Protein

Genbank accession
AGN33584.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDTDGNFSAGTITATLIGNASTAARLASTRQIQLSQDITASGVFDGSANLNLNAELTLVSTLPHYDGTGTPTATYTSVTVDAKGRIINASNPSTLADYNLNGTVEGQSAQPYDLDLVAISGLTTTGIISRTSGGSMATRTITGTATRIAINDGAGLSGNPTIDLIVTAVTPGDYNTESLTSVSGVGGNSEPFGTETVNATKFTVDAYGRLTSATNVPIATATEGSKYPNYDAGTAYSRYAIIQNASKVYQAIADISAGAGAPTHSSGDSGSWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAAGVDNTQLQNNRIIFTDGNTVDEFELDNELTTSTAHTGFDYLNYIKINDTSGNLLFGANNTGDSGAGEIDVNVRSYFSDPDITLDGAVAQTLDKTGDGNLTFQLTQNSASARNLSILSTNAGSGTSTVTITAEDVVDIDASDANGKVHVENARFQANYIATTDATMNLDPGDDRAVTGLVRVWGDLQVDGVTTTVNSTTMTVDDVVLTLGGDTAPASDDNLDRGVEFRYYDTQARLGFYGWDTNYTDLGGHEGGYRFLHAATNTSETFAGTDSGIIAGNVKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGAGIGQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDTMVLRGASKSLQFQNGAGTVKSEIHTTSGNAEFGGIVTVTGATDLNSTLNVASTVNFEDTDEPTVLLSGSTGLYEIQSSDYGSFKFDGGGYVEGDTVFNSDIYLNGQFNQKEDATANYGLRNYLAVRYKMRTGTTAAYTPSYSNHDTSNLRVFGGAGINTTLHVGGTGSGEGLFVGKENSGDTVKFSVLGASGNTDIEGTLNVEGQVTIQDSVIINAANEEFAIQNGSAVDKFTVDTDNGNTLIEGTLNVNGVTDIDADFAVRNGTTDKFTVASATGNTVIEGTLNGKGAADFDSTLNVDGNTTLGGTLTVTGASEFNNTVDVDNNFAVRTSGGVDKFTVASASGNTVTQGTLTVEGETNINETLNVSANGEFFRVRNGNNALQFTVDTDNGNTNVYGTLTVSDATQINDTLGVTGVTSITNSTGQTLTGSYGADGAVRITGGVGVGENLAVGGNMRVYGDFEITGSTTQSGNTGFSGRVSITNTQDVTSFGDNNVSLTTDGGLRVSKNAYVGGDFVVYDDANSRNAFIVDVSTGDATLHNTLTVGGNLVVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGYDRSSDQYTFLVDATNTAEVHSGTDAAVRAGSLRLTSAGTALDVDNNANIDGTLTVDGQIISNVATGSAPFTVASTTKVLNLNADLLDGMTTASAATGSTVVNRDSSGDFAANVITMATSTITGAATVGTTLGVTGAATLSSTLGVTGATTLSSTLGVTGVTTLTGLLNANGGIAVDTNNFTVDGTTGAVVTASTLSVGSTSSFTGAITATGGVVGNVTGNLVAAISTGKTFNPETDSTYNLGASTLRWATAYLDSLNAGTSITTAGTLSVTGTSTFTGEISANGGIALQDTDKATFGDDDDMEIYWSGTQNRIDTEGPFQIRNSNTSSGISFYDGDNTNFMFKALPLGAIELYHSGVKTFETTATGATLTGVLVATSLTGNVTGNVTGTVSSIANHDTDALSEGSSNLYYTDERVDDRVNALIVAGTGITKAYNDVAGTYTLTVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIEHDGSGTLSVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIELSGAGELSVTQADINTDNITEGGTNIFFTNARADARFDTKIAAADTDDLSEGSTNLYFTEARADARVDAGFTAKSTSDLSEGTNQYYTEARVQTKLDNAFAQLQAMLNNLATTTTLTLNLSGDPTPGAVVAVGVSDGGGGGFTAGTAVATSGGTGSSLTVDTTVVGGVITAASVNAGGSDYLISDTVTVTNPNAGKVLSLNLASLAGGSNYVTGTALATTGGSGSASLTVDITAVAGAITNVTINDGGTGYVAGETITIVQPTGADGSNPATGGTVDIATVATNATLTLTDITTMEVGATVTGATSGTTGVITALGTNQITVDTVSGFFKVGEVVSANDVTTLTISSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:2177 AA
molecular weight: 222608,48090 Da
isoelectric point:4,14029
aromaticity:0,06431
hydropathy:-0,13018

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
4–242
SSF69349
IPR041352
5–43
IPR041352
AGN33584.1
1 2177
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-IOM18
[NCBI] 		754039 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGN33584.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ317383 [NCBI]
CDS location
range 75174 -> 81707
