Protein

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Genbank accession
QBX15959.1 [GenBank]
Protein name
tail assembly protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MSKNNVRIAIRDSTDSHSVGFFDNVAGIKYKKAEIQRFLAGSASILTLQYNSKDIDTIRTGCKLAFRYKARDYWLNIMKFEKQGFEVEITACSLHLELNNEERGAHKPDKAMSFAEYLAYYDPEHSVTLGINQVSDKRIKLEWTGTDTILARLFSIANSFDTELEFVTELNDDYSLKRHVLNVYKKGNLGSNKTSSPVRVGKELKVINYSDSIEDLRTAVRATGKDGLTIDGLNKKIYDDNKQLLYYSSGNTVYAPQSRDRFPSVGQASNDNWLVKDLGETEYETKEGLWGYMYGEIQKICLPKIEYKVTGAIDSDVGDTQTLIDDVHYEPPLYLKARVSELTDDILQGKVIDSTFINFERQYSQIADSLLKQVEALAEDAAPYIVRLSTDNGYNFKNGQGTSTITAKLEKYSKIVNANWKWLINNSIVSETSSVTINASQVVGTLNVVAVASVDGNEVAREYITFTNSDDGVGIKSIKRYYTTNDQAEGVTAGGQNWSTKPTTVTADKNYMWSYDVITYTNDTSLVTEPAVIGARGDDGLDADTTGITEALDKAKQELTALSANIEKVRDDSLAAVEEAKQQLTAVANDLSTAKQDLQAQASQLTAQASAQSELTKRVSTVEETANGTKSTVSELTKTVAQNGKDITSVTARTKVVEDDLTSTKTTLSQVQTTADSTSQKTATLETGLNGLNAKFETLKIGSRNYFKNSKSRKYYINSTETQDVRTYIDDEFWQNDTRFTKNYVRMSFDIAFNPALPSNFTTNVHFSASPWYNCGGITFKGGTTALQHFDLKFDLSGASKSYKTDNVFIRLNNTLPLNTAVSLENFNLYLSAVVEDYNQNEADIESKVAEYRQTAEQNYASLQSNLQTLDGTVKQNKSEFDQTASQIKSSISAVEGKASELDGDITKLNTTLTQTANGLEQLSTQVTSQGNTITSHTNSINSLSTGLSAKVSQTDFNTLSGRVTTAENNITAKANELSSKISSVEGKIPTRNDFRNLYIIANSSAGYIQANNASVLGTQDSVFKEWTSDYIPVSAGEKYTFQTWVTLTGSQQGWRAWQFYNEDKSLNGGRWAATYSSDQQAQHVITIPANAKYLRVSARLYSDGKIMVEKGDTYQNYALAPEDYDSKLASAQSEIKQTTDSIKASVSALDSSTVKTATLNLDNNGFVTKVGKTVNGNTFATMIAQNESDVQIIAKKMKVSGDMIVNGAITAEKLNINSLSALSADLGDVTSGSITNSFVDYTRSGTIKIDNSITIDTKDTSATVANKANQHIKMNSSGFALTAENSNNTPAYSMQIMPESINFNKLDYDTTRGGTSGWSLTHNGYYSMLQVDMVWQNVRLNNTSNLMYGIGANYVRIGNLVTISINRQISNIAVVAENEIASEKIPEGFRPISQAHLVLVGGTNKSIDATCIVHLNPDGSIGFTNNKTGNHVWSGTVTYTCVEPMPYVKDLNNGSTI
Physico‐chemical
properties
protein length:1458 AA
molecular weight: 160201,91560 Da
isoelectric point:5,28747
aromaticity:0,08230
hydropathy:-0,44520

Domains

Domains [InterPro]
DC_0690
STR
2–694
DC_0690 DC_0855
PTHR45615
Unmapped
551–992
PTHR45615 DC_0578
Coil
Unmapped
552–572
Coil Coil Coil G3DSA:1.20.5.340
QBX15959.1
1 1458
Architecture
STR
STR
RBD
STR 2-694 | STR 803-1296 | RBD 1297-1447 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage Javan227
[NCBI] 		2548056 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Streptococcus gallolyticus
[NCBI] 		315405 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX15959.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK448707 [NCBI]
CDS location
range 33751 -> 38127
strand +
CDS
TTGAGTAAAAATAATGTACGTATTGCGATTCGTGATTCAACAGATAGCCACAGCGTTGGCTTCTTCGATAACGTGGCAGGTATTAAATACAAGAAAGCGGAAATACAGCGATTTCTGGCAGGTTCTGCTAGTATTTTAACACTACAATACAATTCAAAAGACATTGACACAATTCGTACTGGTTGCAAACTAGCTTTTCGCTATAAAGCTCGTGACTACTGGCTTAACATCATGAAGTTTGAAAAACAAGGCTTTGAAGTCGAAATCACAGCTTGCTCATTGCATTTAGAGTTAAACAATGAAGAACGAGGAGCGCACAAACCAGATAAGGCAATGTCATTCGCTGAATATTTAGCTTATTATGACCCTGAACATTCCGTAACACTCGGCATCAATCAAGTGTCAGATAAGAGAATTAAATTAGAGTGGACGGGTACAGACACGATTCTGGCACGTCTATTTTCGATTGCCAACAGCTTTGACACAGAGCTTGAATTTGTTACAGAATTAAACGACGACTATTCTTTGAAACGTCATGTATTGAACGTCTATAAGAAAGGTAACCTTGGTTCAAACAAAACAAGCAGCCCAGTCCGTGTTGGTAAAGAGCTTAAGGTTATCAATTACAGTGATAGCATTGAGGATTTGCGCACGGCTGTACGCGCAACTGGTAAAGACGGTTTAACTATCGATGGATTAAATAAGAAAATCTATGATGATAATAAACAGCTTCTTTATTATTCAAGTGGCAATACAGTTTATGCGCCACAATCTCGTGACCGTTTCCCGTCCGTCGGTCAAGCTTCAAACGATAACTGGCTTGTTAAAGATTTAGGCGAGACGGAATATGAGACTAAAGAGGGCTTGTGGGGCTACATGTATGGAGAAATCCAAAAAATCTGTTTGCCCAAAATTGAGTATAAAGTGACTGGTGCGATTGATAGTGATGTCGGTGACACACAAACACTCATTGATGACGTGCATTATGAACCGCCACTTTATTTAAAAGCTCGTGTGTCAGAGTTAACAGACGACATATTGCAAGGCAAGGTCATTGATTCAACGTTTATCAATTTTGAGCGACAATACAGTCAAATCGCAGACAGCTTATTAAAACAGGTCGAAGCACTCGCAGAGGACGCAGCGCCTTACATTGTTCGTTTATCAACTGATAATGGCTACAATTTTAAAAACGGTCAAGGTACAAGCACAATCACAGCTAAGCTTGAAAAGTATAGCAAGATTGTTAATGCAAATTGGAAATGGCTTATCAATAACAGCATTGTCAGCGAGACATCAAGTGTTACAATCAACGCTAGTCAAGTTGTCGGTACGTTGAATGTCGTGGCTGTTGCAAGCGTTGACGGCAACGAGGTAGCTCGTGAGTATATCACATTCACTAATTCTGATGACGGTGTTGGTATTAAATCAATCAAACGTTATTACACGACTAACGACCAAGCAGAGGGCGTCACGGCTGGCGGTCAAAACTGGTCTACCAAACCAACGACTGTCACAGCAGACAAAAATTATATGTGGTCGTATGATGTCATTACGTACACGAATGACACAAGTTTAGTAACAGAACCAGCTGTTATCGGCGCTCGTGGTGATGACGGCTTGGACGCTGACACGACTGGCATCACAGAAGCGCTTGACAAAGCTAAGCAAGAATTGACTGCTTTGTCAGCAAATATCGAGAAAGTTCGAGATGATTCGCTTGCAGCAGTCGAAGAAGCCAAACAGCAACTCACCGCAGTAGCTAATGACTTGAGCACCGCTAAGCAAGACTTGCAAGCACAAGCTAGTCAGTTGACTGCACAAGCTAGCGCACAGTCTGAACTAACCAAACGTGTGTCAACAGTCGAAGAAACCGCAAACGGTACGAAGTCGACTGTCAGCGAGTTAACTAAAACAGTAGCTCAAAATGGTAAAGATATTACTAGCGTTACTGCACGAACTAAAGTAGTTGAAGATGACTTGACGAGCACGAAAACAACATTGTCACAAGTTCAAACGACTGCGGACAGTACCAGTCAAAAAACAGCTACTTTAGAAACTGGTTTGAATGGACTTAATGCGAAGTTTGAAACTTTGAAAATCGGTAGTCGAAACTACTTCAAAAATTCAAAATCACGTAAATACTATATTAATAGTACAGAAACACAAGACGTCAGAACTTATATTGATGATGAATTTTGGCAAAATGATACTCGTTTTACTAAAAACTACGTGAGAATGTCTTTTGATATTGCTTTCAATCCAGCTTTGCCATCAAATTTCACAACGAATGTGCATTTTAGTGCTAGCCCTTGGTATAACTGCGGTGGCATTACATTCAAAGGTGGCACAACTGCTTTACAACACTTTGATTTGAAGTTTGATTTGAGTGGTGCTAGCAAGAGCTATAAAACGGATAATGTATTTATTCGTTTAAATAATACACTTCCACTTAATACAGCTGTAAGTCTTGAAAACTTTAATCTCTACTTATCTGCGGTAGTTGAAGACTATAACCAAAATGAAGCCGACATTGAATCGAAAGTTGCAGAGTACAGGCAGACTGCAGAGCAAAACTACGCAAGCTTGCAGTCCAACTTACAAACATTAGACGGTACGGTTAAGCAGAATAAGTCAGAGTTCGACCAAACAGCTAGCCAGATTAAAAGCAGTATTTCAGCAGTTGAGGGGAAAGCTAGTGAGTTGGATGGCGACATCACTAAGCTAAACACAACACTAACTCAAACTGCAAATGGTCTTGAACAGCTAAGTACGCAAGTAACGTCACAAGGAAACACAATTACATCACACACTAACTCGATTAATTCATTATCAACTGGTTTAAGTGCCAAAGTCTCACAGACCGATTTCAATACGCTGTCTGGTCGTGTGACAACTGCTGAAAACAACATTACAGCTAAAGCTAACGAATTAAGCAGTAAGATTAGTAGTGTTGAGGGTAAGATACCGACAAGAAATGATTTTAGAAACTTGTATATTATCGCGAATTCAAGCGCTGGTTATATTCAAGCGAATAATGCGAGTGTTTTAGGTACGCAAGATAGTGTGTTTAAAGAATGGACTTCTGATTACATTCCTGTTAGTGCAGGCGAAAAGTATACTTTTCAAACGTGGGTGACGTTGACCGGAAGTCAGCAAGGCTGGCGAGCATGGCAATTTTATAATGAAGATAAATCATTGAACGGTGGCCGCTGGGCAGCTACCTATTCAAGCGACCAGCAGGCGCAACACGTTATTACAATACCGGCAAACGCAAAATACTTGCGTGTTTCAGCAAGGCTTTATAGCGATGGAAAAATTATGGTTGAAAAAGGTGATACCTACCAAAATTATGCGTTAGCACCCGAAGACTACGATAGCAAGCTAGCCAGCGCCCAATCTGAAATCAAACAGACGACTGATTCAATCAAAGCTAGCGTGTCTGCGCTGGATAGTTCGACGGTTAAAACGGCAACACTTAATCTTGACAACAATGGCTTTGTGACAAAAGTCGGTAAAACGGTAAACGGAAATACTTTCGCGACAATGATTGCGCAAAATGAATCAGACGTGCAAATTATCGCCAAGAAAATGAAAGTTAGCGGTGACATGATTGTAAATGGTGCGATTACAGCAGAGAAGCTAAATATCAATAGTTTGTCTGCGTTGAGTGCTGACCTTGGCGATGTGACATCTGGGTCTATTACCAATTCATTCGTTGACTATACTCGAAGCGGCACGATTAAGATTGATAATAGCATTACGATTGACACCAAAGACACGTCAGCAACTGTCGCTAATAAGGCTAATCAACACATTAAAATGAATAGTTCTGGTTTTGCGTTGACTGCCGAGAACTCAAACAATACACCTGCTTACTCAATGCAGATTATGCCAGAATCTATCAACTTTAATAAGCTGGACTACGACACAACTCGTGGTGGCACGAGTGGTTGGAGCTTGACGCATAACGGCTACTACTCAATGCTGCAAGTAGACATGGTTTGGCAAAATGTGCGACTTAACAATACCTCGAATTTGATGTATGGTATTGGCGCCAATTATGTCAGAATTGGTAATTTAGTAACAATTTCAATCAATCGCCAAATCAGCAATATTGCTGTTGTCGCCGAAAACGAAATAGCGAGCGAAAAAATCCCAGAAGGTTTTAGACCAATTTCACAAGCTCATCTTGTGTTAGTCGGTGGTACCAATAAATCGATTGACGCAACTTGTATTGTGCATTTAAATCCAGACGGTTCAATCGGTTTTACGAATAATAAAACCGGCAATCATGTTTGGTCTGGTACGGTCACTTATACCTGTGTTGAGCCTATGCCTTACGTTAAAGACTTAAATAATGGTTCTACAATTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
889eedca3984e68a264e7156eba7b054d09f3a159776674e6a22e640593c4107
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7674
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50