Protein

Genbank accession
YP_010669719.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,89
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MNTSPTIRLKRSLTAGSVPSLEQLTYGELAINHYDGTVFVRQDTEGVGISTRVVTVGAGKSIGNTWFVTGAGDDLNSGLSQQDALASIKQASIYAQPGDTIKVSAGYYVENNPIVLRDNVSVEGFELRNCFVAPNNPNQDLFHINNACHLTDLAFVGKGADIGGGSKGVPSGGSEPGFLGEPMEYGKAVVAFVPLLGVAXDRYFDGARLIRQNADYIAGEAVGFLTSGFSGIAGSHRAQDAARLIDLNAEYIAAEAVGFITSVNYAGGAFTMSFGTARNCQDDIHDVLEAVAHDLRAGYKDGTQANSRSVGAAQSYFVGGALSHILGAGVSEATIAAMDRAAGIATFVINNKPYGFENVGSGVTITAFEYTPLTGVSTVTTLIGHGLSTTDHVSLAGLAFTCDTEHSGVTTTIFPDGSSPSGHIFKIDADALFNSNQFVINVGISTIAHSYTPSSGTATTVFQYSTFEQQFDTGAAAGTPLRGENVVGNGICLNVNNDITELVGIVTSAIGAGNTDSLPGITTGMRLDQNKCRRDVAKIWKSVCYDITRGGNTKVVGAGKSYYDANGNKLSILVDPDEFEQSVIALEYSKDIARRIVNNVRDGSYTIGTAFSISGANYSPTAGILTVTTNVGHGLTAKDTVKLSGLAFSCATHNNSIGVYDFQYDRQSGFSTVILDNDHGLSSGDEFELRNLTFSCGDSGLGPVVNVSNVVYDENVGIITVTTSSASGVFAGEPVQLKNIAFTCAAEHAGVTTTIFPDGSSQNNINGYGYDVFTVLAVNSATEFQVNVGPSTIAHTYDTGGTVQAGVTTTVFPDVQSNDYVFDAYVGTAGTVIYTNVGISTIEHTYASGGEVRIGVTTTIFPNGGVFGDCFEVQDYVSDTQVKINVGISTFLHVYESGGTIQKTRTFRPDIGQIRDVSIQIDSDTGNNNTVGNCKNVISAMNTAVGIATAIIEDGLRTLQEPLYLTPTSAGYNPSNGELQFTLVGHGLTTGDKIKVAPNSIVFTCGSDGNITQIGYPDKTSPIYDKFTQIKSYTSDTFTIDVGISPETSTHTFVSAATSAVNYGGAGISTRFPGNDGLGSDFENDVSFSPGTDGPVLKGPYIRNCTNFIENSIGMRIDGFDADPGDKDELGVQGSMSVDSFTQYNQGGIGVSITNGAYAQLVSIFTICCNEAIVTLSGGQCDLTNSNSSFGEFGLVSKGVGDETSSSNYRQTAEVVKPGNPGRTVEQGVYDIGDKKVVLTGVGTQRPYDGQTLFFDELYYSVEKVKVTNGGSGYQGAVPSVTFSDPSGPDGITAQGIPIIEDGVVTDFLVANSGTQYQVDSFPSITIGPPPSGGTQATAEVQRMQPLYFKVASATLPHNGISTITMSQGLNNDLTGGEVAYITRQSLQITSSHSFEYVGAGNTILTARPSVGGIIIQDNEVVQEDGGLVVYTSTDQAGNFRIGDGIQIDQATGTISGRVYIKSLFNSVTPFILALGGN
Physico‐chemical
properties
protein length:1478 AA
molecular weight: 154731,36890 Da
isoelectric point:4,57607
aromaticity:0,08531
hydropathy:-0,05037

Domains

Domains [InterPro]
IPR011050
77–160
IPR011050
YP_010669719.1
1 1478
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-SCSM1
[NCBI] 		2588487 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010669719.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_070962 [NCBI]
CDS location
range 35707 -> 40143
strand +
CDS
