Protein
- Genbank accession
- XWX30330.1 [GenBank]
- Protein name
- glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
- RBP type
-
TSPTSPTF
- Protein sequence
-
MADRPRTQASLGSQWQRVNSDNLKFDNLILAKVIKVYYQYQTVELQSLSGKMRIAQGLGTSGKFSAPYPKEFTGMTPENNPYGHIPVIVPGTLVLVAFVDGNPSNPIIVNSYGYNDLNTKLVRTPMISGDMRDNEQFKFNSSSYTLKPSLTYEYFDGEGNVVKTWNGKSLLSVTSDHNEQESSTDFMYGTLYDDLFTSRYADNSLIEPRIQRAPNMLFKHQGEFDMYGEPDNHITMFYLSSDGTFRRSTLNKEEQFRTTVEQDNKGNYRVQYQADSVIIDEGQDYVEFGIDTERQEFYVKNLDHSFRFNDDGILVDGKPLLANIDDGINDAFEKLDKLEKSMDRINDIIQDLGDRNLRELINATNKAISDVSDLTNALATTNKNVSDNKIKIDNSIIKYDKFMQDIGDYQITNNEIVNSHTTSINKINNTELPSIKLDISNIKNKIKSQYVIGDDSPTSNFTTRFQNILNEIRDNGGGTLYVLPGTYEIKSRIKIYDNTTIIMTNQTKLLRCHNGGFFDNGDLNNNVGGYDGVSNITIIGGILDNNYENIDKYPTKQINMIALRHAKNITIKDLTFRNGITVHCVDMNGSKDVMFDGCRFEGYVNLNNASYKEALQISEYVTGGIDGGIFDGTPCKNITVKNCTFSSSDILGGYDVCIGNHITANNVFNSNIKIYNNTFKDCNIAIRDWKWNDLDIHGNTFINNKECLRASSIGSSYESAKNIDGTPSNQSQATRNLIFNENKIYNFTSVGIGIYGIQDNDTAFIENVKIKDNYIKGTGQGIISSLVKDIVIEGNDIEDTYRAIKYSATKNIRVLNNTISNSKTEAIYGDVSNYGDIHSINYNSIIKHNIIDNTQKNGVFISTGDIINITDNVITNSNMINEENNKRGSIKVDYSDKCIINNNSLYGQTESFAIQATTSTNVISNNNNTNIQE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 933 AA molecular weight: 104801,29390 Da isoelectric point: 5,07790 aromaticity: 0,09110 hydropathy: -0,53237
Domains
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Staphylococcus phage PG-2021_15 [NCBI] |
2815614 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XWX30330.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ417318
[NCBI]
CDS location
range 65675 -> 68476
strand +
strand +
CDS
ATGGCAGATAGACCAAGAACACAGGCAAGTTTAGGTTCTCAATGGCAACGAGTAAATTCAGACAATTTAAAATTTGATAACTTAATATTGGCTAAAGTCATAAAAGTTTACTACCAATACCAAACGGTAGAATTACAATCCCTAAGTGGTAAAATGAGAATAGCACAAGGATTAGGTACAAGTGGTAAATTCTCTGCACCATACCCTAAAGAGTTTACGGGAATGACACCGGAAAATAATCCTTACGGACATATACCGGTTATCGTACCCGGAACATTAGTATTAGTTGCTTTTGTTGACGGTAATCCTAGTAACCCTATTATTGTCAATAGTTATGGATATAATGACTTAAACACTAAACTAGTAAGAACACCTATGATTAGTGGAGATATGAGAGACAATGAGCAATTTAAATTTAATAGTTCATCTTACACATTAAAACCAAGTCTTACATATGAATACTTTGACGGTGAGGGTAATGTAGTTAAGACATGGAATGGTAAGTCTCTGCTATCGGTAACTAGCGACCACAATGAGCAGGAAAGTTCTACCGACTTTATGTATGGAACTCTTTATGACGACCTATTTACGAGCCGTTACGCCGATAACTCACTAATAGAGCCGAGGATACAAAGAGCACCTAACATGTTATTTAAACACCAAGGAGAATTTGACATGTATGGTGAGCCGGATAATCATATTACAATGTTTTATTTGAGTTCCGATGGTACATTTAGACGTTCTACATTAAATAAAGAAGAGCAATTTAGAACAACGGTAGAGCAAGACAATAAAGGTAACTATAGAGTACAATATCAAGCAGATAGTGTTATTATAGATGAGGGTCAAGATTACGTAGAGTTTGGTATAGATACGGAAAGACAAGAGTTCTATGTTAAAAACTTAGACCACTCATTTAGGTTTAATGATGACGGTATATTGGTAGACGGTAAACCTTTATTAGCTAATATTGATGACGGTATTAATGATGCATTTGAGAAACTAGATAAGTTAGAAAAATCTATGGATAGAATAAATGACATTATCCAAGATTTAGGTGATAGAAATTTAAGGGAACTTATTAATGCAACAAATAAAGCTATTAGTGATGTTAGTGACTTAACTAATGCCTTAGCTACAACTAATAAAAATGTTTCAGATAATAAAATTAAAATAGACAATTCTATAATCAAGTATGATAAGTTCATGCAAGATATAGGTGATTATCAAATTACTAATAATGAGATTGTTAATAGTCATACTACTAGTATAAATAAGATAAATAATACGGAATTACCTAGTATAAAATTGGATATAAGTAATATAAAAAATAAAATTAAATCTCAATATGTTATAGGTGACGATAGTCCTACTAGTAATTTCACAACAAGATTTCAAAATATATTGAATGAAATTAGAGATAACGGTGGAGGTACATTATATGTGTTACCAGGAACTTATGAAATTAAAAGTAGAATTAAGATATATGATAACACTACAATAATAATGACTAATCAAACAAAATTACTAAGATGTCATAATGGTGGTTTCTTTGATAATGGAGACCTCAATAATAATGTAGGTGGTTATGATGGTGTGTCTAACATTACTATTATAGGTGGCATATTAGATAATAATTATGAAAATATAGACAAATATCCTACTAAACAAATAAATATGATAGCTCTAAGACATGCTAAAAATATAACAATTAAAGACTTGACATTCAGAAATGGTATAACGGTTCATTGTGTAGATATGAATGGTAGTAAAGATGTTATGTTTGATGGGTGTAGGTTTGAGGGTTATGTTAATCTTAATAATGCATCATATAAAGAGGCTTTACAAATATCTGAATATGTTACTGGGGGTATAGATGGTGGAATATTTGATGGTACACCATGTAAGAACATAACTGTTAAGAATTGTACATTTAGTAGTTCTGATATTTTAGGTGGGTATGATGTATGTATAGGTAACCATATAACAGCTAATAATGTGTTTAATAGTAACATTAAAATATATAATAATACTTTTAAAGATTGTAATATTGCTATACGAGATTGGAAGTGGAATGACTTAGATATTCATGGTAATACTTTTATTAACAACAAAGAATGTCTAAGAGCATCGTCTATAGGTAGTAGTTATGAAAGTGCTAAAAATATAGACGGAACACCAAGTAACCAATCTCAAGCTACTAGAAATTTAATATTTAATGAAAATAAGATATATAATTTTACTAGCGTAGGTATAGGTATATATGGTATACAAGATAATGATACAGCTTTTATAGAAAATGTCAAGATAAAAGATAATTATATTAAAGGTACAGGTCAAGGTATTATAAGTAGTTTAGTTAAAGATATAGTTATAGAAGGTAATGACATAGAGGACACTTATAGAGCTATTAAATATAGTGCAACTAAGAATATTAGAGTACTAAATAATACAATAAGTAATTCTAAGACTGAAGCTATATATGGAGATGTATCAAATTATGGAGATATACACTCTATAAATTATAATTCTATTATAAAACATAATATTATAGATAATACACAAAAAAATGGTGTATTTATTTCTACAGGAGATATTATTAATATTACAGATAATGTAATAACTAACTCTAATATGATTAATGAGGAAAACAATAAGAGGGGAAGTATTAAAGTAGATTATAGTGATAAGTGCATTATAAATAATAACTCTCTATATGGTCAAACAGAAAGTTTTGCTATACAAGCAACAACAAGCACTAATGTAATCTCAAATAATAATAATACAAACATACAAGAGTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Natural phage communities crosslink different species within the genus Staphylococcus | Goller,P.C., Elsener,T., Lorge,D., Radulovic,N., Bernardi,V., Naumann,A., Amri,N., Khatchatourova,E., Hernandes Coutinho,F., Loessner,M.J. and Gomez-Sanz,E. | 2024 | — | GenBank |