Protein

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Genbank accession
XYS96203.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,53
Protein sequence
MSDLIKQHFRATNGLDAGGNKVINVAKADRTVMSDGVNVEYLIQENTIQPWANDRGYPEGFAVTMEKRIWVARTDIPAPIPPAVNTFRQGDWISMRVDPKWEQYSSGTTELLPGTYANIDTRVNPVTLVLPKNKVEQGDTIVIRDIGGKPGINQALIKVQDSAPAMIFQGSILRELMLTRPYSMLLLTFTSAGWYVTLSDLSSLARTIDSTTLDAATNVGAQVQSSEYIVLYYTSNKKLTVRLPRYANHGDMITFSEPEGETPLYHFTIKTYDANSSIGTEGATSWTSKIKGGGVLIYDGPRKVWRINSIDMQQRVKIVTDDVVMQPNEAIAIFGANNSTVKTITVTLPTQVAPGDTVRIGMNYMRKGQTVNIITPPAPAGGTKDRIASTVGLLQFPKRSEYPPEAAWTQVDSLSFNGTSDYPPVLELAYVEATPNNYWIVSENIPTVERVDSTNDTTKARVGVIALATTAQAQATSGHNDDRAITPLTLAQRTATESRTGIAEIATQAEANSTTDDTRIITAKKLNDRLATETMRGVAEIATQDETNGSTVDDRIVTPKKLNGRKATATLDGIIQLVNTGGTPGTSRSDPGTSNGTGVYDHTDFSKAVTPKTLREYKATELASGCVWLATEAEVRNGTPASNNIPTVVTPATLHAKTSTTKDIGLIRIATQPEANAMSNALGDAAITPATLNGRTASYTQTGITRYAIQEEFDGGSLENVAVNPKKIKDYFSRAARMTTRPEAGLAQSGNLWDGWALNIQVPTETQRGTPKIATQALVNAGTDDVDYLTSKKLQAKKGTESAYGIVKYATQADTNAGTANDVAVSPIHLKYVIQTSADWRAQDNVRGTVRVANGAVAWTGNSTTGSDNTPKESNGYAVSPNGLKQALANYLPLNAKADNSGLLNGLTSDQFIRRDIDQTVNGKLTLTKSTDFNSDVNVKGLGNFTGGEVKVFATSSTSNSHVRFLNSDGNERGIIYARPVAAGNSQQLTLRVKGSAPDTGKEFSFGNNGEFVAPDKITSNGTIHSASDVNSNTVYRVKNASVIQLQDSDSVASFGNLAKKGRILTNDASQTQVTDNSGNYVILTTKNKDTILDTRYVKKGGDTMTGSLTINNASVVVNGSENWYKNDTSADTEKYMQPGSWTVEIKNASKLASLRGYMVPVREENPLIPGSMIVTGYEEKTAGGGLLAQFSVSSGYTYQTWTPYPKAGENSEKNYAHTMWTRVYNPLKGKFDEWMRVFTSATPPTAADIGAPSSVSTSVKTLEVQEWIKIGPVKIYPDRTSQTVKFEWVGD
Physico‐chemical
properties
protein length:1292 AA
molecular weight: 139516,35530 Da
isoelectric point:6,85708
aromaticity:0,06966
hydropathy:-0,40163

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
7–130
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1140–1239
IPR048391
XYS96203.1
1 1292
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 7-130 | STR 356-1139 | ATT 1140-1239 | STR 1240-1284 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage HMGUkp2
[NCBI] 		3434165 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Klebsiella sp.
