Protein

View in Explore
Genbank accession
QHR67723.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHIRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKAFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNSFQAKQSVVANGEQLTLKTPAGASEAYSAIVGRNANNDKTWAVGNLTRGSLDVHLENSRGSRITLGAIVSVNKALAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTAANQRFAQLVGNNTFRGINNFVGEFNITRDNAVLVVKNATAATGLYLLGQKADGTNKFYLGTDDSDSVVNLHNYTTSTTISLSNVITTTKTVKITGQVQPSDWTNIDSRYISAGTLSNLAKLSDVNTFRIAQIINQNGSLLQLKNTTQDRELYFAGHNADGVRRWYIGNGEPSNPERFVIHNDRTATTIYMKDDFLLNKTVKITGQVQPSDWSNLDARYFLKTKLLNQSLMVRTTNRLEDTASFNKDYSGFVRNNDIEQGLKDLAIHVAHSAGIAHARGIAFTYGSKGLDVFTYAYGSDGEYVGEAQLYSTAFKPTPSDIGAYTKTETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHAHSVSGSTSSAGNHNHSISWIGQNSTHYSGGGGGSIGVGPGYTDANGAHTHSVSGTAASAGNHAHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:781 AA
molecular weight: 83811,77340 Da
isoelectric point:8,53363
aromaticity:0,08195
hydropathy:-0,35032

Domains

Domains [InterPro]
DC_1566
STR
60–781
DC_1566
IPR048388
ATT
161–248
IPR048388 G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
IPR048388
ATT
276–361
IPR048388 IPR048388
QHR67723.1
1 781
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 60-160 | ATT 161-248 | STR 249-275 | ATT 276-361 | STR 362-381 | ATT 382-467 | STR 468-781
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage skuden
[NCBI] 		2696443 Uroviricota > Caudoviricetes > Andersonviridae > Felixounavirus > Felixounavirus skuden
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR67723.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850585.1 [NCBI]
CDS location
range 26865 -> 29210
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTCCTTCATATCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCGTCTTTTAAACTAGAAAGATTTGTCCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGAATTGTCAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTATTTGACCCTACAGGTTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGGCTTTTAAAATCAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTTTATCATACTCTTAATAAGCCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGACTTGCTGTTACAAACTCATTCCAAGCTAAACAGAGTGTCGTAGCAAATGGTGAGCAGTTGACACTGAAGACCCCTGCGGGTGCAAGTGAGGCATACTCCGCTATTGTAGGTCGAAATGCCAATAATGATAAAACTTGGGCTGTTGGGAATCTAACTCGAGGAAGTCTTGATGTTCATCTCGAAAACAGCAGAGGTTCAAGAATCACTCTAGGTGCAATTGTGTCTGTTAATAAGGCTCTCGCTATTACTGGACAGGTTCAACCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGCAGCTAATCAGAGATTTGCGCAGCTAGTTGGCAATAACACCTTCAGGGGTATTAACAATTTTGTAGGAGAGTTCAATATCACCAGAGATAACGCTGTGCTAGTCGTTAAGAATGCCACTGCTGCAACTGGACTGTACTTGCTGGGGCAGAAGGCTGATGGGACAAACAAGTTCTACTTAGGGACTGATGACTCTGATTCTGTAGTCAACCTACATAACTACACCACGAGTACAACTATCTCTTTGTCAAATGTGATTACCACTACTAAGACTGTGAAAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTGGACTAACATTGACTCTAGATACATCTCAGCAGGAACTTTGAGCAATCTTGCTAAGTTAAGTGATGTAAACACTTTTAGGATTGCACAGATTATTAATCAGAATGGCTCATTGTTACAGCTAAAGAATACTACACAAGACAGAGAGCTATACTTTGCTGGTCATAATGCTGATGGTGTTAGAAGGTGGTACATTGGGAATGGGGAACCATCCAACCCAGAAAGATTTGTTATCCATAACGACAGAACCGCAACTACGATTTATATGAAAGATGATTTCTTGTTGAATAAAACTGTCAAAATCACTGGTCAAGTGCAGCCTTCTGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATATTTCTTAAAAACAAAACTGCTAAACCAATCTTTAATGGTAAGGACAACTAATAGGTTGGAGGACACAGCGTCATTCAATAAAGATTATTCAGGGTTTGTAAGAAATAACGATATTGAGCAGGGTCTGAAAGATTTAGCCATCCATGTAGCACACTCTGCTGGCATTGCTCATGCCAGAGGTATTGCTTTTACATATGGGTCTAAAGGTCTTGATGTCTTCACATATGCTTATGGGTCAGATGGAGAATATGTTGGAGAGGCACAGTTGTATTCAACGGCATTTAAACCAACCCCTTCAGATATTGGTGCATACACTAAAACTGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTCAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGACTCTGTGACGTTAGCTGTTGGGAACTTGCCTTCACACACTCACAGTTTTTCTGCTACCACTTCATCTTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACGCTCACTCTGTAAGTGGCTCTACTTCATCTGCTGGTAACCACAACCATTCCATTTCGTGGATTGGTCAGAACTCTACACACTACTCTGGTGGTGGTGGTGGTAGTATTGGTGTAGGACCGGGTTACACCGATGCTAACGGTGCTCACACCCACTCTGTAAGTGGTACTGCCGCTTCTGCTGGTAACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGCCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
0a31359635be466e34d2fa410eb762300e5ffc308ef8f70fe964542c3b70a3a6
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6578
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank