Protein

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Genbank accession

XMR01216.1 [GenBank]

Protein name

tail fiber protein

RBP type

Evidence Phold

Probability 1,00

Evidence RBPdetect2

Probability 0,95

Protein sequence

MYSIKTDLDVSGNSTVSKDLLVKGNAVFSNDLTVNGEVSFANATFTAITAGSVNVTGALDVAGKATLSGGADVSGAATFAGNITAADGTTAKFDNLEANSGSFDSVESTDITSTGTATFKDVNISGTLGGTFNLSDINATTLNVTGASALTGAVTLGANITGLASTANFRDIRIGPNEAGQAYRLNFGYTVPGQRPTVLLQNEVQSELMSPAKLNVLQTATFGDSSLSTYGITGNGLNKLDYVTISGNAIQSPTTPLLEVTKGKTKVVDLEVTGVATIPNIESSGTANFNNINVSGTIGGSFDLDDIQATTLSVSGASALTGAVTLGANITGLASTATFKAINLGQNTADANVKLGFAYTAPSARPTVLLANEVQSELMSPAKLNVLQTATFGSAALSTYGITGNGLNKLDYLTITGNATQNPATPQLQVGGKAILNDVEFTGTVTGLTVDVSGQDLTPKSVVAAEAIKGQTLESVGQTTVGSSLQVGGAATVTGALSAASGTFSGDVSGSKGIFSDSVSGTSATFTGDVSGDNATFSGDLSAVAGTFSGDVTVTGQTITVKDLVVTGTSTGVTAIADVDGLDIAPNKVDVTTTLSVAGESTLAGVTATSINSTGAIAGTAISGSTITATGEISGASSVVTGLSKSGSVETGALKASSVETAIISNTAGVSITNNTSIAGNLSVTGTVTPGAIDLSTTDIDAKSLTTSEGANIGGDLVVAGTVDLSAADVAVKSLTSTGAVISSEGTVSSVLPKLSSTEANITTVTATTANATTLNVTGTSTLAGVNASGAITSATNITATGVLKGASVETASISNADGVAINNNTTITGNLDVSGTLTPGAIDLSTTDISSKSLTTTEGATIGGDLVVAGTVDLSAADVSVKSLASAETITSAGVITVSDTVNSSTLPKLITTDATIGAVRADTIETTGSSTLKQVSATEVTATSIVLNGVGEGLRVDNNANINGILNVNNISSVNDTIDIAKSASITGDLTVSGTVTPGAIDLSTTDISSKSLSTTEGATIGGDLVVNGSIDLSSSNVSAITLASSGNTTVGGNLVLTTGVVTGSPSVSGNLSVAGTASVTGATTLTDIVNIGKKVTVSTGGIQVDAGGINTNAILVSGDTTLNNTTVNTTLNVTGQSTVAALSAASLNVSGDSTVQKLTVEGELVPQGGIDLTGADISANSLATASTITATGLSTLSGGVSTTDVTASGTVNAGSLGVTNNATVGGTLGVTGSLSSGPLTVTGLANITGVTTVGSLVSGAVSGSTGTFSSTLDVTGAATFDNDVTVEGVFTPAGGLDLTTADITAKSLSVSETIHSDGAASFGGNTTVGGTLGVTGEVTAPSATLSGTGTALAVTNNATIGGTLGVTGQASLGSIVTSGVSATSGSFSTTLGVTGAATFGNDVTVVGTLTPGSLDLTGADISAKTLTLSETLNATGNTTLGGTLGVTGLATIGGTLTSGAVTAPSATLNGSGTGLAVTNNATVGGTLGVVGQTTLGSVKTGATLTVGTPLGEQPETVQIMPDTYIAGKLRVEGGINADIDVGGQTLEPFAVIASDSLSSAGNITAGAAIISSSATIGEVGSQNNNLIVNGNVVNNGDFTVTGVLNAQLNQADSDVAVKSLTATNNVAAGTSITANTSITAGTSITATGLLKGNTLEVTTTGSFGGAVTMSSGANITGTVGITAGNLTVGGNISATGTAGFGATTVSTITTSGLATLASASVTGNATVGGTLAVTGALTANGNVTLGDAAADVLTVNATSSFKENAVFDKAVTVTGELTTTNANLTTTTVTTKKYDVIPTQVTSSVIAPTGTWTPDGTSNVYFITLDQDTTLAPITGLIGGGKAASVYIYVKQDTTGNRNFTTDGTYAVVDGELNKTAGSVTIYQVIYDGVSSVTDLFIAQRTA

Physico‐chemical properties

protein length:	1906 AA
molecular weight:	185160,90380 Da
isoelectric point:	4,06316
aromaticity:	0,02833
hydropathy:	0,28027

Domains

Domains [InterPro]

