Protein

Genbank accession
YAF79503.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,75
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGQRPAASVLAEGELAINLKDRTLFTKDDSGNIIDLSISAGGNISGNITQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHTNKAPIFTDLSSTTSISEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVAEGSFKFHYIDETGTSKYWTFRRDGGFTVDNGGLAVSGGSITTTGNIAAIGNITSPQINTKNIILDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGEENGINYLRKVRAKSGGTIYHEIASAQTGKNDEISWWTGNTLTIKLMGLRNDGAMVLRRSLAIGTITTDENTNNYGSPTPMGERYIALGDAATGLKYIKQGVYDLVGNWNSVASITPDSFRSTRKAIFGRSEDQGGTWIMPGTNAALLSVQTQADGNSAGDGQTHIGYNSGGKMNHYFRGTGQMNINTQQGMEINPGVLKLTTGANNVMLYADGGITSVKQLSIYNGVYLAANNSTAGLTFAPTTTIDGTKQILWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNASGDRNRETVFEVADGQGYYFYSQRVAPSGSETTGPVVTQFNGQVNARGSIITDGSFKVNGLSTLVGNVTMSNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEASLHIIPTPKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGAGGNMVTVDNDSKVMVMTTNSRISPNFRMQIGQSSYIDVECTDAVRPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRTDTSTYVPIVKQRYVQNNSCYSIGTLINGGNFRVHYHEGGDGVSTGAIIKDLGWEFNKNGDFYSPGKLGAGNIRIGTDGNITGGTGNFANLNTTIESLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPNGYAIMEGQTFDKSAYPKLAIAYPSGVIPDMRGQTIKGKPSGRAVLSAEADGVKAHNHSASASNTDLGTKTTSSFDYGTKTTSSFDYGTKTSNTTGNHSHTVSGTTSSAGAHQHARSGPQIQAGIPNNIFYDGYNSVGANANAKFTGTVNGATAGSNIAKTSSDGAHTHTWSGTTSTTGNHAHTVGIGAHTHTVGIGAHTHTVAIGSHGHTITVNSTGNTENTVKNIAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1090 AA
molecular weight: 115344,13080 Da
isoelectric point:8,70834
aromaticity:0,08257
hydropathy:-0,38606

