Protein

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Genbank accession
YP_009785747.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,82
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,80
Protein sequence
MTKSAFVEVNITNPTKLAQDSQDTANTAVKGVTDLNDPNLMSVIEKQNNVVQFAGLTSQYNVIVQNAKDEGINTDSLITAYNNLNKFMIDVLTDPDHASDVDRKTYKNYQDAYNSELAKIQTALKNNTDGKFTSAASATSQAASMANAAKSAADSNYNYANSEIAVQSTATAKAQSTADNAFSQAQAVGSQASAEIAINSQATAKAQSTANNAYSYANSQMAVNSQATAKAQSTADNAFSQAQAVGSQASAEISNNSTATTKAQSTADNAFSQATTAIDTGKVTSQAVTDLKDGSKLTIAELENGLATKVANSDYASYKVQTASQIAQKVDNGAFSAYQTTTADLIAQKVATKDFSAYQATTAKEISSKVDNGDFNTYKSQTADLIDNKVSSSEYASDKTQTASQIADRVSNSAFSTYQTQTASQIASKVDNGDFETYQTQTSKLIESKVDNGTYQTDKTQTAKDIASKVSSSDFSTYQTQTADLIDSKVSNSAYASDKQQTASQISERVANSDFETYKTQTAGLIAQKVATSDFSAYQATTAKSIESKVESSDFNTYKTQTADLIDDKVSNSAYASDKTQTASEIADRVSNSAFSTYQTQTASQIASKVDNGDFSTYKTQTAGLIAQKVATSDFSAYQATTAKEISSKVESSDFNTYKTQTADAISSKVESSDFQTLQTQVDNSVVGTNLLTNSNFSDESLTYWTVDPGTTTSFDSSGNLVLAVKAASGNRIYYSASQTLIAGTTYTISFYAYVDSSSTSSSINVKVGPYDNLTSISVSGNTLTRYTGIIKPVWGNSGTLSITVGAFNSGTVGDIVHITRIKLEKGSVATDWSLNPEDQATQSQITQLSGDINLRVTKGDLVDQINIQAGKTLISSSGQLTLSGKSVFLDSVDPVIMKSANIDKLLVGKKLTAADIAANTFTTNNGTFTVDSNGLVTATSLIIRGSTNLVYNSALSGGNGTYIPGWVIGSMGYYSNFTLHDGVPSVGFNNSTGSGNWVNFGQTKRVPLNGLTGQPYSASVWFIDAGSDATMTYQMTLAFYDANGNRLPAGNYTSVNLHGTGSAQAWQYLTIDGFNAPSTASSVGLQYWAYNGKGHALFSSPMLTQTAHSTGYQPDTGNVVSAGTILGTNISASTINGTTFHGGDIINDANNASQFYPTTISSNGHIYTTMFNAADAMQTDLSTGSLTTKYRATNSSSNQYEAYDTNISANQIVLSAGHTNGKDMSFSQSVTGSNQDGYVLISPLDGLTFKGDNQQITFSGTSADVTPKGIIITPYGNINPNGTQNIWYVGNGPTMKTASFGIDGSGANNIKFNRSLDIGNFNINTYHTITSSDNGPIHFNRNDGSSGDIYAATVHYTSLVKSSLLSVKRDVKKADTAYWAQLVNSIDLATYQYKTDDNTSHLRLSSIVDDVNVTKQWQLPDVFVARDENGKLVGVDDSVLLNATLATVQEQQKEIDQLNGHNMELEAKLNKLEAKLNG
Physico‐chemical
properties
protein length:1479 AA
molecular weight: 157155,59270 Da
isoelectric point:4,87249
aromaticity:0,08046
hydropathy:-0,39615

Domains

Domains [InterPro]
DC_0336
RBD
1–195
DC_0336 DC_1418 DC_1194
G3DSA:2.60.120.260
STR
685–825
G3DSA:2.60.120.260 G3DSA:2.60.120.260 IPR030392
IPR008979
STR
686–826
IPR008979 Coil
YP_009785747.1
1 1479
Architecture
RBD
STR
RBD 1-195 | STR 557-1472 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage SA-C12
[NCBI] 		1755697 Uroviricota > Caudoviricetes > Tybeckvirinae > Lenusvirus SAC12 >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009785747.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_047760.1 [NCBI]
CDS location
