Protein

Genbank accession
QQM13550.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,57
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,92
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MAITKIILQQMVTMDQNSITASKYPKYTVVLSNSISSITAGELTTAIESSKASAAAAKQSEINAKQSELNAKDSENEAEISAASSQQSATQSASSATASANSAKAAKTSETNAKASETAAKTSETNAKASETAAKTSETNANSSKTAAAASASAAKTSETNAAASASAAKTSETNANSSKTAAANSANAAKVSETNAKTSETNAAASATKAENVASGMRDSIGLGNSARDCPDISGNPSAYIGFMRIREGVPGWPSIANGEAYLTGVISVNDGSPSYTGIFQGWGSRSLYTYRWASNLGPQWTRHARKDEVNRLVQIANDQTRLYAGNGTTYMEVGNNRAWGVYDSVLNKWQPLAIAQGGTGGITDIEARTNLRLGVNDSPQFANLNLVRSSDVATTAGGILQSILSDTTGVQRTRCRFYSELRGDDKAWGTIHLQKGDKNQYAGLNEDGDFSLNSGDFIGRRVKLSANFSYPVEITSAHPTIRFNETDRPANTPYYSFVFDGGNWRIQKDGYDGTKSSSAISYNYARDEIEIPNLKVNAIATPINLTQTKTNLQIPFTGLARWTDYNAPAGAEAKKYYPVIISHPLYYNGDFLVEVAMRTKSITRNEEPNCNAIHLWIRDAGWSDMGAAVFGHYFCYAKNENAILCVRGTDKGQYPHNAIYVRGDAFPIRLATTVGCIVTIPTSDWKPSTAAGSPTYKWGISNSGEGIDIDTYGISNNLLDFTASATGFYCTDTYRNKYGDSYQVISANGTIQPANGVATYLNQDWNTQHTDGVNKFKPIAGQVNSPENGIVYAGFHTSFSESYATQFAGRNSRFWVRSIEAGESKEWLKLITATLAPKIPTDARDGFISDNAGDTSWAPSNGGGFQSSYAENRIMQSWIDSAGRLYSRFLTTNQPTTSKTDVPWKSAAMLELDNRFTGSNTFLGDILCSAANPLTLKSANPTLSFVESDVDNSTYMFVADGGGFRLNRDNTAGAEIFNYSRSQNNLKLGVSSYFTLNTRFDQGWTSRGSVDVTTTGYSGIAFITTGSTDSVGARNQFEVSPDNSFYLARRNRSNQTGQWIIHFPTAGGTLALSGTSDINYKTNIEEYDGIHSIENIKAMDLVTFVFKDDEKKRTRRGVIAQQIEQIDPTYVKHTYEPCGEPIVDDDGVVQGYTDTKERVVLDNNVLLLDALCAIKVLAQRDEEKTERINKLEKDVEDLKTVVEHLLTTMKNS
Physico‐chemical
properties
protein length:1214 AA
molecular weight: 131448,49600 Da
isoelectric point:5,76492
aromaticity:0,08896
hydropathy:-0,46639

