Protein

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Genbank accession
AAK27911.2 [GenBank]
Protein name
putative protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,81
Protein sequence
MLTQTKEVRDAWRASQRTLDIKVAVNGKTYTATDINSLKYDSGAYTGDTFAIGSTYSNSVQIEFSHLIENLKLGMEVLPSIGIKTSSGYVYEPLGVFIISSEIKMDRNNNLTSISASDRFCGLEGSYKSKLAYPAKVLDVIAEICEQSGVKANVDDLARLPHQADLPRPITGQTYRKALGWIAQLYAGYATFDRKGLFTIRTIAEPNYELDPSQYEQAGLTKNEAPYRISGIQCQTTITTKTRDGEDTDETKNYQVGDTNGSQIKLENNIMTPDRLTNIWEQIKDVNFYPFSLNWFGNPAIEAGDWLKLQDKQGNKFIVPNNSYTLDFNGGLSATSKADQTSSTDSVIAWEGTFSQTIRELQGRKAPDGTVIFPPSVTEPPTNAKPNDVWFKQNGNSTELWVFTEQEDGTRKWIRRDLTPDEIKKQVQEAQDGLKDAKKEIADNLAKADKDIAELNESINNQKGSLDGLSTTVNTVVIPKVTDVTNQVSDAIKKVNEQKNIVTGLQNQAIQQGKDISKITSDVHGVTVDLANLNGDVNQTKATVQGLQSTLGNAQGDIAQIKVDAKKLETSLSGKVDNSTYATFVNQTNQALNAKLIASDLNGYAKTTDLQATANGLQFNINSVTDKLNNLRIGGRNLVGGTDKEYVMGFGIPNTVWKDNFAYISLPLISGDGGEILPQGAGFWHVLSPGEEYTQTIWIETDAIIKSLNGTFLTWLTMDDGHDVQKAYIQRIGNNSYKIVGSYTWPQNKKGNRVRLFDIFSLPNSIDLKSGTYLKFGKLKLEVGNASTDWTPAVEDTEHDLESLSARITINSQQFGSYYTKGESDNRTNTAKNEVINSIKNDSNWHGLTNILTNSGFIQTADGFIQKVQQTMQPIINENNSGGVNLLTNTYTLRNFNNAGNAGEATGFEIDSGDSHKNELNAGEISTNVFHVYAKDLNHAPVYFGQNFTLPKGTWTLSFLVRHNGSSEQKIRLSFYTDDCANRGWIPLGTSDEIDNIWKRHQITFTTTQEIFEQNPRVHMPTDDIVPGGSLYFANFKLESGSIATTWCPAPEDLAKQVAVTELGQTIKGLQSTVSSNYGNLQSQISQTAGTIRNEITDRTNNLQSQITQNANNISIKVNAVGDLSNICLNPTFIDGSTEGWENVFSSSGDPGSPTKFYGGVNTRNAFYGNMFSVAAGDKYFFSVFAWQNQSTNPLNIGFTYLQKDGTWNWQSAINFAPNEGARTKSGSITIPKEAVKARIWVEIDSFSNFGNWWFTNLIVRKNDTISQINMSAGTTLIQNDKIYMDASSTVFSGKAFIPDAAITNISADKINTGTLDAGRINVINLNANNITTGTIKGQNSSFNLTDGTLTALNQYNEGVFMRNGKLEFTSRQSWNNNSTATYGYIQSLPKMFALGYNYGGLDINGTSGFVLHNDKTKIKTSNSGQSGSAVEGGSYIFGSDGLTSINNENSVIINAGAQSYSEWTAGISLLSGNASRNVPPSITLGSSNSLNDRSTVTISGSLAVLGSKNAAVRTSQGLRAINAYETAEYYFGDIGRAKTNSNGAVCIYMDPLFLETVNTGVPYHIFLTSYSEARIWVSEMYPSYFVIRSDKPNADFVWEIKAKRKGYENDRLKIIDQEKKVNE
Physico‐chemical
properties
protein length:1624 AA
molecular weight: 178522,24670 Da
isoelectric point:5,38700
aromaticity:0,09236
hydropathy:-0,45148

Domains

Domains [InterPro]
DC_1421
STR
1–817
DC_1421 G3DSA:1.20.120.20
Coil
Unmapped
427–465
Coil DC_1054
AAK27911.2
1 1624
Architecture
STR
STR 1-1624
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus prophage Lj965
[NCBI] 		139870 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Lactobacillus johnsonii
[NCBI] 		33959 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAK27911.2 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AY459535 [NCBI]
CDS location
range 32167 -> 37041
strand +
CDS
TTGCTAACACAAACGAAAGAAGTTAGGGATGCTTGGCGAGCATCACAACGAACGTTAGATATTAAAGTGGCAGTTAATGGGAAAACTTATACCGCTACCGATATCAACAGTTTGAAATATGATTCAGGAGCTTATACTGGTGACACGTTTGCCATTGGCTCAACATACTCAAATAGTGTTCAAATTGAATTTTCACATTTAATAGAGAATCTAAAACTTGGTATGGAAGTTTTACCAAGTATCGGGATTAAGACGTCTAGTGGCTATGTATATGAGCCGTTGGGCGTTTTTATTATCTCTAGTGAAATCAAGATGGATCGCAATAACAATCTTACTTCCATTAGTGCAAGTGATAGATTTTGCGGGTTAGAAGGATCCTATAAATCTAAGCTGGCTTATCCAGCAAAAGTTTTAGATGTAATTGCTGAAATCTGTGAACAATCAGGAGTCAAGGCTAATGTGGATGATCTGGCTAGACTTCCACATCAAGCTGACTTACCTAGACCTATCACTGGTCAAACATATAGAAAGGCTTTAGGTTGGATTGCACAACTATATGCCGGGTATGCTACGTTCGATCGTAAAGGTTTATTTACGATTAGAACTATCGCAGAGCCTAATTATGAGTTAGATCCCAGTCAGTATGAACAAGCTGGTTTAACTAAAAATGAAGCTCCATATAGAATTAGCGGTATTCAGTGTCAAACGACAATTACCACTAAAACTAGGGATGGTGAAGATACTGATGAAACTAAGAATTATCAAGTTGGAGATACGAATGGATCTCAAATTAAGCTTGAAAACAATATTATGACGCCTGATAGGCTGACTAATATTTGGGAGCAGATTAAAGATGTTAATTTCTATCCATTTAGTTTGAATTGGTTTGGAAATCCTGCAATTGAAGCGGGAGATTGGTTAAAACTACAAGACAAGCAAGGCAATAAGTTTATTGTTCCCAACAATAGCTACACACTTGATTTTAATGGAGGACTTTCAGCAACTTCTAAGGCAGATCAAACTTCTTCCACAGACTCTGTAATAGCTTGGGAGGGAACTTTCTCTCAAACTATTAGAGAACTTCAAGGTCGTAAAGCACCAGATGGAACAGTGATTTTTCCGCCTAGTGTAACTGAACCACCTACGAATGCTAAACCTAACGATGTTTGGTTCAAGCAAAATGGTAATTCAACAGAATTGTGGGTGTTTACTGAACAAGAAGATGGGACTAGAAAATGGATTAGGAGGGATTTAACTCCTGACGAGATTAAGAAACAAGTTCAAGAAGCACAAGATGGCTTGAAAGATGCTAAGAAAGAAATAGCAGATAATCTTGCTAAAGCGGATAAAGATATTGCTGAACTTAATGAAAGTATTAACAATCAAAAAGGTTCACTTGATGGTCTAAGTACTACAGTCAATACCGTTGTTATTCCTAAAGTAACCGATGTAACTAACCAAGTTTCTGATGCTATTAAAAAAGTAAATGAACAGAAAAATATTGTTACTGGACTGCAAAATCAGGCTATTCAACAAGGAAAAGATATCTCTAAGATTACTTCTGATGTTCATGGTGTAACTGTTGATCTAGCTAATCTCAATGGGGATGTAAACCAGACAAAAGCCACAGTTCAAGGCCTTCAATCAACGTTAGGCAATGCCCAAGGTGATATTGCCCAGATCAAAGTAGATGCGAAGAAATTGGAAACTAGTCTATCTGGTAAAGTTGATAATTCTACTTATGCAACTTTTGTTAATCAAACTAATCAAGCATTAAATGCTAAGTTGATTGCTAGTGATCTGAATGGATATGCTAAAACTACTGATTTGCAAGCTACGGCTAATGGATTGCAGTTTAATATCAATAGCGTAACGGATAAATTGAATAATCTAAGAATTGGAGGTAGAAATTTAGTTGGTGGGACTGACAAAGAATACGTAATGGGATTTGGAATTCCTAATACCGTTTGGAAAGATAATTTTGCTTATATCTCTTTACCGTTAATTAGTGGTGATGGAGGCGAAATTTTACCCCAAGGTGCAGGATTTTGGCATGTATTAAGTCCAGGAGAAGAATATACTCAAACCATTTGGATCGAAACAGATGCTATCATAAAAAGTTTAAATGGTACATTTTTAACATGGCTAACTATGGACGATGGGCATGATGTGCAAAAAGCATATATTCAAAGGATAGGCAATAACAGCTATAAAATTGTAGGTTCTTATACTTGGCCACAAAATAAAAAAGGCAATAGAGTTCGCTTATTTGATATTTTTAGTTTGCCAAATTCGATTGACTTGAAAAGTGGAACATATCTAAAGTTTGGAAAACTAAAGTTAGAAGTGGGAAATGCTTCAACTGACTGGACTCCGGCTGTTGAAGATACTGAACACGATCTAGAAAGTTTGTCTGCACGCATAACTATTAATAGTCAACAATTTGGTTCTTACTATACTAAAGGTGAGTCTGACAATAGAACTAATACTGCAAAAAATGAAGTTATCAATTCAATTAAGAATGATAGTAATTGGCATGGATTAACCAATATACTAACGAATAGTGGCTTTATACAAACCGCAGATGGCTTTATACAAAAAGTACAGCAAACGATGCAACCAATTATTAATGAAAATAATAGTGGTGGAGTGAATTTATTAACTAATACATATACTTTGCGTAACTTTAATAATGCCGGTAATGCTGGAGAAGCTACTGGATTTGAAATTGATTCTGGAGATAGCCATAAAAACGAATTAAATGCTGGTGAAATAAGCACAAATGTTTTTCATGTTTATGCCAAAGATTTAAATCATGCTCCTGTTTACTTTGGTCAAAACTTTACACTACCCAAAGGAACTTGGACTCTAAGTTTTTTAGTTCGTCATAATGGAAGTAGTGAACAAAAAATCAGACTAAGCTTTTATACAGACGATTGTGCTAACAGAGGATGGATTCCTCTAGGAACATCTGATGAGATAGATAACATTTGGAAAAGACATCAGATAACTTTTACAACAACCCAGGAAATTTTTGAACAAAATCCGAGAGTACATATGCCAACTGATGATATAGTCCCCGGTGGCTCTTTGTATTTTGCAAATTTTAAATTAGAATCCGGATCAATTGCTACTACTTGGTGTCCTGCTCCCGAAGATTTAGCTAAGCAAGTAGCAGTTACTGAATTAGGTCAAACCATAAAAGGGCTTCAATCAACTGTTTCAAGTAACTACGGAAATCTACAGAGCCAGATAAGTCAAACTGCTGGAACTATTAGGAATGAAATAACTGATAGAACCAATAATCTACAAAGTCAAATTACTCAAAATGCTAATAATATTAGTATTAAAGTAAATGCCGTGGGGGATTTATCTAACATATGTTTAAATCCAACATTTATTGATGGAAGTACTGAAGGTTGGGAAAACGTATTTAGTTCGTCTGGAGATCCCGGTAGTCCTACAAAGTTTTACGGGGGAGTTAATACAAGAAATGCGTTTTACGGAAATATGTTCTCAGTGGCGGCAGGGGATAAATATTTTTTCTCGGTCTTTGCTTGGCAAAATCAATCTACTAATCCTTTAAATATAGGATTTACTTATTTGCAAAAAGATGGAACTTGGAATTGGCAATCCGCTATAAATTTTGCTCCTAATGAAGGTGCGCGAACTAAATCAGGATCTATCACTATTCCTAAGGAAGCAGTTAAAGCCAGAATATGGGTAGAAATTGATTCATTTTCTAATTTTGGAAATTGGTGGTTTACCAATCTTATAGTTAGAAAGAATGATACTATCTCGCAAATTAATATGTCAGCTGGCACAACTTTAATCCAGAATGACAAAATATATATGGATGCAAGCTCAACCGTATTTTCTGGTAAAGCCTTCATTCCTGATGCAGCAATAACTAATATATCAGCTGATAAAATTAACACTGGTACACTCGATGCCGGCAGAATTAATGTAATTAACTTAAATGCAAACAACATCACTACTGGGACAATTAAGGGACAAAATAGTAGTTTTAATTTAACTGATGGAACGTTAACGGCTTTAAATCAGTATAATGAGGGCGTTTTTATGAGAAATGGGAAACTTGAGTTTACCTCACGTCAAAGCTGGAATAATAACTCCACAGCTACATATGGATATATTCAATCTTTACCCAAAATGTTTGCCTTAGGATATAACTATGGTGGATTAGATATTAATGGTACTAGTGGGTTTGTACTGCATAATGATAAAACGAAAATTAAGACTAGTAATAGTGGACAGAGTGGTTCAGCAGTTGAAGGAGGAAGCTATATTTTTGGATCTGATGGTCTTACTAGCATAAATAATGAAAATTCAGTGATTATTAATGCAGGTGCTCAATCATACAGTGAGTGGACGGCTGGAATAAGCTTATTATCAGGGAATGCATCTAGAAATGTTCCTCCAAGTATCACTTTAGGATCCTCTAACAGTCTCAATGATCGCTCTACAGTTACTATATCTGGAAGTCTTGCGGTATTAGGATCGAAGAATGCCGCTGTTCGAACATCTCAAGGATTAAGAGCTATTAACGCATATGAAACAGCCGAATATTACTTTGGAGATATAGGAAGGGCAAAGACTAACAGTAATGGGGCTGTTTGCATATACATGGATCCGTTATTTCTTGAAACAGTCAATACAGGAGTTCCATATCATATATTTCTTACTAGTTATAGTGAGGCAAGAATTTGGGTTTCAGAGATGTATCCATCATATTTTGTAATTAGATCAGATAAGCCAAATGCTGACTTTGTTTGGGAAATTAAAGCAAAGCGTAAAGGATATGAAAATGATAGATTAAAAATTATAGATCAGGAGAAAAAAGTAAATGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
43f48f035337c930a3d5dfabed3b7ac0da0d99526e90ff3fa4abf8e02e25df8e
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7313
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The prophages of Lactobacillus johnsonii NCC 533: comparative genomics and transcription analysis Ventura,M., Canchaya,C., Pridmore,R.D. and Brussow,H. 2004 15016546 GenBank