Protein

Genbank accession
AVH85809.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,63
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MIKFHDPAGTPHFGQATITRTTSVNGGLSLTGEVFAGDDVLNGLDYGWWLNFDKEKYVITYKKLSDDTNTVVFDAVHQFFWDFAKVALHAQYTGSHEYTFYLGQLFDKSGYTYKNDVTVPAFEKENWGYKNKLDLFNDIIDQAGVEFEVHNETVHIAKQIGSDLTSFARKGINLSNLTEEMKISDFATYAKGYGAFKDTEDQSKGRLEVEYRSELAKQFGDLEMDPIVDERYTIADNLIAALKKQVDATYTVSMTMNIYDLENAGYPNYEAPKVGDWILAIDEALNFKRKIRIIQLEEQFDVTGKRIGYTATCGDLSIVDQYTHLQSSLDSKVQRIQESVDNALSSANGKSTNYYGEKEPTSANEGDLWFDQSDSDPDKWSIKQWVNGRWEQITLNPGEVDAKVNAAKQEAETAVENAKSASDKADQLAAKYDDTNALANQAPDQAIDAQNSAAGLIDDVNKASQNADDAKSIANSVNSKYTTLTDGSTMTIAELENGLAAKLTKDDLSGYATETWTQNQIKVTADGINSTLSSVKTTVDGQTTSLNDLKADSSGFKAQFVTVNDTLGKQTKDIGTLQATNKSLVASFDSLNASNAVNEHNISQLQVTANSFSSTLATVQQQVTDSAVGVNLLRNARTLDGWKVWAGAGAGKGFNIEDKFSDSGQYRMAHIFNNVDGQNSDGPYWPGVNLFLNAGQVYTISIWAHSLGTSEQPVSWKLWLNWDKDHTYQGVNITNTTAPDWTHYSATFTATVGGQVNNVRIVPYFGTGSAANVGGSVYLLKPKLERGSRATDFSVNPADNATVDAVSSISQTVDAIQTTVRGKVDNDVYQSKVTQLSNQITSVVGQVNTLGQRNLVANSRFQYDKFDGSTWTSDIASNWYSSDMTWSWWNGYQGICCNIPIANPVNTNQWNSIVSKKIYVPDPASVYSASAIFNVDTVGNRTQLVLDWYDQSMKRIGYATKGVTVFHTQTLVKIENQTPPTGTAYVAIHVDVNGGGHLAVIAPMLVNAASVGSYVPDNASWTEFQQTASDINLKVSKDGVVNAVNISPEGIQIYGNKLHITAATYIDNAVIKDAMIANLNANKLTAGSINAANINVYNINGANIVANSITANQLKAGSLLIALNSTMQTMRIGTDGLYTTDNKGDGVGHIHTNSVVGHPDVYGLNFDLDATGDYMGWGAKNRGDPNGTYAIKLGWYRSDTANTIGNIKGFVFSDQVTLNGGIQVSGAYQNLGFGTSTFNNNTHYPYFGSTGMKAGLAYGSTDTYLISDGKYADMTKVIFALQGIGDAYIPVKLSDGKITSYVKVNFQH
Physico‐chemical
properties
protein length:1308 AA
molecular weight: 142534,01100 Da
isoelectric point:4,97434
aromaticity:0,09862
hydropathy:-0,35948

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:3.55.50.40
77–161
G3DSA:3.55.50.40 Coil G3DSA:2.60.120.260 IPR012892
IPR010572
105–299
IPR010572 IPR008979
IPR003305
679–761
IPR003305
AVH85809.1
1 1308
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage PM411
[NCBI] 		2079298 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AVH85809.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MG788324 [NCBI]
CDS location
range 42740 -> 46666
strand +
CDS
