Protein

Genbank accession
YP_009876786.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,71
Protein sequence
MDNLQSSGLNLRNIKLRDLNTLVSDIQYNFQQIVQLPGFKGVTGKDGLSITGATGERGNKWVFANSASFITEYVTVTTSGQVTLNFLNSQLTADLARLLTTLGIDKLVGNDIIVLPSRDVIQFSSLTNEFVSTGIRFADGLSLNEEEVIEIINEVLGGLNNNDVYGIYKGIIKNYADNSAGLNNQSNYNSIIDLPVSGSGIGLETNDFIFSAIKEANIGNGVNTMFLTGSPKDYHNLAQKTLTNKTVDYMAGVDDFGALAVLQNSYKNGILIGHKDSNDFSTWGRIFRTENKLRFLSDYDPKLDEVGRLDLAKSGTVLFSPKDLQLMIKNGVLKMTDYKTNYDWLDATSERMVLGNANLPYVSIYSKNYAKLYTSIGANTQILGLYGNELKASIFQPKNDLLVNDQNLLVTHNILFDIKEDLETWIDDLDDRVSILESQNVYRQQTRLVGNANANLLTQFGLYDIRYNSSASYTNFPNNTLSNGFATNAYLKVNRFDEGTNVVIEQEYVNKSASNNYLVTSKRQGISNDSGSTFTWSNWTVLLDSRNSLFKGDGLSIVIENETFGDSGKLVIKHKAGVGSKVEAENPTTDSHKVVRGLNLDSSGHPTSVIAQDLDEWYYDKIEIDKLLRSNLPIGTIVIWSGNPNTIPAGFILCDGNNDTPNYGGRFLVGYDATNTDYNVVGARGGEAFVTLTKAQMPIHSHGGVTGSGGVHDHTIRFRYSGAEQDNQIGFLQPEWWTDQTNMGESGGNGTDNGYVNVTIPSSDAHNHTIQSEGGGQAHENRPPYEVVCFIMFVGFGVPSVTSPTNLSTTVGLPFSVVPDSIGVVTSWSATNLPLGLSINPTTGEISGIPTTPSNNEVTLIATNSNGSSAPYKFFINVEPFLGSVPVITSGNVIDVEVGQSFSYRITASGDPTSFGATGLPSWMSLDTTTGFITGTVPLGTPQSLFEINVSAINGSGTGSQNVSVIVTSLATINAPLLIGGGLTRSFYTGESVSYSHINGGGTATNWSALGLPTGLSINASTGRITGTINFAYSGETFNVQVTASNAAGISTISYNIYVYSDFGGDFRIN
Physico‐chemical
properties
protein length:1070 AA
molecular weight: 115472,02220 Da
isoelectric point:4,79723
aromaticity:0,09252
hydropathy:-0,17028

Domains

Domains [InterPro]
SSF88874
628–792
SSF88874 IPR013783 IPR013783 IPR013783
cd22641
630–719
cd22641 PF05345 IPR015919 IPR015919
IPR015919
799–880
IPR015919 PF05345 PF05345
YP_009876786.1
1 1070
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Tenacibaculum phage pT24
[NCBI] 		1880590 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009876786.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_049383.1 [NCBI]
CDS location
range 156468 -> 159680
strand +
CDS
ATGGATAATTTACAATCAAGTGGGTTAAACCTACGAAATATTAAACTTAGAGACTTAAATACATTAGTCTCAGATATACAATATAACTTCCAACAGATAGTGCAACTACCTGGTTTTAAGGGTGTTACAGGTAAAGATGGGTTATCTATTACTGGTGCTACTGGTGAGCGTGGTAATAAATGGGTTTTTGCTAATTCAGCATCATTCATAACTGAATATGTTACCGTAACCACATCAGGACAAGTTACACTAAACTTTTTAAATTCACAGTTAACAGCCGACTTAGCTCGGTTGTTAACTACTTTGGGTATTGATAAGTTGGTTGGAAATGATATAATTGTTTTACCATCTAGAGACGTTATACAGTTCAGTAGTTTAACAAATGAATTTGTATCTACTGGTATTAGATTTGCTGACGGTCTTTCATTAAATGAAGAAGAGGTTATCGAAATTATTAATGAGGTTTTAGGAGGTCTTAATAACAATGATGTTTACGGTATTTATAAGGGTATAATAAAAAACTATGCTGATAATAGTGCGGGTCTAAACAATCAATCAAATTACAATTCTATTATTGATTTACCAGTATCGGGTTCGGGTATTGGTTTGGAAACTAATGATTTCATTTTTTCTGCAATAAAAGAGGCAAATATCGGTAATGGTGTTAATACCATGTTTTTAACAGGTTCACCAAAAGATTATCATAATTTGGCTCAAAAAACATTGACCAACAAAACTGTTGATTATATGGCAGGTGTTGATGATTTTGGTGCTTTGGCTGTTTTACAAAACTCATACAAAAATGGTATTTTAATAGGTCATAAAGATTCTAATGATTTTAGTACATGGGGTAGAATTTTCAGAACAGAAAACAAGTTAAGATTTTTATCAGATTATGACCCTAAATTAGATGAAGTTGGAAGATTGGATTTAGCCAAGTCGGGAACTGTTTTATTTTCACCGAAGGATTTACAATTAATGATTAAGAACGGTGTTCTAAAAATGACTGATTATAAAACAAATTATGATTGGTTGGATGCTACTAGTGAAAGAATGGTTTTAGGTAATGCTAATTTACCTTACGTTTCAATATACTCTAAAAATTATGCAAAATTATACACAAGTATAGGAGCTAATACACAAATTTTAGGACTTTATGGCAATGAATTAAAAGCATCTATTTTTCAACCAAAAAATGATTTACTTGTTAATGACCAAAATTTATTGGTCACACATAATATTTTATTTGATATCAAAGAAGATTTAGAAACATGGATTGATGATTTAGATGATAGAGTAAGTATATTAGAATCTCAAAATGTTTATAGACAACAAACTAGATTAGTTGGTAACGCAAACGCAAACCTTTTAACTCAATTCGGTTTATACGATATTAGATATAATTCAAGTGCATCATATACAAATTTCCCAAATAATACATTATCTAACGGATTTGCAACAAATGCGTATTTAAAAGTAAATAGGTTTGATGAAGGTACAAATGTTGTTATTGAACAAGAATATGTTAATAAATCAGCATCAAATAACTATTTGGTTACATCAAAAAGACAGGGTATTTCAAACGATAGCGGTTCTACATTCACATGGTCAAATTGGACTGTTTTACTAGATTCTAGAAATTCATTATTCAAAGGCGATGGTTTATCTATTGTTATAGAAAATGAGACATTTGGTGATAGTGGTAAATTAGTTATAAAACATAAAGCAGGTGTTGGTTCTAAGGTAGAAGCTGAAAATCCAACAACAGATTCACATAAAGTTGTCCGAGGTTTGAATTTAGATTCAAGCGGACACCCTACAAGTGTTATAGCACAAGATTTAGATGAGTGGTACTATGATAAAATTGAGATTGATAAACTTTTACGCTCGAATTTACCAATTGGAACAATAGTTATTTGGAGTGGTAATCCTAATACAATTCCTGCGGGATTTATTTTATGTGATGGTAATAATGATACACCAAATTACGGTGGTAGGTTCTTAGTTGGATATGATGCAACAAACACAGATTATAATGTTGTAGGTGCTAGAGGTGGTGAAGCTTTCGTTACACTAACAAAAGCACAAATGCCTATACACTCACATGGTGGTGTTACAGGTTCAGGTGGTGTTCACGACCATACAATAAGATTTAGATATTCAGGTGCTGAACAAGATAATCAAATTGGTTTCTTACAACCTGAGTGGTGGACTGACCAAACTAATATGGGTGAAAGTGGTGGTAATGGTACAGATAATGGCTATGTTAATGTAACAATACCATCAAGTGATGCGCATAACCACACAATTCAATCAGAGGGTGGTGGTCAAGCACATGAAAATAGACCACCTTATGAAGTTGTTTGCTTTATCATGTTTGTTGGTTTCGGAGTTCCGTCAGTTACTTCACCAACAAATTTAAGTACAACAGTTGGTTTACCTTTTTCTGTAGTTCCTGATAGTATTGGTGTGGTAACATCATGGAGTGCTACAAATTTACCTTTAGGATTGAGTATTAATCCTACAACTGGTGAAATTTCGGGTATTCCAACAACACCAAGTAATAATGAAGTTACATTAATCGCTACAAACTCTAACGGTTCATCAGCACCATATAAGTTTTTCATAAATGTTGAACCATTCTTAGGTAGTGTTCCTGTAATCACGTCAGGTAATGTAATTGATGTTGAGGTTGGTCAATCATTTTCATATAGAATTACAGCAAGTGGTGACCCTACTTCTTTTGGAGCTACTGGTTTACCATCATGGATGAGTTTAGATACAACAACAGGATTTATAACTGGCACAGTTCCGTTAGGAACACCACAAAGTTTATTTGAAATTAATGTAAGTGCTATTAATGGTTCGGGTACAGGTTCACAAAATGTTTCAGTTATTGTTACATCTTTAGCTACGATAAATGCACCTTTATTAATAGGTGGTGGACTTACAAGAAGTTTCTATACTGGTGAGTCTGTTTCATATAGTCATATTAATGGTGGTGGTACTGCTACGAATTGGAGTGCTTTAGGTTTACCAACAGGTTTAAGTATCAATGCTTCAACTGGTAGAATCACAGGAACTATAAATTTCGCTTATTCGGGCGAAACATTTAATGTGCAAGTTACAGCATCTAACGCGGCAGGAATTTCAACAATATCATATAACATTTATGTTTATAGTGATTTTGGTGGTGATTTTAGAATAAATTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
22dad20e364bc6db2f5195cb0279d5c6a82050a41d4e3d188a8854bf8f3b97c1
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5645
Evidence 0,5645
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterization of three bacteriophages infecting bacteria isolated from shrimp culture pond water Khoa,H.V. 2017-07-13 — GenBank