Protein

View in Explore
Genbank accession
QHR72833.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,81
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTTGNGAWANQHSNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVNEGSFKFHYIDETGTSKYWTFNRNGNFQVDSGSLLVSNGYLVTQSNIETKAGSLIGPKVITKNINVSTKSWDTNIDTAYDLVSLPTWQYTPTETDLDTNGINYLRKFRGHVSSAIFHEVADARSGKPQNISYWTGRNAEVYQWSYTTDGRMSVANSIGIGLADVGDQGRYPLVSFGKGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDLMANGISSATILNNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDFPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYSSNAKMYHYFRGTGRMSVSMGDGLLVEPGILDIKTGSNSLNLRADGTIASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLVFKAASGIDGTKQIMWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNATGDKARETVFEVSDGQGYYFYSQRVAPTGSETTGPVVTQFNGQVNARGSLITDGSLRVNGLSTLVGNVTMNNGLFVQGGASITGQVKIGGTADAFRIYDAEYGAIFRRSEDKFYIIPTPQNAGESGGISNLRPFYITLSNGKVSMDHDVDIGGGRFKVEAAGTTAGQRITVNMASDAIRINAPTQESSNFIQGRKADVPKWYLGIGDGGNIVRMHSYTYSHGIALNSDTVDIAKPLKVGNAQFGTDGNITGGTGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDADLYPKLAAVYPSGALPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASSTDLGTKTTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGNTSSAGAHQHARSGPQIQAGIPNNIFYDGYNSVGANANAKFTGTVNGATAGSNIAKTSSDGAHTHSWSGTTSATGNHAHTVGIGAHTHSVGIGAHSHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1038 AA
molecular weight: 110239,30560 Da
isoelectric point:8,14353
aromaticity:0,08863
hydropathy:-0,39682

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–1036
DC_0538
G3DSA:6.20.80.10
STR
689–748
G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
IPR048388
ATT
691–765
IPR048388 SSF88874 SSF88874
IPR037053
ATT
786–839
IPR037053
IPR011083
ATT
791–838
IPR011083
QHR72833.1
1 1038
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 1-690 | ATT 691-765 | STR 766-785 | ATT 786-839 | STR 840-1037 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage mobillu
[NCBI] 		2696421 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR72833.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850622.1 [NCBI]
CDS location
range 136907 -> 140023
strand -
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTAGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACCAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGCGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAACTGGTGATTATTTACAAAACGGCACGTATAATCTCAATGGAAATCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATACATTGAATTTTTACCTAAAACCACTGGAAATGGCGCTTGGGCTAACCAACATTCGAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTAAGTTCAACTACTTCTGTTTCAGAATACCATCCACTGATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGCTGGTACATTAGTAAACGAAGGTAGTTTTAAATTCCATTATATTGATGAAACCGGGACTTCAAAATACTGGACTTTTAATCGAAACGGTAATTTTCAAGTTGATTCCGGAAGTTTATTAGTATCTAATGGATATTTAGTTACTCAAAGTAATATTGAAACTAAAGCTGGTTCTTTAATTGGTCCTAAAGTTATTACCAAAAACATCAATGTGAGCACTAAATCTTGGGACACTAATATTGATACTGCATATGATTTAGTTTCATTACCGACTTGGCAGTATACTCCAACCGAAACGGATTTGGATACTAATGGTATAAACTACCTTCGTAAATTCCGCGGACATGTTTCTTCTGCTATTTTCCATGAAGTTGCTGATGCTCGTTCAGGTAAACCACAGAATATTTCGTATTGGACGGGACGTAATGCCGAAGTTTATCAATGGTCTTATACCACAGATGGGCGTATGTCTGTTGCTAATTCGATAGGTATAGGTCTTGCTGATGTTGGTGACCAAGGACGTTATCCATTGGTTTCGTTTGGTAAAGGTATTGCCATTGGTGATAACGATACAGGTATTAAATGGGTTCGCGACGGCGTTATCGATTTAATGGCCAACGGTATTTCTTCGGCTACCATTTTGAACAATGGTATTAACAGCACCAAGAAATTGATGGTTGGTTATAGCCGAGATTCAGGTTCTACTTGGGATTTCCCAAATAATAACCAAGCAATGTTTACTGCGCGTACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGCGATGGACAGACTCATATCGGATATAGCAGCAATGCTAAGATGTATCACTATTTCCGTGGTACAGGTCGTATGTCCGTTAGTATGGGCGATGGACTTCTTGTTGAGCCCGGCATTTTAGATATTAAAACTGGTTCAAATTCGCTAAATTTGCGTGCTGATGGTACCATCGCTTCTGTTCAAACGTTAAAACTTAATAACGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTCTAGTTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGATGGCACTAAGCAAATAATGTGGGAAGGCGGTACTCGTGCAGGTCAGAACAAAAGTTATGTGACCGTGAAAGCATGGGGTAACTCATTTAATGCTACTGGTGATAAAGCTCGAGAAACCGTATTTGAGGTTTCTGATGGCCAAGGTTATTATTTCTATTCTCAACGCGTAGCTCCGACCGGTTCTGAAACTACAGGCCCTGTTGTAACTCAGTTCAATGGACAGGTTAATGCTAGAGGAAGCTTAATAACCGACGGAAGTCTTAGAGTTAACGGATTAAGCACTCTAGTTGGCAACGTTACAATGAATAATGGATTGTTTGTTCAAGGTGGTGCCTCAATTACCGGACAGGTTAAAATTGGCGGGACTGCTGATGCTTTCCGTATTTACGATGCTGAATATGGTGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGATAAGTTTTATATTATTCCAACTCCGCAGAATGCTGGTGAATCAGGTGGTATTTCTAATTTACGTCCATTCTATATTACATTAAGTAATGGTAAAGTTTCCATGGATCATGATGTAGATATCGGCGGCGGTAGATTTAAAGTAGAAGCGGCTGGAACTACGGCTGGTCAACGAATAACAGTAAATATGGCATCAGATGCTATTAGAATAAATGCTCCAACACAAGAGTCTTCTAACTTCATTCAAGGACGTAAAGCAGATGTTCCGAAATGGTATTTAGGTATTGGCGATGGCGGTAACATCGTTCGTATGCACAGTTACACCTACTCCCATGGTATTGCATTAAACTCTGATACGGTTGATATAGCTAAACCTCTTAAAGTCGGTAATGCTCAATTCGGTACTGATGGTAACATCACTGGCGGCACTGGTAATTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGACGGATATTGTCTCAAGTTATCCTATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTATGCCATAATGGAAGGTCAAACATTTGATGCTGACTTGTATCCTAAGTTAGCTGCGGTGTATCCTTCCGGCGCTCTGCCTGATATGCGTGGTCAAACTATCAAGGGTAAACCATCTGGGCGTGCTGTATTGAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCATCAAGCACAGATTTGGGTACTAAGACCACTTCTAGTTTTGATTACGGTAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGTAATACCACTGGTAACCATAACCATACAGTGAGTGGTAATACTAGTTCCGCTGGTGCGCACCAACACGCGCGTTCAGGTCCTCAGATACAAGCCGGCATACCCAATAACATATTCTATGACGGATATAATAGTGTAGGTGCAAACGCCAACGCTAAATTCACTGGAACCGTGAACGGTGCTACTGCAGGGTCGAATATAGCCAAAACTTCTTCAGACGGTGCCCACACTCATAGTTGGTCAGGAACTACTAGCGCTACTGGTAACCATGCTCATACTGTGGGTATTGGTGCTCATACCCATTCGGTAGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTGCAATTGGTTCCCATGGACATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACAGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
35580891bd7505e2f4ac7d01aaf603fd8e21309a4fa76899c8c1c7d6eb75e1b4
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5291
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank