGAACAAATGGTAGCATGTATACTTGGGGTCATGATCCTTGGGGAGGTAACTATGACATTGCTATGAACCCTTCTTCAGATAGAGATATCAAAAGAGATATTAATTATGATGATGGGTTAGCCTCCTATGAGAATATAAAGCAATTTAAACCTACCACATTTATCTATAAACTAGATAAGTATAATCGTGTACGCCGTGGTGTTATTGCTCAAGATCTTTATAAAATTGACCCCGAATATGTCAAGTTAATACCTGGTTCTCCTATTATAGAAATCCCAGAACATCATTGCTGTAATGGTGAAGCTGAGAATGCAGAAGGTAAGATCATTGGTTATAATGATGATACTCTAGCCTTAGATATCAACCCAATTGCTATTGATACTGCTTTAGCAGTTCGCTACTTATCTATTAAGTTTGAAGAGTCACAGGAAGAACTGAAAACAGTCAAGGCAGAGCTGGCAGAGTTAAGAGCTCTAGTAGCTACTCTAGTTAACAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
34f47cd824356eed989324417cdf959543d151351921556955b7f55ff537460b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3362
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterization and genomic study of ECOP18 phage Lee,J.-H. and Yoo,B.-E. 2023-05-12 — GenBank