Protein

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Genbank accession
QWT77094.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein host specificity
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MQLNIHDSTLKRVGFINNNLPDALHYFDDNWHRYLAEGTSTFDFSVNKINSSYALLTLQSYISFTYDGEDYLFNIINIEQDHYSMHLQCENLNLELISEEVGAYGNTKRHSIVWYLKNVAKITNDFVEIGNNPFPLNDEDSSNPILSFDSTDTKLARIISICNSFNAEFQFRTQLKNDGTLQNITIDLYKEEGVGQKRKDVTLYYGKNIAGITSKADRTSTFFNATTVTDSKNKFNWLSVEGKHYNSDGQLEFYKNAGDNTAYAPLSRDMFPSQLKSSSSDRYTRKNLSIEATSANGLWDYAVSQFKLYAYPQMTYEVVVSVNAVTSALGNDKKLNIGDTIIVQDSTFDKSDGGLILSARVSQQEISFTNPLDNKITFTNFVRLKSEISADLYGRMKDLVDQNTPYKAEVETTNGLQFKNGTGSTTLSAHIFKGSATDETIADSYEWSKDGTVVAPTQTITVDASGVVDKAVYSFKATIAGKVVASQSVTITNVNDGERGPQGLKGDPGATGKDGVAGKDGVGIKTTVITYALSSSGTDKPNTGWTSQVPTLVKGQYLWTKTVWTYTDSSSETGYSVSYISKDGNNGHDGIAGKDGVGIKKTTITYAIGTSGTTAPSSGWNSQVPNVPAGQYLWTKTVWDYTDKTSETGYSVSKFGEKGDRGDRGDRGIQGLQGPDGTQGIPGPKGVDGTDAPTITVKSYTYSAGSRAEIELTGPNAFKKTVYNRGHNVWVIDATTHELKEFVNCDTYNTMSFSHNGVNTTLADYLASLKDSIVVIAASDADSIDQNVRDVLNSMGGFPDLGTWGNWRVGHVFIGMSKRNDGTWPLQPRQGYEESIIKDGSAPEIGCTLSKGGIVAKGADGKTQYTHIAYANSSDGVTNFSTSDSNRTYIGMYVDFNIDDSTKPSDYSWTLVKGADGTQGIPGKPGKDGKTPYFHTAWSYSADGKDGFTTVYPNLNLFTGTSDKPSTSTGGDWNIATIGVYKTPKVGQEYTLSVEVPETDHEVIVEVYGWNNAGERVGRPLSSTLIKSGEKAHITFTWPDPKDSGGIQLAADLAWTNDKDIGTYSYCKTKLEEGSTATPYMPSKSEVKTSDYPNFIGQRTDDVKADSTNPTEYTWSLIRGIDGKDGATGKDGVAGKDGVGIKTTVITYALYSSGTDKPNTGWTSQVPTLVKGQYLWTKTVWTYTDNSSETGYSVTYISKDGNNGNDGIAGKDGVGIKTTTITYADSTSGTTAPTTGWTSTVPTVAEGSYLWTKTVWAYTDNTSETGYSVGKMGDTGPAGPAGSDGNPGKVVSDTEPTTKFKGLTWKYSGVVDMKLGDGTKILAGTEYYWNGTVWALYEINAHNINGDNLSVTNGTFKDGKIESFWGSNGVKGTTTIEGSHLQIYSSNSTTNTENTVALDNLQGYAQVYTERNSGRAITVQASFQGFFVSDSTGPFVRVTPNGIENSVDVSWTTIGTYASYRRDGRVVTIRVVGAKTSTKGDMYIGSIPFKDCPAASVMATALAWSASVANDRHIQINGLSQRNSGTVTILSAAANQEYTFQITYQI
Physico‐chemical
properties
protein length:1546 AA
molecular weight: 167477,53590 Da
isoelectric point:5,22876
aromaticity:0,10220
hydropathy:-0,48486

Domains

Domains [InterPro]
DC_0690
STR
2–697
DC_0690 IPR039477 DC_1971 DC_1328
G3DSA:1.20.5.320
STR
495–543
G3DSA:1.20.5.320 G3DSA:1.20.5.320 DC_1971 DC_1328
PTHR24637
Unmapped
496–1289
PTHR24637
QWT77094.1
1 1546
Architecture
STR
STR
STR
STR
STR 2-712 | STR 725-797 | STR 826-1064 | STR 1090-1545 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactococcus phage CAP
[NCBI] 		2849079 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Lactococcus cremoris
[NCBI] 		1359 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QWT77094.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ308445.1 [NCBI]