Domains

Domains [InterPro]
IPR051934
732–1090
IPR051934
SSF88874
832–962
SSF88874 SSF88874
IPR037053
838–891
IPR037053
IPR011083
843–890
IPR011083
YAF79503.1
1 1090
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage CBDS-06
[NCBI] 		3459902 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YAF79503.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PX104379 [NCBI]
CDS location
range 57349 -> 60621
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGTCAACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGACCGTACTCTTTTTACTAAAGATGACTCGGGAAATATTATTGATTTAAGCATTTCTGCCGGTGGTAACATTAGTGGAAATATCACTCAAACTGGTGATTATTTACAAAACGGCACGTATAATCTTAATGGAAATCAGTTTGTTTACGCAGGAAAGTATATTGAATTCTTGCCAAAAACTGCTGGAAATGGTGCTTGGGCAAATCAGCACACAAATAAAGCTCCAATTTTCACCGATCTGAGTTCAACTACTTCTATTTCAGAATATCATCCACTCATTAAGCAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCAGCGGGTACATTGGTTGCTGAAGGCAGTTTTAAGTTCCATTATATTGATGAAACTGGGACTTCAAAATACTGGACGTTTCGCCGTGACGGTGGATTTACTGTTGACAATGGAGGTTTAGCAGTATCAGGAGGTAGTATAACTACAACTGGAAATATTGCAGCTATTGGAAATATTACTTCACCTCAAATTAATACTAAAAATATTATTTTAGATACAAAAGCATTTGGACAATACGATTCGCAATCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACAGGTGAAGAAAATGGTATAAACTATCTTCGTAAAGTTCGAGCTAAATCAGGCGGAACTATTTACCATGAAATCGCTTCAGCTCAAACTGGTAAGAATGATGAAATTTCTTGGTGGACCGGAAATACACTTACTATTAAATTAATGGGTCTTCGTAATGATGGCGCAATGGTATTACGTCGTTCACTTGCTATTGGCACAATTACCACTGACGAAAATACTAACAACTATGGTTCTCCTACTCCAATGGGAGAAAGATATATTGCTTTGGGCGATGCTGCCACTGGTTTAAAATACATTAAGCAGGGCGTTTATGATTTAGTAGGTAATTGGAATTCTGTTGCGTCTATTACTCCTGATAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGCGATATTTGGACGTTCAGAAGACCAAGGTGGAACATGGATTATGCCTGGAACTAACGCTGCGCTTTTATCAGTTCAAACTCAAGCTGATGGAAACTCCGCTGGTGATGGTCAAACACACATTGGATATAATTCTGGTGGTAAAATGAACCACTATTTTCGTGGTACAGGTCAGATGAATATCAATACCCAACAGGGTATGGAAATTAATCCAGGAGTGTTAAAATTAACCACTGGGGCAAATAATGTAATGTTATACGCGGACGGCGGTATTACATCTGTTAAGCAGCTTTCAATATACAATGGGGTGTATTTAGCAGCTAATAACTCGACCGCTGGATTAACATTCGCTCCAACTACTACAATTGATGGCACTAAGCAAATTTTGTGGGAAGGCGGTACTCGTGCTGGTCAGAATAAAAGCTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGTAATCGTGAAACGGTTTTTGAAGTAGCTGATGGACAAGGATATTATTTTTATTCACAGCGTGTGGCTCCAAGTGGCTCTGAAACTACTGGGCCTGTTGTAACCCAGTTCAATGGACAAGTTAATGCTAGAGGAAGTATTATTACTGACGGAAGTTTTAAAGTTAATGGATTAAGCACTTTAGTCGGTAATGTTACTATGTCTAATGGTTTGTTTGTCCAAGGTGGTTCTTCTATTACTGGACAGGTAAAAATTGGTGGAACGGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGTGCTATTTTCCGCCGTTCAGAAGCGTCATTACATATTATCCCTACTCCTAAAGATGCCGGTGAAAGCGGTGGAATAAGTAATCTCCGCCCACTTAGTATTAGCCTTAATAATGGTATGGTGCAAATGCGTCATTCCGTTACATTAGGTGATGATGGTGCAGGCGGTAATATGGTGACGGTTGATAATGATTCTAAAGTTATGGTAATGACGACTAATAGCCGTATTAGTCCTAACTTCCGTATGCAAATTGGACAGTCGTCTTATATTGATGTGGAATGTACTGATGCTGTGAGACCTGCTGGAGCCGGTTCTTTTGCTTCACAGAATAACGAAAACGTTCGCGCTCCGTTCTATATGAATATTGATAGAACAGATACAAGCACTTATGTTCCTATTGTGAAACAAAGATACGTTCAAAATAATAGTTGCTATTCTATTGGTACTTTAATTAATGGTGGTAACTTTAGAGTTCATTATCATGAAGGCGGTGACGGCGTTTCTACTGGTGCTATTATAAAGGATCTTGGATGGGAATTTAATAAAAACGGTGATTTTTATTCTCCTGGTAAATTAGGCGCTGGAAATATTAGAATAGGTACTGATGGTAATATTACTGGCGGAACTGGTAACTTTGCTAACTTGAACACAACTATCGAATCATTAAAAACCGATATTGTTTCAAGTTATCCTATTGGAGCTCCTATTCCATGGCCTACAGATACTCCTCCTAATGGTTACGCTATTATGGAAGGACAGACTTTTGATAAGTCTGCATACCCAAAATTGGCTATAGCTTACCCATCTGGAGTAATTCCTGATATGCGCGGGCAAACTATCAAAGGTAAACCAAGCGGTCGTGCTGTGTTAAGTGCAGAAGCTGATGGTGTTAAGGCTCATAACCATAGTGCTTCAGCATCTAATACTGATTTAGGTACTAAAACTACATCAAGCTTTGATTATGGCACTAAGACGACAAGTAGCTTTGACTATGGCACTAAGACTAGCAATACCACAGGTAACCACTCTCATACTGTAAGCGGTACTACGAGTTCTGCTGGTGCACACCAACATGCGCGCTCAGGTCCTCAGATACAAGCCGGCATACCCAATAACATATTCTATGACGGATATAATAGTGTAGGTGCAAACGCCAACGCTAAATTCACTGGAACCGTGAACGGTGCTACTGCAGGGTCGAATATAGCCAAAACTTCTTCAGACGGTGCTCATACTCATACTTGGTCCGGTACTACAAGCACTACAGGTAACCATGCTCACACAGTAGGTATTGGTGCTCATACCCATACTGTAGGTATCGGTGCTCATACCCACACGGTAGCAATTGGCTCGCATGGTCATACTATCACTGTAAATAGTACAGGTAATACAGAAAACACGGTTAAAAACATTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

Title Authors Date PMID Source
A machine learning approach to predict strain-specific phage-host interactions Camejo,P.Y., Leon,L.E., Rojas,F., Ossa,A., Hurtado,R., Tichy,D., Pieringer,C., Pino,M., Mora-Uribe,P., Ulloa,S., Norambuena,R., Tobar-Calfucoy,E., Aguilera,M., Rojas-Martinez,V., Cifuentes,O., Sabag,A., Cifuentes,N., San Martin,D., Infante,C., Cifuentes,P. and Pieringer,H. — — GenBank