Protein

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Genbank accession
ADL40327.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical phage structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MLIIADTNYAQLGVLPSAQDIKRTRDISGTDTLEFNYAMFNVVGAEEIKDDMINVIKTQNHILTADQVYVIKEVNPSSDNLIAVECEVDTEALKSLYNNAFTRTNVPITDIANNALIGSGWVVNTDVTKLRSLAMTNSTALDILKKLAETYMCDLQFDAKNKVVNFLKSMGTSKGTFFNDKLNLVALNIKQDTHDFCTRLIPVGQNNMYITDVNGGLPYVENHQYTNQVITAYWSAGQYTDANALKEDAIAKLAIMSQPQVTFDATVLDLARISEINPDFENYSELSYNIGDTVTIMDSKKEIGQTVRIVQTVEYMDKPEQNTVQFDSMYQLMEDLFEKSLHTTDTVDSITTPDGGSVNGDTVDKIDWTKVQNVQVQTAQIANLTVTTEKVADSTITTAKIGDAQITNAKIYSLSADKLTAGTIDAGVITVTNLNADNISGGTIDAHIIGVTNLNASNIVSGTLDASKIVVENLDASAITTGTLDASQISVINLDASSITTGTFSANRISGGTIDASTISVINLDASAITTGTFSANRISGGTIDASLISVIKLNASNITTGELDGTLIKAHTIVADQMVIGTITADSGIIATSAIGTAQIADGSITDAKVVNLSANSITAGTLSVDRLIIRGSDKSIVYELNNIAGATQVLSQTTINGEALTDRTITADKVVANAITANEIATNTITANSGIIASLDATKITTGTLDAAQISVINLDASSITTGELSGDRINGGTITGVNIVGTTIKTNNTANYLTLHDQQISIFQNSNEMISLGYMVYGSNTLPLIQMFGKHLISRTGATDDGTMTIGDIKPADLTNGKVSIYNISALGAFECWGNSKFNADMEIDATLNVVGSSGSGSGTGAVSTDSLLVRTNANFLNGKVIISSSYIDMYDALWMNGNNIMMSGGNIASAGTISANNFYGIGKVPAYTSSSLSIPTGNSVTIAHNLGYHPIIRLNGTVGNLIVTTQDTDVNHTRIYCYSGGGATFSGYAYFY
Physico‐chemical
properties
protein length:996 AA
molecular weight: 105539,08680 Da
isoelectric point:4,49587
aromaticity:0,05723
hydropathy:0,04096

Domains

Domains [InterPro]
DC_1353
STR
1–509
DC_1353 DC_1258 DC_1258
IPR044051
ENZ
2–84
IPR044051 IPR010572
IPR007119
Unmapped
20–327
IPR007119
ADL40327.1
1 996
Architecture
STR
STR
STR 1-551 | STR 625-859 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Clostridium phage phiCTP1
[NCBI] 		871584 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Clostridium tyrobutyricum
[NCBI] 		1519 Bacteria > Firmicutes > Clostridia > Clostridiales > Clostridiaceae > Clostridium

