Protein

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Genbank accession
QEG11396.1 [GenBank]
Protein name
L-shaped tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,76
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIALNTHGRTLAIYTKDEADNVVQLAGKGVPFLDTAGNLNVDGTTTLKDNVTISPNKAINFEASDLSGALVRHITGKCANNDGWYIGAGGASDQGFLEIGTYDNGNEPIYFVQRTGGTTQAEVRRLALLDGFGDTSIPGDLRLTNKTVKISNGSTLTLEMGVGANDAYIKNLRGTGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYTISAATAGTPRWVKVATIKHPGDASSQLDLMITGGIDSEHGRHYVDFITLSGRNLTSWSTSNLDNWVEWRRMGSPNKRNVPEYYVVKNDAATDSEASFDFYAKVPRYGNGLYVTVLNTAGYNGQDSGKVIIYETGQDTGATTPSGSILVSMKQIFDSIAKPDFGDTTGTLPVNRGGTGATNTGDARNNLGLRTAAVRDVGESNGNVMEVGAYGLGGNGGKSINDIVSNADMLTRLKAYGGTFWRGATKSGVSVQNGLYSHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASAKVRVYAANNTSLAAGNVNYNELYGTANKPTKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLAAPNLHASGTGTASVYVNAGSGNAHVWFRTNANERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGDVSAGDFSFRSDGRFDVPVAVKVGGAAMLTKDGNITLGSLFGGNLNNYLNTIKNDIVAGDNKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGSMVDLGSENSDKYSRLTLARKVGSGAAVAMLKITPEGYVQFGYQDAVATPSPSKYIRVKPDGLDVEGDLVFNQTYRGTEEAVDISDKTNDLNNMVIKGSDLGTRQLYKCVSSGGSNIANKPTSDGNFVLEVLSLRKISDSDWTCKQTFTTKNGNVEGVYVRYCQNGTWSAWREVVAGVQPINLGGTGATSAASARNNLGVGEGQSVKFGWLVVNGVGTSDPTIAFKNGAVVREAQGGSTGALIMSASATAAAGAKYIAFRPYGDSSNSEIRVKAFGNNETSLEWSQGAGVRSNTQGAFVVYAKAGQALHLRPNGDSANQATVIDQNGKMTVGGEFEAQNSKITGNLNVSEDNRMIVLGKNSDIGLVKKNGMPGKMAISKSNSFTVMVSTNTNNQINPADTFNDIFKVDADGNQTVYGNSAVSRALTVSSTATVNGVINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGRLTITGDQLKTTSLWTTGDAAVNGVLNVDGKARFNQEFSVSTSVNVQNDGNSHVFFRKANGTEKGLIWVDDPGNVSIRSAGASGPVWNFWNSGSCQFPGAISNYNGISSTTNYPGGNKNDYLNTAGLVSRFSNGAYASLYFQEYVGNYHQAILNVNGYGQDNSFYFRAGGDFICTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVETLCGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDIEADGGLLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKGLKAEIEELKSK
Physico‐chemical
properties
protein length:1515 AA
molecular weight: 160383,81250 Da
isoelectric point:6,19019
aromaticity:0,07459
hydropathy:-0,35102

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–621
DC_1942 cd19958 DC_0246
DC_1159
STR
451–1142
DC_1159 IPR030392
IPR030392
CHP
1415–1470
IPR030392 Coil
QEG11396.1
1 1515
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 4-621 | STR 622-1142 | RBD 1143-1515
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
QEG11396.1
1 1515
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 1094 1094 0,1102
Central domain 1095 1293 200 0,4343
C-terminal 1294 1515 221 0,8783
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-1094
Central
1095-1293
C-terminal
1294-1515

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage KMI13
[NCBI] 		2601623 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Klebsiella
[NCBI] 		570 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QEG11396.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN101229.1 [NCBI]
CDS location
range 51245 -> 55792
strand +
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGCGTTGAATACACATGGGCGTACTCTTGCCATTTACACTAAAGATGAAGCCGATAACGTTGTTCAGCTTGCAGGTAAAGGGGTTCCTTTCTTAGATACTGCAGGTAATCTTAATGTTGATGGAACTACTACGTTAAAAGACAACGTTACTATTTCTCCGAATAAAGCGATCAATTTTGAAGCTTCAGATTTAAGCGGAGCATTAGTACGTCATATCACCGGTAAGTGTGCTAATAATGATGGCTGGTACATTGGAGCTGGTGGCGCATCTGACCAGGGATTTCTTGAAATCGGTACGTATGATAACGGAAATGAACCTATCTATTTTGTTCAAAGAACCGGTGGAACGACTCAAGCTGAAGTTCGTCGTTTAGCATTATTAGATGGGTTTGGCGATACATCTATACCTGGGGACCTTCGTTTAACTAATAAAACGGTAAAAATTTCAAACGGAAGCACTCTTACTTTGGAAATGGGTGTAGGCGCTAATGACGCGTACATTAAAAACCTGAGAGGAACCGGTGTTCTTCAATTAACCAATGACAGTAATCTGACATTCAGAAATTCACAGGTTTATTACGCCATGAACGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGCACTCTTCTGACGAATGTAGAAAACAATCGTCAGGCGTGGCAATATACTATTTCTGCTGCAACTGCTGGAACTCCACGTTGGGTTAAAGTAGCTACAATTAAACACCCAGGAGATGCGTCTTCACAGTTAGATTTAATGATTACAGGTGGCATTGATTCTGAACACGGAAGACATTATGTTGATTTTATCACGCTATCTGGTCGCAATTTAACATCCTGGAGCACTAGCAATTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCAGGATGGGTTCTCCTAATAAAAGAAACGTTCCAGAATATTACGTTGTTAAAAACGATGCTGCTACAGATTCAGAGGCTTCATTTGATTTTTACGCTAAAGTTCCTCGATATGGCAATGGGCTTTATGTTACAGTGCTTAACACTGCTGGATACAACGGACAAGACAGCGGTAAAGTAATTATCTATGAAACCGGCCAAGATACTGGTGCTACTACACCATCTGGAAGCATTCTTGTTTCGATGAAACAAATTTTTGACAGTATCGCAAAACCAGATTTCGGCGATACTACCGGTACTCTTCCGGTTAACCGCGGTGGTACAGGTGCTACTAACACAGGAGATGCTCGTAACAACCTGGGCCTTAGAACTGCGGCTGTTCGCGATGTGGGTGAATCTAACGGAAACGTGATGGAAGTTGGTGCTTATGGCTTAGGTGGCAACGGTGGTAAATCTATCAATGACATTGTCTCTAATGCAGATATGCTGACTCGTTTAAAAGCATATGGCGGTACTTTCTGGCGTGGTGCTACTAAATCTGGTGTTAGTGTTCAAAATGGTCTTTATAGCCACGGCTCTGGTATTTTTATGAATGCTGGCGATACCATGTCAGCTATTAATATCGACTACGCTAGTGCTAAAGTTCGTGTATATGCTGCTAATAACACTAGTCTTGCCGCAGGAAATGTTAACTACAATGAACTTTATGGTACAGCAAACAAACCGACAAAGGCTGATGTCGGACTTGGTAATCTGACAAACGATACCCAAGTTAAGAAAGCTGGCGACACCATGACCGGTGATTTAGCTGCACCTAATTTACATGCTTCCGGCACCGGTACTGCATCAGTGTATGTTAATGCAGGAAGCGGAAATGCTCATGTATGGTTTAGAACAAACGCCAATGAACGCGGTGTAATTTGGGCAACTCCAAATACAGCGGATTTAGGACAAATTAATATTCGCGCAAAAACTACTGGAGATGTTTCTGCTGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGACGGTCGATTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTCGGTGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGAAACATTACCTTAGGTTCATTGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGAATACCATTAAAAACGACATCGTTGCTGGCGATAATAAGCAAGTAAGTAAGACTGGTGACACCATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTCGAAAACCCTAATGGATCAATGGTTGATTTAGGTTCAGAGAACTCAGATAAGTATAGCAGATTGACCCTTGCACGTAAAGTTGGCTCTGGCGCTGCCGTAGCAATGCTTAAAATTACTCCTGAAGGATACGTGCAATTTGGTTATCAAGATGCAGTTGCTACTCCGTCTCCCAGCAAGTACATCCGGGTTAAACCTGATGGTCTTGATGTAGAAGGGGATTTGGTTTTTAATCAGACCTATCGCGGTACTGAAGAGGCAGTTGATATTTCTGATAAGACTAATGACCTTAACAACATGGTTATTAAAGGCAGTGATTTAGGTACTCGTCAGCTGTATAAATGTGTATCATCTGGTGGTTCTAATATAGCTAATAAACCCACATCTGATGGCAACTTTGTTCTTGAAGTTCTGTCTTTGCGTAAAATTTCTGATAGTGATTGGACATGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAATGGTAATGTTGAAGGCGTATATGTTCGATACTGCCAAAACGGTACATGGTCTGCATGGAGAGAGGTTGTTGCAGGGGTTCAACCAATCAACTTGGGCGGTACCGGAGCAACTTCTGCAGCTTCTGCTCGTAATAACCTCGGTGTTGGTGAAGGTCAGAGTGTGAAGTTCGGCTGGTTAGTTGTTAATGGCGTCGGAACAAGTGATCCAACTATCGCATTTAAAAATGGCGCAGTAGTTCGTGAAGCCCAAGGTGGTAGTACTGGTGCATTGATCATGTCAGCTTCTGCTACAGCCGCCGCGGGCGCCAAGTATATTGCTTTCAGGCCATATGGGGATTCGTCCAACTCCGAGATTAGAGTCAAAGCATTCGGCAATAACGAGACATCGCTTGAGTGGTCGCAGGGCGCCGGTGTTCGTTCAAATACCCAGGGTGCTTTCGTAGTTTATGCAAAAGCCGGACAGGCGCTTCATTTAAGACCAAACGGTGACAGTGCGAACCAAGCTACTGTTATCGATCAGAACGGTAAAATGACAGTCGGTGGTGAGTTCGAGGCTCAGAACTCAAAAATCACAGGTAACCTGAACGTATCTGAAGATAACAGAATGATCGTTCTTGGTAAAAACTCTGATATAGGTTTAGTAAAGAAAAACGGTATGCCAGGTAAAATGGCTATCAGTAAATCTAACTCGTTTACTGTTATGGTGTCAACCAATACTAACAATCAGATTAATCCTGCTGATACGTTTAACGATATATTCAAAGTTGATGCAGATGGAAACCAAACTGTTTACGGAAATTCAGCAGTTTCTAGAGCTTTGACTGTATCAAGTACAGCTACAGTTAATGGTGTTATTAATGCCAATGGCGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTACAAATTGCTGATGCTCCTACGCAGAATAACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAACGCTGGCGATACTTATCTCCCATTAGCAGGTGGTACTGTAACTGGGCGGTTAACAATTACAGGTGATCAGTTAAAAACTACCTCTCTGTGGACTACCGGAGACGCTGCCGTTAACGGCGTTTTAAATGTTGACGGAAAAGCTAGATTTAATCAAGAGTTCAGTGTATCTACTTCAGTTAATGTTCAGAACGATGGTAATAGTCATGTGTTCTTCCGTAAAGCAAACGGCACAGAAAAAGGTCTTATTTGGGTTGATGACCCCGGTAATGTTAGTATAAGATCAGCCGGTGCTTCTGGACCGGTATGGAACTTCTGGAACAGTGGTTCTTGCCAATTCCCAGGTGCTATTAGTAACTATAACGGAATTAGCAGCACTACTAATTACCCTGGTGGTAATAAAAACGACTATTTAAACACGGCAGGATTAGTGTCTAGATTTAGCAATGGTGCTTATGCTTCGTTATATTTCCAAGAATATGTTGGGAATTATCACCAGGCTATTCTTAACGTCAACGGGTATGGCCAAGACAATAGCTTTTACTTTAGAGCTGGCGGTGACTTCATCTGTACCCGCAATGGTTCATTCGATAACGTTGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCTAAATCAGATATTAAAGTTATTGAAAACGCTTTGGAAAAAGTAGAAACACTGTGCGGTAATACTTATGAGCTTCATAACACTTCAGGCGGTACTACCCGTTCTGCGGGTTTAATCGCGCAGGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCGGAAGCAGTTACTCAAGATATTGAAGCGGACGGCGGATTATTGCGTCTGAATTACAACTCAGTAATTGCACTTCTTGTTGAATCTGTTAAAGAGCTTTCTGCTGAGGTTAAAGGCCTTAAAGCGGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
9c30d2db12c7a022b936cdca42fb783941817cd1c88ef084ecd72375da46d320
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6874
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Comparative genomics of Klebsiella bacteriophages in the elucidation of host range specificity Ku,H., Brown,T., Kabwe,M., Chan,H.T., Petrovski,S. and Tucci,J. 2022-11-21 — GenBank