Protein

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Genbank accession
XAO54579.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,61
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,59
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYSVLSDGVNVGFFIEENTVQQYDATRGYKKNFAVINDNRIWVAQRDIPAPAGAFTPQYWLATRTDPKWETVASPTRQLSSGEFIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGNTGYNEIKVQSSNVPGQGNQKIVRFGNQYSEVLITKPFSYNMLIFSNRLWQFWEAGNEERGIRVEPSTGRFHAQAGDFIMRRYTTGAPITFILPKYANQGDIVKSVDIDGMGPTFHLMVETFDTSSSLDKAGQHQMEFRTTGDGFFVYDAAEKLWHVWDGDFKTRLRIIRDSVKLLPNESIIVFGEDNSTPATINIDLPTDVLQGDIVKIALNYLRKSQTVNIRAAVGDKIASDIKLLQFPKRSEYPPDTTWVMVDSLTFNGNISYTPVIELSYAEDAVSGTSYWVVAQNVPTVERVDSLNDSTRTRLGVIALANQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVAKENQRGIARIATTAQVNQNSDFAFVDDVIISPKKLNERTATETRRGLAELATQQETDAGVDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYVSTTGATPAASRELNGTNVYNKNTVNLVISPKALDQYKATYTQQGAVILAVESEVIAGTSQAGWSNAVVTPEMLHRKTALDSRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKASETLTGIAEIATQSEFDTGTDDTRISTPLKVKTRFNNTARTSVNALSGLVETGTLWDHYNLNILEANETQRGTARLATQGEVNTGTDDKTIVTPLKLMSKKATENAEGIVRIATNAEATAGTSKVLAISPSALKYIAQTETTWEASETLRGFVRLSSGAATSAATTTTGAGFTYENGVYTPDPSKLVSYAKSGYAVSPYELNRVLQNFLPINAMAVNAEKLDNLDSTQFIRRDIAQTVEGVLTLTKQTNISAPVVSTSTAVFTDVTAGTSTFGTVNVVNGTNKWKITAPSAGTTMTIGDTTNVLTLNTASGNVAVLNNLSAGNDVQAKNNYVLNGRTIATTTGEVSGATLSLGDNSQNLVLKTLDAGNIIANGGGAFKVLTEKNAVEIVDRNFVNQAGDTMSGVLRVNAPVRVFGTKPSLIAQAPTADTVGFWSVDINDEPTYSQFPGYWTMKLKRQVNIDTVQTKPAGVTDEVWNASGWLTENGTFASPAIRYRNDDGTLGDEVLGSSGQKLRGTWFDYSVRDKQIKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKSAWTTFAMVYTADNPPSAEDVGALPADNTTMGNLTILDWLRIGNVRIIPDPTTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1318 AA
molecular weight: 143125,26860 Da
isoelectric point:5,22654
aromaticity:0,07891
hydropathy:-0,29613

Domains

Domains [InterPro]
DC_1946
ATT
1–210
DC_1946 DC_1209
IPR048391
ATT
1112–1145
IPR048391 IPR048391
XAO54579.1
1 1318
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-210 | STR 349-1111 | ATT 1112-1145 | STR 1146-1204 | ATT 1205-1266 | STR 1267-1299 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Yersinia phage vB_YenM_P8
[NCBI] 		3141560 Viruses >
Host Yersinia enterocolitica