[NCBI] 		576 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYS96203.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV683292 [NCBI]
CDS location
range 84384 -> 88262
strand -
CDS
ATGAGCGACTTAATCAAACAGCATTTTAGAGCAACCAACGGGCTTGATGCTGGTGGAAACAAAGTAATCAACGTCGCTAAAGCCGATCGTACTGTAATGAGCGATGGGGTCAACGTTGAGTATCTTATCCAAGAAAACACCATCCAGCCTTGGGCTAACGACCGCGGGTATCCTGAAGGCTTTGCGGTTACTATGGAAAAACGTATCTGGGTGGCACGTACAGATATCCCAGCCCCGATCCCACCAGCAGTAAATACCTTTAGACAAGGTGATTGGATCTCCATGCGTGTAGACCCGAAGTGGGAACAGTATAGTTCAGGAACCACAGAACTTTTACCAGGGACCTATGCAAACATCGATACCCGAGTTAATCCGGTTACACTAGTTCTTCCTAAAAATAAAGTAGAACAAGGTGATACGATTGTTATTCGTGACATCGGTGGTAAACCCGGTATCAACCAGGCATTAATTAAAGTACAGGACTCTGCGCCTGCTATGATTTTCCAGGGCAGCATTCTTCGTGAACTGATGCTGACTCGTCCTTATAGCATGTTGCTGCTGACGTTTACATCCGCAGGTTGGTATGTAACACTTTCTGATCTGAGTTCTTTGGCCCGTACTATTGATTCTACCACACTAGATGCTGCTACTAATGTGGGTGCTCAGGTACAAAGTTCAGAGTACATTGTACTTTATTACACTTCTAATAAAAAATTAACGGTTCGTCTTCCGCGGTATGCTAACCATGGAGATATGATTACCTTTTCTGAACCGGAAGGCGAAACACCATTATACCATTTTACTATTAAGACTTATGATGCAAATAGTTCTATTGGAACAGAAGGGGCCACGTCTTGGACCTCTAAGATTAAAGGTGGCGGTGTTCTGATTTATGATGGCCCTCGTAAGGTGTGGCGCATCAACTCTATAGACATGCAGCAACGTGTAAAAATCGTTACTGATGATGTAGTGATGCAACCTAACGAAGCTATTGCTATATTTGGTGCTAATAACTCGACTGTTAAAACTATTACTGTTACTTTGCCTACTCAAGTTGCTCCTGGTGATACCGTTAGAATTGGCATGAACTATATGCGCAAAGGACAAACAGTCAACATTATTACTCCTCCTGCTCCGGCTGGCGGTACTAAAGATAGGATTGCATCCACAGTTGGCCTACTTCAGTTCCCTAAACGCTCTGAGTATCCGCCTGAGGCCGCTTGGACCCAAGTTGATAGTTTATCATTCAATGGAACTTCGGACTATCCTCCGGTCCTAGAGTTGGCCTATGTTGAAGCTACTCCTAATAACTACTGGATCGTTTCGGAAAATATCCCTACCGTAGAGAGGGTTGATTCTACCAACGATACGACTAAAGCTCGTGTAGGTGTTATTGCGTTAGCAACTACCGCACAGGCTCAAGCAACCAGTGGGCACAATGATGACAGAGCTATTACTCCGTTAACTTTAGCCCAGCGTACTGCTACAGAGTCTCGTACCGGTATTGCTGAAATTGCTACTCAAGCTGAAGCTAATTCAACAACAGATGATACCCGCATTATTACGGCTAAAAAATTGAATGATCGTTTAGCTACAGAAACTATGCGTGGCGTTGCTGAAATTGCTACTCAAGATGAAACAAACGGTTCTACGGTAGATGACAGGATCGTTACTCCTAAAAAATTAAACGGGCGTAAAGCTACTGCTACGCTAGACGGAATTATCCAGCTGGTTAATACAGGCGGCACACCGGGAACAAGCCGATCAGACCCTGGTACTTCTAATGGTACTGGCGTATACGACCACACTGATTTCTCTAAGGCGGTAACTCCTAAAACTTTACGCGAATATAAAGCTACGGAACTTGCCTCCGGATGCGTGTGGCTTGCTACCGAAGCAGAAGTTCGTAATGGTACTCCAGCGTCTAATAATATTCCGACTGTTGTTACGCCGGCAACATTACATGCTAAAACTTCTACTACAAAAGATATTGGTTTAATCCGTATCGCTACTCAACCTGAAGCCAATGCAATGTCTAATGCTTTAGGTGATGCAGCTATTACTCCAGCAACATTAAACGGACGGACGGCAAGTTATACCCAAACTGGTATTACCCGTTATGCTATTCAGGAAGAATTTGATGGTGGGTCTTTAGAAAACGTTGCAGTGAACCCTAAAAAAATTAAAGATTATTTTTCTCGCGCTGCTCGTATGACGACAAGACCTGAAGCTGGGCTGGCCCAATCCGGAAACTTGTGGGACGGATGGGCCCTTAATATCCAGGTTCCAACAGAAACGCAGCGTGGTACTCCTAAGATTGCAACACAGGCACTTGTTAATGCTGGTACAGACGATGTTGACTATCTGACCTCTAAAAAGCTTCAAGCTAAAAAAGGTACTGAATCCGCATATGGTATTGTTAAATATGCAACCCAAGCCGATACTAACGCCGGCACTGCTAACGATGTAGCCGTTTCTCCGATCCACTTGAAGTATGTTATTCAGACTTCAGCCGATTGGCGTGCACAAGATAACGTTCGCGGTACAGTCCGTGTGGCTAATGGCGCTGTTGCTTGGACCGGTAACAGTACTACAGGTTCTGATAATACACCAAAAGAATCTAACGGATATGCGGTTTCACCTAATGGGCTTAAACAGGCATTAGCTAACTATCTTCCTTTGAATGCTAAAGCTGATAACTCTGGTTTATTAAATGGCCTTACTTCAGACCAATTTATTAGACGTGACATAGATCAAACCGTTAATGGTAAATTGACTCTTACCAAATCTACAGACTTTAATTCAGACGTCAATGTTAAGGGCCTTGGTAATTTTACCGGTGGTGAGGTTAAGGTATTTGCTACTTCGTCTACATCCAATTCTCACGTCAGATTTTTAAACTCAGATGGAAATGAACGTGGAATAATTTACGCTAGACCGGTAGCTGCAGGAAATTCTCAGCAGCTTACGCTACGTGTTAAAGGTTCAGCCCCTGATACAGGTAAAGAATTTTCTTTTGGTAATAATGGTGAGTTTGTTGCACCTGATAAAATAACCTCTAACGGGACAATTCATTCTGCTTCAGATGTTAACTCAAACACCGTATACCGTGTTAAAAATGCTTCAGTAATCCAACTCCAGGATTCTGATAGTGTAGCATCTTTTGGTAATCTTGCTAAGAAAGGAAGAATCTTAACAAACGATGCTAGCCAAACACAAGTTACCGACAACTCCGGAAATTATGTTATTTTAACCACTAAAAATAAGGACACCATTTTAGATACCAGGTATGTTAAAAAAGGTGGCGATACCATGACAGGTTCGTTAACAATAAACAACGCATCTGTTGTTGTTAACGGTTCTGAAAATTGGTATAAAAATGATACCTCTGCTGATACCGAAAAATACATGCAGCCGGGTTCTTGGACAGTAGAAATTAAAAATGCTTCTAAGCTAGCTTCGCTTCGTGGTTATATGGTGCCTGTCAGAGAAGAAAATCCTTTAATTCCTGGTTCTATGATTGTAACCGGCTATGAAGAAAAAACTGCAGGTGGCGGTTTACTTGCCCAATTTAGCGTTTCTTCTGGATACACCTATCAGACTTGGACTCCTTACCCTAAAGCTGGTGAAAATTCAGAGAAAAACTATGCCCACACAATGTGGACTAGGGTTTATAATCCACTTAAAGGCAAGTTTGATGAATGGATGCGCGTATTTACTAGTGCCACTCCTCCTACGGCTGCAGATATCGGTGCTCCGAGTTCAGTAAGTACTTCTGTTAAAACCTTGGAAGTTCAAGAATGGATTAAGATTGGCCCTGTCAAGATTTATCCTGATCGTACTTCTCAGACCGTTAAGTTTGAATGGGTAGGTGATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
c3c45ff1e957708adba664214c54aac5b0e919465931efe02ecb78cb05be1968
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7548
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50