Protein

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Genbank accession
WJZ47901.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,82
Protein sequence
MPLSRLENFLKNVEGNIIYVNPADLDSTDAIENQGNSQARPFKTIQRALIEAARFSYNIGVENDKFDRTSILLMPGTYVVDNRPGFSIVNSSGTASFRDINGEVQTVLQLTNNSNFDIEDPDNDLYKFNSTEGGIIVPRGTSIVGLDLRKTKIRPKYVPDPYNASINPSAIFKVTGGCYFWQFSFFDGDINSSVYYNNTKSLKAPTFSHHKLACFEYADGVNGVGIGTSSGLTDLQMYYYKLTRAYGASSGRDIQDFPTGEDFQPSSPEFKIVGAVSANDIGISSAVSVSANPLTVTVNTDIAHGLSKDDIIRISGFSSSIYNGSWIVTGIGSDRQFDINIGAIPPTSGVVLNGGEKLIIEPDNVNGASPYIFNCSMRSVYGMSGLHGDGSKSTGFKSIVVAQFTGISLQRDDNAFVIYNRNTGTYQDNDTAINAGISSVPLHLNSQAIYKPEYESYHVKTSNSSFIQAVSIFSIGFSQHFLAESGGDISITNSNSNFGARSLVAKGFQEQSFDRDDVGYITHIIPPKDLPNDPDTKTWLSLNVGLTTNAPGITTTNRVYLYGSTSVDNPPPHIVDSFSIGAKQDEILYVNVATATSEVALSAPILMPIPDGTDGPTSEKSFKVIRVGAANSITSGNTLNFETPHTLFTGESVRVLADDGLTPDGLITNNIYYAITGGALSSNQIQLSKSLNDAISGTPVPIDIYNTGGGLLRVVSRVNDKSPNDIGHPIQYDSANSNWYVTTSSSTSKNTIRSGFTTYRQFLITGESSKSFITRKIDTRSVNDRIYRFRYVIPKEYSVAREPSLNYIIQETKSSGVENSSEFTLVDNQIKKRNHKIISNVSYDSINNLVTVTTELPHKFMVGDKVTLQNVRSTDNTTGASNSGYNGINSVTSVLNSKQFQYSVDLSLGTFIDNLSTRNEGLPYVYRQEYKNTFYIYTIEKLETHEYNKTDGVYHLTCLTSNVSPSDTFFNGYNFSQSPSNLYPTLDRDNFNSDPVQSITNAKNDLLGKVVINSRQNSITKETVATFLRNNRIGIAITDAKNNAGITSIFTEVEHNFNSVKSLSIVSAGANYGYSGIATVLYNAKLIGIGITGEGATANVSVSAAGTINGVTVVDGGSAYGVGMTMTVIGVTTQASWSPAVVSVSAINNNIGDAIEIVGVGTTGNRTNSGYNGLYRISGITSSKIFTYDNGGNPGIYTGTTNVSGYARLTDEVGVATGIQYSDTTTGIVTVFTSNPHGLQSGEKFTIVGAAQTVYNGTYLVKNRLHVNSFNFYIGAGFTNPSFTGSCFVLSGATSSKGADTAIADEKIGGRMVPFYAGISTTTSTGITTSGTTITLGNIVGFNTGDFLQIDNEVIRISGSINTSTNTANIIRGTLGTKAEPHDTNSLIRKINVIPTELRRHSILRASGHTFEYVGFGHGNYAAALPSRQNRILTREEQFLTQSVLSDGGTAAYTGTNDSGDFYIGNKIISPINNTEISINVPTETYLGVNDSSLSVTYDDITINNSLKVTGGIGNFQSSEFRGPVSLYKKLTSTATDGIEAIKLELKGNATQVRSYTVGISTPSTVVTQGDVVYNSTPEVGKFLGWTYTGAATGWKRFGLVSQQANSTVITPDQIGIGTAQPQDLLQITGGGAIFDQLRVTGIVTFDNGGSVNRISLGDVQNVGFTTFLSGSGLQVLTGAGASFAGITTFGGVVGTRVAITTNTYLNVAGVSTFTGNVRMGNLEVDTINIVFPDGFTGTASNTKNIITAGVSTNSSHYLPFVSSSTGVDQATGGEKLFVDPGVSYNPSTNKLTLTGDIQSNSTFIGNLANTLTLNTSGTGISGSTTFNNSAAATFTVTSNATSNNTNDTIVSRNGLGGFVAGIVTATTFIGNLTGTVTGSVNSVSSSVDYLSTINQITSGISTFSGSANNINQTAGTAALNRLTVAGITTFTGNVSAASSLAVTGATTLQSSLAVTGATNLNGNVTLGDASADLITISGTINSAVLPTSNTYNLGGLSNLWLNVYANTFHGAFNGNASTATTLQTARNINGVSFNGSGDITITANTTNTLTKGSYLTGSNFNGSAATTWAVDADTAATGSKIVARDPNGYVFAAYFNAPDGDTASVGRILVKNGSDNYYRSATAATIASFLSGQSMNISGSSTSCSGNSATSSQVYVNTGNNSSTFYLLGATSTGAYNSVYGDSDFYFTGSNTLYATNMTVGSTLTINSDISLKTNIEPLEGSLAKILSLRGVEYDRVDREKHQIGLIAQEVEEVLPEIVSETDKGLKTVEYTSIIPILIEAIKELKAEIDELKKTK
Physico‐chemical
properties
protein length:2297 AA
molecular weight: 243491,68260 Da
isoelectric point:5,30913
aromaticity:0,08620
hydropathy:-0,13539

Domains

Domains [InterPro]
DC_0066
STR
1–1221
DC_0066 DC_0613
DC_0066
STR
1190–1929
DC_0066 IPR030392
IPR030392
CHP
2209–2260
IPR030392 Coil
WJZ47901.1
1 2297
Architecture
STR
RBD
STR 1-1929 | RBD 2002-2297
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WJZ47901.1
1 2297
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 82 82 0,8072
Central domain 83 448 367 0,8618
C-terminal 449 2297 1848 0,2484
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-82
Central
83-448
C-terminal
449-2297

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage DSL-LC03
[NCBI] 		3058961 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WJZ47901.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR003938.1 [NCBI]
CDS location
range 41658 -> 48551
strand +
CDS
ATGCCACTAAGTAGACTGGAGAATTTTCTCAAAAACGTAGAAGGGAATATTATTTACGTCAATCCAGCAGATCTAGATTCGACTGATGCAATTGAAAACCAGGGTAATTCACAAGCAAGACCTTTTAAAACAATTCAAAGAGCACTGATTGAAGCTGCTCGTTTTTCCTATAATATTGGTGTAGAAAACGATAAGTTTGATAGAACATCAATTCTTTTGATGCCTGGTACTTATGTTGTAGACAATAGACCTGGATTTAGTATAGTTAACTCTTCTGGAACAGCATCGTTTCGTGATATTAACGGGGAAGTCCAAACAGTACTACAATTAACTAATAATAGTAACTTTGATATTGAAGATCCTGATAATGATCTATATAAATTCAATTCTACTGAAGGTGGTATTATTGTACCTAGAGGTACTTCTATTGTTGGTCTCGATCTTCGTAAAACAAAAATTAGACCAAAATATGTTCCTGATCCATATAATGCGTCTATAAATCCATCGGCTATATTTAAAGTTACTGGTGGTTGTTACTTCTGGCAGTTTTCTTTCTTTGATGGTGATATTAATAGCAGTGTATACTATAATAATACTAAAAGTCTGAAGGCACCTACGTTTTCACACCATAAACTAGCTTGCTTTGAGTATGCAGATGGTGTAAATGGTGTTGGAATTGGAACCTCATCAGGTCTTACCGATCTTCAAATGTATTACTATAAGCTTACTAGAGCTTATGGTGCAAGTTCTGGAAGAGATATACAAGATTTCCCAACTGGAGAAGATTTCCAACCATCTTCACCAGAATTTAAAATTGTTGGTGCTGTAAGTGCTAACGATATTGGTATTTCTAGTGCAGTTTCAGTATCTGCAAATCCACTTACAGTTACAGTCAATACTGACATTGCTCATGGATTATCTAAAGATGACATTATTCGCATTTCTGGATTTTCTTCTTCGATTTATAACGGATCTTGGATTGTTACTGGTATTGGTAGTGATAGGCAATTTGACATTAATATTGGAGCAATACCACCTACATCAGGCGTAGTTTTAAATGGTGGCGAAAAACTTATTATTGAACCTGATAATGTAAATGGTGCATCACCATATATCTTTAACTGTTCAATGAGATCAGTTTATGGTATGTCTGGTCTTCATGGTGATGGTTCTAAATCAACTGGTTTCAAATCAATTGTTGTAGCTCAATTTACTGGCATTTCACTTCAACGTGATGACAATGCTTTCGTAATTTATAATAGAAATACTGGAACATACCAAGACAATGATACTGCAATTAATGCTGGTATTTCTTCTGTTCCTTTACATTTAAATTCACAAGCAATTTATAAGCCTGAGTATGAATCTTATCACGTCAAGACTTCTAACTCCTCATTTATTCAGGCGGTTTCGATCTTCTCAATTGGTTTTTCTCAGCATTTCTTAGCTGAGTCTGGTGGTGACATTTCGATTACTAACTCAAACTCCAACTTTGGTGCTAGATCTTTAGTTGCAAAGGGATTCCAAGAACAATCATTTGATAGAGATGATGTAGGTTACATTACTCACATTATTCCACCAAAAGATCTACCAAATGATCCTGATACTAAAACTTGGTTATCTCTTAATGTTGGATTGACGACTAATGCCCCTGGTATTACTACTACTAATCGTGTTTATCTTTATGGATCAACTAGTGTAGATAATCCACCTCCACATATTGTAGACTCTTTCTCTATTGGTGCGAAGCAAGATGAAATTCTTTATGTAAACGTTGCAACTGCAACATCTGAGGTTGCATTAAGTGCTCCAATTTTAATGCCTATTCCTGATGGTACAGACGGACCAACATCAGAAAAATCATTTAAAGTTATTCGTGTAGGTGCCGCTAACAGCATTACTTCTGGTAATACATTAAATTTTGAAACACCTCATACTTTATTTACTGGAGAAAGTGTTAGAGTTTTAGCTGACGATGGATTGACTCCAGATGGTTTGATCACAAACAACATTTACTATGCCATCACTGGTGGAGCATTATCATCTAATCAAATTCAACTTTCTAAGAGTTTAAACGATGCTATTTCGGGAACACCAGTACCAATTGACATTTATAATACTGGTGGTGGTTTATTAAGAGTTGTTAGTAGAGTTAATGATAAGTCACCAAATGATATTGGACACCCAATTCAATATGATTCTGCCAACTCCAATTGGTATGTAACTACGTCGTCATCGACATCTAAAAATACAATCAGAAGTGGATTTACCACCTATAGACAATTCTTAATTACTGGTGAAAGCTCTAAATCATTTATCACTAGAAAAATTGATACTCGTTCTGTAAATGATAGAATTTATAGATTCCGTTATGTTATTCCGAAAGAATATTCTGTTGCAAGAGAGCCATCTTTAAACTATATTATTCAAGAAACTAAGAGTAGCGGTGTAGAAAATTCCTCTGAATTTACATTAGTTGATAATCAAATTAAAAAGAGAAATCATAAAATTATATCAAATGTTTCCTATGATTCTATTAACAATTTAGTTACTGTTACAACTGAACTACCACATAAATTTATGGTAGGTGATAAAGTAACGCTTCAAAATGTAAGAAGTACAGATAATACAACTGGTGCTTCTAATAGTGGTTATAATGGCATTAATAGTGTCACTTCAGTATTAAATTCAAAACAATTCCAATACTCAGTTGATTTATCTTTAGGAACTTTCATTGACAATTTATCCACACGAAATGAAGGACTTCCTTATGTTTATAGACAAGAATATAAAAATACTTTCTACATTTATACAATTGAAAAATTAGAAACTCATGAATACAATAAAACTGATGGTGTATATCATTTAACTTGCCTAACAAGTAATGTAAGTCCATCGGATACTTTCTTCAATGGTTATAATTTTTCTCAAAGTCCATCAAATCTATATCCAACATTAGATAGAGATAACTTTAATTCTGATCCAGTACAATCAATTACAAATGCCAAAAATGATCTTCTAGGTAAAGTTGTTATTAATAGTAGACAAAATAGTATTACTAAAGAAACTGTTGCTACATTCTTAAGAAACAACAGAATTGGTATCGCTATTACGGATGCAAAAAATAATGCTGGAATCACTTCTATTTTCACTGAAGTTGAGCATAATTTTAACTCAGTAAAATCACTTTCGATCGTCTCTGCAGGTGCTAATTATGGATACTCTGGTATTGCCACTGTTCTTTATAACGCAAAGCTTATTGGTATTGGTATTACTGGTGAAGGTGCGACAGCTAATGTCTCAGTAAGTGCAGCTGGTACAATCAATGGCGTTACTGTAGTTGATGGTGGTTCTGCCTATGGTGTAGGTATGACCATGACAGTCATTGGAGTTACTACACAAGCTTCATGGTCTCCTGCAGTTGTTTCAGTTAGTGCAATCAATAATAACATTGGTGATGCAATTGAAATTGTTGGTGTTGGTACAACAGGAAACAGAACTAATAGTGGATATAATGGACTCTATAGAATTTCTGGCATCACTAGCAGCAAGATCTTTACATATGATAATGGTGGAAATCCTGGCATTTATACTGGAACTACTAATGTTAGTGGATATGCTAGATTAACTGATGAAGTTGGAGTTGCAACTGGAATTCAATACTCAGATACTACAACAGGAATTGTAACAGTCTTTACATCAAATCCTCATGGTCTACAATCTGGAGAAAAATTCACGATTGTAGGTGCTGCTCAAACAGTATACAACGGAACTTATCTTGTAAAAAATAGATTGCATGTTAACAGCTTTAATTTCTATATTGGAGCTGGATTTACAAATCCATCCTTTACAGGAAGTTGTTTTGTTCTAAGTGGTGCTACAAGTTCTAAAGGTGCTGATACTGCAATTGCTGATGAAAAGATTGGTGGTAGAATGGTTCCATTCTATGCTGGTATTAGTACAACTACTTCTACTGGCATTACAACTTCAGGAACAACAATTACACTAGGAAATATTGTTGGATTTAACACAGGTGATTTCTTACAGATTGATAACGAAGTCATTCGTATTAGTGGAAGCATTAATACTTCAACAAATACTGCTAACATTATTAGAGGTACTCTTGGAACAAAGGCAGAACCTCATGATACAAATTCACTTATTAGAAAAATTAATGTAATTCCAACAGAACTAAGAAGACATAGTATTTTACGTGCTTCTGGTCATACATTTGAATATGTTGGTTTTGGTCATGGTAACTATGCCGCTGCTTTACCATCCAGACAGAATAGAATTCTAACTAGAGAAGAGCAATTCTTAACACAATCAGTTCTGAGTGATGGTGGTACTGCTGCTTATACTGGTACAAATGATAGTGGCGATTTCTATATTGGTAATAAGATTATTAGCCCAATTAACAACACTGAAATTTCAATTAATGTACCAACTGAAACTTATCTTGGAGTTAATGATTCTAGCCTTTCAGTAACTTATGATGATATCACTATTAATAATAGTTTAAAGGTAACTGGTGGCATTGGTAACTTCCAATCATCAGAATTTAGAGGTCCAGTTTCTCTCTATAAGAAATTAACTTCTACAGCAACTGATGGTATTGAAGCTATTAAGTTAGAACTTAAAGGTAATGCAACTCAGGTTAGATCATACACTGTTGGTATTTCGACTCCATCAACTGTTGTTACTCAAGGTGATGTGGTATACAATAGCACTCCTGAAGTTGGTAAATTTCTAGGTTGGACTTACACTGGCGCAGCAACTGGTTGGAAGAGATTTGGTTTGGTTAGCCAACAAGCTAATTCTACTGTAATTACTCCAGATCAAATTGGTATTGGTACAGCACAACCACAAGATTTGCTTCAAATTACAGGCGGTGGTGCTATCTTTGATCAACTCAGAGTTACTGGTATCGTAACCTTTGATAATGGTGGTAGTGTTAATAGAATTTCTCTTGGTGACGTTCAAAATGTTGGCTTTACAACATTCCTTTCTGGGTCTGGATTGCAAGTTTTAACAGGAGCTGGAGCCTCTTTTGCAGGAATTACAACCTTTGGTGGAGTTGTTGGCACTAGAGTTGCAATTACAACTAACACTTATTTGAATGTTGCTGGTGTATCAACATTCACTGGTAACGTTAGAATGGGCAATCTTGAAGTTGATACGATTAATATTGTATTCCCAGATGGATTTACTGGAACTGCATCAAACACCAAAAATATAATTACTGCTGGTGTTTCAACAAATTCATCACATTATCTACCATTTGTATCAAGTAGCACTGGAGTAGATCAAGCAACTGGTGGAGAAAAACTATTTGTTGATCCTGGCGTTTCTTATAATCCTTCAACAAATAAATTAACTCTCACAGGGGACATTCAATCCAATTCCACTTTTATTGGAAATCTAGCAAATACACTAACACTGAATACTAGTGGTACTGGTATTAGTGGATCAACTACATTTAATAATTCTGCTGCTGCAACATTTACTGTTACCTCCAATGCAACCAGTAATAATACTAATGATACTATTGTTTCTAGAAATGGATTAGGTGGATTTGTTGCTGGTATTGTAACAGCTACAACTTTTATTGGAAATCTGACAGGAACTGTAACGGGAAGTGTAAATTCAGTATCTTCTTCAGTAGATTATCTTTCTACTATAAATCAAATCACAAGTGGTATTTCAACCTTTAGTGGTTCTGCAAATAATATCAATCAAACTGCTGGTACTGCAGCACTCAATAGATTAACAGTTGCAGGTATAACTACCTTTACTGGAAATGTAAGTGCAGCTTCTTCATTAGCTGTTACTGGAGCAACAACACTTCAATCAAGTCTTGCAGTTACTGGAGCAACTAATTTAAATGGTAATGTTACATTAGGTGATGCTTCTGCAGATCTTATTACAATTTCAGGAACAATTAATAGTGCTGTTTTACCAACAAGTAATACTTATAATCTAGGTGGATTATCAAATCTTTGGCTAAATGTTTATGCAAACACATTTCATGGTGCTTTTAATGGAAATGCAAGTACAGCAACTACATTACAAACTGCTAGAAATATTAATGGTGTTTCCTTCAATGGTAGTGGTGATATCACAATCACTGCAAATACGACAAACACTTTAACAAAAGGAAGTTATTTAACTGGTTCTAACTTTAATGGATCTGCTGCTACAACTTGGGCGGTTGATGCTGATACAGCTGCAACTGGAAGCAAAATCGTAGCTAGAGATCCTAATGGATATGTATTTGCAGCATACTTTAATGCTCCTGATGGAGACACCGCATCAGTTGGTAGAATTTTAGTTAAGAATGGTAGTGATAACTATTATAGATCTGCAACTGCCGCAACCATAGCATCGTTCCTCAGTGGACAATCTATGAATATTAGTGGTTCCTCTACATCCTGTAGTGGAAACTCTGCAACATCAAGTCAGGTTTATGTAAATACTGGAAATAATAGCAGCACCTTCTATCTTCTTGGAGCTACTTCAACGGGAGCATATAACTCAGTTTATGGTGATTCCGATTTCTACTTCACTGGTTCAAATACATTATATGCAACTAACATGACAGTTGGTAGCACATTGACAATTAACTCTGATATTTCATTAAAGACAAACATTGAACCTCTTGAAGGATCACTTGCTAAGATCTTAAGTCTTCGTGGTGTTGAGTATGATAGAGTTGATCGTGAAAAGCATCAAATTGGTTTGATTGCACAAGAAGTTGAAGAAGTATTGCCAGAGATTGTTTCTGAAACTGATAAGGGACTAAAAACCGTTGAATACACAAGTATCATTCCAATTCTTATTGAAGCAATCAAAGAACTCAAGGCTGAAATTGACGAGTTAAAGAAAACTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
968e2c4287b0d3ca4936c95ba09cb81940bb52da5257c64b6bb2bee3bbd2953b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6938
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50