Protein

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Genbank accession

USL83645.1 [GenBank]

Protein name

tail fiber protein

RBP type

Evidence Phold

Probability 1,00

Evidence RBPdetect2

Probability 0,95

Protein sequence

MYSIKTDLAVTGNTNVGKELSVKGNAVFDKNVTIKGTVSFADATFTAITVDQATINTTLDVTGKASLKGGMDVLGNTVIGNTTAGSDTATINSNATFNGTSTFAKDITQTSGKAIFQDTTTSALEVNGTTTLNGNLTAAAATTASFDKLTANEATIATVSATDITATGATVENLTVTGKLDGDFTLGDVNTDNLVVEKLSTLKGAVTLESNIIGTNTVANIKAVSLGSNAADSTARLGFAYTAPGLRPTVILQNEVQSELMTPANLTVLKTATFGDVSAATNGITAKGLNLFDYLTLSGNSIQDPTTPILRVTKGKTQLTDLQVDGTTNITGKTTVGDLDITGTLSGNFVLSDITADNLVVEKLTTLKGALNLESNIVGSTANANLKSVTLGGNVADTNAKVNFTYTAPGLRPTVILQNEVQSELMTPANLTVLKTATFGDVSASTYGITAKGLNLFDYLKITGNAVQDPNTLTLDVDGKAQFKDVNFTGTVTGFVPDISGQDITPKDVTASGNISGVNLDASGTLTVDGDSVLKGTTITDLTVTGTTTGITLAGQDITPKDVTASGNVKGVDVTASGNLTVDGTTTLVGNTVVDGLFEVVGQTTTVKDLNVTGTLSGAAIKANVDGLDILPNSVTTTEEVAVGTNLSVGGNALFSGLKVEVTGKVTGVGSDALETGSIESDGTISAPNITATTKVTAASAQITGTGTGLSVDHNASVGGDLNVTGTLTAGVIDLSAADVTVKTLDVSESAHIGGNLTVDGTVDLSAADVSVKSLTSAGPVISNDATGTNILPKLQSTDITTTNSTTGTATVTTANISTLNVTGESTLAAVSAVSVTTPSIVNTDGINLENDTVAHGDLTVKGTFTPEGGLDLSPVDISSKSLTTTEGATIGGSLTVDGAINAAAADLTVKSLTSSGVITVTENTEPSILPKLTSTEATAGKLNVTGDATVGGKATVSGALEVTGTSTFGNAVTVNVGGITAKGGLTVASGNLKVAAAAVVDGSVSAGSYTSAGDKITLAKPTDVTGDLHVEGAFTATSVDFSTTDLTVKSLQVDNDVTIDGNLTITNADLETNSLASTTSTTVGTDLILTTGTITGAPTISGATTLSSTLHTVGAATFDGTVDVGGKITSKSIQVSATGVGVAVDNDATVGGYLTIGETLGVTGLSTLSGGVDAGSALIKTTGEVQSATLQTSGKATLASVDVSGDAVVTGDLTVKGAFTPEGSLNLGSAVLNVEGVDASANLTALGSVTAGTTLTVTGVSTLNGGTNTTTLSTSGKATLSSAEVTGALSAGGALAVTGTTNLTGKLTAGEAALSSLTVSGDVTINGTLNPGTLDLSTTPVDAKSLKSRETLEVTGLSTLTGGLAVSANTAITAAGDITGTTITTTGKGTFGSAAVTTGLTVGGALVVNGASVNISDASTVTMPKADISAKGIIIGPKVSSRPETIQFVGDTYIGSNLFVAGNINGSVDLAGQDISLNSLTSNTTIHAVEDITTDEDMHARAATFGAQGSTANSLTVNGNAVTTGDFTVSGKIIGTLDQSASAVEVKSLTSTTFIAAGTTLTVGSTITAEGLSTLKGGIATNGATINAGDGAITTTGDVSGANVSASGAVTTATITTSGLATMASAKINTTLAVTGATTLSDVVTIGKKLTVSTGGIEITAGGFNVVAGGAAITGATNLKGAVTLGSASADAITVTGTSSFAENATFAKDVTIEGTLHTDIADLVTESVTTKKYAVTPSPKVTASTAAVGGNWTPDGLSNVYYITLDQNVMMTPITGLIGSGKAGSYYIYVAQDTTGGHSFDWDGTYANVGGEINTNPGGVSIVQLIYDGYSPVVDMFIAQRTA

