Protein

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Genbank accession
YP_112522.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,85
Protein sequence
MDFTSLRLGQLPTAAISLTDNIAHEVGSDLRKATVQELADFVANYASTIQGAGFRPVNVIDGQTLPTTTTKEFILVGKGTYFNVNGGATIVLNEELNALVSNGTFWSIGVEIPVNVELAGIVQTIRSGYTTTTPSENTLFDALALKLNIADLPPPALTPPSIATGLSQGGVSTINTDNTKFDLSAGSGYVINGHSNVDLPIVQRVSWVAKIGNVVPNISSQKQTYVALDINGDLFLTPIPLTATERRNYIRIGVLIHSNNTIISYIDNQPTINIEVGGQVQDLLESLGFRSLSGNRILPVGTNLKIKKELGKAFKPGANFNVLSTQPHSFVLAAQDPITFRYRTQTGIELADTTDINPGIYDVNGTITAMPSTATFVSIQRIYIFQDGVIRIQPGQRSFVDMNTAVNNINSAPFITDNDIENNGLYLGAIAITRNNINLSTTTEVIFIPSQGTTVNGSFATPALGYNAEDVANKQNNLNTDGTGAKYPTVDAVKLALTTKADLVGGLVPANQLPSYVDDVLEFANLVSFPATGEIGKIYIALDSNKQYRWTGSAYIQITNGLIASTNDVPEGSNNLYFTAARVLANVLTGLSTASSAVISATDTVLLAFGKLQAQINGKAPSSGSANYIQNGTAQQTANLNISGTGVFASSVTATGGLFSGILEATGINKKAIVINGSVGVGTYEIGRNQSTGLLEFKGTEATFNGYLFKGPTIDLFTLSDTGAATFASSLTANSLAITTAPTTSTGTPPILTYNASNKAIESLPYSSIGSAFKRKQYISFSPNQSFAASSSWYTYPNGTTTNLSNTPMTTTTAIPTDQFATQSKQTLNSPIFSNSKVTNVFFSIESNTSPAVPMDLVIQVKRASTSFNKILARQTITLASGFLEGTFTAGNLDLTTALNPLDQIRLFINNGNLAVNAYDFTITLEITEN
Physico‐chemical
properties
protein length:930 AA
molecular weight: 98598,59580 Da
isoelectric point:5,08734
aromaticity:0,07957
hydropathy:0,02935

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Flavobacterium phage 11b
[NCBI] 		294631 No lineage information
Host Flavobacterium sp.
[NCBI] 		239 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > FCB group > Bacteroidota/Chlorobiota group > Bacteroidota