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGAAGAGGTGGCGCTCAGGAATGGGCAAACGCTAACCCAACCTTGGCACAAGGTGAACTCGGAATCGAACTTGATACTGGTCGTTTCAAAATCGGTGACGGTGTTTCTGCTTGGAACACGCTGAGATATGAACGCCCTGTTGAGTCTACCTCTAATACGGCAAATACTCTTGTACAGAGAGATACTGATGGCAACTTTTCTGCAGGTACTATTACTGCAACTCTGATTGGTAATGCTTCTACCGCTGCACGTCTGGCATCTACCAGACAAATTCAGTTATCTCAAGACATCACTGCTTCTGGTGTTTTCGATGGTTCTGCAAACCTGAACCTCAATGCTGAACTCACCCTGGTTTCAACTCTTCCCCATTACGATGGTACAGGAACACCTACAGCAACATACACCTCTGTTACTGTAGATGCAAAAGGTAGAATTATCAATGCTTCAAATCCATCTACCCTTGCAGATTATAATCTTAATGGAACTGTAGAAGGTCAATCTGCACAACCATATGACCTTGATCTGGTTGCTATTTCTGGTCTGACAACTACTGGTATTATCTCCAGAACTTCTGGTGGTAGTATGGCAACCAGAACTATCACTGGTACTGCCACAAGAATTGCAATTAATGATGGTGCAGGTCTTTCTGGTAATCCAACAATCGATCTTATTGTTACTGCTGTAACTCCTGGTGATTATAATACAGAATCTCTGACATCTGTAAGTGGTGTTGGTGGTAACAGCGAACCATTTGGCACAGAAACTGTAAACGCTACGAAATTTACAGTTGATGCCTATGGTCGTTTAACAAGTGCAACAAATGTGCCCATTGCTACTGCCACTGAGGGTAGTAAGTATCCTAACTATGATGCAGGGACTGCTTATTCTAGATATGCAATCATTCAGAATGCATCCAAGGTTTACCAAGCGATTGCGGACATTAGTGCTGGTGCTGGTGCTCCTACTCATTCCAGTGGTGATTCTGGATCATGGCGTTACCTCGCGGCTGAAGCAACGGAACAGAAGGGACTGGCTAGTTTTGCACAGGAAGATTTTGACGTTGACGCAAACGGGCACGTTACCATCGCCGCCGCAGGCGTAGATAATACACAACTTCAAAATAATAGAATTATTTTCACCGATGGCAATACCGTCGATGAGTTTGAATTAGATAATGAACTTACAACATCTACAGCGCACACTGGTTTTGATTATCTCAACTATATCAAAATCAATGATACAAGTGGCAATCTTCTGTTTGGCGCTAATAATACAGGGGACAGTGGCGCTGGTGAGATTGATGTTAACGTCCGTTCCTATTTTTCTGATCCTGATATTACTCTTGATGGAGCAGTTGCTCAGACATTGGATAAAACTGGGGATGGCAACCTTACCTTCCAGTTAACACAAAACTCTGCATCTGCTAGAAACCTTAGCATCCTCTCTACAAATGCTGGGTCTGGTACAAGCACAGTTACAATCACTGCAGAAGATGTTGTTGACATTGATGCATCTGATGCAAATGGTAAAGTTCATGTAGAAAACGCAAGATTCCAAGCAAACTACATCGCCACAACCGATGCGACGATGAATCTTGACCCTGGCGATGACCGTGCTGTAACTGGTCTGGTTCGTGTTTGGGGTGACCTCCAAGTTGATGGTGTGACAACAACTGTCAACTCTACAACCATGACAGTTGATGATGTTGTACTCACTCTGGGTGGTGATACTGCTCCTGCTTCTGACGATAACCTCGATCGCGGTGTTGAGTTCCGTTATTATGATACTCAAGCACGTCTTGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTATACTGATTTGGGTGGTCATGAAGGCGGTTATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTTCCGAAACTTTTGCTGGTACTGATTCTGGTATTATTGCTGGTAATGTAAAACTCACCACTAATACTAACTCTACTTCCAACACAACTGGTGACCTTGTAGTTGCTGGTGGTGCTGGTATCGGTCAAGATGTAAACATCGGTGGTCTGCTGGATGTTGATGGCACCTTCCGTGCTAACAGCACCTCCCGCTTTGATGACACCATGGTTCTTCGCGGTGCATCTAAGTCACTTCAGTTCCAGAATGGTGCTGGCACTGTTAAGTCTGAAATTCATACAACTTCTGGTAATGCTGAGTTTGGTGGTATCGTTACTGTAACTGGTGCTACCGATCTTAATAGCACCCTTAATGTTGCATCTACAGTTAACTTTGAAGATACTGATGAACCCACTGTTTTACTCAGTGGCAGTACTGGTCTTTATGAAATTCAGTCGAGTGATTATGGTTCGTTTAAATTTGATGGTGGTGGATATGTTGAAGGAGATACAGTCTTTAATAGTGATATCTACCTTAATGGTCAATTTAACCAGAAAGAAGACGCAACAGCGAACTATGGTTTAAGAAACTACCTGGCAGTTCGTTATAAAATGAGGACAGGTACTACTGCTGCCTATACTCCCTCATATTCTAATCACGACACCTCTAACCTAAGAGTCTTTGGTGGTGCTGGTATTAACACAACTCTGCACGTTGGTGGTACAGGTTCTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAAGAGAATAGTGGTGATACCGTTAAGTTCTCCGTTCTTGGTGCATCTGGTAACACTGATATTGAAGGCACACTGAACGTTGAAGGTCAAGTAACTATTCAAGATAGTGTAATCATCAACGCTGCGAATGAAGAGTTTGCAATTCAAAACGGTTCTGCAGTAGATAAGTTTACTGTCGATACTGACAACGGTAACACTTTAATTGAGGGCACACTGAATGTTAACGGCGTAACTGATATTGACGCCGACTTTGCTGTTAGAAATGGCACAACTGATAAGTTTACAGTTGCATCTGCCACAGGTAACACTGTAATTGAAGGCACTCTGAATGGTAAGGGTGCAGCAGACTTTGATAGCACTCTGAATGTTGATGGCAATACTACTCTGGGTGGAACTTTAACAGTTACTGGTGCTTCTGAGTTCAACAACACTGTTGATGTTGATAATAACTTTGCAGTTAGAACTTCTGGTGGTGTAGATAAGTTTACTGTTGCTTCTGCTTCAGGTAACACCGTTACTCAGGGTACACTCACGGTTGAAGGCGAAACTAATATCAACGAAACTCTGAATGTTTCTGCAAATGGTGAGTTCTTCAGAGTTAGAAACGGCAATAATGCTCTGCAGTTTACTGTCGATACTGACAATGGTAATACCAATGTATACGGTACATTAACGGTTAGTGATGCGACTCAAATCAATGACACTTTGGGTGTTACTGGTGTTACTTCTATTACTAATTCCACTGGTCAGACTTTAACTGGAAGTTATGGTGCTGACGGCGCAGTTCGCATTACTGGTGGTGTCGGAGTTGGAGAGAATCTCGCTGTTGGTGGCAACATGCGTGTCTACGGTGACTTTGAAATCACTGGTAGCACAACTCAGTCTGGTAACACTGGATTCAGCGGTCGTGTTTCGATCACCAATACACAAGACGTTACATCTTTTGGTGATAACAATGTTTCTCTCACAACCGATGGCGGTCTTAGAGTAAGTAAGAATGCATATGTTGGCGGTGATTTCGTTGTATATGATGATGCAAACTCCAGAAATGCATTTATTGTTGATGTAAGCACTGGTGATGCAACTCTACACAATACACTGACAGTTGGAGGAAACTTAGTTGTAAATGGAACGACCACTACTGTTAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTTTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTATGACGGCTCTGCGAAAGTGGGCTTCTTCGGATATGACAGATCCTCCGACCAATACACATTCTTAGTTGATGCAACTAACACTGCCGAAGTTCATTCTGGTACAGACGCTGCAGTTCGTGCTGGTTCTCTGAGGCTCACTAGTGCTGGCACTGCACTTGACGTTGATAACAATGCTAACATCGATGGTACTTTGACTGTTGATGGTCAAATCATTTCTAATGTTGCTACGGGAAGTGCTCCTTTTACAGTTGCTTCTACAACTAAAGTTCTTAATCTGAATGCTGACCTTTTGGATGGCATGACCACAGCATCTGCAGCAACAGGATCTACAGTTGTTAATCGTGATTCTTCTGGTGATTTTGCTGCTAACGTCATCACGATGGCAACAAGCACAATCACTGGTGCAGCGACGGTTGGTACAACTCTCGGCGTCACTGGTGCAGCAACATTAAGTTCCACACTTGGTGTTACAGGTGCAACGACACTTAGCAGTACCTTAGGAGTTACTGGTGTTACCACACTTACTGGTCTTCTTAATGCCAATGGTGGCATTGCAGTTGATACAAATAACTTTACTGTCGATGGAACAACAGGTGCAGTTGTAACAGCAAGTACATTGAGTGTTGGTAGCACGTCTTCCTTTACAGGTGCTATTACAGCAACTGGTGGAGTTGTTGGTAATGTTACTGGTAATTTGGTTGCTGCCATTTCTACTGGTAAGACTTTTAACCCAGAAACTGATAGTACATATAACTTGGGTGCTAGCACACTGAGATGGGCAACTGCATATCTTGATTCTCTTAACGCTGGTACATCCATTACAACTGCTGGCACTCTGTCTGTAACAGGTACTTCTACCTTTACTGGTGAGATTAGTGCCAATGGTGGCATCGCTCTCCAAGATACCGATAAAGCGACATTCGGTGATGACGATGATATGGAGATTTACTGGAGTGGCACTCAGAATAGAATTGATACTGAAGGTCCTTTCCAGATTAGAAATAGCAATACCTCATCTGGTATCTCCTTCTATGATGGCGACAATACTAACTTTATGTTCAAAGCGTTACCTCTGGGTGCGATTGAACTCTATCATAGTGGTGTAAAAACCTTTGAAAC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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
f073f330af08b8dc951a220f4a08bca6bbfe8d87bbee3f334001b6c5fb6526ee
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4903
Evidence 0,4903
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Synechococcus phage S-IOM18 Henn,M.R., Clokie,M., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Fitzgerald,M.F., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Neiman,D., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank