Protein

Genbank accession
QHR74520.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKAFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNTFSRNQNIQSDGNALRLRNQIANNAQYIEGVNLDGSARWWVGIGSNGEDAVSLYNSKYNSAVIVASNISVNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTAANQRFAQLVGNNTFSGLNTFSNNVNVNSDGAAIILKNKTANDTLFILARDSENNNLWYIGKGDVTSNITIYDYNGDTSIKLNASGVTFNKGVKITGQVQPSDWTNIDSRYVLIGSYANLAKKNEANTFTLQQNIQSDGEALRIYSKAQNNSSYIVGKNTDNTNKWFIGCGTNGSGTASFHNYLTGARLDLADEILLSKSLQITGQVKPSDWSNLDARYFTQSAANQRFMVAGSTGEATEQNADGVAWNAKTGLYNVTSPNGDYTSLVFQMYQGVSSSTACAQLKFQYKNGGMWYRTSVDSKGFEAKWSKVYTEAQKPTPSELGAYTKAETNQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFYATTSSFDYGTKNTNTTGAHTHSVSGSTSSAGHHNHAISWIGQNSTHYSGGGGGRIGTGPGYTDGGGDHTHSVSGTATSAGDHAHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:783 AA
molecular weight: 84087,51890 Da
isoelectric point:8,14199
aromaticity:0,09068
hydropathy:-0,43448

Domains

Domains [InterPro]
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage warpig
[NCBI]
2696461 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR74520.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850637.1 [NCBI]
CDS location
range 79437 -> 81788
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGTTGGGCGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTAGAAAGGTTTGTCCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGAATTGTCAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTGTTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGGCTTTTAAAATCAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACCGTTTATCATACTCTGAATAAGCCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGGTTGGCTGTAACAAACACATTCTCTAGAAATCAGAACATTCAAAGTGATGGTAATGCACTTCGCCTTAGAAACCAGATTGCAAATAATGCACAATACATTGAGGGTGTAAACCTAGATGGTTCAGCTAGATGGTGGGTTGGTATTGGTAGCAATGGCGAGGATGCAGTAAGCCTGTATAACAGCAAATACAACTCAGCAGTGATTGTTGCAAGCAATATCTCTGTTAATAAGTCTTTAGCAATCACTGGTCAAGTTCAGCCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGCAGCTAATCAGAGATTTGCGCAGTTAGTTGGTAATAATACCTTCAGTGGTTTAAACACATTCAGTAATAATGTTAATGTGAACTCTGATGGTGCTGCTATCATTCTAAAAAATAAAACGGCCAATGATACTCTGTTCATCCTAGCAAGAGACAGTGAAAACAATAATTTGTGGTATATTGGTAAAGGTGATGTAACCTCTAATATCACGATTTATGATTATAATGGTGACACTTCTATTAAATTAAACGCGTCTGGTGTAACATTTAATAAGGGTGTAAAAATCACTGGTCAAGTACAACCTTCTGATTGGACTAACATTGACTCTCGTTATGTTCTTATTGGTTCATACGCAAATCTTGCTAAGAAGAATGAAGCTAACACATTCACTTTACAGCAGAATATTCAATCTGATGGTGAAGCATTAAGAATCTACAGCAAGGCTCAGAATAATTCTTCTTACATTGTTGGTAAGAATACTGATAACACAAATAAGTGGTTTATCGGTTGTGGTACTAATGGTTCTGGTACGGCATCATTCCATAACTACTTGACTGGTGCAAGACTCGATTTAGCTGACGAAATTCTTCTGTCTAAATCTCTACAGATTACTGGACAGGTAAAACCTTCTGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGTCAGCAGCTAATCAGAGATTCATGGTTGCAGGTTCTACAGGAGAAGCTACAGAGCAGAATGCAGATGGTGTGGCATGGAACGCTAAAACAGGCTTATATAATGTAACATCACCAAATGGTGATTACACATCACTTGTATTTCAAATGTATCAGGGAGTGTCCTCTTCTACTGCCTGTGCGCAACTAAAGTTCCAGTATAAAAATGGTGGGATGTGGTACAGAACATCTGTAGACAGTAAAGGTTTTGAGGCTAAGTGGTCTAAGGTTTACACAGAGGCTCAGAAACCAACCCCTTCAGAGCTTGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTAACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAACAAAATCTATCCAGTGGGTATTGTGACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTATCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGACTCTGTGACGTTAGCTGTTGGGAACTTGCCTTCACACACTCACAGTTTTTATGCGACTACCTCATCGTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACACCCACTCTGTGAGTGGTTCTACTTCATCTGCTGGTCACCACAACCACGCTATCTCGTGGATTGGTCAGAACTCTACACACTATTCTGGTGGTGGTGGTGGTAGAATCGGTACAGGTCCGGGTTACACTGATGGGGGTGGTGACCACACCCACTCTGTAAGTGGTACTGCTACTTCTGCTGGTGACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGTCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
3b7bffbf16dc6efcaacd05ae0322ca26dff21f375baf9d765899097a686cba15
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6916
Evidence 0,6916

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 GenBank