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_112522.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_006356.2 [NCBI]
CDS location
range 24418 -> 27210
strand +
CDS
ATGGATTTTACAAGTTTAAGATTAGGTCAATTACCAACAGCTGCAATTAGCTTGACTGATAATATTGCACATGAAGTAGGTAGCGATTTAAGAAAAGCGACAGTACAAGAACTAGCTGATTTTGTAGCAAATTACGCTAGCACTATACAAGGCGCAGGATTCAGACCTGTGAATGTAATAGATGGGCAAACATTACCAACCACAACTACAAAAGAGTTTATTTTAGTAGGTAAAGGAACATACTTTAATGTTAACGGAGGTGCTACAATAGTATTAAATGAAGAGTTAAATGCTTTAGTTAGTAATGGCACTTTTTGGTCTATAGGTGTTGAAATACCTGTTAACGTAGAGTTAGCTGGCATAGTTCAAACTATTAGAAGTGGCTATACAACAACTACTCCTAGTGAAAACACTTTGTTTGATGCTTTAGCTTTAAAATTAAATATTGCAGATTTACCACCTCCAGCATTAACACCACCCTCTATAGCAACTGGTTTATCTCAGGGGGGTGTATCGACTATAAATACAGATAATACTAAATTTGATTTAAGTGCAGGCTCAGGTTATGTTATAAACGGTCATTCAAATGTAGATTTACCAATAGTGCAAAGAGTTAGTTGGGTTGCTAAAATTGGTAATGTAGTGCCTAATATATCTAGTCAAAAACAAACATATGTAGCTTTAGATATTAACGGGGATCTTTTTTTAACTCCTATACCTTTAACAGCAACCGAAAGAAGAAATTATATTAGAATAGGTGTTTTAATACATTCTAATAATACTATTATATCTTATATTGACAATCAACCTACTATTAATATAGAGGTAGGTGGTCAGGTTCAAGATCTTTTAGAGTCTTTAGGTTTTAGATCTTTAAGCGGTAACAGAATTTTACCTGTAGGAACTAATTTAAAAATAAAAAAAGAATTAGGTAAGGCTTTTAAACCAGGGGCGAATTTTAACGTTTTATCAACACAACCACATTCTTTTGTTTTAGCTGCTCAAGACCCTATTACATTTAGATACAGAACTCAAACAGGTATAGAGCTTGCAGATACAACAGATATAAACCCAGGTATTTATGACGTAAACGGTACGATAACAGCGATGCCATCAACAGCAACATTTGTAAGTATTCAAAGAATATATATTTTTCAGGATGGGGTAATAAGAATACAACCAGGGCAAAGGTCTTTTGTCGATATGAATACCGCTGTAAACAATATAAATTCAGCCCCTTTCATTACGGATAATGATATAGAAAATAATGGTCTTTATTTGGGTGCGATTGCTATAACTAGAAATAATATTAATTTAAGCACTACGACAGAGGTTATTTTTATCCCGTCTCAAGGTACTACTGTTAATGGGTCTTTTGCCACTCCTGCTTTAGGATATAATGCTGAAGATGTTGCTAACAAACAAAATAATTTAAATACCGACGGAACAGGTGCAAAATATCCTACAGTTGATGCTGTAAAATTAGCTTTAACTACAAAAGCTGATTTAGTAGGTGGTTTAGTACCTGCTAATCAATTACCATCTTATGTTGATGACGTCTTGGAATTTGCTAATTTAGTTTCTTTTCCTGCTACAGGAGAAATAGGAAAAATATACATTGCATTAGATTCTAATAAGCAGTATAGATGGACAGGTTCTGCTTATATCCAAATAACAAACGGTTTAATAGCTTCAACAAATGATGTTCCTGAAGGCTCTAATAACCTTTATTTTACCGCCGCTAGGGTTTTAGCTAATGTTTTAACAGGTTTATCTACTGCTTCTAGTGCGGTTATTTCTGCTACTGATACTGTTTTATTAGCCTTTGGAAAACTACAGGCTCAAATTAACGGAAAAGCACCTTCAAGCGGTTCAGCTAACTACATTCAAAACGGAACGGCTCAACAAACTGCAAATTTAAACATAAGCGGTACTGGAGTTTTTGCTTCAAGTGTTACGGCAACGGGGGGACTATTTAGCGGTATTTTAGAAGCTACAGGAATTAATAAAAAAGCAATTGTAATTAATGGCAGTGTGGGCGTTGGAACTTACGAAATTGGAAGAAATCAAAGTACAGGATTATTAGAGTTTAAAGGTACTGAAGCAACTTTTAACGGATATTTATTTAAAGGTCCAACAATAGATTTGTTTACTTTATCTGATACTGGAGCAGCTACATTTGCTTCAAGTCTTACTGCTAATAGTTTAGCAATAACAACAGCCCCCACAACATCAACAGGAACGCCACCTATATTGACTTATAACGCTAGTAATAAAGCTATTGAAAGTTTGCCTTATAGTTCTATAGGCAGTGCCTTTAAGAGAAAACAGTACATATCATTTAGTCCTAATCAAAGTTTTGCAGCTTCTTCAAGTTGGTACACCTATCCAAATGGCACGACTACTAATTTGAGCAACACGCCTATGACTACGACAACTGCAATACCAACAGACCAATTCGCAACTCAAAGTAAACAAACATTAAATAGTCCTATTTTTTCTAATTCAAAAGTAACAAATGTATTTTTCAGTATTGAATCAAACACGTCTCCTGCTGTTCCGATGGATTTAGTAATACAGGTTAAAAGAGCGTCTACTTCTTTTAATAAAATATTAGCTAGGCAAACCATAACTTTAGCTAGTGGATTTTTAGAGGGTACTTTTACAGCTGGTAATTTAGATTTAACAACTGCTTTGAATCCTTTAGATCAAATAAGATTATTTATAAACAACGGTAATTTAGCAGTAAATGCATACGATTTCACAATAACTTTAGAAATAACTGAGAATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
9ab0dfa8e5138aee2999118cc3b46d93e0c6b5a8fb202ed16e362cd2d9fc81ce
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5496
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50