Protein

Genbank accession
ADO98169.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,73
Protein sequence
MSTRVTPGSGALLRPSFNSVYGVVNVEVLDGGSGYAKTDPPKIIIEGTTTPLTEGVFFPVISGLGTISEVIIFKTGAGYYPVFSTSTQSQVVVERGAFGTISTSHSVGTAYSVYTGDYNIIDDNIFFTDAPYGQAGPIGLQTSSSFAGRLFSRKLDPFDPKDKNVILDDIALEFTGVAGTQFDLSENLGVVTALYNSVNTGVDINNNPFILINNVVQTPGLDFEIVDNADNKINFLSGVPRAGRINKVGLQTGAGYYLPLKAAARVGVGSTGSLQFIQLEGKGQGYRNPPEVTVRSSQGYGASISAQMGTSAGSAVAISTADYNHITGVCTFVTGGTSHGFVENDLVRITGAGFTFTPVSANRNINTFGYDYITGIATIGVSGGHYIGTATNRSRSLVVKQVQVTNGITTYLFREDAYPIVEVIDSLNVLVDCGVSTQPLTYVSGGLVQAGVDTAIMEGRNVIGFDVLSGHTTNTFRAFVGVSTFEHNYVGGGVVNRAEAGIVTNFTIVEGGTGFFAPKTVGFLDGTPVNGITTVTAYGNKSGDEKNINALEYDAVSGIATITSSSAHGLTTSNVVKLSGIAFSTGIGDIIFPSNANRYFGVVGVASDLNFTVNIGAAMTTTGIHTANVGAGIGSFIPYEGHGLETDDFVNVTGIAVTFTSAPSVRVGGVEYDETSGIATIFTRDRHNLTEDDCVILSGIGFTCDYDPSIGIGTAQYNNVTGIMTVTTIASHGYKVGKDVILSGLAFTCSIDNGARFHYYPRSRSTAYDTSLPITGYAGTALSIDVGAAPPKDQYTHQFSEAINGALVYGGDYDHTFIRAVDGALLTGGPFAHSFIGATATSTFAGGDYAHTYVSSDDKTIKTGGDYAHTFDSAITNAITVPGIGGLFTPTNADYTPSTGSLIITVPGHGLSGPSQHSITTANYNPLVGILTITVPNHGFSNGDQVLIADNSIGWKCSLDGFTTTKYYPRNTDTLSNTWVPISNVSTNTFEVFAGITTRVDYTVSAADYTPTTGIMTMSIGTHDLRAGQSFKFKPESLGFTCRADNYTRIKYYPRSKDPVYETAVPIVSVAGTTITTQVGITTEVKYNIRFAAYTPQTGIMTVSLDRLHNFQVGEAIKFKPGSIVFKCEQDAFQTNHFYPRPTDPYYEKTVDIVGAAGTLFTVNVGPTTSSQIYSFVPNQGVAVEAVIAGGDYPYQLNGIGTDAVITGGGDYTPYWYQNSTTGAVQRPTQKVGVVTGGLSFKCAKDNYATVHAYPRPTDPIHNLDVGIVSATSNTFEIRVGVSTIRERGISTSVYNPATGELTMTVGAGHSYINESSHTISTATYNTSTGVLEPTIANHGFVAGEYVKFDLGSISFTCDLDGNVASKAYPRYSDPYLNKWLPIYNVGVNTFSVYVGIATLGGNHTFVSATSGGLKKARDTVGINTGSIVFTCARDDHATEHAYPRSYDPIGSNVSVGIGSTSATTLTINVGVSTIVNYGIATAAYTPTTGIMTVFSNIHGLNGAYDDKTIQFATYDAISGIMTVTTNQPHGMITGNRVNFKRDSIRFRCMMDQRKSIKSYPRAKDPSDQQWLSVTGISTNQFSVDVGTSPLVYHSPTSGSYDPFTGLMTVDIGSHTLRKGTGVKLKTRGFKFTCALDNHATNHFYPRASGISGPDPAYNTSVKITSTTDTTITLDVGKSSNQSEHIFVSAASSSVISGGNYIHTFENADLDSMLIARDTVGLATNSYTWRCAQDNYATDHTYPRTTDPIHDVEVGIVSTTLDTFTMNVGITSRVKFNVTNATYDPNSGLVTMTTDSSHGLSTTTAVGLVTNGFVYTCTMDQNSTEHAYPRTTDPAHDTSLYPTAVTSNNVTVNVGVSTRVEYNINHADYNDVVGIMTMFLPTAHGITTAAGVPRNVKLKNESIYFTCSKDNYATAHVYPKGGDPYYNGSIVNRVIDNNNIEIQVGPSTTPSFYNGGGIIQGAILAPRLRNNSPSGEDFASGGTFVDKVIDDHTYVVNVGISTVDHIYARGGISQQGKRIAASDEIGFSGFDVIEKIDAGKFRVNAGLTTEIALFKRGGRIDKPVFLDITEPDGYFNRDLEYISGSTGIGTNAVVNFRVNVDGNIGEFDLIEEGTAYKVDEVLTVSGIMTNPRVGVLTEFQLTVQELENDTFSGFYPGQFILFDDISEFFNGNRKKFTLSVTTSGVTEILSLKTLPGSDMDITNNIFIYINDILQTPQSSYTFKGSRVIFTEAPKQDSKCSVFYFRGSKRDVETVEPVASVKAGDIVQIKENRINPADIDQFERTGKRIVASDVLETFSYNSIGIDTNTAAERPLSWEKQRQDQILSGVLISKARPGLKSKVLPTTRIIRNVGELDDSIYVNNAFPVFNAIDLLVQSERNVQIFEDNEIAPGVVTSVVSTSSSISALTIGYGGTGYTISNPTVAISSALIERKDPISAWEFDAISGITSAIEFRAITKEDPYVAVGSSSFYINTKSGTFWERGRIGFGGTITFNGVGVGNSGTADVHVMAVGEFASMARAVAIGNSISTWTPIDLKEQRQIPAINQVSTFDSTYTGHFNDVIWEGTRNTWVAVGAAGTIFSAVGLTTGEAFSQFSGTLQNLNAVCYGQSEYIAVGNGGVILASNDGTGWADKTSNTVFDLNDIIYDGNRFIVVGDSGTIGISTDKNFWQPWSQQLPAGTVSPATFDFAKIKFVDNFYVGISTVGDLYYSFDLANWNERPVAHSNEIRDLVQTPYGDFASTRVIAVGSGTTNFYADPVINRATATASVTSGVITSINITDGGFGYRVGSSPPVIVESDATKREDLFSVDAEGDFGDIVGINTWLPGSANVLPRLAFTLKSQFNDNTNLGYGYSSLNSLGVEYSGLQKGDFFTIYDSSLVVGHALTGITTSSGANEVVGMVTAGDYLGGVFRVEQITTGDAISGLVTVTCAFQPGPTPYGNNTIQVGVGTTATTDTFWGKYSWGKLLGYQNRGAGNPTSFLVNTMNGNVGLSTAAVVSRKKPLT
Physico‐chemical
properties
protein length:3001 AA
molecular weight: 319752,17830 Da
isoelectric point:5,14196
aromaticity:0,09997
hydropathy:-0,06008

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-SSM7
[NCBI] 		445686 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 8109
[NCBI] 		166314 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO98169.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071098 [NCBI]
CDS location
range 67650 -> 76655
strand +
CDS
ATGTCAACAAGAGTTACGCCAGGATCAGGAGCTCTACTAAGACCGTCTTTTAACTCAGTATATGGAGTAGTTAATGTCGAGGTTTTAGATGGTGGCTCGGGGTATGCCAAAACCGATCCTCCAAAGATCATAATTGAAGGAACAACTACACCTTTAACTGAGGGTGTTTTCTTTCCTGTAATTAGTGGTCTAGGAACAATATCGGAAGTTATTATCTTCAAAACTGGAGCAGGGTATTATCCTGTATTCAGTACATCTACACAATCTCAAGTTGTTGTAGAAAGAGGTGCTTTTGGTACTATTTCTACAAGTCATAGTGTAGGAACTGCGTACTCAGTATATACTGGTGATTATAATATTATTGATGACAATATCTTCTTTACTGATGCACCGTATGGTCAAGCAGGACCTATTGGATTACAAACAAGTTCTTCTTTTGCTGGTAGATTATTCTCTAGAAAATTAGACCCATTTGATCCTAAAGATAAGAACGTAATTCTTGATGATATTGCACTAGAATTTACAGGTGTTGCAGGCACACAGTTTGACTTATCAGAAAACCTTGGTGTAGTTACTGCTCTTTATAACAGTGTCAACACAGGTGTAGACATTAACAACAATCCGTTTATTTTGATAAACAATGTTGTTCAAACGCCTGGTCTTGACTTTGAGATTGTTGATAATGCAGATAATAAGATTAACTTCCTGAGTGGAGTTCCTAGAGCTGGAAGAATTAATAAAGTTGGATTGCAGACTGGTGCTGGATATTACTTACCTCTCAAAGCTGCAGCAAGAGTTGGTGTTGGATCAACAGGTAGTCTTCAGTTTATTCAACTAGAAGGAAAGGGACAAGGATATAGAAACCCACCAGAGGTCACTGTAAGGTCTTCACAGGGTTATGGTGCGAGTATTTCTGCACAGATGGGTACATCTGCTGGTTCAGCAGTTGCCATCTCCACAGCGGATTATAACCACATTACAGGTGTCTGTACATTTGTTACTGGTGGTACATCTCATGGATTTGTTGAAAACGATTTAGTCAGAATTACAGGCGCTGGATTTACATTCACTCCTGTTTCTGCAAACAGAAATATCAATACATTTGGGTATGATTACATTACTGGTATTGCAACTATTGGTGTATCAGGTGGTCACTACATTGGAACTGCAACTAACAGAAGTAGAAGTTTAGTTGTAAAACAAGTTCAAGTTACAAACGGCATAACCACATATCTATTCAGAGAAGACGCATATCCTATTGTAGAAGTAATTGACAGTCTCAATGTATTAGTAGATTGCGGTGTTAGTACGCAACCATTAACCTATGTTAGCGGGGGACTGGTGCAAGCAGGCGTTGATACCGCAATCATGGAAGGTAGAAACGTCATTGGTTTTGATGTTCTTAGTGGTCACACTACAAACACATTCAGAGCATTTGTTGGTGTCTCCACATTTGAACATAATTATGTGGGTGGTGGTGTTGTAAACAGAGCCGAAGCTGGTATCGTTACAAACTTTACTATTGTTGAAGGTGGAACAGGATTCTTTGCTCCTAAGACTGTTGGATTCCTTGATGGTACACCTGTAAATGGAATTACAACTGTTACTGCGTATGGTAATAAGAGTGGTGATGAAAAAAATATAAATGCGTTGGAATATGATGCAGTTTCTGGTATTGCAACAATTACTTCATCGTCTGCTCATGGATTGACAACTTCAAACGTTGTTAAGTTATCTGGTATTGCATTTAGTACAGGTATTGGTGATATTATATTCCCATCAAATGCAAACAGATACTTTGGTGTTGTTGGTGTTGCAAGTGACTTAAACTTCACCGTTAATATCGGTGCTGCAATGACAACCACTGGTATTCATACTGCAAATGTTGGTGCTGGTATTGGTTCATTCATACCTTACGAAGGTCATGGATTGGAGACTGATGATTTTGTCAACGTAACTGGTATTGCAGTCACATTTACAAGTGCTCCATCTGTTCGTGTTGGTGGCGTTGAGTATGATGAAACATCTGGTATTGCAACTATCTTTACTAGAGATAGACACAACCTTACAGAAGATGATTGTGTAATACTTTCTGGTATTGGATTTACTTGTGATTATGACCCTTCAATAGGTATTGGAACTGCTCAGTATAACAACGTAACAGGAATTATGACTGTTACAACTATTGCTTCTCATGGATATAAGGTAGGTAAGGATGTTATATTGTCTGGTCTTGCATTTACATGTTCAATAGACAATGGTGCTAGATTCCATTATTACCCAAGAAGCAGATCTACTGCATACGATACATCTCTACCTATTACAGGTTATGCTGGAACTGCACTTTCAATAGATGTTGGTGCTGCACCTCCTAAAGATCAATACACTCACCAATTCTCAGAAGCAATCAATGGTGCTTTAGTTTATGGTGGTGACTATGATCATACCTTTATTCGTGCAGTAGATGGTGCATTACTTACTGGAGGACCTTTTGCACATTCCTTCATCGGTGCAACTGCAACATCGACTTTTGCAGGCGGTGATTATGCACACACATATGTAAGTTCTGATGATAAGACTATCAAGACTGGTGGAGACTATGCACACACCTTTGATAGTGCTATTACTAATGCAATTACTGTTCCTGGCATTGGTGGATTGTTCACTCCCACTAATGCAGACTATACTCCTAGCACTGGTTCATTAATTATAACAGTGCCTGGTCATGGATTATCAGGACCTAGTCAACATTCAATCACAACTGCTAACTACAACCCCTTAGTGGGTATCTTGACCATCACTGTTCCTAATCACGGATTCTCAAATGGTGATCAAGTTTTAATTGCAGATAATTCTATAGGTTGGAAATGTTCACTTGATGGATTTACAACAACAAAATATTATCCAAGAAACACAGATACTCTAAGCAATACTTGGGTTCCTATCAGTAACGTCTCTACAAACACATTTGAGGTCTTTGCTGGTATTACTACTAGAGTGGATTACACCGTGTCTGCGGCGGACTACACACCCACTACAGGTATCATGACCATGAGTATTGGAACTCATGATTTAAGAGCAGGACAAAGTTTCAAATTTAAACCAGAATCATTAGGATTTACTTGTAGGGCTGATAATTATACACGCATCAAATACTATCCAAGATCTAAAGACCCTGTTTATGAAACTGCTGTTCCTATTGTTAGTGTTGCTGGAACTACAATTACAACTCAGGTTGGTATAACAACAGAGGTCAAGTACAATATTAGATTTGCTGCATATACACCGCAGACTGGTATTATGACTGTCTCTCTAGACAGACTTCATAACTTCCAAGTTGGTGAAGCAATTAAGTTCAAGCCTGGATCTATCGTATTCAAATGTGAACAGGACGCTTTCCAAACAAATCACTTCTATCCAAGACCAACTGATCCATATTATGAAAAAACTGTAGATATAGTTGGTGCTGCTGGAACACTCTTTACTGTAAACGTAGGACCTACAACATCTTCACAGATCTACTCCTTTGTTCCTAATCAGGGTGTTGCTGTAGAGGCAGTTATTGCTGGTGGTGACTATCCATATCAATTAAATGGTATTGGAACTGATGCTGTCATAACTGGTGGTGGAGACTATACTCCATATTGGTATCAAAATTCCACAACTGGTGCAGTTCAAAGACCAACCCAAAAAGTTGGTGTTGTGACTGGTGGATTATCATTCAAGTGTGCTAAGGACAACTATGCAACTGTTCACGCATATCCTCGTCCTACAGATCCTATTCACAATCTTGATGTAGGTATTGTTTCTGCTACAAGTAATACCTTTGAGATAAGAGTTGGTGTATCTACAATCAGAGAACGTGGTATCTCTACATCAGTCTACAACCCTGCAACAGGTGAGTTGACAATGACAGTGGGTGCTGGACACTCTTACATCAATGAGTCATCTCATACAATTTCGACGGCAACGTACAATACTAGTACTGGTGTACTAGAACCAACTATTGCAAATCATGGTTTTGTTGCTGGTGAATATGTTAAATTTGATTTGGGTTCTATCTCATTCACATGCGATCTTGATGGTAATGTTGCTAGCAAGGCATATCCAAGATACTCCGATCCATATCTTAATAAATGGTTGCCAATTTACAACGTTGGTGTAAACACATTTTCTGTTTATGTTGGTATTGCAACTCTTGGTGGAAACCACACATTTGTATCTGCAACTTCTGGTGGTCTCAAGAAAGCTAGAGACACTGTTGGTATCAATACAGGTTCTATTGTATTCACATGTGCCAGAGATGATCATGCTACAGAACACGCATATCCTCGTTCCTATGATCCTATTGGTAGTAATGTTTCTGTAGGTATTGGTTCTACTTCAGCGACCACACTTACAATTAATGTTGGTGTGTCTACAATCGTAAACTACGGTATTGCTACTGCTGCATATACACCTACTACAGGTATCATGACCGTGTTCTCCAACATTCATGGTCTCAATGGTGCATACGATGATAAGACAATCCAGTTTGCAACTTATGATGCTATCAGTGGTATTATGACAGTCACCACTAATCAACCTCACGGAATGATTACTGGTAATAGAGTCAACTTCAAGAGAGACTCTATCAGATTCAGATGTATGATGGATCAGAGAAAATCTATTAAGAGTTATCCAAGAGCAAAAGATCCATCAGATCAACAGTGGTTATCTGTAACTGGTATTTCTACTAATCAGTTTAGTGTCGATGTGGGAACATCACCTCTTGTTTATCACAGTCCCACAAGCGGATCATATGATCCTTTCACTGGATTGATGACTGTAGACATTGGTTCTCATACTCTTAGAAAAGGAACTGGTGTAAAACTTAAAACAAGGGGATTCAAATTCACTTGTGCTTTAGATAATCATGCGACAAATCACTTCTACCCAAGGGCAAGTGGCATATCTGGTCCAGACCCTGCTTATAATACTTCTGTTAAGATTACTTCTAC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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage 8109-3 Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Erlich,R., Young,S.K., Koehrsen,M., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Borenstein,D., Chen,Z., Engels,R., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heiman,D., Hepburn,T., Howarth,C., Jen,D., Larson,L., Lewis,B., Mehta,T., Park,D., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., Walk,T., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C., Galagan,J. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank