Protein

Genbank accession
ADP00167.1 [GenBank]
Protein name
tail tube protein B
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,56
Protein sequence
MPAINQRIPNFLGGVSQQPDTIKYPGQLRVCDNAVPDVTFGLMKRPPGEFVKTLTNANADGYWYEILRDGDEKYLVQMTALSSYSGTKPIRIWNLLTGVEQSLTNSNGDSLFSYMEQSGTTIPYATQTIQDYTIISNPHKTVTTTGTTDAPLANGNYAFARLDTIAYNTEYILYTGSTAPAANKYYRVTALSVDKGTNDGNTWDDTNKDGRYAGLAQFSFSDSLCEDVEGHVTVNAASYVDSNTANYDGGGTAQSNFLGYTQNYKTRYTAQIVLKDGGLIKTGSESTALSRHHDITIEGISYRVKVKAVEEVDTYESVSGIAFHRTPKNPDKGKLSMTNLISALHASINSSLNNVTSEVIGSGMYLYGSAAPTVNFLGGAVNENMNIIGNTAQDVSRLPSQCKHGYIAQIANSENVDADNYYVKFYADNGVQGSGSWEECVRPHNFSAGSDPMVKGLDPANMPHALVNNRNGTFTFKKLDETTANADSNDNYWKYREVGDDITNPFPSFKGLKISKIFFHRNRLGLIANEQVVMSRPGDYFNFQIVSAITTSDDNPVDITVSDIKPAFINHVLPIQKGVMMFSDNGQFLLFTESDIFSPKTARLKKLSSYETYPALDPIDMGTSVMFTSNVSAYARAFEATIVDDDIPPKIIEQTRVVPEFIPKDITISTVSSAIGIVSFGKKNSSEIYHYKYYDAGDRRDQSAWYSWTVQGKLQHCLYTGGSFWTVTKQGPDGGYQTMVLSKHEYVTEATSGRTYVLGGEATDVGSPLKTARWFEACLDNMTIPTAINYTAQGGSVTGPDFTDLTLAYTPHTADNFYAVALSGTDTAGNEVAGTVIEATSVGTNKATFEGVNMTGWVVAVGYQYTSTITLPSYYLAFDQGKYDLDADLRITGINFEMGIGGPMEFHLESTYADMDDYIQYESGLKLDDSDFGKPPSQMTKSIRVPIQKKNEKYNLTIKIPDPFSTAIISGSWDGRYNQRRHVRR
Physico‐chemical
properties
protein length:985 AA
molecular weight: 108307,33000 Da
isoelectric point:5,16390
aromaticity:0,10761
hydropathy:-0,38081

Domains

Domains [InterPro]
IPR058003
1–179
IPR058003 IPR058003
ADP00167.1
1 985
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage NATL2A-133
[NCBI] 		445692 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Prochlorococcus marinus str. NATL2A
[NCBI] 		59920 Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADP00167.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071104 [NCBI]
CDS location
range 19304 -> 22261
strand -
CDS
ATGCCAGCTATTAATCAACGGATTCCAAACTTTTTAGGAGGTGTATCTCAACAGCCCGACACAATTAAATATCCAGGACAGCTCAGAGTGTGTGATAATGCAGTGCCTGATGTGACTTTTGGATTAATGAAACGTCCTCCAGGAGAATTTGTGAAGACGTTGACTAACGCTAATGCGGATGGTTACTGGTATGAGATACTAAGAGATGGGGATGAAAAATATTTAGTACAAATGACAGCGTTATCTAGTTATAGTGGGACTAAACCTATAAGGATTTGGAACTTATTAACTGGAGTAGAACAAAGTCTTACCAATAGTAATGGTGATTCTTTGTTTAGTTACATGGAGCAATCAGGTACTACCATACCTTATGCTACACAGACAATACAAGATTATACAATAATAAGTAATCCCCATAAAACAGTTACTACAACTGGTACTACTGATGCTCCCCTTGCTAATGGTAATTATGCTTTTGCTAGGTTAGATACCATTGCTTATAACACTGAGTATATATTATATACAGGAAGTACAGCACCTGCAGCTAATAAATATTATAGAGTAACAGCTCTTTCAGTAGACAAAGGTACTAACGATGGTAACACATGGGATGATACCAATAAAGATGGTCGGTATGCGGGTCTAGCTCAGTTTTCATTTAGCGATAGTTTATGTGAAGATGTTGAAGGACACGTAACAGTTAATGCTGCAAGCTATGTAGATAGTAATACTGCTAACTACGATGGAGGGGGAACTGCTCAGTCAAACTTCTTAGGTTATACACAAAACTATAAAACTAGATATACTGCACAGATTGTATTAAAAGATGGAGGGCTTATTAAAACTGGTAGTGAATCTACAGCTTTAAGCAGACACCACGATATAACTATTGAAGGTATTTCTTATAGAGTTAAAGTAAAAGCAGTCGAAGAAGTTGATACATATGAGAGTGTTAGTGGGATAGCTTTCCACCGTACACCTAAGAATCCTGATAAGGGTAAACTTAGTATGACTAATTTAATATCAGCATTACACGCTTCAATTAATTCTAGTCTAAATAATGTAACTTCAGAAGTTATCGGTAGTGGTATGTATCTTTATGGTAGTGCTGCTCCTACAGTAAACTTCTTAGGTGGTGCTGTAAATGAAAACATGAATATCATTGGTAACACAGCACAAGATGTAAGTCGATTACCAAGTCAATGTAAACATGGTTATATAGCACAGATTGCTAACTCAGAAAACGTAGATGCTGATAATTATTATGTAAAATTTTATGCGGATAATGGTGTTCAAGGTTCTGGTAGTTGGGAAGAGTGTGTAAGACCACACAACTTCTCGGCAGGTAGTGACCCTATGGTTAAGGGTTTAGACCCTGCTAATATGCCACACGCTTTAGTTAACAATCGTAACGGTACCTTTACTTTTAAAAAGTTAGATGAAACTACAGCTAATGCTGATAGTAATGATAACTACTGGAAGTATAGAGAAGTTGGTGATGATATCACTAACCCATTCCCTAGTTTTAAAGGCTTAAAAATTTCCAAAATATTTTTCCATAGAAATAGATTAGGATTAATTGCAAATGAGCAGGTAGTTATGAGCCGTCCTGGAGATTATTTTAATTTCCAAATTGTGTCTGCTATAACTACCAGTGATGACAACCCAGTTGATATAACAGTATCAGACATTAAACCTGCATTTATTAACCATGTCTTACCTATTCAAAAAGGTGTGATGATGTTTAGTGATAACGGGCAATTTTTGTTATTTACTGAGTCTGATATTTTTAGTCCAAAAACTGCTAGGTTAAAGAAACTATCTAGTTATGAAACATACCCAGCTTTGGACCCTATTGATATGGGAACATCAGTTATGTTTACTTCTAATGTATCTGCTTATGCTAGAGCGTTTGAAGCAACAATTGTTGATGATGATATACCTCCTAAAATAATAGAGCAGACTAGAGTTGTACCTGAGTTTATACCTAAAGATATAACAATATCTACAGTATCAAGTGCTATAGGTATTGTAAGTTTTGGTAAGAAAAATTCTTCTGAAATTTATCATTATAAATACTATGATGCTGGAGACAGAAGAGATCAATCCGCTTGGTATAGCTGGACAGTACAAGGTAAATTACAGCATTGTTTATATACTGGTGGTAGCTTCTGGACTGTTACTAAACAAGGTCCAGATGGAGGTTATCAAACAATGGTTTTAAGTAAACATGAGTATGTTACAGAAGCCACCAGTGGTAGAACATATGTACTAGGTGGAGAAGCCACTGATGTAGGTTCCCCCTTAAAGACAGCTAGATGGTTTGAAGCTTGTCTAGATAACATGACAATACCAACTGCTATTAATTATACAGCTCAAGGAGGTTCAGTAACAGGGCCAGATTTTACAGATTTAACACTAGCTTATACACCACACACCGCTGATAATTTCTATGCTGTAGCCCTTTCTGGAACAGATACAGCTGGTAATGAGGTTGCTGGTACGGTAATTGAAGCTACTTCTGTAGGTACTAATAAAGCTACGTTTGAAGGAGTCAATATGACTGGATGGGTAGTGGCTGTAGGGTATCAATATACCTCTACAATTACACTTCCTAGCTATTATTTAGCTTTTGATCAAGGTAAATATGACCTAGATGCTGACCTTAGAATCACTGGTATTAACTTTGAGATGGGTATTGGTGGTCCTATGGAGTTCCATTTAGAGTCTACTTATGCTGATATGGATGATTATATACAGTATGAATCAGGTTTAAAGCTAGATGACAGTGATTTTGGTAAACCACCTTCTCAAATGACTAAAAGTATTAGAGTACCTATACAGAAAAAGAATGAAAAATATAATTTAACTATAAAAATACCCGATCCTTTTTCCACCGCTATTATCTCAGGTTCTTGGGATGGTAGGTATAACCAAAGAAGACATGTACGAAGGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
97b7bc4e26937d36bbe02db7e13a56f707519dc6b5d7f1652413fa72b6b76030
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7138
Evidence 0,7138
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage NATL2A-133 Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Erlich,R., Young,S.K., Koehrsen,M., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Borenstein,D., Chen,Z., Engels,R., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heiman,D., Hepburn,T., Howarth,C., Jen,D., Larson,L., Lewis,B., Mehta,T., Park,D., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., Walk,T., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C., Galagan,J. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank