Protein
View in Explore- Genbank accession
- UYL23050.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MTDKLIRELLIDVKQKGATRTAKSIENVSDALENAAAASELTNEQLGKMPKTLYSIERAADRAAKSLTKMQASRGMSGITKSIDGIGDKLDYLAIQLIEVTDKLEVGFDGVSRSVKAMGNDVAAATEKVQDRLYDTNRVLGGTARGFNDTAGAAGRASRAIGNTSGSARGATRDFAAMAKIGGSLPIMYAALASNIFVLQSAFEQLKLGDQLNRLEKFGVIVGTQTGTPVQSLARSLQEAAGYAISFEEAMRQASSASAYGFDAEQLNKFGLVARRAAAVLGVDMTDALNRVIKGVSKQEIELLDELGVTIRLNDAYADYVKQLNAANTGITYNINSLTTFQKQQAYANAVIAESTKRFGYLDEVLRATPWEQFAANADAALRTIQQAAAKYLGPVIDAINTVFYTSQASVSAEAARAQEKTNRQIDPTNVGAVALSLAASEEGYNKALDMYKESLDKRNKLKSEFDKRMEQADFYTKLAIRQVGEGIPVGLAAAGASEANKKFVEETAAMGLQVTRLGKEVEDSTENLNAWKSAYQAAGAAAAKANPEFQKQINLQKDVYDPDAVYDFNSAALKSLTEQQKAYNQTKKTASDLANDFQNIASSTDTAAKTSATFEEVIRNVESLSAGTGKSADEYVKSLNLGFNTLSEMKTASQALSEYVKLTGNETKNQLAVQQKIADVYNQTKDKEKAQEAGRRLELQQLEEQETALRRVLQTNQGNKAVEKEIEKIQLEKLKLTNQGMEAQKKVKDYTDKILGVDREIALLNNRTMTDTQYRLAQLNLELTIEKEKYEWYTKQADKQKEAEQSRRSQAQIEREIWKFRQDQQAEMTSKRQEAFENTLTSMFPLAGEMQKMEMQLDFYTQMKELTKGNANEQMRWNAEIAKTRAQMSALTAQRNAQMQQQVGSSVGATYTPTTGLSGADKDFADMQNRMSSYDQAISKLSELNSEATAVAQSMGNLTNAMIQFSQGSLDTTSMIASGMQTVASMIQYSTSQQVSAIDQAIAAEQKRDGKSEASKAKLKKLEAEKLKIQQDAAKKQIIIQTAVAVMQAATAVPYPFSIPLMVAAGLAGALALAQASSASGMSSIADSGADTTQYLTLGERQKNVDVSMQASSGELSYLRGDKGIGNANSFVPRAEGGMMYPGVSYQMGEHGTEVVTPMVPMKATPNDQLSDGLKTTSGRPIILNISTMDAASFRDFASNNSTALRDAVELALNENGSTLKSLGNM
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1227 AA molecular weight: 133201,38110 Da isoelectric point: 5,66710 aromaticity: 0,05868 hydropathy: -0,43521
Domains
Domains [InterPro]
IPR056207
TAS
1–81
TAS
1–81
Coil
Unmapped
686–745
Unmapped
686–745
1
1227
Architecture
TAS 1-81 | STR 82-1189 | TAS 1190-1225 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Salmonella phage PS3-1 [NCBI] |
2985647 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Salmonella typhimurium [NCBI] |
90371 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UYL23050.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP594723.1
