Protein

Genbank accession
YP_010076863.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGQRPAASVLAEGELAINLKDRVLFTKDDQGNIIDLGFAKGGSIDGNVIHKGNYNQTGDYTLNGTFTQTGNFNLTGIARVTRDIIAAGQIMTEGGELITKSSGTAHVRFHDSADRERGIIFSPANDGLTTQVVNIRVQDYKAGSESTFAFNGNGLFSSPEVFGWKSVSTPVIYTNKVITNKKVKDDYDIYSTADNVPLSESTTAINHLRVMRNAVGSGIFHEVKDNDGITWYSGDGLDVYLWSFTWSGGIKSSHSISIGLTPGPKDYSILGPSSIALGDNDTGFKWHQDGYYFSVNNGTKTFLFSPSETTSLRKFVAGYSTNGTDLTTPPTENYALATVVTYHDNNAFGDGQTLLGYYQGGNYHHYFRGKGTTNINTHGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGRNNASTAMFKGNTTGSSSVDNMTISVWGNTFTNPSVGNRKNVMEISDATSWMSYIQRLTTGEVEMNVNGSFESSGVTAGNRGVHTTGEISSGAVNALRIWNADYGAIFRRSEGSLHIIPTAYGEGKYGDIGPLRPFSMALDTGKVTIPDLQSSYNTFAANGYIKFVGHGAGAGGYDIQYAQAAPIFQEIDDDAVSKYYPIVKQKFLNGKAVWSLGTEISSGTFVIHHLKEDGSQGHTSRFNQDGTVNFPDNVSVGGGEATIARNGNIWSDIWKTFTSAGDVTNIRDAIATRVAKEGDTMTGRLTLSAGNDALVLTAGAGASSHIRSDVGGTGNWYIGKGGGDNGLSFYSYITQAGVNITNNGEIALSPQGQGAFNFNRDRLHINGTQWVAHKSGAFGDQWSLEAPIFIDFGSVSNDCYYPIIKGKSAITNEGYISGVDFGMRRITNNWAQGIIRVGNQENGSDPQAVYEFHHNGTLYVPNMVKTGARLSAGGGDPVWTGPCLVIGDNDTGLVHGGDGRINMVANGVHIASWSSAYHLHEGLWDTTGALWTEQGRAIISFGHLIQQSDAYSTFVRDVYVRSDIRVKKDLVKFENASQKLSKINGYTYMQKRGLDEEGNQKWEPNAGLIAQEVQAILPELVEGDPDGEALLRLNYNGVIGLNTAAINEHTAEIAELKSEIEELKALVKSLLK
Physico‐chemical
properties
protein length:1103 AA
molecular weight: 118806,26370 Da
isoelectric point:5,74826
aromaticity:0,09610
hydropathy:-0,32575

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
450–549
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392 Coil
IPR030392
993–1091
IPR030392
YP_010076863.1
1 1103
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage SH7
[NCBI] 		1913049 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010076863.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_054942 [NCBI]
CDS location
range 151546 -> 154857
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACGGCAGGTCAACGTCCAGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATCGTGTACTTTTTACTAAAGATGATCAAGGAAATATTATTGACTTAGGTTTTGCTAAAGGCGGTAGTATTGACGGGAATGTTATTCATAAAGGCAATTATAACCAAACTGGCGATTATACTTTAAACGGTACATTCACCCAGACTGGTAATTTTAATTTAACCGGTATTGCTCGAGTAACTCGTGATATTATTGCTGCTGGGCAGATTATGACTGAAGGCGGAGAACTTATTACAAAAAGTTCAGGAACGGCACACGTTCGTTTTCATGATTCCGCCGACCGTGAACGCGGTATTATTTTTTCTCCTGCTAATGACGGTTTAACTACACAGGTAGTTAACATCAGAGTTCAAGATTACAAAGCTGGTTCAGAAAGCACTTTCGCTTTTAATGGAAATGGTTTGTTTTCTTCACCAGAAGTTTTTGGGTGGAAATCTGTATCAACTCCGGTAATTTATACCAATAAAGTTATCACCAATAAAAAAGTTAAAGATGATTATGACATCTATTCGACGGCAGACAATGTTCCATTGTCTGAAAGCACTACTGCTATTAATCATCTTCGTGTTATGCGTAATGCAGTTGGTTCTGGTATTTTCCATGAAGTTAAAGATAATGATGGAATAACATGGTATAGTGGAGATGGATTAGACGTTTATCTTTGGTCATTTACTTGGAGCGGCGGAATTAAATCAAGTCACTCAATTTCCATCGGTTTAACACCCGGACCTAAGGATTACTCAATATTAGGACCGTCTAGTATCGCTTTAGGAGATAATGATACTGGATTTAAATGGCATCAAGACGGATATTATTTCAGTGTTAACAATGGCACAAAAACGTTTTTATTTAGTCCCAGCGAAACAACTAGCCTAAGAAAATTTGTAGCTGGATATTCTACTAACGGAACCGATTTAACTACTCCTCCAACTGAAAATTATGCTCTTGCTACTGTAGTGACATACCATGATAATAACGCGTTTGGGGATGGTCAGACTCTTTTAGGATATTATCAAGGCGGTAACTATCATCACTATTTCCGCGGTAAAGGTACCACAAACATTAATACTCACGGTGGTTTGTTAGTTACTCCTGGTAATATTGATGTTATTGGCGGTTCTGTTAATATCGATGGTAGAAATAATGCTTCTACAGCGATGTTTAAAGGTAACACAACAGGTAGTAGTTCTGTGGATAACATGACAATTTCCGTTTGGGGCAATACGTTTACTAATCCTAGTGTAGGTAATCGTAAAAACGTCATGGAAATTTCTGATGCAACTAGCTGGATGAGTTATATTCAAAGACTTACAACAGGTGAAGTAGAAATGAACGTTAACGGTTCATTTGAATCATCTGGTGTTACTGCTGGAAATAGAGGAGTTCACACAACGGGCGAAATTTCATCTGGGGCTGTGAATGCGCTTCGTATTTGGAACGCAGATTATGGAGCTATTTTTAGACGTTCAGAAGGCAGTCTTCATATTATTCCAACTGCTTACGGTGAAGGTAAATATGGCGATATCGGTCCACTTCGCCCGTTTAGTATGGCTTTAGATACCGGTAAAGTTACTATTCCAGATTTACAATCAAGTTACAATACGTTTGCTGCTAACGGTTATATTAAATTTGTTGGTCATGGAGCGGGTGCCGGCGGTTATGACATTCAATATGCTCAAGCGGCTCCTATTTTCCAGGAAATTGATGATGATGCTGTAAGCAAATATTATCCTATTGTTAAACAGAAGTTTTTAAATGGTAAAGCTGTTTGGTCTTTAGGTACTGAAATTAGTTCAGGTACATTCGTTATTCATCATCTGAAAGAAGATGGTTCACAAGGCCATACGTCTCGTTTTAATCAAGACGGTACTGTTAACTTCCCAGATAACGTTTCTGTCGGCGGCGGTGAAGCTACTATTGCTCGCAATGGTAATATCTGGTCTGATATCTGGAAAACGTTTACTTCAGCAGGCGACGTAACTAATATTCGCGATGCAATAGCTACTCGTGTTGCTAAAGAAGGTGATACGATGACCGGTAGGTTGACTTTATCTGCTGGAAATGATGCCCTTGTTTTAACTGCAGGCGCGGGTGCTTCATCGCACATCCGTAGTGATGTAGGTGGTACAGGTAACTGGTATATAGGCAAAGGCGGCGGCGACAATGGTCTAAGTTTTTACAGTTACATTACACAAGCCGGTGTGAACATAACAAATAACGGCGAAATAGCGCTTTCTCCTCAAGGACAAGGAGCGTTTAATTTTAATAGAGACCGCCTTCATATAAACGGTACACAATGGGTTGCGCATAAATCTGGCGCCTTTGGTGACCAATGGAGTTTAGAAGCTCCGATATTTATAGATTTTGGTAGTGTCAGTAATGACTGCTATTATCCTATTATTAAAGGAAAATCTGCTATTACTAATGAAGGATACATATCTGGTGTTGATTTTGGTATGCGTCGTATCACTAATAACTGGGCGCAAGGTATTATTCGTGTAGGTAACCAGGAAAACGGTTCTGACCCACAAGCTGTATATGAATTTCACCATAACGGAACTCTGTATGTTCCTAACATGGTTAAAACTGGAGCAAGATTATCAGCTGGCGGCGGCGACCCGGTGTGGACTGGGCCATGTCTTGTTATTGGTGATAATGATACTGGTTTAGTCCATGGCGGTGATGGCCGAATCAATATGGTTGCCAATGGTGTTCATATTGCTTCATGGTCATCTGCTTATCATCTCCATGAAGGTCTTTGGGATACTACTGGTGCTTTGTGGACTGAGCAAGGAAGAGCTATTATTTCTTTTGGTCATTTAATCCAACAGAGTGATGCCTATTCTACATTTGTCCGTGATGTTTATGTCCGTTCTGATATTCGCGTTAAAAAAGACCTCGTTAAATTTGAAAATGCTTCTCAGAAGCTTTCTAAAATTAACGGTTACACTTATATGCAGAAGCGAGGCCTGGATGAGGAAGGTAATCAGAAATGGGAACCTAACGCTGGTTTAATTGCTCAAGAAGTTCAAGCTATTTTACCAGAATTAGTTGAAGGCGACCCTGATGGTGAAGCTTTACTTCGTTTGAACTATAACGGTGTAATTGGTTTAAATACAGCTGCAATCAATGAGCATACTGCAGAAATTGCGGAACTTAAATCAGAAATTGAAGAACTTAAAGCATTAGTTAAATCATTGTTAAAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
f0850df02886089c46b03246e0628eb3a305798b42d25506438f52f021805894
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5282
Evidence 0,5282
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Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterization of two polyvalent phages infecting Enterobacteriaceae Hamdi,S., Rousseau,G.M., Labrie,S.J., Tremblay,D.M., Kourda,R.S., Slama,K.B. and Moineau,S. — — GenBank