DC_0092
STR
1–279

DC_0092 DC_0062 DC_0092 DC_0931

DC_0092
STR
251–594

DC_0092 DC_0062 IPR058970

XMR01216.1

1 1906

Architecture

STR

RBD

STR 1-1122 | STR 1237-1389 | RBD 1493-1906

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_0092	STR	DC_0092	1	279	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	251	594	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0062	STR	DC_0062	512	817	Novel HMM	DC_0062	Central	Low	Positional only	50 proteins / 50 hits
DC_0062	STR	DC_0062	801	1122	Novel HMM	DC_0062	Central	Low	Positional only	50 proteins / 50 hits
DC_0092	STR	DC_0092	1237	1389	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0931	RBD	DC_0931	1493	1906	Novel HMM	DC_0931	C-terminal	Low	Positional only	65 proteins / 65 hits
IPR058970	RBD	DC_0552	1815	1894	InterPro cluster	Putative phage tail fibre, C-terminal domain	C-terminal	Low	Positional only	292 proteins / 292 hits

Taxonomy

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Escherichia phage Turkey3 [NCBI]	3375710	Viruses >
Host	Escherichia coli [NCBI]	562	cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

XMR01216.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

PQ471515.1 [NCBI]

CDS location

range 147640 -> 153360
strand -

CDS

ATGTACTCGATTAAAACGGATCTTGATGTATCTGGTAATTCCACGGTAAGTAAGGATCTTTTGGTCAAAGGTAATGCAGTATTCAGTAATGACCTAACGGTTAATGGAGAAGTGTCTTTTGCTAACGCAACATTCACAGCAATCACCGCTGGTTCTGTGAATGTCACAGGTGCATTGGATGTTGCTGGTAAGGCAACCTTATCCGGTGGTGCTGATGTTTCAGGTGCTGCGACATTTGCAGGAAACATTACTGCTGCTGACGGCACAACTGCAAAATTTGATAACTTAGAAGCTAATTCAGGATCATTTGATTCTGTTGAATCAACTGATATTACTTCAACTGGCACAGCTACTTTTAAAGATGTAAATATTTCTGGCACACTTGGTGGTACTTTTAATCTTTCTGATATTAATGCCACAACACTTAATGTGACTGGTGCTTCAGCACTAACTGGTGCAGTTACATTGGGTGCAAATATCACTGGTCTTGCAAGTACTGCAAACTTCCGTGATATTCGTATCGGGCCTAATGAAGCAGGTCAAGCATATAGACTAAACTTTGGTTACACCGTTCCAGGACAACGACCAACCGTTCTTCTACAGAACGAAGTTCAATCCGAACTAATGTCACCAGCTAAGTTGAATGTTCTACAAACTGCAACATTTGGTGATTCTTCACTTTCAACTTACGGTATTACAGGTAATGGTTTAAACAAATTAGATTATGTAACTATTTCCGGTAACGCAATTCAATCACCAACTACTCCTTTACTTGAAGTAACTAAAGGTAAAACTAAAGTTGTTGATTTAGAAGTAACTGGTGTTGCAACTATTCCTAATATCGAAAGCTCTGGTACTGCAAACTTTAACAACATCAACGTATCTGGTACTATTGGTGGTAGTTTTGATTTAGATGATATCCAAGCAACAACATTATCAGTATCCGGTGCTTCAGCACTAACTGGTGCAGTTACATTGGGTGCAAATATCACTGGTCTTGCAAGTACTGCAACATTCAAAGCAATCAATTTGGGTCAAAATACCGCTGATGCTAACGTTAAGCTAGGTTTTGCATATACTGCACCTAGTGCACGTCCAACAGTCTTGTTAGCAAACGAAGTTCAATCTGAACTAATGTCTCCTGCTAAGTTGAACGTTCTACAAACTGCAACCTTCGGTTCTGCTGCACTATCTACCTATGGTATTACTGGTAATGGTCTAAACAAATTAGATTATCTAACAATTACTGGTAACGCTACACAAAATCCTGCAACTCCACAACTTCAAGTTGGTGGTAAAGCAATTCTTAATGATGTTGAATTTACAGGTACTGTAACTGGCCTAACTGTTGATGTGAGTGGACAAGATCTAACTCCTAAATCAGTAGTTGCTGCTGAAGCAATCAAAGGTCAAACTCTTGAATCAGTTGGTCAAACAACTGTAGGTTCATCTCTACAAGTTGGTGGTGCTGCAACTGTTACTGGTGCATTATCTGCTGCCTCTGGTACTTTCAGTGGTGATGTTAGTGGTTCTAAAGGTATCTTCAGTGATAGCGTATCCGGTACAAGTGCAACCTTTACTGGGGATGTTAGTGGTGATAACGCAACCTTTAGTGGTGATTTATCTGCTGTAGCTGGTACTTTCAGTGGTGATGTAACCGTAACTGGTCAAACAATCACTGTTAAAGACTTGGTAGTAACTGGAACTTCAACTGGTGTAACTGCAATCGCTGACGTTGACGGTCTTGATATTGCTCCAAACAAAGTTGATGTTACAACAACTCTATCTGTTGCTGGTGAATCAACTCTTGCTGGTGTTACAGCAACTTCAATCAATAGTACTGGTGCAATTGCAGGTACTGCAATTTCTGGCTCTACTATTACAGCAACTGGTGAAATTTCTGGTGCATCATCTGTAGTAACTGGTCTTTCTAAATCTGGTAGCGTTGAAACTGGTGCTCTAAAGGCATCTTCTGTTGAAACTGCAATCATTAGCAACACTGCTGGTGTGTCAATAACAAACAACACTTCAATTGCAGGTAATCTATCTGTGACTGGAACTGTTACCCCTGGTGCAATTGACCTAAGTACTACTGATATTGATGCTAAGTCTCTAACAACTTCTGAAGGTGCTAACATTGGTGGTGACCTAGTTGTTGCAGGTACAGTTGATCTAAGTGCTGCTGACGTTGCTGTTAAATCTCTAACCAGTACTGGTGCAGTTATTAGTTCTGAAGGTACAGTAAGTAGTGTTCTACCTAAACTTTCCAGTACTGAAGCTAATATTACCACAGTAACTGCAACCACTGCAAATGCTACCACACTAAATGTAACTGGTACATCAACTCTAGCTGGTGTTAACGCTTCTGGTGCTATTACTTCTGCAACTAACATTACCGCTACTGGCGTATTAAAAGGTGCATCTGTTGAAACTGCGTCAATCAGCAATGCTGATGGTGTAGCAATTAACAATAACACTACAATCACTGGTAATTTGGACGTATCTGGGACATTGACCCCTGGTGCAATTGACCTAAGTACTACTGATATTAGTTCTAAGTCTCTAACCACAACTGAAGGTGCTACAATTGGTGGCGATCTTGTGGTAGCAGGTACAGTTGATCTAAGTGCTGCTGATGTGTCTGTGAAATCTCTTGCAAGTGCAGAGACAATTACAAGTGCTGGTGTTATTACAGTTTCTGATACAGTGAATTCTAGCACTCTACCAAAACTAATTACTACTGATGCAACTATTGGTGCTGTCCGTGCAGATACTATTGAAACAACTGGTTCAAGTACACTAAAACAAGTATCTGCTACTGAAGTAACAGCTACAAGTATTGTACTAAATGGAGTTGGTGAAGGTTTACGTGTTGACAATAATGCAAACATTAATGGTATATTAAATGTTAATAATATTAGTTCTGTTAATGATACAATTGACATTGCGAAAAGTGCTTCTATTACTGGTGATTTGACCGTATCTGGTACTGTTACTCCTGGTGCTATCGACCTAAGTACTACCGATATTAGTTCTAAATCCCTAAGTACTACAGAAGGTGCTACAATTGGTGGTGACCTAGTTGTTAATGGTTCAATTGATTTAAGTTCTTCCAATGTTTCAGCAATTACCCTTGCTAGTTCTGGAAATACTACCGTTGGTGGTAACCTAGTACTAACAACTGGTGTTGTAACTGGTAGCCCATCCGTATCTGGAAACCTTTCAGTCGCAGGTACTGCTTCAGTAACTGGTGCAACTACCCTAACTGATATCGTAAATATCGGCAAGAAAGTAACTGTAAGCACTGGTGGTATTCAAGTTGATGCTGGTGGTATCAATACCAACGCTATATTAGTATCCGGTGATACAACTTTAAACAACACTACAGTAAACACCACTTTAAATGTAACTGGTCAAAGTACAGTAGCTGCACTAAGTGCTGCATCCTTAAATGTATCTGGTGATAGTACTGTTCAGAAACTAACAGTTGAAGGTGAATTGGTTCCACAAGGTGGTATTGACCTAACTGGTGCAGATATTTCTGCTAATAGTCTTGCAACTGCTTCAACCATCACTGCAACTGGCCTAAGCACACTAAGTGGTGGTGTTAGTACTACTGATGTTACTGCATCTGGCACAGTGAATGCTGGTAGTTTGGGTGTTACTAACAATGCGACCGTTGGTGGAACATTAGGTGTAACTGGCTCATTATCTTCAGGTCCATTGACTGTAACTGGTCTTGCGAATATTACTGGTGTAACAACTGTTGGTTCATTGGTTTCCGGTGCTGTATCGGGTAGTACTGGTACATTTAGTTCTACATTGGATGTTACTGGTGCAGCTACATTTGACAACGATGTAACTGTTGAAGGTGTATTCACACCAGCAGGTGGTTTAGACCTAACAACTGCTGACATTACAGCTAAGAGTTTGTCAGTATCTGAAACTATTCACTCTGATGGTGCAGCTTCCTTTGGTGGTAACACAACAGTAGGTGGAACATTAGGTGTAACTGGTGAAGTAACTGCTCCATCGGCAACCCTAAGCGGTACTGGTACTGCACTAGCAGTAACTAATAATGCAACTATTGGTGGTACATTAGGAGTAACTGGTCAAGCATCACTTGGTTCTATCGTAACTTCTGGTGTATCTGCAACAAGTGGCTCTTTCAGTACTACTCTTGGCGTTACTGGTGCTGCGACATTTGGTAACGATGTAACTGTAGTTGGAACACTAACTCCTGGTAGCTTAGATCTAACTGGTGCAGATATCTCTGCTAAAACACTAACTCTATCTGAAACATTAAATGCGACAGGTAATACTACCCTTGGTGGAACATTAGGTGTAACTGGTTTAGCAACAATTGGTGGAACACTAACTTCTGGTGCAGTAACTGCTCCATCTGCAACCTTGAATGGTTCAGGAACTGGTCTAGCAGTAACTAACAACGCAACCGTTGGTGGTACACTAGGTGTAGTTGGTCAAACAACACTAGGTTCTGTTAAAACTGGTGCAACTCTAACAGTTGGTACACCATTAGGTGAGCAGCCTGAAACTGTACAGATTATGCCAGACACTTATATTGCTGGTAAACTACGTGTTGAAGGTGGTATTAACGCAGATATCGATGTTGGTGGACAAACACTAGAACCGTTTGCAGTAATAGCATCCGATTCTTTATCTTCTGCTGGTAATATTACTGCTGGTGCGGCAATTATTTCAAGTTCTGCAACAATTGGTGAAGTCGGTTCACAAAACAACAACCTAATCGTTAATGGTAACGTTGTAAACAACGGTGACTTTACTGTTACTGGTGTACTAAATGCACAATTGAACCAAGCAGATTCCGATGTAGCTGTTAAGTCTTTGACTGCAACTAACAACGTAGCGGCTGGCACTTCAATTACTGCTAACACTTCAATTACTGCTGGTACTTCTATCACTGCAACTGGATTGCTTAAAGGTAATACTTTAGAAGTTACTACTACTGGTTCATTTGGTGGTGCAGTAACTATGTCAAGTGGTGCAAACATCACTGGTACTGTTGGTATCACTGCTGGTAACCTAACAGTAGGTGGTAATATCTCTGCAACTGGTACTGCTGGATTCGGTGCAACAACCGTTTCTACAATTACAACATCAGGTTTGGCTACACTTGCAAGTGCATCCGTTACTGGTAACGCAACAGTAGGTGGAACACTAGCAGTAACAGGAGCACTAACTGCGAATGGTAACGTAACATTAGGTGACGCAGCGGCTGACGTTCTAACCGTTAATGCAACTTCATCATTTAAAGAAAATGCTGTGTTTGATAAGGCAGTAACAGTAACTGGTGAACTAACCACTACTAATGCTAACTTAACTACTACAACAGTAACTACCAAAAAGTATGATGTAATCCCAACTCAAGTTACATCATCAGTAATTGCTCCAACCGGAACATGGACTCCAGATGGTACAAGTAACGTATACTTCATCACTCTAGACCAAGATACCACGTTGGCTCCAATTACTGGCCTAATTGGTGGTGGTAAAGCTGCATCAGTATACATCTATGTTAAACAAGATACAACTGGTAACAGAAACTTTACAACTGATGGTACTTATGCTGTTGTTGATGGTGAACTAAACAAAACTGCTGGTAGCGTGACCATTTACCAAGTAATTTATGATGGTGTAAGTTCAGTTACTGATTTGTTCATTGCACAACGTACTGCTTAA

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID

3ba271e902afa423da063f0874945c7f531f6a3f293034ec463c55feeaa1febb

ColabFold

Source ColabFold

Method ColabFold

Resolution 0,4947

Oligomeric State monomer

Download PDB

Model Confidence

Very high
pLDDT > 90

High
90 > pLDDT > 70

Low
70 > pLDDT > 50

Very low
pLDDT < 50

Literature

Title	Authors	Date	PMID	Source
Transient expression effect of genes from a Jumbo E. coli phage	Petrzik,K. and Brazdova,S.	2023-07-26	—	GenBank

Protein

Domains

Domains [InterPro]

Domains [InterPro]

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

Predicted Aligned Error (PAE)

Model Confidence

Literature