Protein

Genbank accession
ANN87549.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,81
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTTGNGAWANQHSNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVNEGSFKFHYIDETGTSKYWTFNRNGNFQVDSGSLLVSNGYLVTQSNIETKAGSLIGPKVITKNINVSTKSWDTNIDTAYDLVSLPTWHYTPTETDLDTNGINYLRKFRGHVSSAIFHEVADARSGKPQNISYWTGRNAEVYQWSYTTDGRMSVANSIGIGLADVGDQGRYPLVSFGKGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDLVANGISAGTILNNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDYPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYSSNAKMYHYFRGTGRMSVSMGDGLLVEPGILDIKTGSNSLNLRADGTIASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLVFKAASGIDGTKQILWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNATGDKARETVFEVSDGQGYYFYSQRVAPTGSETTGPVVTQFNGQVNARGSLITDGSLRVNGLSTLVGNVTMNNGLFVQGGASITGQVKIGGTADAFRIYDAEYGAIFRRSEDKLYIIPTPQNVGESGGISNLRPFYITLSTGKVSMDHDVDIGGGRFKVEAAGTTAGQRITVNMASDAIRINAPTQESSNFIQGRKADVPKWYLGIGDGGNVVRMHSYTYSHGIALNSDSVDITKPLKVGNAQFGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDTGLYPKLAAVYPSGALPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASSTDLGTKTTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGNTSSAGAHQHARSGPQVTAAWANDLFRDGVTTIGANSYAKINSGITGSTLATKVGKTSNDGAHTHSWSGTTSSTGNHAHTVGIGAHTHSVGIGAHSHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1038 AA
molecular weight: 110236,38660 Da
isoelectric point:8,54150
aromaticity:0,08671
hydropathy:-0,38998

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:6.20.80.10
689–748
G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
IPR048388
691–765
IPR048388 SSF88874 SSF88874
IPR037053
786–839
IPR037053
IPR011083
791–838
IPR011083
ANN87549.1
1 1038
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage SHSML-52-1
[NCBI] 		1863011 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ANN87549.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX130865.1 [NCBI]
CDS location
range 45467 -> 48583
strand -
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTGGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGACCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGTGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAACTGGCGATTATTTACAAAACGGCACGTATAATCTCAATGGAAATCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATACATTGAATTTTTACCTAAAACCACTGGAAATGGCGCTTGGGCTAACCAACATTCGAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTAAGTTCAACTACTTCTGTTTCAGAATACCATCCACTGATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGCTGGTACATTAGTAAACGAAGGTAGTTTTAAATTCCATTATATTGATGAAACCGGGACTTCAAAATACTGGACTTTTAATCGAAACGGTAATTTTCAAGTTGATTCCGGAAGTTTATTAGTATCTAATGGATATTTAGTTACTCAAAGTAATATTGAAACTAAAGCTGGTTCTTTAATTGGTCCTAAAGTTATTACCAAAAATATCAATGTGAGCACTAAATCTTGGGACACTAATATTGATACTGCATATGATTTAGTTTCATTACCGACTTGGCACTATACTCCAACCGAAACAGATTTGGATACTAATGGTATAAACTACCTTCGTAAATTCCGCGGACATGTTTCTTCTGCTATTTTCCATGAAGTTGCCGATGCTCGTTCAGGTAAACCACAGAATATTTCGTATTGGACGGGACGTAATGCTGAAGTTTATCAATGGTCTTATACCACAGATGGGCGTATGTCTGTTGCTAATTCGATAGGTATAGGTCTTGCTGATGTTGGTGACCAAGGACGTTATCCATTGGTTTCGTTTGGTAAAGGTATTGCAATTGGTGACAATGATACTGGTATTAAATGGGTTCGTGACGGGGTTATCGATTTAGTTGCGAATGGTATTTCTGCCGGCACTATTCTTAATAACGGTATTAACAGTACTAAAAAATTGATGGTTGGTTATAGTCGAGATTCTGGTTCTACTTGGGATTACCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACTGCGCGTACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGTGACGGTCAGACTCATATTGGTTATAGCAGCAATGCCAAGATGTATCACTATTTCCGTGGCACTGGTCGTATGTCCGTTAGTATGGGTGATGGGCTTCTTGTTGAGCCTGGCATTTTAGATATTAAAACTGGTTCAAATTCGTTAAATTTGCGTGCTGATGGTACCATCGCTTCTGTTCAAACGTTAAAACTTAATAATGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTCTAGTTTTTAAAGCGGCTTCAGGTATTGATGGCACCAAACAAATCCTTTGGGAAGGCGGTACTCGTGCAGGTCAGAACAAAAGTTATGTGACCGTGAAAGCATGGGGTAACTCATTTAATGCTACTGGTGATAAAGCTCGAGAAACCGTATTTGAGGTTTCTGATGGCCAAGGTTATTATTTCTATTCTCAACGCGTAGCTCCGACCGGTTCTGAAACTACAGGCCCTGTTGTAACTCAGTTCAATGGACAGGTTAATGCTAGAGGAAGCTTAATAACCGACGGAAGTCTTAGAGTTAACGGATTAAGCACTCTAGTTGGCAACGTTACAATGAATAATGGATTGTTTGTTCAAGGTGGTGCCTCAATTACTGGACAGGTTAAAATTGGCGGGACTGCTGATGCTTTCCGTATTTACGATGCTGAATACGGGGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGATAAGCTTTATATTATTCCAACTCCACAGAATGTTGGTGAATCAGGTGGTATTTCTAATTTACGTCCGTTCTATATTACATTAAGTACTGGTAAAGTTTCCATGGATCATGATGTAGATATCGGCGGCGGTAGATTTAAAGTAGAAGCGGCTGGAACTACGGCTGGTCAACGCATAACAGTAAATATGGCATCAGATGCTATTAGAATAAATGCTCCAACACAAGAGTCTTCTAACTTCATTCAAGGACGTAAAGCAGATGTTCCGAAATGGTATTTAGGTATTGGAGATGGCGGCAACGTCGTTCGTATGCACAGCTACACATATTCACATGGTATTGCATTAAACTCTGATTCTGTCGATATTACTAAACCATTAAAAGTTGGTAATGCTCAATTCGGTACTGATGGTAATATTACTGGTGGTTCTGGCAACTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGACGGATATTGTCTCGAGTTACCCAATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTATGCCATAATGGAAGGCCAAACATTTGATACTGGCTTGTATCCTAAGTTAGCTGCGGTGTATCCTTCTGGCGCTCTGCCTGATATGCGTGGTCAAACTATCAAGGGTAAACCATCTGGGCGCGCTGTATTAAGTACAGAAGCAGATGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCATCAAGCACAGATTTGGGTACTAAGACCACTTCTAGTTTTGATTACGGTAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGTAATACCACTGGTAACCATAACCATACAGTGAGTGGTAATACTAGTTCCGCAGGAGCTCACCAACACGCGCGTTCAGGTCCACAGGTCACTGCTGCATGGGCAAACGATTTGTTTAGAGACGGGGTTACTACGATAGGTGCAAACTCATATGCTAAAATTAACTCAGGTATCACTGGTTCGACTTTAGCAACTAAGGTCGGTAAAACATCAAATGACGGTGCCCACACCCATAGTTGGTCAGGAACTACTAGCTCTACGGGTAACCATGCTCATACGGTAGGTATTGGTGCTCATACCCATTCGGTGGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTGCAATTGGTTCCCATGGACATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACTGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
4aa1ef94845475a3a5d7e90471e50f2638a71dc6b0fabd7b6384ea75e78bebf5
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5293
Evidence 0,5293
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genetic characterization of ShigActive phages Das,C.R., Woolston,J., Li,M., Sulakvelidze,A. and Soffer,N. 2013-11-08 — GenBank