TTGATTAAATTTCATGATCCGGCTGGGACGCCCCATTTCGGCCAAGCTACCATTACAAGAACTACTAGCGTTAATGGCGGACTGTCACTGACTGGTGAAGTGTTTGCTGGTGATGACGTATTGAACGGTTTAGACTACGGCTGGTGGTTAAACTTCGATAAAGAAAAGTACGTCATTACGTATAAGAAGCTGAGTGATGATACCAATACCGTTGTCTTTGATGCGGTACACCAGTTCTTTTGGGACTTTGCCAAAGTAGCATTGCACGCACAATACACGGGTAGTCATGAGTATACATTCTATCTGGGACAACTCTTTGATAAATCCGGGTATACCTACAAGAATGACGTTACCGTACCAGCATTTGAAAAAGAAAATTGGGGTTATAAAAATAAGTTAGATTTATTTAACGACATTATTGATCAGGCTGGCGTTGAATTTGAAGTGCACAATGAGACGGTTCACATTGCTAAACAGATTGGTAGTGACCTGACCAGTTTTGCCCGTAAAGGGATTAACCTTAGTAATCTCACGGAAGAAATGAAAATATCCGATTTTGCGACGTATGCTAAGGGCTATGGTGCTTTCAAAGATACTGAAGACCAAAGTAAGGGTCGATTAGAAGTTGAGTATCGCAGTGAGTTAGCCAAGCAGTTTGGCGACTTAGAAATGGACCCGATTGTCGATGAACGATACACAATTGCAGATAACTTGATTGCCGCCTTAAAAAAGCAGGTTGATGCGACCTATACCGTGTCAATGACTATGAACATCTATGACTTAGAGAACGCTGGTTATCCTAATTATGAAGCACCTAAAGTCGGGGACTGGATTCTAGCGATTGATGAAGCATTAAATTTCAAGCGTAAGATTCGCATTATTCAGCTTGAAGAACAGTTTGACGTGACCGGTAAGCGTATCGGGTATACGGCCACTTGTGGTGATTTGAGTATTGTGGATCAGTACACACATCTACAAAGTAGTTTGGATAGCAAGGTGCAACGTATTCAAGAAAGTGTTGATAATGCACTTAGCAGCGCTAACGGCAAGAGTACAAACTACTATGGTGAAAAAGAACCCACGAGCGCCAATGAAGGTGACTTATGGTTTGACCAAAGTGATAGTGATCCAGACAAGTGGTCTATCAAACAATGGGTCAACGGGCGTTGGGAGCAGATTACTTTGAACCCTGGCGAGGTAGACGCCAAAGTTAACGCTGCTAAGCAAGAGGCTGAAACTGCGGTTGAAAATGCTAAAAGTGCATCAGATAAAGCTGACCAGCTTGCAGCCAAGTACGATGATACAAATGCATTAGCTAATCAAGCACCGGATCAAGCTATTGATGCACAAAATTCAGCCGCTGGGTTGATTGACGATGTTAACAAGGCCTCTCAAAATGCCGACGATGCAAAGAGCATTGCTAATTCAGTTAATTCTAAGTACACAACATTAACCGATGGTTCTACTATGACGATTGCTGAATTGGAAAATGGACTAGCTGCTAAGTTGACTAAAGATGACCTAAGCGGATACGCCACTGAGACCTGGACACAGAATCAGATTAAGGTTACCGCTGATGGAATTAACTCAACATTATCTAGTGTTAAAACTACGGTTGATGGACAGACGACAAGTCTTAATGATTTGAAAGCTGATTCCAGTGGGTTTAAAGCTCAATTTGTTACCGTCAATGATACTTTGGGTAAGCAAACTAAGGACATTGGAACCCTGCAGGCAACGAACAAGTCTTTAGTTGCTAGCTTTGATTCTTTAAATGCTTCCAATGCTGTTAATGAACATAATATTAGTCAGTTGCAAGTAACAGCCAACTCGTTTAGCAGCACTTTAGCAACTGTTCAACAGCAGGTTACTGATAGTGCAGTGGGCGTTAATCTACTACGTAACGCACGTACTTTAGACGGTTGGAAAGTTTGGGCTGGAGCTGGAGCTGGAAAAGGTTTCAATATTGAGGATAAATTTTCAGATAGTGGCCAGTATAGAATGGCTCATATTTTTAATAATGTTGATGGTCAAAATTCTGACGGTCCTTATTGGCCTGGCGTAAATCTATTTCTAAATGCTGGACAAGTTTACACGATTAGTATATGGGCTCATAGTCTAGGCACCTCTGAACAGCCTGTTTCCTGGAAATTGTGGCTTAATTGGGATAAGGACCATACGTATCAAGGTGTAAACATAACTAACACGACAGCCCCTGATTGGACGCACTACTCAGCTACTTTTACGGCAACCGTCGGGGGACAAGTCAATAATGTCCGAATAGTTCCGTATTTCGGAACTGGATCTGCGGCTAACGTCGGCGGGTCTGTTTATTTGCTAAAGCCTAAACTAGAACGAGGAAGTAGAGCTACTGACTTTTCAGTAAATCCTGCTGACAATGCGACGGTTGATGCTGTTTCTAGTATTTCGCAAACTGTGGACGCCATTCAAACAACTGTTCGTGGAAAGGTTGATAATGACGTGTACCAGTCCAAGGTAACCCAATTGAGTAATCAGATAACTTCTGTCGTAGGACAAGTTAATACTCTTGGGCAGCGTAATCTGGTTGCTAACTCACGATTCCAGTACGACAAATTCGATGGCTCAACATGGACCTCTGATATAGCTTCTAATTGGTATTCGTCAGATATGACCTGGTCCTGGTGGAACGGATACCAAGGGATATGTTGTAATATTCCAATAGCCAATCCAGTTAATACCAACCAATGGAATTCTATAGTTTCAAAGAAGATCTATGTTCCAGATCCTGCTTCTGTGTATTCAGCCAGTGCGATATTCAATGTTGATACAGTTGGGAACCGTACTCAGTTGGTGCTGGACTGGTATGATCAATCAATGAAGCGAATTGGATACGCCACTAAAGGAGTAACTGTCTTCCATACGCAAACATTGGTTAAGATAGAGAACCAAACTCCACCAACTGGAACAGCTTACGTTGCTATTCACGTTGACGTTAATGGTGGTGGTCACTTAGCAGTGATAGCACCCATGCTTGTTAACGCAGCTAGTGTTGGTTCGTATGTTCCTGATAATGCTAGTTGGACGGAGTTTCAACAAACTGCGTCAGATATCAATCTTAAGGTTTCCAAAGATGGTGTTGTAAATGCAGTTAACATCTCGCCTGAAGGAATCCAGATATACGGTAACAAACTGCATATAACGGCTGCTACCTATATTGATAATGCAGTCATTAAGGACGCCATGATTGCCAACCTAAATGCTAATAAGTTAACAGCTGGATCAATTAATGCGGCTAATATCAATGTGTATAACATTAATGGCGCAAATATTGTCGCCAATTCGATAACTGCTAACCAGCTTAAAGCCGGGTCTCTATTAATTGCATTAAACTCCACTATGCAAACTATGAGGATTGGCACCGATGGTTTATACACTACTGATAATAAAGGCGACGGGGTTGGCCATATTCATACCAACTCAGTCGTTGGGCATCCGGATGTCTATGGCCTAAACTTTGACCTTGATGCTACCGGGGACTATATGGGTTGGGGAGCTAAGAACCGTGGAGATCCTAATGGAACCTATGCCATCAAACTAGGCTGGTATCGTTCAGATACGGCTAATACCATTGGTAATATTAAAGGATTCGTATTCTCAGACCAAGTAACCTTAAACGGCGGTATTCAAGTTTCCGGAGCATATCAGAATCTAGGCTTCGGTACAAGTACGTTTAACAACAATACCCATTACCCTTACTTTGGGTCAACTGGCATGAAGGCTGGATTAGCCTATGGCTCGACGGATACCTATCTGATTTCAGATGGTAAGTATGCTGATATGACTAAGGTTATATTTGCTTTACAAGGTATCGGTGATGCTTATATTCCCGTTAAGCTTAGTGACGGAAAGATAACTAGTTATGTTAAAGTCAATTTCCAACATTAG

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
9592254fe52a17d1b5933700faf857805e4fc785c2d3731df965533e713a2532
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7187
Evidence 0,7187
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Monitoring viable cells of the biological control agent Lactobacillus plantarum PM411 in aerial plant surfaces by means of a strain-specific viability quantitative PCR method Daranas,N., Bonaterra,A., Frances,J., Cabrefiga,J., Montesinos,E. and Badosa,E. 2018 29523544 GenBank