Protein

Genbank accession
YP_009778983.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,99
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MANQNFRVKKGIEVGLGATFLYADDSGVGINSASPRSNLDVRGRSQTEELLVDNYAEVQGPSTFVGLGTFGGDLYVGNDLYVKGNLSFTSFESETGNVTGVLTTRDFNVTGLSTFAGDATFQSDVNISGASSITGNLVVSGASTLTGIVTTGDDLYVGGSLYVFNDIFYDEITGRNLSISGIATLRQLEIQQDLEVAGLSTFVGLVSFRDAVGTNLTVYNLSANTGNFVEINVDGGGGGGGGTGIDSTSVNTEFLNVTGVATFNNGIATNFSAEFIDAGVTTTTDLHFTNGYGVNLNMSGITTVGILTVYENIYDSRNQVGYGDSLLVTQGGKLVWTRPDIAGIATSFQPGSTFYVSENGSNTNDGRSPEKAWGSIAYAVSQIGDTSHDILEVTAGEYTETFPITVPKGLTISGAGQRATIVRPSQATETNDGFLLNDRSTIHNITVTGFYKPQGSINYAFKFSVGAAITSRSPYVDKVTVINKGTQTSASDPYGYGSADSYPTTAPGGAGVLVDGSVVATNSLEAAILLNEVTLFTAGNQGIKITNGGRVEWLNGFIYFASEALVGLSDKTTGLAGAGKARLTLENASGGLVGGNTVQYYDSDGTTVLASGTIDNVSGSYVTLTNAGVGTFTTPRNRTAKKVDFVNGAQLSTAQARFGTSSLDVTGAGTDNITVDSTSDFGFGTGDFTVEFWIYRTGNINGKVICDFRDTAATDQAITIQGDGGNETDVYIGTTSVVTGTVPTTLNAWNHIAVCRVGSTITQYIDGAVSGSGTAATDLGVARQLTFGDRYDNSNNGPTAYLDELRVTKGAAKYTGAFTSPSVALTGDKDTSILLHFDGINGATSTTDDIIVLQDIRITGGNTADKVTLADYSQFGADLRSIACAIEYGNQGMIGDGDGVTLRAISINFNHVGALGDITNDPNLAIQSNEVIELNGGQVSYVSIDQKGDFRVGEAFYVNQETGEVSFTDTVTDLTALSSLTITDGTNSSIITPTSGRFGNVLISGQSVESVTGDLNIKTGGSGEINIFGNTNVIGILTAQIIEINAIQKGDTAIALDDTGTDGTIRFITDGQEAQRITNQQRVGINTTTPVTQLEVKGGTQLENLNVTGIATLNGVGIATIGGDPDFRNLNITGLSTFAGVGTFLSDLYVGGNLSVLGDIKFDEVDARNANITGIATVGFASITDARVGSALTNLGHTQLNTLNVSGVSTLSLLEVSGNSVFTGISTFNNNVTINGDLTINGSQNVDSFGTGDLIVSGIASINQAKIATGIVTTLTATRTESAELKVTGLSTFVGVATFANDVFVAGNLNVLGDIAYDEVTGRNLNISGIATIGFASITDAKIGVATITKLDVTEINVDGGTGIDDNSVTTENLVVSGIATINSGILTTLQAEVGSITNLTAGVSTFTGIVTTTEDLYVGGNLYVFNDIFYDEITGRNLSISGVSTLGFASVRDLRVSGVATFLGDVEISGSQIVDSLITGDLEVTGVTTTKELRFTDAVGVGLTLTNLVVTGNAELNGSGIVTAGQDINFRNLEVAGLSTFVGLQSFRSAVGTALTVYNLRVPENGIVSLPGIPVQGGDAEFRNVNVTGVSSFSGVSTFGSDLYVDGNLFVSGLDFRETLAGENLLVAGVGTVNNLNSNIGIITHLQAGISTFTGITTFQSDASFLSDVYVDGNLNVTGDIRYDEVNGRNLNISGIATIGYSSITDAKIGVATISTLSFGDGVGTALTLTDLTVTGDANLNGSGIVTAGSDVAFRNLEVTGLSTFTGVGTFLSDLYVGGDLFVFNDIKYDEINGRNLNISGISTLGFTSISDIRVSGGSTFLGNVEIDGNLDVTGDLTFDEFDATNANITGIATIGNLLAGVGTITTLSSTDGEITTLTSTDTVVGTLTATDATITTLGVTDSIVGTSTITTLSVTDSVVGTSTITTLNFTDGVGVALTLTDLNVLGEANLNGSGIATAGSDIEFRNLSITGLSTFVGVATFQDDLYVAGNLNVLGDLTYDEVNGRNLNISGIATIGFASITDLRVSGVTTFLGPVNIDGGQQTDFIQTTDLIVTGVATIGYATVTKLIADHSDMRNLNVSGIATIGSLVSDGNGGIIVDGAVSISGIVTIGENSIILDGRKDVEAIYLGDTGRAIVSGISLLLYDVHSRNRYSETI