[NCBI] 		630 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XAO54579.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP693301 [NCBI]
CDS location
range 131160 -> 135116
strand -
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCAGCATTCAGAGCAACATCCGGTCTCGATGCTGCTGGTGAGAAAGTCATTAATGTCGCAAAAGCTGATTACTCAGTTTTATCAGACGGCGTTAACGTAGGTTTCTTTATAGAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATGCAACACGCGGATACAAAAAGAACTTTGCAGTTATTAATGATAACCGTATTTGGGTTGCTCAACGTGATATTCCGGCACCAGCTGGAGCATTTACCCCTCAGTATTGGTTAGCAACTCGTACTGACCCTAAATGGGAAACTGTTGCATCTCCAACTCGTCAGCTTAGCTCCGGGGAATTTATCGCAGTCGACTCAGCTGCAAGCTTTACCACATTTACATTGCCTCCGAACCCGACTGATGGTGATACCATCGTTATTAAAGATATCGGCGGTAATACTGGTTATAATGAAATTAAAGTTCAGTCGAGCAATGTGCCTGGTCAAGGTAACCAAAAGATTGTTCGCTTTGGTAATCAGTATTCAGAAGTTTTAATTACCAAACCATTCTCTTATAACATGCTTATCTTTTCAAACCGCTTATGGCAATTTTGGGAAGCAGGTAACGAAGAACGTGGTATCAGAGTAGAACCGTCGACCGGACGTTTCCATGCACAAGCTGGCGACTTTATTATGCGTCGTTATACAACTGGTGCACCGATTACTTTCATTCTTCCTAAGTATGCAAACCAGGGTGATATTGTCAAATCTGTTGATATCGATGGTATGGGACCAACGTTCCACCTGATGGTTGAAACCTTTGACACTAGTTCCAGTCTTGATAAAGCTGGTCAGCATCAAATGGAATTCCGTACCACAGGTGATGGTTTCTTCGTTTATGATGCTGCCGAAAAACTCTGGCATGTTTGGGACGGTGATTTTAAAACTCGTCTTCGTATTATTCGTGACAGCGTTAAACTTTTACCAAACGAAAGCATCATTGTATTTGGCGAAGATAACTCAACTCCAGCGACGATTAATATCGATTTACCAACGGATGTTTTGCAAGGTGATATTGTTAAAATTGCACTGAACTATCTCCGTAAATCGCAGACTGTTAATATAAGAGCTGCTGTTGGTGATAAGATTGCATCTGACATTAAATTACTACAATTCCCTAAACGTTCCGAGTATCCACCGGATACAACTTGGGTGATGGTTGATTCATTGACCTTTAATGGCAACATCAGTTATACTCCGGTTATTGAATTATCATATGCAGAAGATGCAGTGTCTGGAACAAGTTATTGGGTTGTCGCTCAGAACGTCCCGACTGTCGAACGAGTTGACTCATTAAATGATTCCACGCGTACACGTCTTGGTGTTATTGCTCTGGCAAACCAGACTCAGGCAAACGTTGACCATGAAAATAACCCAGAAAAAGAACTCGCAATTACCCCTCAGACTTTAGCCAACCGTGTTGCTAAAGAGAACCAACGAGGCATTGCCAGAATCGCAACGACTGCCCAAGTAAATCAGAACAGTGATTTTGCATTTGTTGATGATGTAATTATTTCTCCGAAAAAACTCAATGAACGTACGGCAACAGAAACGAGACGTGGGCTCGCAGAACTCGCCACACAGCAAGAAACCGATGCGGGTGTAGATGATACCACAATTATAACTCCAAAGAAACTGCAAGCTCGCCAGGGCTCAGAATCGCTATCCGGTATTGTAACTTACGTTTCAACGACTGGTGCAACTCCTGCTGCTTCGCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAATACGGTTAATCTGGTAATTTCCCCGAAAGCTCTTGACCAATACAAAGCTACTTACACTCAGCAGGGTGCAGTTATTCTGGCCGTTGAAAGTGAAGTAATTGCAGGTACATCGCAAGCTGGCTGGTCAAACGCTGTTGTTACTCCGGAGATGTTGCATCGTAAAACAGCTCTTGATTCCCGTATCGGTTTAATCGAAATTGCTACTCAGGCAGAAACAAATGCAGGAACCGATTATACCAGAGCTGTGACTCCTAAAACGTTAAATGACCGTAAAGCATCAGAAACGTTAACCGGCATAGCCGAGATTGCTACGCAATCAGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCAACTCCATTAAAAGTTAAAACTAGATTTAATAATACTGCTCGTACTTCTGTTAATGCATTAAGTGGTTTAGTAGAAACAGGGACGCTCTGGGACCATTATAACCTGAATATTCTTGAAGCAAATGAGACTCAGCGTGGCACAGCAAGATTAGCAACTCAGGGTGAAGTCAATACTGGCACTGACGATAAAACAATCGTTACTCCGCTTAAATTGATGTCGAAAAAAGCCACTGAAAATGCCGAAGGTATTGTTCGTATCGCGACAAATGCAGAAGCAACTGCCGGTACATCGAAAGTCTTGGCCATCAGTCCGTCTGCGCTGAAATATATTGCACAAACGGAAACAACCTGGGAAGCATCTGAAACACTGCGTGGATTTGTTCGTTTATCTTCCGGTGCAGCTACTTCGGCCGCAACTACAACGACGGGCGCGGGATTTACATATGAAAATGGTGTGTATACCCCGGACCCAAGTAAACTGGTTAGCTATGCGAAATCTGGATATGCAGTTTCGCCTTACGAATTAAACCGCGTATTGCAAAACTTCTTACCGATAAATGCGATGGCTGTTAATGCTGAAAAACTGGATAACCTCGATTCGACCCAGTTTATTCGTCGTGATATTGCTCAGACTGTTGAAGGTGTATTAACCCTTACTAAGCAGACAAATATCTCTGCTCCGGTTGTATCGACGAGCACTGCGGTGTTTACTGATGTAACGGCTGGTACTTCGACGTTCGGAACTGTGAATGTTGTTAATGGAACTAACAAGTGGAAAATCACTGCTCCTTCCGCCGGAACAACAATGACTATTGGCGATACGACTAACGTATTGACATTAAACACCGCCTCGGGTAATGTTGCTGTATTGAACAACCTTAGCGCCGGAAACGATGTTCAAGCCAAAAATAATTATGTTCTAAATGGTCGTACTATCGCAACCACGACGGGTGAAGTTTCTGGTGCAACTTTGTCTCTGGGTGATAACTCACAGAATTTAGTGCTCAAAACTCTTGATGCTGGTAATATCATAGCAAATGGTGGCGGTGCATTTAAAGTTCTGACCGAGAAAAACGCAGTAGAAATTGTTGATAGAAACTTTGTTAACCAGGCTGGTGATACAATGTCTGGTGTACTCCGTGTGAATGCTCCGGTCCGTGTATTTGGTACGAAACCGAGTCTTATTGCACAAGCTCCGACTGCTGATACTGTTGGCTTCTGGTCTGTCGATATCAATGACGAACCGACTTACAGCCAGTTCCCTGGCTACTGGACAATGAAGTTAAAACGTCAGGTAAACATTGATACAGTTCAAACTAAACCTGCTGGGGTAACTGATGAAGTTTGGAATGCTTCTGGTTGGTTAACTGAAAACGGAACTTTTGCCTCGCCCGCTATTCGTTATCGTAATGATGATGGTACACTTGGTGATGAAGTATTAGGTAGCTCTGGGCAGAAACTGCGTGGAACCTGGTTTGACTATTCAGTTCGTGATAAACAAATTAAATATCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACGCTGGATTCGTGCTATCAAGATTGGGTTTGTTATCCAACTGGATTGAACGGTGGTACTATTCGTTATACTCGTACATGGCAGAAAAATAAATCTGCATGGACGACTTTCGCAATGGTTTACACCGCGGATAACCCTCCGTCTGCAGAGGATGTTGGTGCATTACCGGCTGACAACACAACGATGGGGAACTTAACCATTCTTGATTGGTTACGTATCGGTAACGTACGTATCATCCCAGACCCGACCACTAAATCTGTTAAGTTTGAATGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
ffec01680675343a771fb4c0921a954148da382c2512da539e0d26b256dc4622
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5461
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genome sequence of Yersinia phage vB_YenM_P8 Hammerl,J.A. 2003-08 — GenBank