Protein

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Genbank accession
UJD05869.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
Protein sequence
MSDLIKQHFRATNGLDAGGNKVINVAKADRNVMDDGVNVEYLIQENTIQPWANDRGYPEGFAVTMEKRIWVARADIAAPIPPAVNTFKQGEWISMRVDPKWEQYSSGTTELLPGTYANIDTRVNPVTLVLPKNKVEQGDTIVIRDIGGKPGINQALIKVQDSAPAMIFQGSILRELQLTRPYSMLLLTFTSAGWYVTLSDLSSLARTIDSTTLDAATDVGAQVQSSEYIVRYYTSNKKLTVRLPRYANHGDMITFAEPEGKTPIYHFTIKTYDANSSIGTEGTTSWTSKIKGGGVLIYDGPRKVWRINSIDMQQRIKIVTDDVVMQPNEAITIFGANNSTVKTISVTLPTQVAPGDTVRIGMNYMRKGQTVNIVTPPAPAGGTKDRIASTVGLLQFPKRSEYPPDAAWTQVDSLSFNGTSDYPPVLELAYVEATPNNYWIVSENIPSVERVDWTNDTTRARVGLIALATQANLEANSSTLVDGVAVTPHTLSKRTATEARTGIAAIALSSDVLQNSTYAFINDKIITPKRLNERTATETRRGLAEIATQAETNAGTDDTTIVTPKKLNARKATATLDGIIQLVNTGGTPGTSRADSGTSNGTGVYDHTDFSKAVTPKTLREYKATELASGCVWLATEAEVRNGTPASNNIPTVVTPATLHAKTSTTKDIGLIRIATQDEANAMSNALGNAAITPATLNGRSASYTQTGITRYAIQEEFDGGTLENVAVNPRKIKDYFSRPARMTTRSEAGLAQSGNLWDGWTLNIQVPTETQRGTPKIATQTLVNAGTDDVDYLTSKKLQAKKGTESAYGIVKYATQADTNTGTANDVAVSPVHLKYVIQTSADWRAQDNVRGTVRVANGAVAWTGNSTTGSDGVAKESNGYAVSPNGLKQALANYLPLNAKADNSALLNGLTSDQFIRRDINQTVNGSLTLTKVTTSSANIETSAILKSSKVETTGDIRISNATARLLLSSDTNAWSVQASANSGRIAFISENDTQNVHLSVYNDSRGVTANVKFEAPVINATTQFQLNGTGVIAAAGSSSIRLATSGKGLELASNDAGNIVAAEGSATYKVLTTKNKDSILDSRYVKKGGDTMTGSLTINNASVVVNGSENWYKNDTSADTEKYMQPGSWTVEIKNASKLASLRGYMVPVREENPLIPGSMIVTGYEEKTAGGGLLAQFSVSSGYTYQTWTPYPKAGENSEKNYAHTMWTRVYNPLKGKFDEWMRVYTSATPPTAADIGAPSSVSTSVKTLEVQEWIKIGPVKIYPDRTSQTVKFEWVGD
Physico‐chemical
properties
protein length:1282 AA
molecular weight: 138153,09050 Da
isoelectric point:7,99816
aromaticity:0,06864
hydropathy:-0,34072

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
6–130
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1130–1229
IPR048391
UJD05869.1
1 1282
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 6-130 | STR 356-1129 | ATT 1130-1229 | STR 1230-1275 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage PWKp18
[NCBI] 		2863268 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UJD05869.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ634349 [NCBI]
CDS location
range 73698 -> 77546
strand -
CDS
