Protein
- Genbank accession
- ANZ52027.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fibers protein
- RBP type
-
TSPTFTFTF
- Protein sequence
-
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKVVFNPTGSSEVTIGDVLKTFKINANGLKLTIADTSRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAITNTFSGTQNIQGDANLLRLRNQNANNAQYIEGVNLDGSARWWVGIGSNGSDEVKLYNNKYNSALTVASNVSVNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAANNNFTGTNTFSRNLLIISDSAALRLKNATTSSLFIQGVDSQNTNRWYVGNGDNTASVLLHNYVHGSNIRLDNGYISVNQNFRITGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSNLPKLNVANTFVNVQTIVSNNEGVVLRNLTQGQPQYIRGVDTQNVSRWWVGVGGTNSTDVALNNSYSGTQITLMPSAIKANKNLTITGQVQPSDWSNLDARYFVKTQLLNQSLMTVSVDNLENPSGFNLGYSGFVRNNQVASGLRELAIHVAHSNKTAAHARGISFVYGSNGLATFTYAYDKNGDYAGEAQLYTTDFKPTPSEIGAYTKAETDQKIATAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKSTNSTGGHTHTVSGTTSAAGNHAHHLGLLLVNGGDAQYGYTTVSNSKTRTLDWLDRKDNKFPNTNTTGNHTHTWSGTTSNTGAHTHSVGIGAHTHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 794 AA molecular weight: 85839,72960 Da isoelectric point: 8,97472 aromaticity: 0,08438 hydropathy: -0,39295
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Enterobacteria phage KhF3 [NCBI] |
1651200 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ANZ52027.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KT184315.1
[NCBI]
CDS location
range 4591 -> 6975
strand -
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGATACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTAGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGATTTCTTAGCATCTTTTAAACTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCCGGTAGTACTATGACGGGTGATTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGTAGTCTTTAACCCAACAGGCTCTTCTGAGGTTACTATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATCAACGCAAATGGCCTTAAACTGACTATTGCAGACACTTCAAGGTCGGCAACTGTTTATCATACTCTGAATAAGCCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGGTATGCAAGACTAGCTATCACAAACACATTCTCTGGAACACAAAATATTCAAGGTGATGCTAACTTACTTCGCCTTAGAAACCAAAATGCAAATAATGCACAATATATCGAAGGTGTAAACCTAGATGGCTCGGCTAGATGGTGGGTTGGTATTGGTAGTAATGGCTCTGACGAAGTAAAGCTGTACAATAACAAATACAACTCAGCCTTGACTGTTGCAAGTAATGTCTCTGTTAATAAGTCTTTAGCAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGTAGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCGAATAACAATTTCACTGGCACTAACACGTTTAGCAGAAACCTACTTATTATCAGTGACAGTGCTGCTTTAAGGTTGAAAAATGCAACAACTAGCTCACTATTCATTCAGGGTGTTGACTCTCAGAACACTAACAGGTGGTATGTAGGGAACGGGGATAACACAGCCTCTGTGCTGCTACACAACTATGTACACGGTTCAAATATCAGACTTGATAATGGCTATATCTCAGTCAACCAGAACTTCAGAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCGGATTGGACTAATATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACTTTGAGTAACCTACCTAAGCTTAATGTTGCTAACACATTTGTGAATGTGCAAACTATTGTATCAAATAATGAAGGCGTAGTATTAAGAAACTTAACACAGGGGCAGCCACAATATATCCGTGGTGTTGATACCCAGAATGTATCTAGGTGGTGGGTAGGTGTGGGTGGCACAAATTCTACTGATGTGGCATTAAACAACAGCTACTCTGGGACTCAAATTACTCTTATGCCTTCAGCGATTAAGGCTAATAAGAACCTAACCATTACTGGTCAAGTTCAACCTTCTGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATATTTTGTTAAAACTCAGTTATTAAACCAATCCTTAATGACTGTTTCTGTAGATAACCTTGAAAACCCTTCAGGTTTTAATCTTGGATATTCAGGTTTTGTCAGAAACAATCAGGTTGCTAGTGGACTGAGAGAATTGGCAATTCATGTTGCTCACTCTAATAAGACTGCTGCACATGCAAGAGGAATCTCTTTTGTGTATGGCTCAAATGGACTGGCAACATTTACCTATGCCTATGACAAAAATGGTGACTATGCCGGAGAGGCACAGCTTTACACAACTGATTTTAAACCAACCCCTTCAGAGATTGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAAATTGCAACAGCAATTAGTGACTCTACAGACCTTAACAAAATCTATCCAGTTGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTCCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATCGCAGCAGCTAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTAACATTAGCTGTTGGTAACTTACCATCACACACTCACAGCTTCTCTGCTACCACTTCATCTTTTGATTATGGTACGAAGAGCACTAATAGTACTGGTGGTCACACCCACACTGTAAGTGGTACAACAAGTGCTGCGGGTAACCATGCTCACCACTTAGGTCTGCTATTGGTTAATGGTGGTGATGCTCAGTATGGTTACACAACTGTTAGCAACAGCAAGACAAGAACTCTTGACTGGCTTGATAGAAAAGATAACAAATTCCCTAACACTAACACAACTGGTAACCATACACACACATGGTCTGGTACTACAAGTAACACTGGTGCTCACACCCACTCTGTAGGTATCGGTGCTCACACTCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTCAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
cfed820bc265fbebda36a876dc51e31d12c16f8830d60fee7e7aa18e309758b9
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Identification and characterization of nine bacteriophages able to infect non-O157 STEC | Farrokhzad,K., Applegate,B.M. and Zhang,J. | 2017-12 | — | GenBank |