[NCBI]
CDS location
range 21125 -> 24808
strand +
strand +
CDS
ATGACTGATAAGCTAATACGAGAATTATTAATAGACGTTAAACAGAAGGGGGCAACTCGTACTGCAAAGTCTATTGAAAACGTATCTGATGCGTTGGAAAACGCTGCTGCTGCTTCCGAACTGACAAATGAGCAGTTAGGTAAAATGCCCAAAACCCTTTACTCCATTGAGAGGGCAGCGGATAGAGCAGCGAAAAGTCTTACTAAAATGCAAGCTAGTAGGGGTATGTCTGGTATCACTAAATCCATTGATGGTATTGGTGATAAGCTAGATTACCTGGCTATCCAACTTATTGAAGTAACAGATAAACTAGAGGTTGGATTCGACGGAGTTTCTAGATCTGTTAAAGCAATGGGTAATGATGTTGCAGCTGCAACAGAAAAAGTTCAAGATAGATTGTATGACACCAATAGAGTTTTAGGCGGTACAGCTAGAGGTTTTAATGATACTGCTGGTGCCGCTGGCAGAGCTTCTAGAGCTATTGGTAATACTTCCGGTTCAGCACGCGGTGCAACTCGTGATTTTGCGGCAATGGCTAAGATCGGTGGTAGTTTACCTATTATGTATGCAGCTCTTGCTTCCAACATCTTCGTTTTGCAATCTGCATTCGAACAACTTAAATTAGGTGATCAGTTAAATCGTCTAGAAAAATTTGGTGTTATAGTGGGTACTCAGACAGGTACTCCTGTTCAGTCTCTTGCTAGATCACTACAAGAGGCAGCTGGCTATGCAATCTCTTTTGAAGAAGCTATGAGGCAAGCATCCTCAGCGTCCGCTTATGGATTTGATGCTGAACAACTTAATAAATTTGGTTTAGTAGCTCGTCGTGCTGCTGCTGTTCTTGGCGTTGATATGACTGATGCACTTAATCGTGTAATTAAGGGTGTATCTAAACAAGAAATCGAACTTCTGGATGAGCTTGGTGTTACTATTCGTCTTAACGATGCTTATGCTGATTACGTTAAACAGTTAAATGCTGCAAACACAGGTATAACATATAATATTAATAGCCTTACTACCTTCCAGAAACAGCAAGCGTATGCTAATGCTGTTATAGCAGAATCTACTAAACGTTTTGGTTACTTAGATGAAGTTTTACGTGCTACTCCGTGGGAGCAGTTTGCTGCTAACGCAGATGCTGCACTAAGAACAATACAACAAGCTGCTGCTAAGTACTTAGGGCCAGTAATTGATGCTATCAACACAGTATTTTATACCTCTCAGGCTTCTGTATCCGCTGAAGCAGCTAGAGCTCAAGAAAAAACTAATAGACAGATAGATCCCACCAACGTTGGTGCTGTTGCTTTAAGTTTGGCCGCTTCTGAAGAAGGCTATAATAAAGCTCTAGATATGTATAAGGAATCTCTTGATAAGCGTAATAAGCTAAAATCTGAGTTCGATAAACGAATGGAACAAGCAGATTTCTATACAAAATTAGCTATACGTCAAGTTGGTGAAGGTATTCCTGTTGGTCTTGCAGCAGCAGGTGCTTCGGAAGCTAATAAAAAGTTTGTAGAAGAAACAGCGGCTATGGGTCTACAAGTAACTAGACTTGGTAAGGAAGTAGAGGATTCTACAGAGAACCTCAATGCTTGGAAATCGGCTTATCAAGCTGCTGGAGCTGCTGCTGCAAAAGCTAATCCAGAGTTCCAGAAACAGATTAATCTACAGAAAGATGTGTATGACCCAGATGCTGTATACGACTTTAATTCTGCTGCTCTAAAGAGCCTGACAGAACAACAAAAAGCATATAATCAGACTAAGAAAACGGCTAGTGATTTAGCTAATGACTTTCAAAATATAGCTAGTAGTACAGATACCGCTGCTAAAACTAGTGCAACTTTTGAAGAGGTAATTAGAAATGTAGAATCTCTCTCCGCAGGAACTGGTAAGAGTGCGGATGAATATGTTAAAAGTCTCAACTTAGGGTTTAACACCCTATCTGAGATGAAAACTGCTTCCCAAGCCTTATCCGAGTACGTTAAACTAACGGGTAATGAAACTAAAAATCAGTTAGCAGTTCAACAGAAAATAGCTGATGTGTATAATCAAACTAAGGATAAGGAAAAAGCTCAGGAAGCTGGTAGACGTTTAGAGTTGCAACAGTTAGAAGAGCAAGAAACTGCTTTACGCCGTGTTCTTCAAACAAACCAGGGAAATAAAGCTGTTGAGAAAGAAATTGAAAAAATTCAGCTGGAGAAACTTAAACTTACCAATCAGGGTATGGAAGCTCAGAAGAAGGTCAAGGATTACACAGATAAAATTCTTGGTGTAGATCGTGAGATAGCTCTCTTAAATAACCGTACTATGACAGATACTCAGTATCGTCTAGCACAGTTAAATCTTGAATTGACCATTGAAAAAGAGAAGTACGAATGGTATACAAAACAAGCTGATAAACAGAAAGAGGCTGAACAGTCTAGACGTTCTCAAGCCCAGATTGAACGTGAAATATGGAAATTCCGTCAGGATCAGCAAGCTGAAATGACCAGTAAAAGGCAAGAAGCCTTTGAAAATACTCTAACTTCCATGTTCCCTCTGGCAGGGGAAATGCAAAAAATGGAAATGCAGTTAGATTTTTATACTCAGATGAAAGAACTTACCAAAGGTAATGCTAACGAGCAAATGCGCTGGAATGCTGAAATAGCCAAGACAAGGGCCCAGATGTCAGCTTTAACAGCACAACGTAATGCTCAGATGCAGCAACAGGTAGGTTCTTCTGTTGGGGCTACTTATACTCCTACAACTGGTCTATCTGGAGCAGATAAAGATTTTGCTGATATGCAGAATAGGATGTCTTCATATGATCAGGCAATCTCTAAACTATCTGAGCTAAACTCTGAAGCAACTGCTGTAGCTCAAAGTATGGGTAACCTAACCAATGCTATGATTCAGTTCTCTCAGGGATCTCTAGATACTACGTCTATGATTGCTTCTGGTATGCAGACTGTGGCCTCTATGATTCAATATAGTACTAGTCAACAGGTTAGTGCAATTGATCAGGCTATTGCAGCAGAACAGAAACGAGATGGTAAATCTGAAGCATCTAAAGCTAAACTGAAAAAGTTAGAAGCTGAAAAGTTAAAAATCCAGCAAGATGCAGCTAAGAAACAAATTATTATCCAGACAGCAGTAGCAGTAATGCAGGCAGCAACAGCTGTACCATATCCGTTCTCTATTCCTTTGATGGTGGCGGCAGGTTTAGCAGGTGCCTTAGCCCTTGCTCAAGCATCTTCTGCATCTGGTATGTCTTCTATTGCAGATTCTGGAGCAGATACTACTCAGTACCTAACTCTAGGTGAGCGACAGAAGAACGTTGATGTATCTATGCAAGCTAGCTCAGGAGAATTATCCTACCTACGTGGTGATAAAGGTATTGGTAATGCCAACTCATTTGTTCCGCGTGCTGAAGGTGGTATGATGTACCCTGGGGTTAGTTATCAAATGGGTGAGCATGGTACCGAAGTAGTAACTCCTATGGTTCCTATGAAAGCCACACCTAATGATCAGCTTTCTGATGGATTAAAGACTACCTCTGGAAGACCAATCATTCTGAATATTAGCACAATGGATGCTGCTAGCTTTAGAGATTTTGCATCGAATAACAGCACTGCTTTAAGAGATGCCGTGGAACTGGCTCTTAATGAGAATGGATCCACCCTTAAATCTCTTGGTAATATGTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
eefa45ea5b7c05724a03c48b09a5f3ec46d746eb98928525e6a5f0a95fe91c18
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50