Protein

Genbank accession
ATG86330.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,61
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSNISIPENDNPIRTQASLGGNQKYRNMGNVSGQAYLVRGQVTHVYYQKGTLDFNPYGSSSSSETTDGSGSAPIPVDFWGTNTDGKVFGCYRPVKIGSQVLVAYINGDTSYPIVVGIYPDNEKGYELISPVPYNLGDDSTDSVQGDSLGEKKLYANQQLRYMSGKGDILKSMGGKSFLYISKNDSGYLDDINYAYDQISDFYDRDGNQINPTQTKAQSWLLVHEDNDSDENSDGHRTRFYLNKAGELMVAFMNKNDASNITLLEASKDTGFKLTRRFDTSDLTEESNTYVQLGIGNGNKVNITSVDSGDATTFDLENGSINLNTPEKGTISFNNVSVDTILGKVSDAQNTANNAADKADNAYLAGETAKSAASDAASQALAASQAGEEAKSAAVDAKAAGEDAKAEAKDTQNRIIYYSSISQEKDVAIPGKYIIVNTDTYIKSATIQTAHIADAAITTAKIANAAIGTAQIEDAAITTAKIGNAAIGTAQIEDAAITDAKVGDLSANHLKAGTIDFSVINGTNINASNITVGKLVANQLEIKSLDELSNNLGTVDNGTLGNLNNWGSVKIYADVYAHTFSNLNGTFTADANGGVVASNLTIRGVTNLVYNAALLGNSGTYPNTKVPGWNLFTTGYYSNATLHDGVPSIGFNSSTGGAVWTTFAQSKLYPLNGLTGQPYSASVWFIEDGSDPNMLYQFTLAFFDTNGNRINGYVGQTWSGISSAQPWRYITINKAVSPSNAAYVGLQYWAYNGTGHALFSSPMLTQTAQSTGYQPDTGNIISAGTITGSSFYGGSVINNSNNTAGYYPMSIDSLGTYNSTYIDSAVALRASVQSGAILYNYRSMIANSGQYVYSDTVINGQGLTVDSGYTTVKDTTFSASSTETAYVSISTTGGLFLHGSDANIDFGGHLSDNETNVGMYMNPYGNIIGKSSSDYWQVSKQGADNTGGGATARFGIDTGGKGTINFYRPLFVDEIGAFTSSNGGALLVHDQKGTSQMVFRNDGNPQVVSASIYNRTYSSGSTVTVTSYGTLGRITSASKYKLDIVKDTSIDKANKLLTLDMSSWVDKSSAESLAESKTNGSELSEPEMNVFRHYGLIAEDLIKAGLDEFVIKGDKGQAEGIEYDRLWTVLIPKIRQLSNEQIQNTMTISKLENEIKLLKQEGN
Physico‐chemical
properties
protein length:1162 AA
molecular weight: 124078,00280 Da
isoelectric point:4,76535
aromaticity:0,09122
hydropathy:-0,34225

