Protein
View in Explore- Genbank accession
- CCE45949.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MEVHNNFSPLAFRKKESKATYEKWYAFGKNYAIPASANTLIPFQFTDVNVGEVQPDSIEVVAVNQETGEGIKTGVYVSRDDMPEHGSVLYVSPGKNSFSEALPQGTYRAEFSIGTQVYISTPFCVIPGIETSSKYLLIEYWNDEKIAYPGGFITTGANNDFKYQMYVPATICKPKYEFEEELTKRAGYKFLELQTSTKVYAFTFVAPEFICDAMRLIRLSDYIRISHDGEYYNALNFEFDVDWQEQLYLAAVDCQFETDSIIQKLPSFNRRDKASFYNALLANIDTPIMFSPDTVGLYYKEYRETEPVVKGKLIRELSPIDLIDENTTIAVDLGTGEARKFNLYRMLQDYISKSHEDATNFLLHLRGGATFGDDISGSAAHINSAGDARFNDVDADSVSADAVDAGSWLSVGNTAFTVNKSGKTDTGELTARGKAYLTEDVYTGGRTGTITKDGQLKYLSAIIQQFLSSPTFVSGFLGEGFKIWVENGNWHIECDNLTVRQTMNIFELLIQKIRSVNGALVVSQSNGKLSAVEEVGTQYKLTTGEEFPTFQEGDLVRCQTFAGYQGAGLTFDFTQFAKYDYSGGAFDSSLIDVTPDSISFNLNDTGNSGFAFYKFSESSPTPIEIPSFTLTLEGGYPGMMAFAAGLDSNDSPVEGVGVLLQNGDNVIPAIKSEQGIHNFAITITGDSGHGDGKVTVKQKKAAGSAPNNSLVKFYWVEVKAVDGASFFADKAEFNGVVPAVGDEVVQMGNTKNSERQALIYITAQESGHPYIEILNGVKTKSLSGTNRTRLGDLSNIQDSAFPEGQQPSGSGLYCDNAFLRGIFLLRNGKSVEDEVNQAKQDAANATTEAERAQQTAQEAKDRLNKWADDGFISPTEKPALIDEGKRIQAEFLQIKNNADKYAVPVPEYTKAYENYLNELRYHSAQQPEDIAVRPELAQSQTAYYDKRNGALNAIATASKEYVDNADKKLKEYLDTEITAIPGKIELAVRSLKTANYNLLADSNRVLNGNPYQLGVYRYETHLVVGKSYTLTVCYKCADSSSILAYNNAGGGHVAEFPKSDNETIVSVKISPFNEDLTYFEFYKLPQKETTQTYVKWAVITEGDIGVANWIPSRTESELNIGGANLLLKSGICVSGVNRNERIEMSKYWRDLRGKKVTISFDYEYSGLELGGNNRIGLEEAILKDGTSEYYYVGTFKYFNSLSPKADSGRFSHTITVPYDIVNSQNKGISLIIQIGNSTVMKVCNPQIQIGETATEWFPAPEDMLNESIKYTDNQILAVDGKIELTVKTKVENLGIGANNLFSYTSSDLNNLGDSYVAVEKINDIHGFKVTGENHGRNTVRIPNIIPPIPGKYTVSGWIKGSQSTTPGITIDVCDSASFRVFATPDNNWSYFKHTFDVSKNTEDQKDIYNFVDLGDISWAYIWVKDFKVEAGEIATAWSPNFQDAVYKGAEYTNSQISVVEGKITSTVEKINTVDGRVTGLASRVEQTEKSITSVVGDIGVINSTTNRHISKRIDLRGWDNNKFFPLVISIPVYHKTRVEISRPLAAVYGKPSYGTHDGGFSMNLTFEMSGSGWGSLPAVTNIFDYTKAWTSAGAKIVVDLGQITETSTCRMGIRGGSMYDVTVDDTIDPNVINVYQTDYHGSYNTSFPVRTDGTEPVRTYGYYTEIKQTQESIALTANKVDDQGRRLSAAELTLSSDHAKLSVVEQTANSANSLAGTANNKADIVDGRVTATQNGLVETGINITSRKIILKADNLLFQNNTGQQTAAINANGKLTANSIEVGEVVAGGFAAQRITTGNLTVTDGAVIAGMTISGGVLTGKNIHITDGAKIGNFTIESGILSANGMVAGMQMRLSNNLMEISSSGLRIDHNSGGYAINVTGNGRCYMQGVESYRKFGVYEFAGATQWKAPGVHFACTISSAAAVRQKWGNPSIRVSAVKHSTGRYTVRFTGVHSQGFIPMVMALNATKWVNACVEDIVSTTQFTVKLMDVNTGMIDSDFAVYICGFV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2006 AA molecular weight: 219944,50740 Da isoelectric point: 5,15987 aromaticity: 0,10120 hydropathy: -0,28470