range 6567 -> 11006
strand -
CDS
TTGACAAAAAGTGCTTTCGTTGAAGTCAACATTACTAATCCGACAAAATTAGCACAAGATTCACAAGACACGGCGAACACTGCTGTTAAGGGGGTTACAGATTTAAATGACCCTAATTTGATGTCTGTGATTGAGAAACAAAATAATGTCGTACAATTTGCGGGATTAACGTCACAATATAATGTAATTGTTCAAAATGCAAAGGACGAAGGAATCAATACAGATTCTTTAATCACCGCATATAATAATTTAAACAAGTTCATGATTGATGTGTTGACAGATCCAGATCACGCCAGTGATGTAGATCGAAAGACTTATAAAAATTATCAAGACGCCTATAATTCCGAACTTGCAAAGATACAAACAGCCCTAAAGAATAATACAGACGGTAAGTTTACAAGTGCAGCCAGTGCTACAAGTCAGGCGGCTTCAATGGCAAATGCCGCTAAATCAGCCGCAGATAGCAATTACAATTACGCCAATTCAGAAATAGCGGTCCAATCTACTGCTACTGCCAAAGCTCAGAGCACAGCTGATAATGCGTTTAGCCAAGCTCAAGCAGTCGGTAGTCAAGCTAGTGCTGAAATAGCGATCAACTCTCAGGCTACTGCTAAAGCTCAGAGTACGGCCAATAATGCCTATTCATATGCTAACTCTCAAATGGCAGTTAACTCACAGGCTACTGCTAAGGCTCAAAGTACAGCTGATAATGCGTTTAGCCAAGCTCAAGCGGTTGGTAGTCAAGCTAGTGCTGAGATAAGCAATAACTCTACGGCTACTACTAAGGCTCAAAGTACAGCTGATAATGCGTTTAGCCAAGCGACTACAGCAATAGATACTGGTAAAGTAACTAGTCAAGCAGTGACAGACCTAAAAGATGGTTCCAAGCTAACGATTGCTGAACTAGAAAATGGACTAGCTACAAAGGTTGCTAACTCAGACTATGCTAGTTACAAGGTTCAGACAGCTAGCCAGATAGCGCAGAAAGTTGATAATGGTGCTTTCTCAGCCTATCAAACGACTACCGCTGACTTAATAGCCCAAAAGGTGGCTACTAAGGACTTCTCAGCTTACCAAGCGACAACTGCTAAAGAAATATCTAGCAAAGTCGATAATGGTGATTTTAACACCTATAAGTCCCAAACAGCTGACTTAATTGATAATAAGGTTTCTAGTTCAGAGTATGCCTCAGATAAGACCCAGACAGCTAGTCAAATTGCAGATAGAGTAAGTAATAGCGCTTTTTCAACCTATCAAACTCAAACAGCTAGTCAAATAGCGTCTAAAGTTGATAATGGTGACTTTGAAACCTATCAAACACAAACTAGCAAGTTAATTGAATCAAAAGTTGATAACGGAACTTATCAAACAGACAAAACACAGACGGCTAAAGATATTGCTTCAAAAGTATCTTCTAGTGATTTCTCAACTTATCAAACACAGACTGCTGACTTGATTGATAGTAAAGTATCTAACTCAGCATATGCGTCTGACAAGCAACAGACAGCTAGTCAAATATCCGAAAGGGTAGCTAACAGTGACTTTGAAACTTATAAAACCCAAACGGCTGGATTAATAGCTCAAAAGGTGGCTACTAGTGACTTCTCAGCATACCAAGCTACAACTGCAAAGTCAATTGAAAGTAAAGTTGAATCTAGTGACTTTAACACTTACAAAACACAAACCGCTGACTTAATTGATGACAAAGTTTCTAACTCAGCTTATGCGTCTGACAAGACACAAACGGCTAGTGAGATAGCGGATAGGGTAAGTAATAGTGCTTTCTCAACCTACCAAACACAAACTGCTAGTCAGATTGCTAGCAAGGTTGATAATGGTGACTTCTCAACTTACAAAACGCAGACGGCTGGATTAATAGCTCAAAAGGTGGCTACTAGTGACTTCTCAGCATACCAAGCGACAACTGCTAAAGAAATATCTAGCAAGGTTGAATCTAGTGATTTTAACACGTACAAGACACAAACTGCTGATGCTATTTCTAGCAAGGTTGAGTCTAGCGACTTCCAAACCTTACAAACGCAAGTTGATAATAGTGTGGTTGGGACTAACTTATTAACTAATTCTAATTTTTCAGATGAAAGTTTAACATATTGGACAGTAGACCCAGGGACAACTACCAGTTTTGATTCTAGTGGAAATTTAGTTTTGGCTGTTAAAGCTGCATCAGGTAACAGAATATATTATTCCGCAAGCCAGACCTTAATTGCAGGCACGACATATACGATTAGTTTTTATGCCTACGTAGATAGCTCCAGCACTAGTTCTAGTATAAATGTAAAAGTAGGTCCTTATGATAATCTAACTTCTATAAGTGTCAGCGGAAATACTTTAACTAGATATACAGGAATCATCAAGCCTGTATGGGGAAATAGTGGGACTTTATCGATAACAGTTGGAGCATTCAATTCGGGTACAGTTGGGGACATAGTGCATATCACCAGGATTAAACTTGAAAAAGGTAGTGTAGCAACAGATTGGTCTCTTAATCCAGAAGACCAAGCTACGCAGTCTCAAATCACACAGTTAAGCGGCGATATTAACCTTAGAGTAACCAAGGGTGACCTAGTCGACCAGATTAATATTCAAGCCGGTAAAACCCTAATCTCATCCAGTGGTCAATTAACGCTGTCTGGTAAAAGTGTATTCCTTGACAGTGTTGACCCCGTTATCATGAAAAGCGCAAATATCGACAAGCTCCTTGTTGGTAAAAAGTTAACGGCGGCCGACATTGCGGCCAATACTTTTACAACTAACAACGGGACTTTCACAGTAGACTCGAACGGTCTTGTCACAGCTACAAGTTTAATTATCCGTGGCTCAACTAACCTAGTTTATAACTCAGCATTGTCTGGCGGCAACGGGACATATATTCCGGGGTGGGTAATAGGTTCGATGGGGTATTACTCAAACTTTACGTTGCATGATGGTGTCCCTTCTGTCGGGTTTAATAATTCAACTGGTTCTGGGAACTGGGTAAACTTTGGACAAACCAAAAGAGTACCACTAAATGGTTTGACTGGACAGCCTTACAGTGCGTCAGTCTGGTTTATTGACGCCGGTAGCGACGCTACAATGACATACCAAATGACACTAGCTTTCTATGACGCCAACGGTAACAGGTTGCCGGCTGGGAATTACACCAGTGTAAATTTACACGGGACTGGTAGTGCTCAGGCATGGCAGTATCTAACTATCGACGGTTTTAATGCTCCTAGCACTGCGTCATCTGTCGGCCTACAGTATTGGGCGTACAACGGCAAAGGCCATGCTCTATTTAGCTCACCAATGTTGACACAAACCGCTCATTCAACTGGCTACCAGCCAGATACAGGTAATGTTGTTAGCGCCGGTACAATTTTAGGCACAAATATTAGTGCGTCAACTATCAATGGGACAACGTTCCATGGTGGCGACATCATTAATGACGCCAATAATGCGTCTCAATTTTATCCAACAACAATATCTAGTAATGGTCATATCTATACGACAATGTTCAATGCTGCTGATGCTATGCAAACAGATTTATCAACTGGATCATTAACAACAAAATATCGTGCAACCAACTCATCTAGTAACCAGTACGAGGCATACGACACTAACATAAGTGCTAACCAAATCGTATTATCTGCTGGTCACACAAATGGAAAAGACATGTCATTTTCACAGTCTGTAACTGGCAGTAATCAAGATGGATATGTATTGATAAGTCCACTCGACGGTCTTACTTTTAAAGGTGATAATCAACAAATCACCTTTAGCGGTACTTCTGCTGATGTTACACCGAAGGGTATCATTATTACACCATATGGCAATATCAACCCTAATGGCACACAGAATATCTGGTATGTCGGTAATGGTCCAACTATGAAGACAGCCAGCTTTGGTATTGATGGCTCGGGTGCTAATAACATTAAATTTAATCGTTCTTTAGATATTGGCAACTTCAACATAAATACCTATCACACGATTACCAGTTCTGACAATGGCCCGATTCATTTTAATCGTAACGATGGTAGCTCTGGTGACATCTATGCCGCTACTGTTCACTATACGAGCCTAGTTAAGTCATCTCTATTAAGTGTTAAGCGGGACGTTAAAAAGGCTGACACAGCTTATTGGGCGCAGCTAGTTAACTCAATTGATTTAGCCACTTATCAGTACAAAACTGACGATAATACCAGTCATTTGAGATTATCTAGCATTGTTGACGACGTTAATGTAACAAAACAGTGGCAATTGCCAGACGTGTTTGTTGCCCGTGATGAAAACGGCAAGTTGGTTGGGGTGGATGACAGCGTGCTTTTAAATGCCACCCTAGCCACGGTGCAGGAACAACAAAAGGAAATTGACCAATTAAACGGTCACAACATGGAACTAGAAGCTAAATTAAATAAATTGGAGGCCAAATTAAATGGATAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
fed6cc93246b8c901b8a52d802384ce1754235af3b41645f6381a78c8035182e
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5138
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Lactobacillus brevis bacteriophage SA-C12: a mosaic Myoviridae member Mahony,J. 2019-05-23 — GenBank