ATGAATACAAGTCCAACAATTAGGTTAAAAAGATCTCTAACTGCGGGATCTGTTCCTAGTCTAGAACAGTTAACTTATGGTGAGTTAGCTATTAACCATTATGATGGTACGGTGTTTGTTCGTCAAGATACTGAGGGTGTAGGAATCTCAACTAGAGTTGTTACAGTCGGTGCTGGTAAAAGTATTGGTAATACTTGGTTTGTTACTGGTGCTGGTGATGATTTGAATAGTGGTTTATCTCAACAAGATGCTTTAGCATCTATTAAACAAGCATCCATATATGCACAACCTGGTGACACTATTAAAGTGTCTGCAGGTTACTATGTAGAAAATAATCCAATTGTACTTAGGGATAATGTATCTGTTGAAGGATTTGAACTAAGAAACTGTTTCGTTGCTCCAAATAACCCAAATCAAGATTTATTTCATATCAATAATGCTTGCCATTTAACGGATTTGGCATTTGTTGGTAAAGGTGCTGATATTGGTGGTGGTTCTAAAGGTGTTCCTTCTGGTGGATCGGAACCAGGATTCCTCGGTGAACCAATGGAATATGGGAAAGCAGTTGTTGCTTTCGTTCCATTACTAGGTGTTGCTRCAGATAGATATTTCGACGGTGCAAGATTAATTCGTCAGAATGCAGATTATATTGCTGGTGAAGCCGTTGGTTTTCTCACCAGTGGATTTAGTGGTATTGCTGGATCTCACAGAGCACAGGATGCTGCAAGACTTATTGATCTAAACGCAGAATATATTGCAGCAGAAGCAGTAGGATTTATCACCAGTGTCAACTATGCTGGTGGTGCATTTACAATGTCCTTTGGTACAGCAAGAAATTGCCAAGATGACATTCATGATGTACTAGAAGCAGTTGCTCACGATCTAAGAGCAGGATATAAAGATGGTACTCAAGCAAACAGCAGATCTGTAGGTGCTGCACAATCTTACTTTGTTGGTGGAGCATTATCTCATATCTTAGGTGCTGGTGTTTCTGAGGCAACAATTGCAGCAATGGATCGTGCTGCTGGTATTGCAACCTTTGTTATCAATAACAAACCATATGGATTTGAAAATGTTGGTTCTGGTGTAACTATTACTGCATTTGAGTATACACCACTTACTGGTGTTTCAACTGTAACAACATTGATTGGTCATGGATTAAGTACTACTGATCACGTTTCACTTGCTGGACTTGCATTTACTTGTGATACTGAGCATTCTGGTGTAACAACTACCATTTTCCCTGACGGAAGTAGCCCTTCTGGACATATCTTCAAGATTGATGCTGATGCATTATTTAATAGCAATCAATTCGTTATTAATGTAGGTATCTCTACAATTGCACATAGTTATACCCCAAGTTCTGGTACTGCTACTACAGTTTTTCAATATAGCACTTTTGAGCAGCAGTTTGATACTGGTGCTGCTGCAGGAACTCCACTTCGTGGTGAAAACGTTGTAGGAAATGGAATTTGCCTCAACGTCAATAATGACATTACAGAACTAGTAGGAATTGTAACCAGTGCAATTGGTGCAGGTAATACTGATAGTCTTCCAGGAATTACAACTGGTATGAGACTGGATCAGAATAAGTGCCGTCGTGATGTTGCAAAAATTTGGAAGTCTGTTTGTTATGATATTACCCGTGGTGGTAATACAAAGGTCGTTGGTGCAGGTAAGTCTTACTATGATGCTAATGGAAATAAACTTTCAATTCTCGTCGATCCCGATGAATTTGAACAGTCTGTTATTGCACTAGAATATTCTAAGGATATTGCAAGAAGAATCGTTAACAACGTAAGGGATGGTTCTTATACTATTGGAACCGCATTTAGTATTAGTGGAGCAAATTATTCTCCAACAGCAGGTATTCTTACTGTTACTACTAACGTTGGACATGGTTTAACAGCAAAAGATACCGTTAAACTTTCTGGTCTTGCATTTAGTTGTGCTACTCACAATAACAGCATTGGTGTTTACGACTTCCAGTATGATAGACAGTCTGGATTCAGCACTGTCATTCTAGATAATGATCATGGACTAAGTTCTGGAGATGAGTTTGAGCTACGCAACCTCACATTTAGTTGTGGTGATTCTGGTCTTGGACCAGTAGTAAACGTTAGTAATGTGGTATATGATGAGAACGTAGGTATTATTACTGTTACGACTTCATCAGCATCTGGTGTTTTTGCGGGTGAACCAGTACAACTTAAAAATATTGCGTTTACTTGTGCTGCAGAACATGCTGGTGTTACGACAACTATTTTCCCAGATGGTTCAAGTCAGAATAATATTAATGGATATGGATATGATGTATTTACAGTCCTTGCAGTAAATAGTGCAACAGAATTCCAAGTCAATGTTGGACCTTCAACAATTGCACACACATATGATACTGGTGGTACTGTACAAGCAGGTGTTACAACTACAGTATTCCCAGACGTTCAAAGCAATGATTATGTCTTTGATGCTTATGTAGGAACTGCAGGAACAGTCATCTACACTAATGTAGGTATTTCTACAATTGAGCATACTTATGCTTCTGGTGGTGAAGTAAGAATTGGTGTCACTACAACAATCTTCCCTAACGGTGGAGTATTTGGTGATTGTTTTGAAGTTCAGGATTATGTATCTGACACTCAAGTTAAAATTAATGTTGGTATATCAACATTCCTCCATGTTTATGAAAGTGGTGGCACTATTCAAAAGACAAGAACCTTCAGACCAGATATTGGTCAGATTAGAGACGTAAGCATTCAAATTGATTCTGATACGGGTAATAATAATACTGTTGGTAACTGTAAGAACGTTATCTCTGCAATGAACACTGCAGTTGGTATTGCCACAGCAATTATTGAAGATGGTCTCAGAACACTTCAAGAACCTCTCTATCTAACTCCAACAAGTGCAGGATACAATCCATCAAATGGTGAATTGCAATTCACTTTAGTGGGTCATGGATTAACTACTGGAGACAAAATTAAAGTTGCTCCAAATTCTATAGTATTTACTTGTGGTTCTGATGGAAATATTACTCAAATTGGATATCCAGACAAAACAAGTCCAATTTATGATAAATTTACACAAATAAAATCTTATACCTCAGATACTTTCACAATTGATGTTGGAATTTCACCAGAAACTTCTACTCATACATTTGTTTCTGCAGCAACTTCTGCAGTGAACTATGGTGGTGCTGGTATTTCTACAAGATTCCCAGGAAATGATGGATTAGGTTCTGACTTTGAGAATGATGTATCTTTCTCTCCTGGTACTGATGGTCCAGTTCTAAAGGGTCCTTATATTAGAAACTGTACTAACTTCATTGAAAACAGCATCGGTATGAGAATCGATGGATTTGATGCTGATCCTGGTGATAAGGATGAACTAGGTGTACAAGGATCAATGAGTGTTGACTCATTCACTCAATACAATCAGGGTGGTATCGGAGTATCCATCACAAACGGTGCATATGCTCAGTTGGTGTCTATCTTCACCATCTGCTGTAATGAGGCAATTGTAACCCTCTCTGGTGGTCAGTGTGACCTTACAAACTCCAACTCTTCATTCGGTGAGTTTGGTCTAGTTTCTAAGGGTGTTGGTGATGAGACTTCTAGCTCTAACTATAGACAAACTGCTGAAGTTGTAAAACCAGGTAATCCTGGAAGAACAGTTGAACAGGGTGTTTATGATATTGGTGATAAAAAGGTTGTTTTGACTGGTGTTGGAACTCAAAGACCTTATGATGGTCAGACCCTATTCTTTGATGAACTTTACTACTCTGTAGAAAAAGTTAAAGTTACAAATGGGGGATCTGGATATCAAGGTGCTGTACCATCAGTTACATTTAGTGATCCATCAGGTCCAGATGGAATTACTGCACAGGGTATTCCAATTATTGAAGATGGTGTCGTTACCGACTTCCTAGTTGCTAACTCTGGAACACAATATCAAGTCGATTCTTTCCCATCAATTACAATTGGACCACCTCCTTCTGGTGGAACTCAGGCAACTGCTGAAGTTCAAAGAATGCAACCACTATACTTTAAGGTTGCTTCTGCAACACTCCCCCATAATGGAATCTCAACTATCACAATGAGTCAGGGACTAAATAATGATTTAACAGGTGGTGAAGTTGCATATATAACTCGTCAGAGTTTGCAAATTACATCCTCTCACTCATTTGAATATGTTGGTGCGGGTAATACAATCCTCACCGCAAGACCTTCAGTTGGAGGTATCATTATTCAAGATAATGAAGTTGTTCAAGAAGATGGTGGTCTCGTAGTTTATACAAGTACGGACCAAGCAGGTAACTTCAGGATTGGTGATGGTATTCAAATTGACCAAGCAACTGGAACCATCTCTGGTCGTGTTTATATTAAATCATTGTTCAACAGCGTTACACCATTCATTCTAGCACTCGGAGGAAACTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genomic and proteomic characterization of cyanophage S-SCSM1 provides new insights into understanding the viral gene diversity and phage-host interactions Wang,Q., Xu,Y., Jiao,N. and Zhang,R. 2022-10-26 — GenBank