Protein

Genbank accession
XWX30161.1 [GenBank]
Protein name
glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,74
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,89
Protein sequence
MTKYLRLYNKAGTLLKSSGNIEGSTGTIKIENLFPETIYHSGDFLVSWVINGEELNRIPVPEFKTLSGNVDKTIIVYFSDINDENLVSLKGDSAYKIAIDNGFNGSQKEWLESLKGEPGEPGRQGDPGRDGVDITEGGSAYEIALAEGFQGTREEWLGSLKGEPGRQGEKGDPGEDGFGVDGASAYEIALENGFVGNIQDFLDSLVGEPGKDGQDGNDGLSAYQIALENGYTGTESEWLESLNIDVEVAKDYTDSKLISIDDKIAYARTRSFRDIKIHADLPAVFEGYQALLEGTSSNHIYPQGLAVDSDYLYVLYSYDDKSPGKEKILIVYARKDGYRQHSMYTLSNVASESIEIEYTYYGRYLYAKSGTDQLGKYDLSDLTGIPNTPTRLEPMQTYDIPVLYQFARFKNGWIFELANNSKGYYNQRDTFGLYNKNLSEKTSYFTTHASIGNLWSNSLTTKSSKRQGLTVFNNNILQAVGGNYNVGDDVGTYHLQGIQELSPSGEIINDYTYDPNELADFLGSQGKDVNRIEHEGLYTDKEYDKNNVYSIIIYNTTISREDSNENGLLFVEYRPYEPDHTFKQLGKPFLTSNSLYNPYKKVVSNKLVNDYTGKSIDSLKELALYMIDSYQDKVVFYSSWVDILDLSNVKIENGIKVTLENLDNKVFYLSYEDNFGVVKKKLTVNKSQETITIIDTRKEKSITGTDLLTLDYNTSFYSIGSVNSPSGVHVNGFVKCYVSDNNRILTYEPFNSNDTFKNIYNSGSWKGWKNSNVNIDTIVAQKHVITQDNGDRLRVSDVDPITLNTGYYQIWKMKNSPVGFDSNAQYWNVDIITAQDNVKQIKATLSATGQEYTRTIHKGNDLGWKFINNEKYGRNDFKLYTIPLMAPFNTANLSVMENNHIVTVRLQGKANSNTNNISDLDVVIGKLPAHIEYPKDFVRCTISSMTKGETEQFIGNLVIDTKGIITVKFNRSGTSNSYFGGSLSFPKGDNKNVAFNSTNTKVYDYPDPNVVSVQGSDYYDGYIFGAITRTKGNVTEIQVIDTNNTSSSFICTNQQENFSTLVGHGNSLKVVDKLNDEYLMYITMTDDPKIVPVFVNTTTKIARVGEGIKTMQDSGGSEKRIISIDRVDKVGSTYELYCLWYGIEFKYTISNINTVESLKGEQVFKLPLERVIEDKKMLLNDDSNSIKVYQDNLLDGDTFYITQYGENSSAILEYRVENAMAKSTGKYWYNYRTDAERYEIESIFKINGELYASISQKLFNKSTYDTYVIKVTLNT
Physico‐chemical
properties
protein length:1275 AA
molecular weight: 143413,80560 Da
isoelectric point:4,94325
aromaticity:0,11451
hydropathy:-0,50902

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage PG-2021_14
[NCBI] 		2815613 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XWX30161.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ417317 [NCBI]
CDS location
range 106052 -> 109879
strand +
CDS