ATGAGCGACTTAATCAAACAGCATTTTAGAGCAACCAACGGGCTTGATGCTGGTGGAAACAAAGTAATCAACGTCGCTAAAGCCGATCGTAATGTGATGGACGATGGGGTCAACGTTGAGTATCTTATCCAAGAAAACACCATCCAGCCTTGGGCCAATGATCGCGGGTATCCTGAAGGCTTTGCGGTTACTATGGAAAAACGTATCTGGGTAGCACGTGCAGATATCGCGGCTCCGATCCCGCCAGCAGTAAACACCTTTAAACAAGGTGAGTGGATTTCCATGCGTGTTGACCCTAAGTGGGAGCAGTATAGTTCAGGGACCACAGAACTTTTACCAGGGACCTATGCAAACATCGATACTCGTGTTAATCCGGTTACACTGGTTCTTCCTAAAAATAAAGTAGAACAAGGTGATACGATTGTTATCCGGGACATCGGCGGTAAACCAGGTATCAACCAGGCATTAATTAAAGTACAAGACTCTGCGCCAGCAATGATCTTCCAAGGTAGTATCCTTCGCGAACTGCAGCTGACTCGTCCTTATAGTATGCTTCTGCTGACGTTTACATCGGCCGGGTGGTACGTAACTCTTTCAGATCTAAGTTCTTTGGCTCGTACCATTGATTCTACCACACTGGATGCTGCTACCGATGTTGGCGCTCAAGTACAGAGTTCTGAGTACATTGTACGTTATTATACTTCTAATAAAAAATTAACAGTTCGTCTTCCTCGTTATGCTAACCATGGTGATATGATTACCTTTGCCGAACCGGAAGGCAAAACACCAATATACCATTTTACCATTAAGACTTATGATGCAAATAGTTCTATTGGAACTGAAGGGACTACATCCTGGACATCTAAGATTAAAGGCGGCGGTGTTCTGATTTATGATGGTCCACGTAAGGTATGGCGCATCAACTCTATCGACATGCAGCAACGTATCAAAATCGTTACTGACGATGTAGTGATGCAACCTAACGAAGCTATTACTATATTCGGCGCTAACAACTCAACAGTAAAAACTATTTCTGTTACTTTACCTACTCAAGTTGCTCCTGGCGATACCGTTAGAATCGGCATGAACTACATGCGCAAAGGCCAAACTGTCAACATCGTTACTCCTCCTGCTCCTGCTGGCGGTACTAAAGATAGGATCGCATCCACAGTTGGCTTACTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCGCCTGATGCCGCGTGGACTCAAGTTGATAGTTTATCATTCAATGGAACTTCGGACTACCCTCCGGTCTTAGAGTTGGCCTATGTAGAAGCTACACCTAATAACTATTGGATCGTTTCGGAGAACATTCCTAGTGTAGAACGTGTTGACTGGACTAACGATACCACAAGAGCTCGTGTAGGCCTTATTGCATTGGCTACTCAGGCTAATTTAGAGGCAAATAGTTCTACTTTAGTTGATGGTGTTGCTGTTACTCCACATACTTTAAGTAAAAGAACCGCAACTGAAGCTCGTACTGGTATTGCTGCTATTGCATTAAGCTCTGATGTTTTACAAAATAGCACTTATGCTTTTATTAACGATAAGATTATTACTCCTAAACGTCTTAATGAGAGAACTGCTACAGAAACACGTCGTGGATTAGCCGAAATAGCTACCCAAGCCGAAACAAATGCCGGCACAGACGATACAACCATCGTTACCCCTAAAAAGCTTAATGCGCGTAAAGCTACTGCTACTCTTGATGGCATCATCCAGCTAGTTAATACTGGTGGTACCCCAGGAACAAGTAGAGCAGATTCTGGTACTTCTAATGGTACTGGTGTGTACGACCACACTGATTTTTCTAAAGCAGTAACTCCTAAAACTTTACGTGAATATAAAGCTACTGAACTTGCCTCCGGCTGTGTATGGCTTGCTACCGAAGCAGAGGTTCGTAATGGTACTCCGGCGTCTAATAATATTCCGACTGTTGTTACGCCGGCAACATTACATGCTAAAACTTCTACTACAAAAGATATTGGTTTAATCCGTATCGCTACTCAAGATGAAGCTAATGCAATGTCTAATGCTTTGGGTAATGCAGCTATTACTCCGGCAACATTAAACGGACGGTCGGCAAGTTATACTCAAACAGGTATAACCCGTTATGCTATTCAGGAAGAATTTGATGGTGGGACTTTAGAAAACGTTGCAGTGAACCCTAGAAAAATTAAAGACTATTTTTCTAGACCAGCTCGTATGACAACAAGATCCGAAGCTGGGTTAGCCCAATCCGGAAACTTGTGGGACGGATGGACCCTTAATATCCAGGTTCCAACAGAAACTCAACGTGGTACGCCTAAGATTGCAACTCAGACTCTTGTCAATGCAGGAACCGATGATGTTGATTATCTGACGTCTAAAAAGCTTCAAGCTAAAAAAGGTACCGAATCAGCTTACGGTATTGTTAAATATGCCACTCAGGCTGATACCAATACTGGAACTGCTAATGATGTGGCTGTTTCTCCTGTTCACCTGAAGTATGTTATTCAGACTTCTGCTGATTGGCGTGCACAAGATAACGTTCGTGGTACAGTTCGTGTAGCTAATGGAGCCGTTGCTTGGACTGGTAACAGTACTACAGGTTCTGATGGTGTGGCAAAAGAATCTAATGGCTATGCAGTATCACCTAATGGGCTGAAACAGGCGTTAGCTAACTATCTTCCTTTGAATGCTAAAGCTGATAACTCTGCCTTATTGAACGGTCTTACATCAGATCAGTTTATTCGCCGAGATATTAACCAGACTGTCAATGGTTCTTTAACCTTGACTAAAGTTACTACTTCTTCTGCGAATATTGAAACTTCAGCTATCTTGAAGTCTTCTAAAGTAGAAACTACAGGCGATATCAGAATTTCTAATGCTACAGCTAGATTGCTTTTATCTTCTGATACTAATGCTTGGTCCGTTCAAGCGTCAGCTAACTCAGGTCGTATCGCATTTATTAGTGAAAATGATACTCAAAATGTTCATTTATCTGTTTACAACGACTCACGTGGTGTAACGGCTAATGTTAAGTTTGAAGCTCCTGTTATTAATGCCACTACTCAATTCCAGTTAAATGGAACTGGCGTTATCGCCGCTGCCGGAAGTTCTAGTATTCGATTAGCTACTTCAGGCAAAGGTCTTGAGCTTGCTTCTAATGATGCTGGTAATATCGTAGCGGCTGAAGGCAGTGCAACATATAAAGTTCTCACAACCAAGAACAAAGATTCTATTCTTGATTCACGGTATGTTAAAAAAGGTGGCGATACCATGACGGGCTCGTTAACAATAAACAACGCATCTGTTGTTGTTAACGGTTCTGAAAATTGGTATAAAAATGATACCTCGGCTGATACAGAAAAATACATGCAGCCGGGTTCTTGGACAGTAGAAATTAAAAATGCTTCTAAGCTAGCTTCGCTTCGTGGTTATATGGTGCCTGTCAGAGAAGAAAATCCTTTAATTCCTGGTTCTATGATTGTAACCGGCTATGAAGAAAAAACTGCAGGTGGCGGTTTACTTGCCCAATTTAGCGTTTCTTCTGGATACACATATCAGACTTGGACTCCTTACCCTAAAGCTGGTGAAAATTCAGAGAAAAACTATGCCCACACAATGTGGACTAGGGTTTATAATCCACTTAAAGGCAAGTTTGATGAATGGATGCGTGTATACACTAGCGCCACTCCTCCTACAGCTGCAGATATCGGTGCTCCGAGTTCAGTAAGTACTTCTGTTAAAACCTTGGAAGTTCAAGAATGGATTAAGATTGGCCCTGTCAAGATTTATCCTGATCGTACTTCTCAGACCGTTAAGTTTGAATGGGTAGGTGATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7ec59b88f8ae156d76c311dd16d60bf7560c0d673c4171b158a338601f193851
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2882
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Lytic Bacteriophages against Mutidrug-Resistant Klebsiella pneumoniae: Development of an Effective Phage-based Approach to Combat Multidrug Resistance Martins,W.M.B.S., Cino,J., Li,M., Lenzi,M.H., Sands,K., Portal,E., Mathias,J., Hansan,B., Dantas,P., Migliavacca,R., Hunter,J.R., Medeiros,E.A., Gales,A.C. and Toleman,M.A. 2021 — GenBank