Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_004009603.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,66
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,63
Protein sequence
MSDAINKQFRASYGLDAAGEKLINVALADRTVMSDGINVEYMIQENTIQAYSETRAYPKGFAVMHNDRMWVSIVDIAKPSGVFNEAKWEPLRVDPKWILVDSGVKILQSGQYISVDTSQGNPIEFTLPSDAIDGDTIVVKDIGGRPGFTDVVVKAGVQSIVNFQARVREVKMTIPYSQFVFVYNNRLWQLHNTVQPDNAITANTSNIADIQAGQTVIRQYNTLAPITMRLPKNANNGDIIHFVGMDKPSEPYYHLIVNTFDANTSVEVQGQTTFELKRSFSGYFIFNSTTKTWALYDADLSDRLRTVGADTLLFPGETVSVVGTNNTTIQTITLTLPQGVSPGDQITVALNXMRXXQTVKIVPSGTDKILTDMNMMQFPKRSSYPPAGNWVNTTELSFNGTTSYPPIITFAYILWALLVNGWLFKTCHNWSALTQLMIALVLVLVLLLLLLSPMGPISQWMVVQNVPQLERVDPTDDSTRARLGVIALATQAQANLNHENITAASKEVAITPETLANRTATETRRGIAEIATTAEVNQVSTATYLDDVIVTPKKLNERAATETMRGLAEIATQAETNAGTDDITIITPKKLEARRATPTMAGIAKLVNVGGLPVAPGVGVTRDNEGTGIFAHSNFTDIVTPKTLREMRATELSAGIVFLATENETIAGSVSTAAYPLVVTPDQLHKKTATEGRIGFSEIATQAETNAGTDDFRFITPKKLAGRGSTETMTGVARIATQSEFDSGILDNVISTPLKIKTYFNSTSRTSVNSDSGLVETGTLWNHYNLNILEASITQRGTLKLSDQTLTNTGVDDTTAVTPKTLHNKKSTQTTEGIIRTATNAEATTGTSTILAITPVTLKHIVQTETTWEATTTRRGMVKLTEGALTFVGNDTVGSTAALDTYLKTGYAISPYELNKTLANYLPLKAKAVDSDLLDGLDSLQFIRRDIDQTVAGNLTLNSNLIGNDVTTRTRFVTQTGRIESDATHYIDLGKSGTNKLDLGSVGGVVNIVDSSTGSTVTSFAGGNATVNGKTTTNSLEVTTIANVKGSIQINAKSAVTLISNAVTLGDLSTSMNLRSTDSGNILATDGTGSSRVLTEKNFVEITDRNFVNQAGDTMTGRLTVNAPSSSTFTGVTSTNIHQNPTAASIGTWTVEITDSAIYNQLNGYLVPIYVNHPDTGLPILDHYDEVKSGGTLSQFGTDLKTSYQIWVPKPTVTTQDHTANTMWIRHFNVAKNAWDGFARVYTSNQPPTAADIGAMSNDGSMFNNFRVRDWIQIGNMRIYADQASRTVKFDWID
Physico‐chemical
properties
protein length:1294 AA
molecular weight: 139954,98920 Da
isoelectric point:5,51937
aromaticity:0,06894
hydropathy:-0,15786

Domains

Domains [InterPro]
DC_0097
STR
18–544
DC_0097 IPR048391
DC_1209
STR
424–1283
DC_1209
YP_004009603.1
1 1294
Architecture
STR
ATT
STR
STR 18-1140 | ATT 1141-1242 | STR 1243-1283 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter phage Ac42
[NCBI] 		762660 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Acinetobacter
[NCBI] 		469 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Moraxellales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_004009603.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_014660 [NCBI]