Domains

Domains [InterPro]
Coil
57–77
Coil IPR030392 Coil
IPR030392
1078–1190
IPR030392
QQM13550.1
1 1214
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage vB_StyS-LmqsSP1
[NCBI] 		2749424 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QQM13550.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT577844.1 [NCBI]
CDS location
range 20491 -> 24135
strand +
CDS
ATGGCTATAACTAAAATAATCTTACAACAAATGGTCACCATGGACCAAAATAGTATAACTGCAAGTAAATATCCTAAGTATACAGTTGTACTTTCTAATTCTATTAGCTCTATCACTGCTGGTGAGCTAACTACTGCAATAGAATCCTCTAAAGCATCAGCTGCAGCAGCTAAACAATCAGAAATCAATGCAAAGCAATCAGAACTAAATGCTAAAGATTCTGAGAATGAGGCAGAAATTTCTGCAGCATCTTCCCAGCAATCTGCAACTCAGTCTGCTTCTTCTGCTACTGCTTCTGCTAATAGCGCTAAAGCTGCTAAGACTTCTGAGACTAACGCAAAAGCTAGTGAGACGGCTGCAAAAACTTCAGAAACCAATGCAAAAGCTAGTGAAACAGCGGCTAAAACTTCTGAGACCAATGCTAATAGTAGCAAAACTGCTGCTGCTGCATCTGCTTCCGCAGCAAAAACCTCAGAAACTAATGCTGCTGCATCTGCTTCTGCCGCTAAAACTTCTGAAACTAACGCTAATAGTAGTAAAACTGCTGCTGCTAACAGTGCTAATGCTGCTAAAGTATCAGAAACTAATGCTAAAACTTCGGAAACTAATGCGGCTGCTTCAGCTACTAAAGCTGAAAATGTAGCTTCCGGCATGAGAGATTCTATAGGCCTAGGTAATTCAGCTCGTGATTGCCCAGATATTTCTGGTAATCCTTCTGCATACATTGGTTTTATGCGTATTCGTGAAGGTGTGCCTGGATGGCCTTCTATTGCTAATGGGGAGGCGTATTTAACTGGTGTTATTTCTGTTAATGACGGTTCTCCTTCCTACACTGGTATTTTTCAGGGATGGGGTAGTCGCTCATTATACACGTATCGTTGGGCAAGCAATCTAGGCCCTCAATGGACACGTCACGCTCGTAAAGACGAGGTAAATAGACTTGTACAGATAGCGAATGACCAAACTAGATTATATGCTGGCAATGGTACTACATACATGGAAGTAGGCAATAATAGAGCTTGGGGGGTATATGACTCTGTACTCAATAAGTGGCAACCGCTGGCTATAGCTCAGGGCGGTACAGGTGGAATTACAGATATAGAGGCACGTACCAACCTGAGACTGGGGGTAAACGATAGCCCACAATTTGCAAACCTTAACCTTGTAAGGTCTTCAGATGTAGCAACTACGGCAGGAGGTATTCTACAAAGCATCCTCAGTGATACAACAGGGGTGCAGAGGACACGCTGCCGCTTTTACTCAGAATTACGTGGTGATGATAAAGCATGGGGAACGATTCATCTTCAAAAAGGTGACAAAAATCAATATGCTGGATTAAACGAGGATGGAGATTTCTCTCTAAATAGTGGTGATTTTATTGGTAGAAGAGTAAAATTAAGTGCCAATTTTAGTTATCCAGTAGAGATAACAAGTGCTCATCCTACTATCAGATTCAATGAAACTGATCGTCCAGCAAACACACCTTATTACAGTTTTGTTTTTGACGGAGGTAATTGGCGTATTCAGAAAGATGGCTATGATGGTACAAAAAGTAGTAGTGCTATTAGCTATAACTATGCAAGAGATGAAATAGAAATTCCAAATCTCAAGGTTAATGCTATTGCCACTCCCATAAATCTTACACAGACAAAAACAAATCTGCAAATACCATTTACTGGTTTAGCTCGTTGGACTGATTATAATGCTCCTGCAGGAGCTGAAGCTAAAAAATATTATCCTGTAATTATAAGCCATCCATTATACTACAATGGTGATTTCCTTGTTGAAGTTGCTATGAGAACTAAATCTATAACTAGAAATGAGGAACCTAACTGTAATGCTATTCATTTATGGATTAGAGATGCTGGATGGTCTGACATGGGTGCAGCAGTATTTGGTCACTATTTCTGCTATGCTAAAAACGAAAATGCTATCCTATGTGTTAGAGGTACTGATAAGGGTCAGTATCCTCATAATGCAATTTATGTTCGGGGAGACGCTTTTCCTATTAGGCTTGCTACAACTGTTGGTTGCATTGTAACCATACCTACATCTGACTGGAAGCCTTCAACTGCAGCAGGTAGTCCTACGTACAAATGGGGTATCTCAAACTCAGGAGAGGGTATTGATATTGATACCTACGGCATCAGTAATAATTTGCTTGATTTTACAGCAAGTGCGACTGGATTTTATTGTACTGATACATACCGCAATAAATATGGTGATTCTTATCAAGTAATATCAGCGAATGGCACCATACAGCCAGCTAATGGCGTTGCAACATACTTAAACCAAGATTGGAATACTCAACATACAGATGGAGTAAATAAGTTTAAACCTATTGCTGGACAAGTAAACTCACCGGAAAATGGAATTGTTTATGCCGGTTTTCACACCAGTTTTAGTGAAAGTTATGCTACTCAGTTTGCAGGACGTAATTCCAGATTCTGGGTAAGAAGTATTGAAGCTGGGGAAAGTAAAGAATGGTTAAAACTTATTACTGCTACATTAGCCCCTAAAATTCCTACAGATGCACGAGATGGTTTCATCAGTGATAACGCAGGAGATACCTCTTGGGCTCCTAGCAATGGTGGGGGTTTTCAGTCTAGTTATGCCGAAAACCGCATTATGCAGAGCTGGATTGATAGTGCGGGAAGATTATATAGCAGATTTCTAACAACTAATCAGCCTACAACCTCAAAAACGGATGTTCCCTGGAAAAGTGCTGCGATGCTAGAGCTGGATAATAGGTTCACGGGAAGTAATACTTTTCTTGGAGATATTCTATGTAGCGCTGCCAATCCGCTTACTCTTAAGTCTGCAAACCCTACCTTATCTTTTGTAGAGTCTGACGTAGATAACTCTACATACATGTTTGTAGCAGATGGAGGTGGTTTTAGGCTTAACAGGGATAATACTGCAGGTGCGGAGATATTTAACTACAGCCGATCCCAAAACAATCTTAAACTTGGTGTAAGTTCTTATTTTACTCTAAATACTAGATTTGATCAGGGATGGACATCTAGAGGTTCTGTAGATGTAACTACTACGGGGTACAGTGGCATTGCTTTTATTACAACAGGCTCAACTGATAGTGTTGGCGCACGTAACCAATTTGAGGTTTCACCAGACAATAGTTTTTACTTAGCTCGACGTAATAGAAGTAACCAAACTGGACAATGGATTATACACTTTCCTACTGCTGGAGGTACTCTAGCACTTAGTGGTACATCAGATATTAACTACAAGACTAATATAGAAGAATATGACGGTATTCATTCCATAGAAAATATTAAGGCTATGGATCTTGTTACTTTTGTATTTAAGGATGATGAGAAAAAACGTACTCGCAGAGGGGTTATTGCTCAGCAGATTGAGCAGATAGATCCTACCTACGTTAAACATACGTATGAACCATGTGGGGAACCCATTGTTGATGATGATGGGGTTGTTCAAGGGTATACTGATACGAAGGAAAGGGTTGTTCTAGATAATAATGTTCTTTTATTAGATGCGCTATGTGCTATAAAAGTATTAGCACAACGGGATGAGGAGAAAACCGAACGTATTAATAAACTTGAGAAAGATGTGGAAGACTTGAAAACTGTAGTAGAGCATTTGTTGACTACTATGAAAAATAGTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
c541c86f933038a66d62e98be5277345e499771b4524f1c9e9599d62ee879e60
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5738
Evidence 0,5738
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Literature

Title Authors Date PMID Source
Genome sequence of Salmonella phage vB_StyS-LmqsSP1 Hammerl,J.A. and Kittler,S. 2003-08 — GenBank