Protein

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Genbank accession
YP_012086874.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
Protein sequence
MNKLVKRRFQAGLGSEIKRVYKEGQQINTLLLAQVIQVNYKYNTVDLLALQHKEVFQNSYANEGRFSARLPMEFGGRNIVGQPYGQVNPIAVGTVVLVGFINSDKDMPIVISVYNNNDVSKQLSRTQFSNSDPKDLELIGDMHQKFSLYPSLTYDSVDGEGGRVVTFSGKSFIAFDTKEVANSSTTDAGYGTKYEDLETSYYNNGDLIEPMKGRAPNVLFKHQGVLDDDGKPDLHDLLIHINPDGTYRTSMMNKEEDWRTLFEMTPDGRVKLRKQDSINIDGGIEISELGINNEGFVYLRNGDMDLEVRKDGIYSQGKLFTADVDLSDVYDKLNGLSIQIKETNGQLEIIANGVEEQNGKISELSTEITIVAGKVESKVTKTEVQDMIDSSFVDMSDAIKKAQEDADKANKVIADMSSDNRLTPSEKIDLLKEWDIIKNEYPSYLEQAETYEVDSKDYTAKYNSLELFVTPILADMESTSSVDGATLRKTFNSYYTARIALLNSISKKLKDGITEAMKKASQASLDATQAMADASQAKIDADNANKLISDIASDNKLTPSEKYQLKKEWDVIVKEYPTTIAQAEKYAVATAEYTAKYKALELFVEPLFKDMDETSIVDGERLRATFSDYYASKIALLKEVTDSAKTELDAYGNKISVMETNITQTSEAITLLATRVQTVEDGVQSNKAQIEIQAEQISQKVTASEVKGIVDDSINNLTLGGTNLFVIKTQTAGLLNENDGTVGTAVDNSVVSDYIKVNQKTPYIATLYGNTGTNMIITDWYDKNRTFISGEAVADSGDFSKKYVSPDNAVYARVSYKKANYVNIKFEAGTKATDYSPSWEDIKGDQTALEEYIKKVEEQAKKAQQDAENAKNDAENANNAIADMSNDNMLAPNEKKQILLQWEQIKTEYPINLDQATKFGVSSQQYTTAYNALDEYLKPILADMTTTSVVVGSTLRNTFNNYYDKRTTLLNRISDVAKNVADKAQETADTINDNLQNIGGYNYVGFSSGDNMLPRLMIKNVGYYTLGSSTTEFIDSMVAVKGDATTQPFDYTVGTSDKEIAGGGLADYRMKEVKEGQWITASANVQVIGGGSARLAIYTLEGDNWVGSNSTPIQVSDGLKRVVAQRKVTGLTKGVLIRIESADTNVKEFRFGNVQLEVGIIPTPWKKSDIDIQEDINNVVQNIKTYTAWANDLQGLDFTREKVEGKTYMYVGTSMKDSDNYSDYTWRLTDEHIEGQINGKEGAWIYSPTAPTNPSQGLIWVDLSKVPNQPKRWVDSETGWVALTPEEVKDLPWGEDGTNLADWVAQAEQRISSDSIINTVLGSEDFTSVFDTKANTTDLDNLATYEDLDSIKEDYNRLIKEGINGIDFTPYVTNSELQQLKDSFNFSVQQAGGVNMLKNSLGFSGLDFWDGTVGKNLLPNSTWNLGFGRWGGASIASFEILPPEDDKPTSHILGSIGSRSSTKEIGNRPHPLKVNSGETYTISFDYKEEALAYDKDRPILVVRNYPDKDTDQWMEYSIEGWAVMANGSTTDLTVWRRFTKTFTIGTSGYLDILPKTIVESWTHRSFWRELKIEEGSQATTWVPNKEDGAFTGGIVETTQTEELANLGFGSGFVSSKRPSSSLTQSVELPEIGANLEYSLSFYMKVTTDNPVADFKCGIRVYEGDTLTYTLGIEDATQPIPLGFQQYKLVFTPTSTSTKIEMFVENGQEASVIISGIMYNIGNIPLKWQPYPSEIYNTNVKIDINGVTVKNNQTDGYTMITPQEFSGYSRIDGNIERIFTLNGQVTEVKMLKAEKRITMEPVSVFAMNTVTDTKRIRGWAFVPSFE
Physico‐chemical
properties
protein length:1825 AA
molecular weight: 202951,29630 Da
isoelectric point:4,72289
aromaticity:0,09041
hydropathy:-0,46197

Domains

Domains [InterPro]
DC_1874
ATT
77–506
DC_1874 DC_0015 Coil DC_0336
Coil
Unmapped
399–419
Coil DC_0015 G3DSA:2.60.120.260
YP_012086874.1
1 1825
Architecture
ATT
STR
RBD
STR
RBD
ATT 77-506 | STR 524-1532 | RBD 1533-1571 | STR 1572-1717 | RBD 1718-1798 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Enterococcus phage vB_OCPT_Bob
[NCBI] 		2922318 Uroviricota > Caudoviricetes > Herelleviridae > Kochikohdavirus > Kochikohdavirus bob
Host Enterococcus sp.
[NCBI] 		35783 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_012086874.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_106554.1 [NCBI]
CDS location
range 71815 -> 77292
strand +
CDS
ATGAATAAATTGGTAAAACGTAGATTTCAAGCAGGTCTAGGCTCAGAAATTAAAAGAGTATATAAAGAAGGACAACAAATTAACACGCTACTATTAGCACAAGTAATTCAAGTAAACTATAAATATAATACAGTAGACCTACTAGCTTTACAGCATAAAGAAGTATTTCAAAATTCCTATGCAAATGAGGGACGTTTTTCTGCAAGACTCCCTATGGAATTTGGCGGTAGAAATATCGTTGGACAGCCTTATGGACAGGTTAACCCGATAGCAGTAGGAACAGTAGTATTAGTTGGTTTTATTAATTCCGATAAAGATATGCCTATTGTAATTAGTGTTTATAATAATAACGATGTAAGTAAGCAACTTTCAAGAACACAATTTTCAAATTCAGACCCTAAAGATTTAGAGTTAATTGGGGATATGCACCAAAAATTTAGTTTATACCCTTCATTGACATATGATAGCGTTGATGGAGAAGGAGGGCGTGTCGTTACTTTTTCTGGTAAATCATTTATTGCTTTTGATACAAAAGAAGTAGCTAACTCCTCTACAACTGATGCAGGTTACGGTACTAAATATGAGGACTTAGAGACATCATACTATAATAATGGTGACCTAATAGAGCCTATGAAAGGTAGAGCACCAAATGTACTGTTTAAGCATCAAGGGGTACTTGACGATGATGGCAAACCAGATTTGCACGATTTGCTAATTCATATTAACCCAGATGGTACTTATAGAACTTCTATGATGAACAAAGAAGAGGATTGGCGCACACTATTTGAAATGACACCAGATGGCAGAGTTAAATTAAGAAAACAAGACTCTATTAATATTGATGGTGGCATAGAAATAAGTGAGCTAGGAATCAACAATGAGGGGTTCGTTTATTTACGTAATGGGGATATGGATTTAGAAGTACGAAAAGACGGTATCTATTCACAAGGGAAACTGTTTACAGCCGATGTAGACCTATCCGATGTATATGACAAACTAAATGGGTTGTCTATACAGATTAAGGAAACAAATGGTCAATTAGAGATTATAGCTAATGGTGTAGAAGAACAAAATGGAAAAATATCAGAACTTTCTACAGAAATAACAATTGTAGCAGGTAAAGTTGAATCAAAAGTAACAAAGACAGAAGTTCAGGATATGATTGACAGTTCTTTTGTAGATATGTCTGATGCAATTAAAAAAGCACAAGAAGATGCTGACAAAGCAAATAAAGTGATTGCAGATATGTCTAGTGATAACAGACTGACTCCAAGTGAAAAAATAGATTTATTAAAAGAATGGGATATTATAAAAAATGAATATCCAAGCTATCTCGAACAAGCAGAAACCTACGAGGTTGATAGTAAAGACTACACTGCTAAGTACAATTCATTAGAGCTATTTGTTACCCCTATATTGGCTGATATGGAATCAACTAGCTCGGTAGACGGAGCAACACTTCGCAAAACGTTTAATTCTTACTATACAGCAAGAATAGCTTTACTAAACTCTATTAGTAAAAAACTAAAAGACGGTATCACAGAGGCTATGAAAAAAGCATCCCAAGCATCACTAGATGCAACACAAGCAATGGCAGATGCTTCACAAGCTAAGATTGATGCAGATAATGCTAACAAACTTATATCTGATATAGCAAGTGATAATAAGCTGACACCTTCTGAAAAATACCAACTTAAAAAGGAATGGGATGTAATTGTTAAGGAATACCCTACAACAATTGCACAAGCAGAGAAGTACGCAGTAGCCACAGCAGAGTATACAGCTAAATATAAAGCCCTAGAGCTGTTTGTAGAGCCTTTGTTTAAAGACATGGATGAAACTAGTATAGTAGACGGAGAACGCCTTAGAGCGACATTCTCGGACTATTACGCAAGTAAGATTGCGTTACTAAAAGAAGTAACGGATTCAGCTAAAACAGAGCTAGATGCCTATGGTAATAAAATATCTGTAATGGAAACAAACATTACTCAAACGTCAGAAGCTATTACTTTACTAGCTACTAGAGTACAAACTGTAGAAGACGGTGTACAATCAAATAAGGCACAAATCGAAATACAAGCTGAACAAATTAGTCAAAAAGTAACTGCTAGTGAGGTTAAAGGAATTGTAGACGATTCTATTAACAATCTAACATTAGGTGGAACTAACTTATTTGTTATAAAGACACAGACAGCAGGTTTACTAAACGAGAATGATGGAACTGTAGGTACTGCAGTAGATAACTCAGTGGTGTCAGACTACATTAAAGTTAATCAAAAAACACCATATATTGCTACACTTTATGGTAACACTGGCACAAACATGATTATAACAGACTGGTACGATAAAAATAGAACATTTATTTCTGGGGAAGCTGTGGCAGACTCTGGGGATTTTAGTAAAAAGTATGTGTCACCTGATAATGCAGTCTATGCTAGGGTAAGTTATAAGAAAGCAAACTATGTGAATATCAAATTCGAGGCAGGTACAAAGGCTACTGATTACAGCCCTTCATGGGAAGACATAAAAGGTGACCAAACTGCTTTAGAGGAATACATTAAAAAAGTAGAAGAACAAGCCAAGAAAGCTCAACAAGATGCTGAAAATGCTAAAAATGATGCTGAAAATGCAAATAACGCAATAGCTGACATGTCGAATGACAATATGTTAGCACCGAATGAGAAAAAACAAATACTCTTACAATGGGAACAGATTAAAACAGAGTATCCAATAAACTTAGACCAAGCAACTAAATTTGGGGTGTCTTCTCAACAGTATACAACAGCATATAACGCACTAGACGAGTACTTAAAACCAATACTAGCTGACATGACAACAACTTCTGTAGTAGTTGGTTCTACTTTAAGAAATACGTTTAACAACTATTATGACAAAAGAACTACTTTGCTAAACAGAATATCTGACGTAGCAAAAAATGTAGCAGACAAGGCACAAGAAACTGCAGATACTATCAATGATAATTTACAAAATATTGGTGGGTACAACTATGTAGGGTTCTCTTCCGGAGACAATATGTTGCCTAGACTGATGATTAAAAACGTTGGTTACTACACATTAGGTTCGTCAACCACAGAGTTCATTGACAGCATGGTAGCTGTAAAAGGTGATGCAACGACCCAACCTTTCGATTATACTGTAGGTACTTCTGATAAAGAAATTGCTGGTGGCGGTTTAGCTGATTACCGTATGAAAGAAGTAAAAGAAGGTCAGTGGATAACAGCTTCTGCAAATGTGCAGGTAATAGGTGGTGGCTCCGCTAGGTTAGCTATCTACACTTTAGAAGGGGATAACTGGGTAGGTTCTAACAGTACACCTATACAAGTAAGTGATGGTTTGAAACGTGTTGTGGCTCAAAGAAAAGTAACAGGCTTAACAAAAGGTGTATTAATACGTATTGAGTCAGCCGACACTAATGTTAAAGAGTTTCGATTTGGTAATGTTCAACTAGAAGTGGGTATCATCCCAACTCCTTGGAAAAAGTCTGATATAGATATTCAAGAGGACATAAACAATGTTGTTCAGAATATCAAAACGTACACTGCTTGGGCTAACGATTTACAGGGTCTTGATTTTACAAGAGAAAAGGTTGAAGGAAAAACTTACATGTATGTAGGTACCTCTATGAAAGATAGTGATAACTATTCAGATTATACATGGAGGTTAACTGATGAGCATATAGAAGGTCAGATTAATGGTAAGGAAGGCGCATGGATTTATTCTCCAACAGCCCCTACTAACCCATCGCAAGGGCTTATATGGGTAGACTTGTCAAAAGTACCTAACCAACCTAAGCGTTGGGTAGATTCAGAAACTGGGTGGGTTGCATTAACACCAGAAGAGGTTAAAGATTTACCTTGGGGTGAAGATGGCACAAACTTAGCTGACTGGGTAGCACAGGCAGAGCAGAGAATATCTTCTGATAGCATTATAAATACTGTACTAGGTTCTGAGGATTTTACTAGTGTGTTCGATACAAAAGCTAACACTACTGACCTAGACAACTTAGCTACCTATGAAGATTTAGACTCAATAAAAGAGGACTATAACCGACTAATCAAAGAAGGCATAAACGGTATTGATTTTACCCCTTATGTAACTAACTCCGAACTACAACAGCTTAAAGACAGCTTTAACTTCTCTGTTCAACAAGCCGGAGGAGTTAACATGCTTAAAAACTCTTTAGGATTCTCTGGGTTAGACTTCTGGGATGGTACAGTAGGGAAGAACTTATTACCTAACTCTACTTGGAATTTAGGTTTCGGTAGATGGGGTGGCGCTTCAATCGCTAGTTTTGAAATATTACCACCAGAAGACGACAAGCCTACAAGTCATATACTGGGTTCAATAGGTTCTCGTTCTTCTACTAAAGAAATAGGTAATAGACCCCACCCATTAAAAGTTAACTCTGGTGAAACGTATACAATAAGCTTTGATTATAAAGAAGAGGCATTGGCTTATGATAAGGACAGACCTATCCTTGTTGTTAGAAACTACCCTGATAAGGACACAGACCAATGGATGGAGTACTCAATAGAAGGTTGGGCAGTAATGGCTAACGGAAGCACTACTGACCTAACTGTTTGGAGACGTTTTACAAAAACATTTACAATAGGTACTAGTGGCTACTTAGATATTTTACCTAAAACTATAGTAGAGTCATGGACACACAGGTCTTTTTGGAGAGAGCTAAAAATAGAGGAAGGGTCACAAGCTACTACTTGGGTGCCTAACAAGGAAGACGGGGCGTTTACCGGTGGTATTGTTGAAACTACCCAAACAGAAGAACTAGCTAACCTTGGGTTCGGTTCGGGATTTGTTAGTTCTAAAAGACCTAGCTCTTCACTAACACAATCTGTAGAACTACCTGAAATAGGTGCTAACCTTGAGTATTCACTATCTTTTTATATGAAGGTAACTACAGACAATCCTGTAGCCGACTTTAAATGTGGTATTCGGGTTTATGAGGGGGATACTCTAACTTATACATTAGGCATAGAAGATGCAACACAGCCAATACCACTAGGGTTCCAACAATACAAGCTTGTGTTCACTCCCACAAGTACCTCTACTAAAATAGAAATGTTTGTAGAAAATGGGCAAGAGGCATCTGTTATTATATCAGGTATCATGTATAATATCGGGAATATACCTCTTAAATGGCAACCATATCCAAGTGAGATATACAATACGAATGTTAAGATTGATATTAATGGGGTAACTGTTAAAAACAATCAAACAGATGGGTACACAATGATTACCCCCCAAGAGTTCTCAGGATATTCTCGTATTGATGGTAACATAGAACGTATTTTCACTTTAAATGGGCAGGTAACAGAAGTTAAAATGCTAAAGGCTGAAAAACGTATAACTATGGAACCGGTATCTGTGTTTGCTATGAATACAGTAACAGATACAAAAAGAATTAGAGGTTGGGCATTTGTACCATCATTTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
9e018c5257652379ddb00dfc25828316a22f5e2a01c9ede6286077e5a4e6da9f
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7277
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Phage cocktails constrain the growth of Enterococcus Wandro,S. — — GenBank