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADL40327.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HM159959 [NCBI]
CDS location
range 17175 -> 20165
strand +
CDS
ATGTTAATAATTGCAGATACAAATTATGCTCAATTGGGGGTTTTACCTTCCGCCCAAGATATTAAAAGAACTAGGGATATAAGTGGCACCGATACGTTGGAGTTCAATTATGCTATGTTTAATGTTGTGGGGGCAGAAGAAATAAAAGATGATATGATTAATGTGATAAAAACACAAAATCATATTTTAACAGCAGACCAAGTATACGTAATTAAAGAGGTAAACCCAAGTTCAGATAATTTAATTGCAGTTGAATGTGAGGTAGATACAGAAGCTTTAAAAAGTTTATATAACAATGCCTTTACAAGAACCAATGTACCCATTACAGATATTGCAAACAATGCTTTAATTGGAAGTGGCTGGGTAGTTAATACTGATGTAACTAAATTGAGAAGTTTAGCAATGACTAATTCTACTGCATTAGATATATTGAAAAAATTGGCAGAAACTTATATGTGTGATTTACAGTTTGATGCTAAAAATAAAGTAGTTAACTTTTTAAAAAGCATGGGTACCAGTAAAGGTACATTTTTTAATGATAAATTAAATTTAGTTGCTTTAAATATTAAACAAGATACCCATGATTTTTGTACTAGACTAATACCAGTAGGTCAGAATAATATGTATATTACTGATGTAAATGGTGGTTTACCTTATGTAGAAAATCACCAGTACACAAATCAAGTTATAACTGCATATTGGTCAGCAGGTCAATATACAGATGCTAATGCACTTAAAGAAGATGCTATAGCTAAATTAGCAATTATGTCACAACCACAAGTTACATTTGATGCCACAGTTTTAGATTTAGCTAGAATATCAGAAATTAATCCAGATTTTGAAAATTATTCAGAATTAAGTTATAATATAGGTGATACTGTAACTATAATGGATTCAAAGAAAGAAATTGGACAAACTGTACGTATAGTGCAAACTGTAGAATATATGGATAAGCCAGAACAAAATACGGTGCAGTTTGATAGTATGTATCAGCTAATGGAAGATTTATTTGAAAAATCTTTACACACTACTGATACTGTAGATTCAATTACTACCCCCGATGGTGGTAGTGTAAATGGTGATACTGTAGATAAAATTGATTGGACTAAAGTACAAAATGTACAGGTGCAAACTGCACAAATTGCTAACCTAACAGTAACAACCGAAAAGGTAGCAGACTCAACTATAACAACTGCAAAGATAGGGGATGCACAAATAACTAATGCTAAAATATATAGTCTATCAGCAGATAAATTAACTGCTGGTACAATAGATGCTGGGGTTATTACCGTAACTAATTTGAATGCAGATAATATTAGTGGAGGTACAATTGATGCACATATTATAGGTGTTACTAATTTAAACGCTAGTAATATTGTATCGGGTACTTTAGATGCTTCCAAAATTGTGGTCGAAAATCTGGATGCATCCGCAATAACCACTGGTACGCTAGATGCCTCCCAAATATCCGTTATTAATCTAGATGCCTCATCTATTACTACAGGAACATTTAGTGCCAATAGAATATCTGGAGGTACTATAGATGCTAGTACAATTTCTGTAATTAATTTAGATGCTAGTGCAATTACAACTGGAACGTTTAGTGCTAACAGAATAAGTGGAGGTACAATTGATGCTAGTTTAATAAGTGTAATTAAACTAAATGCTAGCAATATTACAACCGGTGAATTAGACGGTACACTTATAAAAGCACATACAATTGTAGCTGACCAAATGGTTATCGGTACAATTACAGCTGATAGTGGTATTATAGCTACTTCTGCTATAGGTACAGCACAAATTGCTGATGGTAGTATCACGGATGCTAAAGTTGTTAATTTAAGTGCTAATAGTATTACTGCTGGAACTTTAAGTGTAGATAGGTTAATTATTAGGGGTAGTGATAAAAGCATTGTTTATGAATTAAATAACATTGCTGGAGCTACACAGGTATTAAGCCAAACTACAATTAATGGTGAAGCATTAACAGATAGAACTATTACTGCTGATAAAGTTGTAGCTAATGCAATCACTGCAAATGAGATAGCAACTAATACTATTACAGCAAATTCAGGAATTATTGCTTCACTTGACGCCACTAAAATAACAACTGGGACACTTGATGCGGCACAAATTAGTGTTATTAATTTAGATGCAAGTTCAATTACTACAGGTGAATTAAGTGGTGATAGAATTAATGGTGGTACAATTACAGGAGTAAATATTGTTGGTACTACTATTAAAACTAATAATACTGCAAATTATTTAACATTACATGACCAACAAATATCAATATTTCAAAATTCAAATGAAATGATTAGTTTGGGATATATGGTATATGGTTCAAATACATTACCATTAATACAAATGTTTGGTAAACATTTAATATCAAGAACCGGGGCAACTGATGATGGTACAATGACTATTGGTGATATAAAACCTGCCGACCTAACTAATGGTAAGGTATCTATTTATAACATTAGTGCATTAGGAGCTTTTGAATGTTGGGGTAATTCAAAGTTTAATGCAGATATGGAAATTGATGCAACTTTAAATGTTGTAGGCAGTAGTGGTTCCGGCAGTGGTACGGGGGCAGTAAGCACTGATTCATTATTAGTTAGAACTAACGCCAATTTCTTAAATGGTAAAGTTATAATTTCATCTAGTTATATAGATATGTATGATGCCTTATGGATGAATGGCAACAATATAATGATGAGTGGTGGAAATATTGCTAGTGCTGGAACAATATCAGCTAATAATTTTTATGGTATCGGTAAAGTACCGGCATACACATCCTCATCATTAAGTATCCCAACTGGTAATTCAGTAACTATCGCCCATAATTTAGGCTATCATCCTATAATTAGATTAAACGGAACTGTAGGAAATTTAATTGTTACCACACAAGATACTGATGTAAACCATACTAGAATTTATTGTTATAGTGGTGGTGGGGCAACATTTAGTGGATACGCCTATTTTTATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
57f6420e28e84d8e1e4cdf02431b2ff1f606368b00c57b356583a9e7ed71464d
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2982
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genomic sequence and characterization of the virulent bacteriophage phiCTP1 from Clostridium tyrobutyricum and heterologous expression of its endolysin Mayer,M.J., Payne,J., Gasson,M.J. and Narbad,A. 2010 20581196 GenBank