Physico‐chemical
properties
protein length:2158 AA
molecular weight: 222759,50860 Da
isoelectric point:4,13426
aromaticity:0,07044
hydropathy:0,15431

Domains

Domains [InterPro]
IPR011050
347–647
IPR011050 PF13385
IPR013320
632–811
IPR013320
G3DSA:2.60.120.200
634–811
G3DSA:2.60.120.200
YP_009778983.1
1 2158
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f_Syn7803US26
[NCBI] 		2790346 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009778983.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_047714 [NCBI]
CDS location
range 189352 -> 195828
strand +
CDS
GTGGCGAATCAGAATTTTCGTGTCAAAAAAGGTATAGAAGTTGGCTTAGGTGCCACTTTTCTATACGCAGACGACAGTGGAGTTGGCATTAATAGTGCTAGCCCACGATCAAACCTAGACGTTCGAGGTAGATCCCAAACAGAGGAACTACTGGTAGACAACTATGCAGAGGTGCAAGGACCCTCTACATTCGTTGGACTAGGTACCTTTGGGGGTGATCTATATGTTGGGAATGATCTATATGTAAAGGGCAACCTATCATTCACCAGTTTTGAATCTGAGACTGGTAATGTAACAGGTGTTCTTACCACAAGAGACTTTAATGTAACCGGATTATCTACGTTTGCGGGAGACGCCACCTTCCAAAGTGACGTAAATATCTCTGGTGCTTCTTCAATTACTGGAAACTTAGTAGTTTCTGGTGCCTCTACGCTCACAGGTATCGTCACAACTGGCGATGACCTCTATGTGGGTGGTAGTTTATATGTATTCAATGATATCTTCTATGATGAGATTACTGGTAGAAACCTCAGTATCTCTGGTATTGCCACACTCAGACAGTTAGAAATCCAACAGGACCTAGAAGTTGCAGGTCTCTCCACATTTGTTGGTTTAGTATCGTTCAGAGATGCAGTAGGTACAAACCTAACAGTTTATAATCTTTCCGCCAATACTGGTAACTTCGTAGAGATTAACGTCGATGGTGGAGGAGGAGGCGGTGGCGGTACTGGTATCGATAGTACCTCCGTCAATACCGAGTTCTTAAACGTCACTGGTGTTGCAACATTTAACAATGGTATTGCCACCAACTTCAGTGCAGAGTTTATTGACGCTGGTGTAACCACAACTACCGACCTCCACTTCACTAATGGTTACGGTGTCAATCTCAATATGAGTGGCATCACAACTGTTGGTATTCTAACAGTCTATGAGAATATCTATGACTCTAGAAACCAAGTTGGATATGGTGACTCACTACTAGTCACACAGGGTGGGAAACTAGTATGGACTAGACCTGATATTGCAGGTATTGCCACTTCATTCCAACCAGGTTCTACCTTCTATGTAAGTGAGAATGGTAGTAATACCAATGATGGTAGAAGTCCAGAGAAAGCATGGGGCTCTATTGCATATGCCGTATCACAGATTGGAGATACTTCTCACGATATTCTAGAGGTTACTGCTGGTGAATACACAGAAACCTTCCCTATCACAGTCCCTAAAGGTCTAACCATTTCTGGTGCTGGACAAAGGGCAACCATTGTTAGACCGTCACAGGCAACAGAAACCAATGATGGTTTCCTACTAAACGATAGATCCACTATCCATAACATCACAGTTACTGGATTCTACAAACCACAAGGTTCTATCAACTACGCCTTCAAGTTTAGTGTTGGAGCAGCAATCACCAGTAGAAGTCCTTATGTTGATAAGGTCACGGTCATCAACAAAGGTACTCAGACAAGTGCCAGTGACCCATATGGTTATGGTTCAGCTGACTCCTACCCAACCACAGCACCTGGTGGTGCTGGTGTTTTAGTTGATGGTAGTGTAGTTGCAACCAACTCACTAGAAGCAGCAATTCTCCTCAATGAGGTTACACTATTCACTGCTGGCAACCAAGGTATTAAGATTACCAATGGTGGTAGAGTAGAGTGGTTGAATGGTTTCATCTACTTCGCTTCTGAAGCACTTGTAGGTCTTAGTGATAAGACTACTGGTTTAGCGGGTGCTGGTAAGGCAAGACTAACCCTAGAGAACGCCTCTGGTGGATTGGTTGGTGGTAATACCGTTCAATACTATGATAGTGATGGAACCACAGTTCTTGCTTCTGGTACCATTGATAATGTATCTGGTAGTTATGTAACACTAACCAACGCTGGTGTTGGTACATTCACAACTCCTAGAAATAGAACAGCCAAGAAGGTTGACTTTGTTAATGGAGCACAACTATCCACAGCACAGGCAAGGTTCGGTACATCCTCACTAGATGTAACTGGTGCCGGAACTGATAACATCACAGTTGATTCCACTTCAGACTTTGGGTTTGGAACTGGAGACTTCACCGTTGAATTCTGGATATACAGAACTGGTAATATTAATGGTAAGGTAATCTGTGACTTCAGAGATACCGCCGCTACAGATCAAGCAATTACTATCCAAGGTGATGGTGGTAATGAGACTGATGTTTATATTGGTACTACATCCGTTGTCACTGGTACAGTTCCTACCACACTGAATGCTTGGAACCATATCGCTGTTTGTAGAGTTGGTTCTACCATCACTCAGTATATTGATGGTGCTGTTTCTGGTAGTGGAACTGCTGCTACTGATCTAGGTGTTGCTAGACAACTAACCTTTGGTGATAGGTACGACAATAGTAACAACGGTCCTACAGCATACCTAGATGAACTTCGTGTCACTAAGGGGGCAGCAAAATACACAGGAGCATTCACTTCACCTTCAGTAGCACTCACAGGTGATAAGGATACTTCTATCCTACTACACTTTGATGGTATCAATGGAGCAACCTCCACTACAGATGATATCATTGTCCTCCAGGATATTCGTATCACTGGTGGTAACACAGCAGATAAAGTTACCCTAGCAGACTACAGTCAGTTTGGTGCTGACCTCAGGTCTATCGCTTGTGCCATTGAATATGGTAACCAGGGTATGATTGGTGATGGTGATGGAGTAACTCTCCGTGCTATCTCTATCAACTTCAACCATGTAGGTGCTCTTGGTGATATCACTAACGATCCTAACCTAGCGATTCAATCGAACGAGGTTATCGAACTCAATGGTGGTCAAGTATCCTATGTAAGTATTGACCAGAAGGGTGACTTCAGAGTTGGTGAAGCATTCTATGTGAATCAGGAGACTGGTGAAGTATCCTTTACAGATACTGTAACAGACCTAACTGCTTTATCCTCACTCACTATTACTGATGGTACTAATAGTAGTATCATTACTCCTACTTCTGGTAGGTTTGGTAATGTTCTTATCAGTGGTCAGAGTGTAGAGAGTGTAACCGGAGACCTTAACATTAAGACTGGTGGTTCCGGTGAGATCAATATCTTTGGTAACACCAATGTTATTGGTATTCTAACCGCTCAGATCATTGAGATTAATGCTATTCAGAAGGGCGATACAGCAATCGCTCTAGATGATACTGGAACTGATGGGACTATCCGTTTCATCACAGACGGACAAGAAGCACAACGCATTACAAACCAACAGAGAGTTGGTATTAACACCACCACCCCAGTTACTCAGTTAGAAGTTAAGGGTGGAACACAACTAGAGAACTTAAATGTAACTGGTATTGCCACACTTAATGGTGTTGGTATTGCTACTATCGGTGGTGATCCTGACTTCAGGAACTTAAATATCACTGGACTATCAACGTTCGCTGGTGTTGGTACTTTCCTCAGTGACTTGTATGTTGGTGGTAACCTCAGTGTCCTAGGTGATATCAAGTTTGATGAAGTTGATGCGAGAAACGCCAACATCACTGGTATTGCCACAGTTGGTTTCGCCTCTATCACAGATGCCAGAGTTGGAAGTGCCCTCACTAACTTGGGTCACACTCAACTCAATACTCTGAATGTAAGTGGAGTATCTACACTATCACTACTAGAAGTCAGTGGTAACTCAGTATTTACTGGTATCTCTACCTTCAATAACAATGTAACTATCAATGGTGACCTCACCATTAATGGTTCTCAGAATGTAGATAGTTTTGGAACTGGTGATTTAATAGTTAGTGGTATTGCTAGTATCAACCAGGCGAAGATCGCCACTGGTATTGTTACCACACTAACTGCCACTAGAACAGAGTCAGCAGAACTAAAAGTAACTGGTCTCTCCACCTTTGTTGGTGTTGCTACCTTTGCTAACGATGTATTCGTGGCAGGTAACCTCAATGTTCTAGGAGATATTGCATATGATGAAGTTACTGGTAGAAACCTAAACATCTCCGGTATCGCAACCATCGGGTTCGCCTCTATCACAGACGCCAAGATTGGTGTCGCCACTATTACAAAACTTGATGTCACTGAGATCAATGTAGATGGTGGAACAGGTATTGATGATAACTCAGTAACTACAGAGAACCTAGTTGTTAGTGGTATCGCTACCATCAACTCAGGTATCCTCACAACCCTCCAGGCGGAGGTAGGAAGTATCACAAACCTCACCGCTGGTGTTTCTACCTTTACTGGTATTGTAACCACTACAGAGGATCTATACGTTGGTGGAAACCTCTACGTATTCAATGATATCTTCTATGATGAAATCACTGGTAGGAACCTTTCTATCTCTGGAGTATCTACATTAGGTTTCGCTTCTGTTAGAGATCTAAGAGTATCTGGTGTCGCTACATTCCTTGGTGATGTGGAGATCAGTGGATCACAGATTGTTGACTCACTAATAACTGGTGACTTGGAAGTTACTGGTGTTACTACAACTAAGGAACTAAGATTTACAGACGCTGTTGGTGTAGGACTCACACTCACCAATCTAGTTGTAACTGGTAACGCGGAACTCAATGGTTCTGGTATTGTTACCGCTGGTCAAGACATCAACTTCAGAAACCTAGAAGTTGCTGGTCTATCAACCTTTGTTGGTCTCCAGTCCTTCAGGTCAGCAGTTGGAACGGCACTCACAGTTTATAACCTAAGAGTTCCTGAAAATGGTATTGTTTCACTACCTGGTATTCCTGTTCAGGGTGGGGACGCTGAGTTTAGAAACGTCAATGTAACTGGTGTATCTTCCTTCAGTGGAGTATCAACTTTCGGTAGTGACCTCTATGTGGATGGAAACCTATTTGTTTCTGGTCTAGACTTCAGAGAGACACTTGCTGGTGAAAACCTATTAGTTGCTGGTGTTGGTACTGTTAATAATCTCAATAGTAATATTGGTATTATCACTCATCTACAGGCAGGTATATCAACCTTCACTGGTATCACCACCTTCCAGAGTGATGCCTCCTTCTT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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
b124326f058d70b8cb7634b0700fcafd945fa1471499602cefaf9abfc0cd27ac
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6127
Evidence 0,6127
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank