Protein
- Genbank accession
- QHR74520.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fibers protein
- RBP type
-
TSPTFTFTF
- Protein sequence
-
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKAFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNTFSRNQNIQSDGNALRLRNQIANNAQYIEGVNLDGSARWWVGIGSNGEDAVSLYNSKYNSAVIVASNISVNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTAANQRFAQLVGNNTFSGLNTFSNNVNVNSDGAAIILKNKTANDTLFILARDSENNNLWYIGKGDVTSNITIYDYNGDTSIKLNASGVTFNKGVKITGQVQPSDWTNIDSRYVLIGSYANLAKKNEANTFTLQQNIQSDGEALRIYSKAQNNSSYIVGKNTDNTNKWFIGCGTNGSGTASFHNYLTGARLDLADEILLSKSLQITGQVKPSDWSNLDARYFTQSAANQRFMVAGSTGEATEQNADGVAWNAKTGLYNVTSPNGDYTSLVFQMYQGVSSSTACAQLKFQYKNGGMWYRTSVDSKGFEAKWSKVYTEAQKPTPSELGAYTKAETNQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFYATTSSFDYGTKNTNTTGAHTHSVSGSTSSAGHHNHAISWIGQNSTHYSGGGGGRIGTGPGYTDGGGDHTHSVSGTATSAGDHAHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 783 AA molecular weight: 84087,51890 Da isoelectric point: 8,14199 aromaticity: 0,09068 hydropathy: -0,43448
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage warpig [NCBI] |
2696461 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR74520.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850637.1
[NCBI]
CDS location
range 79437 -> 81788
strand +
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGTTGGGCGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTAGAAAGGTTTGTCCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGAATTGTCAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTGTTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGGCTTTTAAAATCAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACCGTTTATCATACTCTGAATAAGCCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGGTTGGCTGTAACAAACACATTCTCTAGAAATCAGAACATTCAAAGTGATGGTAATGCACTTCGCCTTAGAAACCAGATTGCAAATAATGCACAATACATTGAGGGTGTAAACCTAGATGGTTCAGCTAGATGGTGGGTTGGTATTGGTAGCAATGGCGAGGATGCAGTAAGCCTGTATAACAGCAAATACAACTCAGCAGTGATTGTTGCAAGCAATATCTCTGTTAATAAGTCTTTAGCAATCACTGGTCAAGTTCAGCCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGCAGCTAATCAGAGATTTGCGCAGTTAGTTGGTAATAATACCTTCAGTGGTTTAAACACATTCAGTAATAATGTTAATGTGAACTCTGATGGTGCTGCTATCATTCTAAAAAATAAAACGGCCAATGATACTCTGTTCATCCTAGCAAGAGACAGTGAAAACAATAATTTGTGGTATATTGGTAAAGGTGATGTAACCTCTAATATCACGATTTATGATTATAATGGTGACACTTCTATTAAATTAAACGCGTCTGGTGTAACATTTAATAAGGGTGTAAAAATCACTGGTCAAGTACAACCTTCTGATTGGACTAACATTGACTCTCGTTATGTTCTTATTGGTTCATACGCAAATCTTGCTAAGAAGAATGAAGCTAACACATTCACTTTACAGCAGAATATTCAATCTGATGGTGAAGCATTAAGAATCTACAGCAAGGCTCAGAATAATTCTTCTTACATTGTTGGTAAGAATACTGATAACACAAATAAGTGGTTTATCGGTTGTGGTACTAATGGTTCTGGTACGGCATCATTCCATAACTACTTGACTGGTGCAAGACTCGATTTAGCTGACGAAATTCTTCTGTCTAAATCTCTACAGATTACTGGACAGGTAAAACCTTCTGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGTCAGCAGCTAATCAGAGATTCATGGTTGCAGGTTCTACAGGAGAAGCTACAGAGCAGAATGCAGATGGTGTGGCATGGAACGCTAAAACAGGCTTATATAATGTAACATCACCAAATGGTGATTACACATCACTTGTATTTCAAATGTATCAGGGAGTGTCCTCTTCTACTGCCTGTGCGCAACTAAAGTTCCAGTATAAAAATGGTGGGATGTGGTACAGAACATCTGTAGACAGTAAAGGTTTTGAGGCTAAGTGGTCTAAGGTTTACACAGAGGCTCAGAAACCAACCCCTTCAGAGCTTGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTAACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAACAAAATCTATCCAGTGGGTATTGTGACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTATCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGACTCTGTGACGTTAGCTGTTGGGAACTTGCCTTCACACACTCACAGTTTTTATGCGACTACCTCATCGTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACACCCACTCTGTGAGTGGTTCTACTTCATCTGCTGGTCACCACAACCACGCTATCTCGTGGATTGGTCAGAACTCTACACACTATTCTGGTGGTGGTGGTGGTAGAATCGGTACAGGTCCGGGTTACACTGATGGGGGTGGTGACCACACCCACTCTGTAAGTGGTACTGCTACTTCTGCTGGTGACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGTCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
3b7bffbf16dc6efcaacd05ae0322ca26dff21f375baf9d765899097a686cba15
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment | Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. | 2020 | — | GenBank |