Protein
- Genbank accession
- QDH84831.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MMKLTNFVFFYNTPFTDYQNTIHFNSNQERDNYFLNGRHFKSLDYSKQPYNFIRDRMEVNVDLSWHDAQGINYMTFLSDFENRRYYAFVNQIEYINDVTTKIYYVIDTVMTFTQGNVLEQLSNVNVERQHLSRDTYKYMLPMLRNNDDVLKVSNKNYVYNQMQQYLQNVVLFQSSADLSKKFGTKKEPNLDTSKGTIYDNITSPVNLYVMEYNDFINFMDKMSAYPWITQNFQKVQMLPKDFINEKDLEDVKTSEKITGLKTLKQGGKSKEWSLNDLSLSFSKLQEMMLSKKDELKHMIRNEYMTIEFYDWNGNTMLLDAGKISEKTGVKLRTKSIIGYHNEVRVYPVDYNSAENDRPILAKNKDILIDTGSFLNTNITFNSFAQVPILINNGILGQSQQANRQKNAESQLITNRIDNVLNGSDPKSRFYDAVSVASNLSPTALFGKFNEEYNFYKQQQAEYKDLALQPPSVTESDMGNAFQIANNINGLTMKISVPSPKEITFLQKYYMLFGFEVNDYNNFIEPINSMTVCNYLKCNGTYTLRDIDPMLMEQLKAILETGVRFWHNDGSGNPMLQNPLNNKFR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 584 AA molecular weight: 68130,28470 Da isoelectric point: 6,07833 aromaticity: 0,12500 hydropathy: -0,56849
Domains
Domains [InterPro]
IPR031772
3–115
3–115
1
584
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Staphylococcus phage SA46-CL1 [NCBI] |
2591106 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QDH84831.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK936476.1
[NCBI]
CDS location
range 8144 -> 9898
strand -
strand -
CDS
ATGATGAAATTAACAAATTTTGTATTTTTTTATAACACACCGTTTACAGATTATCAAAATACAATACATTTTAATAGCAATCAAGAACGTGACAATTATTTTTTAAATGGTCGTCATTTTAAGTCATTAGATTATTCAAAACAACCGTATAACTTTATTCGTGATAGAATGGAGGTTAATGTAGATTTAAGTTGGCATGATGCACAAGGTATTAACTATATGACGTTTTTATCTGATTTTGAAAATAGACGTTATTATGCGTTTGTGAATCAAATTGAATATATTAATGACGTGACAACTAAAATTTATTACGTGATTGATACAGTCATGACGTTCACACAAGGTAATGTATTAGAACAATTATCAAATGTGAATGTAGAACGTCAACATTTATCAAGAGACACATATAAATATATGTTACCGATGTTAAGAAACAACGATGATGTTTTAAAAGTAAGTAATAAAAACTATGTTTATAACCAAATGCAACAGTATTTACAAAATGTTGTACTATTTCAATCAAGTGCTGATTTATCTAAAAAGTTTGGTACTAAAAAAGAGCCTAATTTAGACACATCAAAAGGAACAATATATGACAATATCACATCTCCAGTTAATTTGTATGTCATGGAATATAATGATTTTATTAACTTTATGGATAAAATGAGCGCATATCCGTGGATTACGCAAAACTTCCAAAAAGTACAAATGTTACCTAAAGACTTTATTAACGAAAAAGATTTAGAGGACGTTAAAACAAGTGAAAAAATTACTGGTTTAAAAACATTAAAACAAGGTGGTAAATCTAAAGAGTGGAGCTTAAACGATTTATCATTAAGTTTTTCAAAACTTCAAGAAATGATGTTGTCTAAAAAAGATGAATTAAAACACATGATACGCAATGAATACATGACCATTGAATTTTATGATTGGAATGGTAATACAATGTTACTTGACGCTGGTAAAATTTCAGAAAAAACAGGCGTGAAACTAAGAACAAAATCTATTATTGGTTATCATAATGAAGTTAGAGTTTATCCAGTAGACTATAACAGCGCTGAAAACGATAGACCGATACTTGCTAAAAACAAAGACATATTAATTGATACAGGTTCATTTTTAAATACAAATATTACATTTAATAGCTTTGCCCAAGTTCCAATTTTAATTAATAACGGTATATTAGGACAATCACAACAAGCAAATAGACAAAAAAATGCAGAAAGTCAATTAATCACAAATAGAATTGATAACGTATTAAATGGTAGTGACCCTAAATCAAGATTTTACGACGCTGTCAGTGTTGCTAGTAATTTAAGTCCAACAGCTTTATTTGGTAAGTTTAATGAAGAATATAATTTTTATAAGCAACAACAAGCTGAATATAAAGATTTAGCACTACAACCACCTTCTGTAACAGAATCGGATATGGGTAATGCATTCCAAATTGCAAATAATATTAATGGTTTAACAATGAAGATTAGTGTACCGTCTCCAAAAGAAATTACATTCTTACAAAAATATTACATGTTATTTGGTTTTGAAGTGAATGACTATAACAATTTCATTGAACCTATTAATAGTATGACTGTATGTAATTACTTAAAATGTAACGGAACGTATACATTACGTGATATTGACCCTATGTTAATGGAACAACTCAAAGCAATATTAGAAACTGGTGTGAGATTTTGGCATAATGACGGTTCAGGTAATCCAATGTTACAAAATCCATTAAATAATAAATTTAGATAG
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
c6d5b3489aff8c52485872e8ed423588f2a9e512f7be4219aef6160dfb24629f
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Biocontrol of Methicillin-resistant Staphylococcus aureus using bacteriophage cocktail | Hoang,D.M., Hoang,S.M., Honjoh,K.-I. and Miyamoto,T. | 2008-02 | — | GenBank |