ATGACAAAGTATTTAAGGCTATATAATAAAGCAGGTACATTACTTAAATCAAGTGGTAACATTGAGGGTAGTACAGGAACAATTAAGATAGAGAATTTATTTCCGGAAACTATCTACCACAGTGGTGATTTTCTTGTTAGTTGGGTAATTAATGGTGAAGAACTTAATAGAATACCAGTACCGGAATTTAAAACATTAAGTGGTAATGTAGATAAGACTATCATTGTTTACTTTAGTGATATTAATGATGAGAACCTTGTATCATTAAAAGGTGATAGTGCATACAAAATAGCAATAGACAATGGGTTTAATGGCAGTCAAAAAGAATGGCTAGAAAGTCTTAAAGGGGAACCCGGTGAACCGGGTAGGCAAGGTGACCCCGGTAGAGATGGTGTAGATATTACCGAAGGTGGTTCTGCTTATGAAATAGCTTTAGCAGAAGGTTTTCAAGGAACTAGAGAAGAATGGCTAGGGTCACTTAAAGGTGAACCCGGTAGGCAAGGTGAAAAAGGAGACCCGGGTGAAGATGGCTTTGGTGTAGATGGTGCTAGTGCATACGAGATAGCATTAGAGAATGGTTTTGTAGGTAATATACAAGATTTCCTAGATAGCTTAGTAGGGGAACCGGGTAAAGATGGTCAAGATGGAAATGATGGACTATCTGCATATCAAATAGCATTAGAAAATGGATATACTGGAACAGAGAGTGAGTGGCTAGAAAGTCTTAACATTGATGTTGAAGTTGCTAAGGACTACACTGACTCAAAGCTAATTAGCATAGATGATAAAATAGCTTATGCTAGGACACGTTCTTTCAGAGATATTAAGATACACGCAGATTTACCGGCAGTATTTGAAGGATATCAAGCGTTATTAGAGGGGACTAGTTCAAACCATATTTATCCCCAGGGATTAGCAGTGGATAGTGATTATCTATACGTTTTATATTCCTATGATGATAAATCACCGGGCAAAGAAAAAATACTTATAGTGTATGCTAGAAAAGATGGATATAGACAACATTCTATGTATACTTTATCTAACGTAGCATCAGAGAGTATAGAAATTGAGTACACTTATTATGGTAGGTATTTGTATGCTAAAAGTGGTACAGACCAATTAGGTAAATACGATTTATCAGACTTGACGGGAATACCTAATACACCTACAAGATTAGAGCCAATGCAAACATATGACATACCGGTATTATATCAGTTTGCTAGATTTAAAAATGGTTGGATTTTTGAATTAGCTAATAACTCAAAAGGTTATTATAATCAAAGAGATACATTTGGACTTTATAATAAAAACCTTTCTGAAAAAACAAGTTACTTTACAACTCACGCATCTATAGGTAACCTATGGTCTAATTCACTAACTACTAAATCATCTAAAAGACAAGGATTAACAGTATTCAATAATAATATTCTACAGGCAGTAGGGGGTAATTATAACGTAGGAGATGATGTAGGTACCTATCACTTACAAGGAATACAAGAACTAAGTCCTAGTGGTGAAATAATAAATGATTATACTTATGACCCTAATGAGTTAGCCGATTTCCTTGGGTCACAAGGAAAAGATGTAAATAGAATTGAGCACGAGGGATTATATACAGATAAAGAGTATGATAAAAATAACGTATACTCAATTATAATATATAATACTACCATATCAAGAGAGGATTCAAATGAAAATGGTTTGTTATTTGTAGAATATAGACCTTATGAGCCAGACCATACATTTAAGCAACTAGGTAAGCCTTTCTTAACAAGTAATAGTTTATATAACCCTTACAAAAAGGTTGTAAGCAATAAATTAGTAAATGATTATACAGGTAAATCTATTGATAGTCTAAAAGAGTTAGCATTGTATATGATTGACTCATATCAAGATAAAGTGGTATTTTACTCTAGTTGGGTAGACATATTAGATTTAAGTAATGTTAAGATTGAAAATGGTATAAAAGTTACTTTGGAGAATTTAGATAATAAAGTTTTCTACTTATCATATGAAGATAACTTTGGTGTTGTTAAGAAAAAATTAACGGTTAATAAATCACAAGAAACAATAACAATAATAGATACTAGAAAAGAAAAATCTATAACTGGTACTGATTTACTAACATTAGATTATAATACATCATTCTATAGTATAGGTAGTGTTAACTCACCTAGTGGTGTACACGTAAATGGATTTGTCAAGTGTTATGTAAGTGACAATAATAGAATTTTAACTTATGAACCTTTTAATAGTAACGATACTTTTAAGAACATTTATAATTCCGGTTCTTGGAAAGGTTGGAAAAATTCAAATGTTAATATAGATACGATAGTAGCTCAAAAGCACGTCATTACTCAAGATAATGGAGATAGATTAAGAGTATCAGATGTAGACCCTATAACATTGAATACAGGATATTATCAAATATGGAAAATGAAAAACTCACCTGTTGGTTTTGATAGTAATGCTCAATATTGGAACGTAGATATCATAACAGCACAAGATAATGTAAAACAAATAAAAGCTACATTAAGTGCAACCGGTCAAGAGTATACAAGAACCATTCATAAGGGTAATGACTTAGGTTGGAAGTTTATAAACAATGAAAAGTATGGTAGAAATGATTTTAAACTGTACACAATTCCCCTTATGGCACCTTTTAACACTGCTAACTTATCAGTAATGGAAAATAATCATATAGTAACCGTTAGACTACAAGGTAAAGCTAATTCAAATACTAATAATATTTCAGATTTAGATGTTGTAATAGGTAAATTACCCGCACATATAGAGTACCCTAAAGATTTTGTTAGGTGTACAATATCTAGTATGACAAAAGGTGAAACAGAGCAATTCATAGGCAACCTAGTGATAGACACTAAAGGTATTATAACTGTTAAATTTAATAGGTCAGGTACTTCTAACTCTTACTTTGGTGGTTCATTATCATTCCCTAAAGGAGATAATAAAAACGTAGCGTTTAACTCAACAAATACTAAAGTGTATGACTATCCAGACCCTAATGTAGTATCTGTACAAGGTTCGGATTATTATGATGGGTATATATTTGGTGCTATAACTAGAACAAAAGGAAATGTAACCGAGATACAAGTTATAGATACTAATAATACAAGTAGTAGTTTCATATGTACCAATCAACAAGAGAATTTTAGTACTTTAGTAGGGCACGGTAATAGTTTAAAAGTAGTAGATAAGTTAAATGATGAGTACCTTATGTACATTACAATGACTGATGACCCTAAAATAGTACCTGTTTTTGTAAATACAACGACTAAGATTGCTAGGGTAGGAGAAGGAATAAAAACTATGCAAGATAGTGGAGGCTCTGAAAAGAGAATAATATCCATAGATAGAGTAGATAAGGTAGGAAGTACTTATGAATTATATTGTTTATGGTATGGTATAGAATTTAAATATACAATAAGTAACATAAATACAGTAGAGAGCTTAAAAGGAGAACAGGTATTTAAGTTACCATTAGAAAGAGTAATAGAAGATAAAAAAATGTTATTAAATGATGATAGTAATAGTATTAAGGTATATCAAGATAACCTCTTAGATGGAGATACATTCTATATAACACAATATGGTGAAAACAGTTCTGCAATACTAGAGTATAGAGTTGAAAATGCTATGGCAAAATCTACAGGTAAATACTGGTATAATTATAGGACTGATGCAGAAAGATATGAAATAGAAAGTATATTCAAAATAAATGGTGAATTATACGCATCTATTTCTCAAAAACTATTTAATAAAAGTACGTATGACACTTACGTCATAAAAGTAACATTGAACACCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

Title Authors Date PMID Source
Natural phage communities crosslink different species within the genus Staphylococcus Goller,P.C., Elsener,T., Lorge,D., Radulovic,N., Bernardi,V., Naumann,A., Amri,N., Khatchatourova,E., Hernandes Coutinho,F., Loessner,M.J. and Gomez-Sanz,E. 2024 — GenBank