Physico‐chemical properties

protein length:	1845 AA
molecular weight:	182553,36040 Da
isoelectric point:	4,29859
aromaticity:	0,03089
hydropathy:	0,19718

Domains

Domains [InterPro]

DC_0092
STR
122–328

DC_0092 DC_0092 DC_0092 DC_0931

DC_0092
STR
302–607

DC_0092 DC_0092 IPR058970

USL83645.1

1 1845

Architecture

STR

RBD

STR 122-607 | STR 780-1342 | RBD 1422-1845

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_0092	STR	DC_0092	122	328	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	302	607	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	780	1023	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	974	1153	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	1115	1342	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0931	RBD	DC_0931	1422	1845	Novel HMM	DC_0931	C-terminal	Low	Positional only	65 proteins / 65 hits
IPR058970	RBD	DC_0552	1754	1832	InterPro cluster	Putative phage tail fibre, C-terminal domain	C-terminal	Low	Positional only	292 proteins / 292 hits

Taxonomy

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Escherichia phage A4 [NCBI]	2950725	Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host	Escherichia coli LF82 [NCBI]	591946	Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales > Enterobacteriaceae > Escherichia > Escherichia coli

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

USL83645.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

ON286972.1 [NCBI]

CDS location

range 162381 -> 167918
strand -

CDS

ATGTACTCGATAAAAACAGATCTAGCAGTAACTGGTAATACTAATGTTGGTAAAGAATTATCAGTTAAAGGTAATGCGGTCTTCGATAAAAACGTAACCATTAAGGGGACCGTTAGTTTCGCTGATGCTACCTTCACTGCAATTACAGTAGATCAAGCAACAATCAACACAACACTCGATGTTACAGGCAAAGCGTCACTTAAGGGTGGAATGGATGTACTTGGCAATACAGTTATTGGTAATACTACTGCTGGTTCCGATACAGCAACTATTAATTCCAATGCTACTTTTAATGGCACTTCTACTTTTGCCAAAGATATTACACAAACATCAGGAAAAGCAATTTTTCAAGATACCACCACTTCTGCATTAGAAGTTAATGGTACAACAACATTAAATGGTAACCTCACTGCTGCGGCAGCAACCACTGCAAGCTTTGATAAATTAACTGCTAATGAAGCAACCATTGCAACTGTATCAGCAACTGATATTACTGCAACTGGTGCAACCGTTGAGAATCTAACTGTAACTGGTAAATTAGATGGTGATTTCACATTAGGGGATGTTAATACCGATAATTTAGTTGTTGAAAAACTATCTACATTAAAAGGTGCTGTAACCCTAGAATCAAACATCATTGGTACTAATACTGTAGCAAACATAAAAGCTGTATCTTTAGGTTCTAATGCAGCGGACTCGACTGCACGCCTAGGCTTTGCATACACTGCTCCAGGATTACGCCCAACTGTAATTCTACAAAACGAAGTACAGTCCGAGCTAATGACTCCAGCAAATCTAACAGTACTTAAAACTGCTACATTTGGTGATGTATCAGCAGCAACCAATGGTATTACCGCAAAAGGTTTGAACCTATTTGATTACCTAACACTTTCTGGTAACTCAATACAAGATCCAACCACACCAATTCTACGTGTAACTAAAGGTAAAACACAATTAACTGACCTACAAGTTGATGGAACTACTAATATTACTGGTAAAACTACTGTTGGTGATTTGGATATTACTGGAACACTATCAGGTAACTTTGTACTAAGTGATATTACTGCGGATAATTTAGTTGTTGAAAAACTAACTACACTAAAAGGTGCATTAAACCTAGAATCTAATATTGTTGGTTCAACTGCGAATGCTAATTTAAAATCTGTCACTTTAGGTGGAAACGTAGCAGACACGAATGCTAAAGTTAACTTTACATATACTGCTCCTGGTTTACGCCCAACTGTAATTCTACAAAACGAAGTACAGTCTGAATTAATGACCCCAGCAAATCTAACAGTACTGAAAACTGCTACATTTGGTGATGTATCTGCATCTACCTACGGTATTACAGCAAAAGGTTTGAACCTATTTGATTATTTGAAAATAACTGGTAATGCGGTACAAGATCCAAATACATTAACTCTAGATGTGGATGGTAAGGCTCAATTCAAAGACGTTAATTTCACTGGTACAGTTACTGGTTTTGTTCCTGACATTTCTGGTCAAGATATTACACCTAAAGATGTAACTGCTTCTGGTAATATTAGTGGTGTTAATCTAGATGCTTCTGGTACACTAACAGTTGATGGGGATTCCGTTCTAAAAGGCACAACTATAACTGATTTGACTGTTACTGGAACTACAACTGGTATTACACTAGCTGGTCAAGACATTACTCCTAAAGATGTAACTGCATCTGGTAATGTTAAAGGTGTTGACGTAACTGCATCTGGAAACCTAACAGTTGACGGTACTACCACATTGGTTGGTAACACGGTAGTTGATGGTTTATTTGAAGTTGTTGGTCAAACAACCACTGTTAAAGATTTGAACGTTACTGGTACACTATCTGGTGCTGCAATTAAAGCAAACGTTGATGGTCTAGACATTCTACCTAATTCTGTAACCACAACTGAAGAAGTTGCAGTGGGAACTAATCTAAGTGTTGGTGGAAACGCACTCTTTAGTGGCTTGAAAGTTGAAGTTACTGGTAAAGTTACTGGTGTTGGTTCTGATGCATTAGAAACTGGTTCAATTGAATCTGACGGTACTATCTCTGCCCCAAATATCACAGCAACTACTAAAGTGACCGCAGCTTCCGCACAAATTACCGGAACCGGAACTGGTCTAAGTGTAGATCATAATGCATCAGTTGGTGGTGATTTGAATGTTACTGGAACTTTAACGGCTGGTGTTATTGACCTAAGTGCGGCTGATGTAACTGTTAAAACACTTGATGTATCTGAAAGTGCACATATAGGTGGAAACCTAACTGTTGATGGTACTGTAGATTTAAGTGCAGCAGATGTAAGTGTTAAATCTTTAACTAGTGCTGGTCCTGTGATTAGTAATGATGCTACTGGAACTAACATTCTACCAAAATTACAAAGTACTGATATTACTACAACTAACAGTACAACTGGTACAGCAACAGTAACTACAGCAAACATTTCTACATTAAATGTTACTGGTGAAAGTACATTGGCTGCTGTTTCTGCTGTTTCTGTAACTACTCCTTCTATTGTTAATACCGATGGTATTAATTTAGAAAATGATACAGTTGCACATGGTGACTTAACTGTTAAAGGTACATTTACACCTGAAGGTGGATTAGATTTAAGCCCAGTTGATATCAGTTCTAAATCATTAACAACAACTGAAGGTGCAACCATTGGTGGAAGCTTAACTGTTGATGGTGCAATTAATGCTGCTGCGGCAGATCTAACTGTTAAATCACTAACTTCTTCTGGTGTTATTACTGTTACTGAAAATACTGAACCAAGTATTCTACCAAAACTAACAAGTACTGAAGCAACCGCTGGTAAATTGAATGTTACTGGTGATGCAACAGTCGGTGGTAAAGCGACCGTTTCTGGTGCACTTGAAGTTACTGGTACTTCAACATTTGGTAACGCAGTAACTGTAAACGTCGGTGGTATTACTGCTAAAGGTGGCTTGACTGTTGCTTCTGGAAACTTGAAAGTTGCTGCTGCGGCAGTGGTTGATGGTTCAGTAAGTGCTGGTTCATACACAAGTGCTGGAGATAAAATAACACTAGCTAAACCAACAGATGTTACTGGTGATTTGCACGTTGAAGGTGCTTTCACTGCAACTTCCGTTGATTTTAGTACAACTGATTTGACTGTTAAATCACTACAAGTTGATAATGACGTTACTATCGATGGTAACTTGACTATCACAAATGCTGATTTGGAAACTAACTCATTAGCAAGTACTACAAGTACTACTGTTGGTACTGACCTAATTCTAACTACTGGTACAATTACTGGTGCTCCAACAATTTCTGGTGCAACTACACTAAGTTCAACCCTACATACTGTAGGTGCTGCAACTTTTGATGGTACTGTTGATGTTGGTGGTAAAATTACTTCTAAATCAATCCAAGTAAGTGCTACTGGTGTTGGTGTAGCAGTTGATAATGACGCAACTGTTGGTGGTTATTTGACAATTGGTGAAACATTAGGTGTTACTGGACTAAGTACTCTATCTGGTGGGGTTGATGCAGGTTCTGCATTAATCAAAACTACTGGTGAAGTTCAATCCGCAACTCTACAAACTTCTGGTAAAGCAACACTAGCAAGTGTTGATGTTTCAGGTGATGCAGTTGTTACTGGTGACCTAACTGTTAAAGGTGCATTTACACCTGAAGGTAGCCTAAACTTAGGTTCTGCTGTTCTAAACGTTGAAGGTGTTGATGCAAGTGCTAACTTAACTGCACTCGGTTCTGTAACTGCTGGTACTACACTAACTGTTACTGGTGTTTCAACTCTAAATGGTGGTACTAACACTACTACTCTTTCAACAAGTGGTAAAGCTACATTAAGTAGTGCGGAAGTTACTGGTGCTCTAAGTGCTGGTGGTGCTTTGGCTGTTACTGGTACTACAAATCTAACTGGAAAACTAACCGCTGGTGAAGCTGCTCTCAGTTCACTAACAGTTTCTGGTGATGTTACCATTAATGGAACACTAAACCCTGGAACATTGGATCTATCTACTACTCCAGTTGATGCGAAAAGCTTGAAATCCAGAGAAACACTAGAAGTTACTGGTCTAAGCACTCTAACTGGTGGTTTGGCTGTTAGTGCAAATACCGCAATCACTGCTGCTGGTGACATTACTGGTACTACAATTACCACAACTGGTAAAGGTACATTTGGTAGTGCAGCGGTAACTACTGGTTTGACTGTTGGTGGTGCTTTGGTTGTTAATGGTGCATCCGTGAACATCTCTGATGCTTCTACTGTGACTATGCCTAAAGCTGATATTTCTGCGAAAGGTATTATCATCGGTCCTAAAGTTAGTTCAAGACCGGAAACTATCCAATTTGTTGGTGATACTTATATTGGTAGTAACCTATTTGTTGCTGGTAATATTAACGGTTCAGTAGATTTGGCTGGTCAGGATATTTCCCTGAACTCATTAACTTCTAATACCACAATTCACGCAGTTGAGGATATTACTACTGATGAAGATATGCACGCACGTGCTGCAACATTCGGTGCACAAGGTTCAACAGCTAACAGCCTAACTGTTAATGGTAACGCAGTAACTACTGGCGACTTTACTGTTAGTGGTAAGATTATTGGTACACTGGACCAATCTGCAAGTGCAGTTGAAGTTAAATCTCTAACTTCTACAACCTTTATCGCTGCTGGTACAACCCTAACAGTTGGTTCAACAATCACTGCTGAAGGTTTGAGTACTTTGAAAGGTGGTATTGCAACTAATGGTGCTACTATCAACGCTGGTGATGGTGCAATCACCACAACTGGTGATGTGTCTGGTGCAAACGTTAGTGCGTCTGGTGCAGTAACTACTGCAACTATTACAACTTCTGGCCTAGCAACTATGGCAAGTGCTAAGATTAACACAACTCTAGCAGTTACTGGTGCAACTACACTATCTGATGTTGTTACTATCGGTAAGAAACTAACTGTTAGTACTGGTGGTATCGAAATCACTGCGGGTGGCTTCAATGTAGTTGCGGGTGGTGCAGCAATTACTGGTGCTACTAACCTTAAAGGTGCTGTAACACTAGGTTCTGCGTCTGCTGATGCAATCACAGTTACTGGTACATCTTCATTTGCTGAAAATGCAACATTTGCTAAAGATGTAACTATTGAAGGTACACTACATACAGATATTGCTGATTTAGTAACTGAAAGTGTAACTACTAAAAAGTATGCTGTTACTCCATCACCTAAAGTTACTGCAAGTACTGCTGCTGTTGGTGGTAATTGGACACCAGATGGTCTATCAAATGTGTATTATATAACACTAGATCAAAACGTAATGATGACACCAATAACTGGTTTAATTGGTAGTGGTAAAGCTGGTTCTTATTATATCTATGTCGCACAAGATACAACTGGTGGACATAGTTTTGATTGGGACGGAACTTATGCAAACGTTGGTGGTGAAATTAACACAAATCCAGGTGGAGTGAGTATCGTTCAGTTGATTTATGATGGATACAGTCCAGTAGTAGATATGTTTATTGCTCAACGTACTGCTTAA

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID

81538d7b3b4436f1a041e1bee22856f8dff9bafb26aaa499100980226d024f22

ColabFold

Source ColabFold

Method ColabFold

Resolution 0,5207

Oligomeric State monomer

Download PDB

Model Confidence

Very high
pLDDT > 90

High
90 > pLDDT > 70

Low
70 > pLDDT > 50

Very low
pLDDT < 50

Protein

Domains

Domains [InterPro]

Domains [InterPro]

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

Predicted Aligned Error (PAE)

Model Confidence