Domains
Domains [InterPro]
DC_0204
STR
1–2006
STR
1–2006
Coil
Unmapped
828–869
Unmapped
828–869
1
2006
Architecture
STR 1-2006
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Bacteroides phage B124-14 [NCBI] |
1105171 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Bacteroides fragilis [NCBI] |
817 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > FCB group > Bacteroidota/Chlorobiota group > Bacteroidota |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CCE45949.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
HE608841.1
[NCBI]
CDS location
range 8746 -> 14766
strand -
strand -
CDS
ATGGAAGTACATAACAACTTTAGTCCTTTGGCGTTTAGAAAGAAAGAATCTAAAGCCACATACGAAAAATGGTACGCTTTCGGGAAAAACTACGCTATTCCAGCAAGCGCAAATACGCTTATACCTTTCCAGTTTACCGATGTAAATGTAGGAGAGGTTCAGCCCGATTCTATTGAGGTTGTAGCGGTAAACCAAGAAACCGGAGAGGGCATTAAAACAGGTGTGTATGTTAGTCGTGACGACATGCCCGAACATGGCAGCGTTCTGTACGTGTCACCCGGCAAGAACTCGTTTAGTGAGGCTTTGCCACAGGGTACATATCGGGCGGAGTTTTCAATCGGAACACAGGTTTATATTTCAACTCCTTTTTGTGTTATTCCCGGTATCGAAACAAGTAGCAAATATCTGTTGATTGAGTATTGGAATGATGAAAAGATCGCATATCCGGGTGGATTTATTACAACGGGTGCGAACAACGACTTTAAGTATCAGATGTATGTTCCTGCAACTATCTGCAAACCTAAATATGAGTTTGAAGAAGAACTAACCAAACGTGCCGGATACAAGTTTTTGGAACTGCAAACTTCTACGAAGGTGTACGCCTTTACATTCGTTGCACCGGAGTTTATTTGTGACGCTATGCGACTGATTCGCCTATCTGACTATATCCGAATTTCGCACGATGGCGAATATTACAACGCTCTCAACTTCGAATTTGATGTTGATTGGCAGGAACAATTATATTTGGCTGCTGTTGACTGCCAGTTTGAGACGGACTCAATCATACAAAAACTCCCTTCTTTCAATAGACGAGATAAAGCGTCTTTTTATAATGCCCTATTAGCGAACATTGATACACCTATAATGTTCTCTCCCGATACCGTAGGGCTGTATTACAAAGAGTATCGGGAAACAGAGCCAGTAGTCAAGGGTAAATTGATACGGGAGTTATCCCCTATTGACTTGATAGATGAAAATACAACTATTGCCGTTGATTTGGGTACAGGTGAGGCGAGAAAGTTTAACTTATACCGAATGTTGCAGGACTATATTTCTAAATCGCATGAGGATGCAACAAACTTTTTGTTACATCTCCGTGGAGGTGCAACATTTGGCGATGATATTTCGGGTAGCGCTGCGCACATAAATTCGGCAGGCGATGCAAGATTTAACGATGTTGATGCAGACTCAGTTTCTGCCGATGCAGTTGACGCCGGTTCTTGGTTGTCGGTGGGTAATACTGCATTTACGGTTAACAAGTCGGGAAAGACGGACACAGGCGAGCTTACAGCAAGGGGAAAAGCGTATCTCACAGAGGACGTTTATACAGGTGGCAGAACTGGAACGATAACGAAAGACGGACAATTAAAATACCTTTCTGCAATTATCCAACAGTTCCTATCATCCCCTACGTTCGTTTCCGGTTTTCTTGGCGAGGGCTTTAAAATATGGGTCGAGAATGGCAATTGGCATATAGAATGTGACAATTTGACAGTAAGACAGACTATGAATATATTTGAACTACTTATCCAAAAGATAAGGAGCGTTAACGGTGCATTGGTCGTGTCCCAATCAAACGGCAAATTGTCAGCTGTTGAAGAAGTAGGAACGCAATATAAGCTAACCACAGGAGAGGAATTTCCCACTTTTCAAGAGGGCGATTTAGTCAGGTGTCAGACGTTTGCAGGCTACCAAGGTGCGGGACTTACCTTTGACTTTACTCAGTTTGCAAAATATGACTATTCCGGTGGTGCTTTTGATAGCAGCTTGATTGATGTTACACCCGACTCTATTAGCTTTAACTTGAATGATACTGGTAATTCCGGTTTTGCATTCTATAAATTTTCAGAGTCAAGCCCTACACCAATTGAAATACCTTCATTTACCTTGACTTTGGAGGGAGGCTATCCTGGTATGATGGCTTTTGCTGCCGGACTTGATTCAAATGACAGTCCGGTAGAGGGTGTAGGCGTGTTGCTGCAAAACGGTGATAATGTTATTCCGGCTATTAAATCAGAGCAAGGTATACACAACTTTGCTATAACAATAACTGGTGATTCCGGTCACGGTGATGGTAAGGTTACAGTAAAGCAAAAGAAAGCGGCAGGAAGCGCACCAAACAATAGCTTAGTTAAATTCTATTGGGTGGAAGTTAAAGCGGTTGACGGGGCTTCTTTCTTTGCAGATAAAGCGGAGTTTAACGGTGTTGTTCCGGCTGTCGGTGACGAAGTTGTGCAGATGGGGAACACGAAGAATTCCGAAAGACAGGCTTTAATATACATCACAGCGCAGGAAAGCGGACATCCGTACATAGAGATATTGAACGGAGTTAAAACAAAATCGTTATCCGGTACGAATAGGACACGTCTTGGCGATTTAAGCAACATACAGGACTCTGCATTTCCGGAGGGACAACAGCCATCCGGTAGCGGCTTGTATTGCGATAACGCTTTTCTTCGTGGTATATTCTTGTTGAGAAACGGCAAGTCAGTTGAGGATGAAGTAAACCAAGCGAAGCAAGATGCAGCCAACGCAACAACAGAGGCGGAGAGAGCACAACAGACAGCTCAGGAGGCTAAAGATCGGCTTAATAAATGGGCTGACGATGGTTTTATATCTCCTACTGAAAAGCCCGCTTTGATTGATGAAGGAAAGCGCATACAGGCAGAGTTTTTGCAGATAAAAAATAACGCTGACAAATACGCTGTACCTGTTCCTGAATATACTAAGGCTTATGAAAATTATTTAAATGAACTTAGATACCATTCCGCCCAACAGCCGGAAGATATTGCGGTGCGTCCGGAACTGGCACAGAGTCAAACGGCTTACTACGACAAACGTAATGGAGCGTTGAATGCAATTGCTACGGCTTCAAAAGAATATGTAGATAATGCTGACAAAAAGTTAAAGGAATACTTAGATACTGAGATAACTGCTATTCCCGGTAAGATTGAACTTGCTGTACGGAGTTTGAAAACGGCAAATTACAACTTGCTGGCAGATAGCAATAGGGTGTTAAATGGTAATCCGTATCAACTTGGTGTTTATAGATATGAAACACATTTGGTTGTTGGCAAATCGTATACGTTGACAGTGTGTTATAAATGCGCAGATTCAAGTTCAATTTTAGCATATAATAACGCAGGCGGGGGGCATGTGGCTGAGTTCCCTAAATCAGATAACGAAACCATAGTTTCAGTTAAAATATCTCCATTCAATGAAGATTTAACGTATTTCGAGTTTTATAAGTTACCCCAAAAGGAAACAACTCAAACATATGTAAAATGGGCTGTTATTACTGAGGGTGATATTGGTGTGGCTAATTGGATACCTTCACGAACGGAAAGTGAGTTAAACATAGGAGGTGCAAACCTTCTTTTAAAATCTGGTATATGTGTGTCCGGTGTAAATAGAAACGAACGCATAGAAATGTCTAAGTATTGGCGTGATTTAAGGGGTAAAAAAGTAACTATTTCTTTTGATTACGAATACAGCGGTTTGGAGTTGGGAGGTAATAATCGTATAGGATTGGAAGAAGCAATATTAAAGGATGGAACATCTGAATATTATTATGTGGGTACTTTTAAATATTTCAATTCTTTATCCCCTAAAGCGGATTCGGGACGTTTTTCTCATACTATAACAGTTCCATACGATATTGTTAATTCTCAAAACAAGGGTATAAGCTTAATTATACAAATCGGAAACAGTACGGTGATGAAGGTGTGTAATCCTCAGATTCAGATCGGAGAAACGGCTACTGAATGGTTTCCCGCCCCCGAAGACATGTTAAATGAATCTATAAAGTACACCGACAATCAGATTCTTGCTGTTGATGGCAAAATTGAATTAACGGTAAAGACTAAGGTAGAAAACCTTGGAATAGGAGCAAATAACCTTTTCAGTTATACAAGTTCTGACCTTAATAATTTAGGTGATAGCTATGTTGCAGTAGAAAAGATTAATGATATTCACGGTTTTAAGGTAACAGGTGAGAACCATGGTAGAAATACTGTTAGAATACCAAATATAATACCTCCTATTCCGGGTAAATATACTGTATCCGGATGGATAAAAGGGTCTCAAAGTACAACGCCAGGTATAACTATTGATGTTTGTGATTCCGCTTCTTTCCGTGTTTTTGCCACCCCCGACAACAATTGGAGTTATTTCAAGCATACATTTGACGTTTCAAAAAATACAGAAGATCAAAAGGATATATACAATTTTGTCGATTTGGGTGATATTAGTTGGGCTTATATATGGGTAAAAGACTTTAAAGTAGAAGCGGGTGAAATTGCAACCGCATGGAGTCCCAATTTTCAGGATGCAGTTTACAAAGGCGCTGAATATACCAATAGTCAAATTAGTGTAGTAGAAGGTAAGATAACATCCACCGTTGAAAAGATAAATACCGTTGATGGACGTGTTACCGGGCTTGCTTCACGCGTCGAACAGACCGAAAAAAGTATCACGTCTGTTGTTGGTGATATTGGTGTTATTAATAGTACCACCAATAGGCATATATCAAAGCGAATAGATTTAAGAGGATGGGACAATAATAAGTTTTTCCCGTTGGTTATAAGTATTCCGGTTTACCACAAAACAAGGGTTGAAATAAGTAGGCCTCTTGCTGCGGTATACGGAAAACCTTCATACGGTACTCACGATGGCGGTTTTTCTATGAACTTAACGTTTGAGATGTCCGGTTCGGGTTGGGGTTCGTTGCCAGCAGTAACCAATATCTTTGACTATACTAAAGCATGGACTTCTGCGGGTGCAAAGATAGTTGTTGATTTGGGACAAATAACTGAAACGTCTACGTGTAGAATGGGTATTAGGGGCGGTTCTATGTATGACGTAACAGTAGATGATACTATTGACCCAAACGTAATCAACGTTTATCAAACCGATTATCACGGTTCGTATAATACATCGTTCCCCGTTCGCACCGATGGAACTGAACCCGTCCGCACATACGGATACTATACCGAAATAAA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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
f0d947e1a5b1ba5277e43f1b1ec50f59e3cefb146512bb4e3a99b8a05803a89c
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Comparative (Meta)genomic Analysis and Ecological Profiling of Human Gut-Specific Bacteriophage phiB124-14 | Ogilvie,L.A., Caplin,J., Dedi,C., Diston,D., Cheek,E., Bowler,L., Taylor,H., Ebdon,J. and Jones,B.V. | 2012 | 22558115 | GenBank |