CDS location
range 152515 -> 156399
strand +
CDS
ATGTCTGATGCTATTAATAAACAATTCCGTGCGTCATACGGTCTGGACGCTGCTGGCGAAAAACTAATCAACGTAGCATTAGCAGACCGAACAGTAATGTCAGATGGTATTAATGTAGAATACATGATTCAAGAAAATACCATCCAAGCATACAGTGAAACTCGAGCTTATCCTAAAGGATTCGCTGTAATGCATAATGATCGCATGTGGGTATCTATTGTAGATATTGCTAAGCCTTCTGGTGTTTTTAATGAGGCTAAATGGGAACCTCTTCGTGTTGACCCTAAATGGATTCTTGTCGATTCCGGAGTAAAGATTCTTCAATCTGGACAGTACATTTCTGTTGACACGTCACAAGGTAATCCTATTGAATTCACTCTTCCTTCTGATGCTATCGATGGCGATACTATCGTAGTAAAAGATATTGGTGGACGACCTGGTTTTACCGATGTTGTAGTTAAAGCTGGTGTTCAGTCAATTGTTAACTTCCAAGCTCGTGTCCGTGAAGTTAAGATGACGATTCCATATTCACAATTTGTTTTTGTCTATAATAATCGTTTATGGCAATTACACAATACTGTTCAACCAGATAATGCGATCACAGCTAACACTTCTAATATTGCAGATATTCAAGCCGGACAAACTGTAATTCGTCAATATAATACGTTAGCACCGATCACGATGCGTCTCCCGAAGAATGCTAATAATGGTGACATTATTCATTTTGTTGGTATGGATAAACCATCCGAGCCGTATTACCATTTAATTGTTAATACGTTTGATGCCAATACTTCTGTTGAAGTACAAGGCCAAACTACTTTCGAGCTTAAACGTTCTTTTAGTGGTTATTTTATTTTCAATTCAACAACTAAAACTTGGGCATTGTATGATGCAGATTTATCAGATCGTCTTCGTACTGTTGGCGCTGACACTTTATTGTTCCCTGGTGAAACTGTATCTGTGGTTGGAACAAATAATACAACTATCCAAACTATTACTTTGACTTTACCTCAAGGTGTTTCACCAGGTGATCAAATCACTGTAGCTTTAAACTRCATGCGTAWAKGTCAAACTGTTAAGATCGTCCCATCTGGTACTGATAAAATCTTAACAGATATGAATATGATGCAGTTCCCTAAACGTTCTAGCTATCCACCTGCTGGCAACTGGGTAAACACAACTGAATTATCATTTAACGGTACTACAAGTTATCCACCAATCATTACATTTGCTTATATCCTATGGGCCCTATTAGTCAATGGATGGTTGTTCAAAACGTGCCACAATTGGAGCGCGTTGACCCAACTGATGATAGCACTCGTGCTCGTCTTGGTGTTATTGCTTTTGCTACTCAGCCCTATGGGCCCTATTAGTCAATGGATGGTTGTTCAAAACGTGCCACAATTAGAGCGCGTTGACCCAACTGATGATAGCACTCGTGCTCGTCTTGGTGTAATTGCTTTAGCTACTCAAGCGCAAGCTAATTTAAATCATGAGAATATTACAGCTGCTTCTAAAGAAGTTGCTATTACTCCAGAAACTTTAGCAAATCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGTGGTATTGCAGAAATTGCGACCACTGCAGAAGTCAACCAGGTGTCCACAGCGACATATTTAGACGACGTTATAGTTACACCAAAGAAACTTAACGAACGTGCCGCTACTGAGACTATGCGTGGTTTAGCAGAAATTGCTACACAAGCTGAAACTAATGCTGGTACTGATGACATTACAATCATTACTCCTAAAAAGTTAGAAGCACGTCGTGCAACGCCGACTATGGCGGGTATTGCAAAATTAGTAAATGTTGGTGGTTTGCCTGTTGCACCTGGAGTTGGTGTTACACGTGATAACGAAGGTACTGGAATTTTTGCTCATAGCAATTTTACTGACATCGTTACACCAAAAACACTACGTGAAATGCGTGCAACTGAATTAAGTGCTGGTATTGTTTTCTTAGCTACTGAAAATGAAACAATTGCTGGGTCTGTTTCAACAGCTGCTTATCCATTAGTGGTAACGCCTGATCAATTACATAAGAAAACAGCCACAGAAGGAAGAATTGGATTTAGCGAAATTGCTACACAAGCTGAAACTAATGCTGGTACTGATGATTTTCGTTTTATTACACCTAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTTCTACAGAAACTATGACAGGCGTTGCACGCATTGCTACGCAATCAGAATTTGATTCTGGTATATTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTAAAACTTATTTTAATAGTACATCCCGTACATCTGTCAACTCCGATAGTGGATTAGTAGAAACTGGAACCTTATGGAACCATTATAACCTAAACATTCTTGAAGCAAGTATTACTCAGCGTGGTACGCTCAAGCTAAGCGATCAAACTTTAACCAATACTGGCGTAGATGATACAACTGCTGTGACTCCTAAAACGCTTCACAACAAAAAATCTACACAAACAACCGAAGGCATTATTCGTACAGCGACTAATGCGGAAGCAACAACAGGTACTTCAACAATTCTTGCAATTACGCCTGTGACATTAAAGCATATTGTACAGACCGAAACTACTTGGGAAGCAACTACTACACGTCGAGGTATGGTAAAATTAACAGAAGGCGCATTGACCTTTGTTGGTAATGATACAGTTGGTTCTACTGCTGCGTTAGATACTTATTTGAAGACTGGATATGCAATTTCGCCGTACGAATTGAATAAAACATTAGCAAATTATTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGTTGATTCTGATTTGCTCGATGGTTTAGATTCGCTTCAATTTATTCGTCGTGATATTGATCAAACTGTTGCAGGCAATTTGACATTAAATAGCAATTTGATTGGTAATGACGTCACAACACGTACTCGTTTTGTTACACAAACTGGACGAATTGAATCAGACGCAACACATTACATCGATTTAGGTAAATCTGGAACAAATAAACTTGATCTAGGTTCTGTTGGTGGTGTTGTTAATATTGTTGATTCGTCAACAGGCTCAACAGTTACATCTTTTGCCGGTGGTAATGCAACTGTAAATGGTAAAACAACTACTAATTCATTAGAAGTTACAACCATTGCAAATGTTAAAGGCTCAATCCAAATCAATGCTAAAAGTGCAGTTACATTGATTTCAAATGCTGTAACTCTTGGTGATTTGTCAACATCAATGAATTTACGTTCAACAGATTCTGGCAACATCCTTGCAACAGATGGAACCGGATCAAGTCGTGTATTAACAGAGAAAAACTTTGTTGAGATCACTGATCGAAACTTTGTTAATCAGGCTGGCGATACAATGACTGGGCGTTTAACTGTTAATGCTCCATCAAGTTCAACATTTACAGGTGTAACATCGACAAACATCCATCAAAATCCTACTGCTGCTTCAATTGGTACATGGACTGTAGAGATTACAGATTCAGCAATTTACAATCAATTGAATGGTTACTTGGTTCCGATTTATGTGAATCATCCTGATACAGGTCTTCCTATTCTTGATCATTATGATGAAGTAAAATCTGGTGGTACATTATCTCAATTTGGTACTGATCTTAAAACCTCATATCAAATCTGGGTCCCTAAACCTACAGTTACAACTCAGGATCACACTGCTAATACAATGTGGATTCGACATTTTAACGTCGCTAAAAATGCTTGGGATGGCTTTGCTCGTGTGTATACATCGAATCAACCACCTACAGCAGCTGATATTGGCGCTATGAGTAATGACGGTTCTATGTTCAACAACTTCCGTGTTCGTGATTGGATTCAAATTGGAAACATGAGAATCTATGCTGACCAAGCATCAAGAACAGTTAAGTTTGATTGGATTGATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
26e154670dd5399e6fa1a262aaa383713e2305e2bc998d9b86dceda398e05c78
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7577
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50