CDS location
range 30302 -> 34942
strand +
CDS
ATGCAACTAAATATTCATGATTCAACTTTAAAAAGGGTTGGTTTTATTAATAATAATTTACCGGATGCTCTTCATTATTTTGATGATAACTGGCATCGTTATCTGGCAGAAGGAACTTCAACTTTTGATTTTTCTGTAAATAAAATAAATAGTTCTTATGCTTTATTAACGCTGCAAAGCTATATTAGCTTCACTTATGATGGGGAAGATTATTTGTTTAATATTATAAATATTGAGCAAGATCATTATTCTATGCATTTACAATGTGAGAATTTAAATCTTGAATTAATAAGTGAAGAAGTAGGGGCATACGGAAATACTAAAAGGCATAGTATTGTCTGGTATTTAAAAAATGTAGCTAAAATCACTAATGATTTTGTAGAGATTGGAAACAATCCTTTTCCGCTTAATGATGAAGATTCTTCAAATCCAATTCTTTCTTTTGATAGCACAGATACTAAACTTGCTAGAATTATTTCAATTTGCAATAGCTTTAATGCAGAATTTCAGTTTAGAACCCAACTAAAAAATGACGGGACTCTTCAAAATATCACTATTGATCTTTATAAAGAAGAAGGTGTTGGACAAAAGAGAAAAGATGTCACTTTATATTATGGGAAAAATATTGCGGGAATTACTTCAAAAGCAGATCGTACTTCCACTTTTTTCAACGCTACAACAGTGACGGATTCAAAAAATAAATTTAACTGGCTTTCAGTGGAGGGTAAGCATTATAATTCTGATGGTCAATTGGAGTTCTATAAGAATGCTGGAGATAACACAGCTTATGCCCCACTATCAAGAGATATGTTCCCTTCTCAACTTAAATCCTCAAGTTCAGACAGATATACTCGCAAAAATTTAAGTATAGAAGCTACCTCTGCAAATGGTTTGTGGGATTATGCTGTAAGCCAGTTTAAACTATATGCTTATCCTCAAATGACTTATGAAGTAGTAGTATCAGTAAATGCTGTTACAAGTGCTCTTGGAAATGACAAAAAGCTAAATATTGGAGATACAATAATTGTTCAAGACTCAACTTTTGACAAGTCAGATGGTGGTTTAATTTTATCAGCAAGGGTATCTCAACAAGAAATAAGTTTTACTAATCCATTAGATAATAAAATAACCTTTACTAATTTTGTTAGATTAAAAAGTGAAATTTCTGCCGATTTATATGGAAGAATGAAAGATTTAGTTGACCAAAATACACCCTATAAGGCGGAAGTAGAAACTACTAACGGATTACAATTTAAGAACGGAACTGGTTCAACAACTTTATCAGCTCATATTTTCAAAGGTTCTGCAACGGATGAAACAATCGCTGACAGTTACGAATGGTCGAAAGACGGAACGGTTGTAGCTCCAACTCAGACAATCACAGTTGATGCCAGCGGAGTTGTGGATAAAGCAGTTTATAGCTTTAAAGCAACAATTGCGGGCAAAGTAGTCGCAAGTCAGTCGGTCACTATCACTAATGTTAATGACGGGGAAAGAGGTCCTCAAGGATTAAAAGGTGACCCTGGAGCAACTGGTAAAGACGGTGTTGCTGGTAAGGATGGTGTTGGAATAAAAACCACTGTTATCACTTACGCTTTATCTTCAAGTGGTACAGATAAACCAAACACTGGCTGGACTTCACAAGTCCCTACTCTTGTAAAAGGTCAGTATCTCTGGACGAAAACGGTCTGGACATACACGGACAGCTCATCAGAAACAGGTTACTCAGTATCTTATATTTCTAAAGACGGGAACAACGGTCATGATGGAATTGCTGGTAAAGATGGTGTTGGAATTAAGAAAACCACAATCACTTACGCAATCGGAACATCAGGAACAACTGCTCCATCAAGTGGTTGGAATAGCCAAGTGCCTAATGTGCCAGCGGGGCAATACCTATGGACTAAGACTGTTTGGGATTATACAGATAAGACAAGTGAGACAGGTTATTCGGTTTCTAAATTTGGTGAAAAGGGCGATAGGGGAGACCGAGGAGACCGAGGCATCCAAGGTTTGCAAGGTCCTGATGGAACTCAAGGGATTCCTGGACCTAAAGGCGTGGATGGCACCGATGCTCCAACGATTACTGTTAAGTCCTATACATACTCGGCAGGTTCCAGAGCTGAAATTGAGCTGACTGGGCCAAACGCATTTAAGAAAACCGTTTATAACCGAGGACATAATGTCTGGGTGATTGATGCTACAACACACGAGCTCAAAGAGTTTGTTAATTGTGACACCTATAACACCATGTCTTTTAGTCACAACGGTGTTAATACGACTTTGGCTGACTACCTCGCTAGCCTTAAAGACAGCATTGTCGTAATCGCAGCTTCAGATGCAGACTCGATTGACCAAAATGTTAGGGATGTGCTTAACAGCATGGGTGGATTCCCAGATTTGGGGACATGGGGTAATTGGCGGGTTGGTCATGTCTTCATTGGCATGTCAAAGCGCAATGATGGTACTTGGCCATTGCAACCACGGCAGGGATATGAAGAATCCATTATTAAAGATGGCTCTGCTCCAGAAATCGGGTGCACGCTATCAAAGGGTGGAATAGTAGCTAAAGGCGCTGACGGAAAAACGCAATATACACATATCGCTTACGCAAATAGTTCAGATGGTGTAACTAATTTTTCAACTTCTGATTCTAATCGTACCTATATCGGAATGTATGTTGATTTTAATATCGATGATTCAACCAAACCGAGCGATTACTCATGGACACTTGTTAAAGGAGCGGACGGAACGCAAGGTATACCAGGTAAACCTGGGAAAGACGGTAAGACACCATATTTCCATACTGCATGGTCTTACAGTGCAGATGGTAAGGACGGTTTCACAACCGTTTATCCTAACTTGAATTTGTTCACGGGAACTTCTGATAAGCCTTCTACAAGTACGGGTGGAGACTGGAATATTGCCACTATCGGTGTATACAAGACACCTAAAGTTGGTCAAGAATACACGCTTTCTGTTGAAGTGCCTGAGACTGACCATGAGGTTATTGTGGAAGTATATGGTTGGAACAATGCGGGAGAAAGAGTGGGCCGGCCACTATCTTCCACATTGATAAAGTCTGGCGAAAAGGCTCATATAACATTTACTTGGCCAGACCCTAAAGATAGTGGTGGAATACAATTAGCAGCCGACTTGGCATGGACTAATGACAAAGATATAGGTACATATTCGTACTGTAAAACTAAATTAGAAGAAGGCTCAACCGCCACTCCATACATGCCAAGTAAAAGTGAAGTGAAAACTAGCGATTATCCAAACTTCATTGGACAGCGCACAGATGATGTTAAAGCTGACAGTACCAATCCAACTGAATATACCTGGAGTCTGATACGAGGGATTGATGGAAAAGATGGAGCAACAGGTAAAGATGGTGTTGCTGGTAAAGATGGTGTTGGAATTAAAACTACTGTTATCACTTATGCTTTATACTCAAGTGGTACAGATAAACCAAACACTGGTTGGACTTCACAAGTTCCTACTCTTGTAAAAGGTCAGTATCTCTGGACGAAAACAGTATGGACATATACGGACAACTCATCTGAAACAGGTTACTCAGTAACTTATATTTCTAAAGACGGAAATAACGGTAATGACGGAATTGCTGGTAAAGATGGTGTTGGTATCAAAACTACAACCATTACATACGCAGACTCAACAAGTGGAACAACCGCACCAACTACTGGCTGGACTTCCACAGTTCCGACAGTTGCAGAAGGTAGTTATCTGTGGACTAAGACTGTTTGGGCTTATACGGATAATACCAGTGAAACAGGTTATTCAGTAGGTAAAATGGGAGATACTGGTCCTGCTGGTCCTGCTGGAAGCGATGGTAATCCTGGTAAAGTTGTATCTGATACTGAACCAACCACAAAATTCAAGGGCTTAACATGGAAATATTCCGGAGTAGTGGACATGAAACTTGGTGACGGTACAAAAATATTAGCTGGAACGGAGTACTACTGGAATGGGACGGTTTGGGCTTTATATGAAATTAATGCTCATAACATCAACGGAGATAACCTATCAGTAACAAACGGTACATTTAAAGATGGGAAGATAGAGAGTTTTTGGGGGAGTAATGGAGTAAAGGGTACGACTACTATTGAAGGTAGTCATTTACAAATTTACTCATCTAATTCTACAACTAACACTGAAAATACAGTAGCCCTTGATAATCTTCAAGGATATGCTCAAGTTTATACTGAACGTAATTCAGGGAGAGCCATAACAGTTCAAGCCTCTTTTCAAGGTTTCTTTGTTTCTGATAGTACAGGGCCATTTGTTAGAGTAACTCCTAATGGTATAGAGAATTCTGTAGATGTCTCTTGGACCACAATCGGAACTTATGCATCTTATCGAAGAGATGGGAGAGTAGTAACTATTCGAGTAGTAGGAGCTAAAACAAGTACCAAAGGTGATATGTATATTGGATCCATTCCGTTTAAAGATTGTCCTGCTGCAAGCGTTATGGCTACGGCATTAGCTTGGTCTGCTAGTGTTGCAAACGATAGACATATACAAATAAATGGTTTAAGTCAACGAAATAGTGGGACAGTTACAATTCTTTCTGCAGCCGCTAATCAAGAATATACATTTCAAATAACATATCAAATATAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
75a184e7cf5965421466278b1ba86ec8ace37ec2e9eb07dc2879eeb3c8f23193
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7811
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of the Lactococcus lactis subsp. cremoris phage CAP Wegmann,U., Martinez,B. and Escobedo,S. 2007-04-15 — GenBank