Domains

Domains [InterPro]
IPR030392
1035–1154
IPR030392
ATG86330.1
1 1162
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage LpeD
[NCBI] 		2041210 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ATG86330.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MF787246.1 [NCBI]
CDS location
range 24623 -> 28111
strand +
CDS
TTGAGTAATATAAGTATTCCTGAAAATGATAATCCCATAAGAACTCAAGCTTCTCTTGGAGGAAATCAAAAATATAGAAATATGGGTAACGTTTCTGGACAAGCCTATTTAGTAAGGGGACAGGTAACCCATGTATACTATCAAAAAGGAACTTTAGACTTTAATCCTTATGGTTCTAGTTCATCCTCAGAAACCACTGATGGTAGTGGGAGTGCGCCAATCCCTGTTGACTTTTGGGGAACAAACACTGATGGAAAAGTGTTTGGGTGCTATCGTCCAGTTAAAATAGGTTCCCAAGTTTTAGTTGCCTATATAAATGGTGACACCTCCTACCCTATTGTAGTTGGTATTTATCCAGATAATGAAAAAGGCTATGAACTAATATCTCCTGTGCCTTATAACCTTGGTGATGATTCTACTGATAGCGTTCAAGGGGATTCTTTAGGTGAAAAGAAACTTTATGCTAATCAACAACTAAGGTATATGTCTGGAAAAGGCGACATTTTAAAAAGTATGGGTGGAAAGTCATTTTTATATATTTCTAAAAATGATAGTGGTTATCTCGATGATATTAATTATGCTTATGACCAAATATCGGATTTCTATGATAGAGATGGGAACCAAATAAACCCAACTCAAACAAAAGCTCAATCATGGTTATTAGTTCATGAAGACAATGATAGTGATGAAAACTCGGATGGTCACCGTACGAGATTTTATCTAAATAAAGCCGGGGAATTAATGGTCGCTTTTATGAATAAAAACGATGCAAGCAATATTACTTTATTAGAGGCTAGTAAAGATACCGGATTTAAGTTAACTAGAAGATTTGACACAAGCGATTTAACAGAAGAGTCTAATACCTATGTTCAACTAGGAATTGGCAACGGTAATAAGGTAAATATTACCAGTGTAGATAGCGGAGACGCTACTACTTTTGATTTAGAAAATGGTTCTATTAATTTAAATACCCCTGAAAAGGGAACTATCAGCTTTAATAATGTATCTGTTGATACCATACTTGGAAAGGTATCAGATGCACAAAATACAGCCAATAACGCCGCTGATAAAGCCGATAATGCTTATTTAGCTGGTGAAACAGCAAAATCTGCCGCTAGTGACGCCGCTAGTCAAGCTTTGGCCGCTAGTCAAGCAGGTGAAGAAGCCAAGTCAGCGGCAGTTGATGCTAAAGCCGCTGGTGAAGATGCTAAAGCAGAAGCCAAAGATACCCAAAATAGGATTATATACTACTCTTCAATCTCACAAGAAAAAGATGTCGCTATACCCGGTAAATATATTATTGTCAACACAGATACCTATATCAAAAGTGCTACAATTCAAACAGCCCATATTGCAGACGCCGCTATTACAACGGCTAAGATAGCAAACGCCGCTATTGGTACAGCCCAAATTGAAGATGCCGCTATTACCACAGCCAAAATAGGCAATGCCGCTATTGGTACAGCCCAAATTGAAGATGCCGCTATTACCGATGCAAAAGTCGGAGACCTTAGTGCAAACCATCTTAAAGCCGGAACTATTGATTTTAGTGTTATTAATGGTACCAACATTAACGCTTCTAATATTACCGTTGGTAAACTTGTTGCTAACCAATTGGAAATAAAGAGTCTTGATGAACTATCAAATAACTTAGGAACTGTTGATAATGGTACACTTGGAAACTTAAACAACTGGGGCTCAGTTAAAATATATGCTGATGTTTATGCACACACATTTAGCAACTTAAATGGTACTTTTACCGCTGACGCTAACGGTGGAGTTGTAGCAAGCAACCTAACAATCAGGGGAGTCACAAACCTAGTTTATAATGCGGCATTATTAGGTAATTCTGGCACATATCCAAATACAAAAGTTCCCGGTTGGAATTTATTCACTACAGGATACTATTCAAACGCTACTTTGCATGACGGTGTTCCTTCAATTGGATTTAACTCTTCGACTGGTGGCGCAGTGTGGACTACTTTTGCACAGTCTAAACTATACCCATTAAATGGGTTAACAGGACAACCCTATAGTGCATCAGTTTGGTTTATTGAAGATGGTAGCGACCCTAATATGTTATACCAGTTTACTCTAGCATTTTTTGACACAAATGGTAATAGAATTAATGGATATGTTGGTCAAACATGGTCCGGTATTAGTTCAGCTCAGCCATGGAGATACATTACAATAAACAAAGCAGTATCCCCAAGTAATGCTGCTTATGTTGGACTACAGTATTGGGCCTACAACGGTACTGGTCACGCATTGTTTAGTTCACCTATGCTAACTCAAACTGCTCAATCAACTGGTTACCAGCCTGACACAGGTAATATTATCAGTGCTGGTACTATTACAGGCTCAAGCTTCTATGGTGGTTCAGTAATTAATAATTCAAACAATACTGCTGGCTATTATCCAATGAGCATTGATTCTTTAGGAACCTATAATTCAACCTATATTGACAGTGCGGTAGCATTAAGAGCATCAGTACAATCTGGCGCTATTCTTTATAATTATCGTTCTATGATTGCAAATAGCGGACAATATGTTTACTCTGATACTGTAATTAATGGTCAAGGACTAACGGTTGACTCTGGATACACAACTGTTAAGGATACCACATTTAGTGCTTCAAGTACGGAAACAGCATATGTAAGTATATCAACTACTGGTGGACTTTTCTTACACGGCTCTGATGCCAATATTGACTTTGGGGGGCATCTATCAGACAATGAGACAAACGTTGGTATGTATATGAATCCTTATGGTAATATCATTGGAAAGAGCTCATCTGACTACTGGCAAGTATCTAAACAAGGTGCAGATAATACTGGTGGAGGCGCTACAGCCCGCTTTGGTATTGACACAGGAGGTAAAGGAACAATTAACTTTTATCGCCCATTATTTGTTGATGAAATAGGTGCATTTACCTCTAGTAATGGCGGGGCTCTCCTAGTTCATGACCAGAAGGGTACTAGTCAAATGGTTTTTAGAAATGATGGTAATCCACAGGTTGTATCTGCTTCTATTTATAATAGAACATATTCTAGTGGTTCAACTGTAACTGTAACTAGCTATGGTACTCTAGGACGTATTACGTCTGCAAGTAAGTACAAACTAGATATTGTAAAGGATACTAGTATTGACAAAGCCAATAAATTACTAACACTAGATATGTCTAGCTGGGTAGATAAATCATCCGCTGAAAGTCTAGCTGAGTCTAAGACTAATGGAAGTGAGCTATCCGAACCCGAAATGAATGTATTTAGGCATTATGGTTTAATTGCCGAAGACCTTATAAAGGCCGGCCTAGATGAGTTTGTAATTAAAGGTGATAAAGGACAAGCTGAAGGTATTGAATATGATAGACTATGGACTGTGTTAATTCCTAAAATACGGCAGTTGTCTAATGAGCAAATTCAAAACACTATGACCATATCAAAGTTAGAAAATGAAATTAAACTATTAAAGCAGGAAGGTAATTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
74bf1dea26a23f957a8fdb0e825015961a55a7d477414262a807d5f4364e480f
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5476
Evidence 0,5476
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and Characterization of phages of Lactobacillus pentosus and plantarum Qi,R., Yu,M., Qiao,X. and Li,Y. 2012-01-19 — GenBank