Protein

Genbank accession
QHR67723.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHIRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKAFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNSFQAKQSVVANGEQLTLKTPAGASEAYSAIVGRNANNDKTWAVGNLTRGSLDVHLENSRGSRITLGAIVSVNKALAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTAANQRFAQLVGNNTFRGINNFVGEFNITRDNAVLVVKNATAATGLYLLGQKADGTNKFYLGTDDSDSVVNLHNYTTSTTISLSNVITTTKTVKITGQVQPSDWTNIDSRYISAGTLSNLAKLSDVNTFRIAQIINQNGSLLQLKNTTQDRELYFAGHNADGVRRWYIGNGEPSNPERFVIHNDRTATTIYMKDDFLLNKTVKITGQVQPSDWSNLDARYFLKTKLLNQSLMVRTTNRLEDTASFNKDYSGFVRNNDIEQGLKDLAIHVAHSAGIAHARGIAFTYGSKGLDVFTYAYGSDGEYVGEAQLYSTAFKPTPSDIGAYTKTETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHAHSVSGSTSSAGNHNHSISWIGQNSTHYSGGGGGSIGVGPGYTDANGAHTHSVSGTAASAGNHAHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:781 AA
molecular weight: 83811,77340 Da
isoelectric point:8,53363
aromaticity:0,08195
hydropathy:-0,35032

Domains

Domains [InterPro]
IPR048388
161–248
IPR048388 G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
IPR048388
276–361
IPR048388 IPR048388
QHR67723.1
1 781
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage skuden
[NCBI] 		2696443 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR67723.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850585.1 [NCBI]
CDS location
range 26865 -> 29210
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTCCTTCATATCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCGTCTTTTAAACTAGAAAGATTTGTCCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGAATTGTCAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTATTTGACCCTACAGGTTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGGCTTTTAAAATCAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTTTATCATACTCTTAATAAGCCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGACTTGCTGTTACAAACTCATTCCAAGCTAAACAGAGTGTCGTAGCAAATGGTGAGCAGTTGACACTGAAGACCCCTGCGGGTGCAAGTGAGGCATACTCCGCTATTGTAGGTCGAAATGCCAATAATGATAAAACTTGGGCTGTTGGGAATCTAACTCGAGGAAGTCTTGATGTTCATCTCGAAAACAGCAGAGGTTCAAGAATCACTCTAGGTGCAATTGTGTCTGTTAATAAGGCTCTCGCTATTACTGGACAGGTTCAACCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGCAGCTAATCAGAGATTTGCGCAGCTAGTTGGCAATAACACCTTCAGGGGTATTAACAATTTTGTAGGAGAGTTCAATATCACCAGAGATAACGCTGTGCTAGTCGTTAAGAATGCCACTGCTGCAACTGGACTGTACTTGCTGGGGCAGAAGGCTGATGGGACAAACAAGTTCTACTTAGGGACTGATGACTCTGATTCTGTAGTCAACCTACATAACTACACCACGAGTACAACTATCTCTTTGTCAAATGTGATTACCACTACTAAGACTGTGAAAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTGGACTAACATTGACTCTAGATACATCTCAGCAGGAACTTTGAGCAATCTTGCTAAGTTAAGTGATGTAAACACTTTTAGGATTGCACAGATTATTAATCAGAATGGCTCATTGTTACAGCTAAAGAATACTACACAAGACAGAGAGCTATACTTTGCTGGTCATAATGCTGATGGTGTTAGAAGGTGGTACATTGGGAATGGGGAACCATCCAACCCAGAAAGATTTGTTATCCATAACGACAGAACCGCAACTACGATTTATATGAAAGATGATTTCTTGTTGAATAAAACTGTCAAAATCACTGGTCAAGTGCAGCCTTCTGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATATTTCTTAAAAACAAAACTGCTAAACCAATCTTTAATGGTAAGGACAACTAATAGGTTGGAGGACACAGCGTCATTCAATAAAGATTATTCAGGGTTTGTAAGAAATAACGATATTGAGCAGGGTCTGAAAGATTTAGCCATCCATGTAGCACACTCTGCTGGCATTGCTCATGCCAGAGGTATTGCTTTTACATATGGGTCTAAAGGTCTTGATGTCTTCACATATGCTTATGGGTCAGATGGAGAATATGTTGGAGAGGCACAGTTGTATTCAACGGCATTTAAACCAACCCCTTCAGATATTGGTGCATACACTAAAACTGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTCAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGACTCTGTGACGTTAGCTGTTGGGAACTTGCCTTCACACACTCACAGTTTTTCTGCTACCACTTCATCTTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACGCTCACTCTGTAAGTGGCTCTACTTCATCTGCTGGTAACCACAACCATTCCATTTCGTGGATTGGTCAGAACTCTACACACTACTCTGGTGGTGGTGGTGGTAGTATTGGTGTAGGACCGGGTTACACCGATGCTAACGGTGCTCACACCCACTCTGTAAGTGGTACTGCCGCTTCTGCTGGTAACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGCCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
0a31359635be466e34d2fa410eb762300e5ffc308ef8f70fe964542c3b70a3a6
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6578
Evidence 0,6578
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank