Protein

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Genbank accession
XLQ29186.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,62
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,86
Protein sequence
MVDIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQNYDDTRAYTKDFIVLYDNRFYQALSDIPAPAGPFSLAKWKATRTDAEWITVQGGDFQLSVGNSIAVDTSAGTDINFTLPKNPLNGDTVILSDIGGRVGYVKVQITAEAQSIVNFRGQQVRSVLMTHPKSKMVFIFSNRLWQTYVSDYERNAVTVTPAKPYQAQPNDFIIRRFTSAAPINITLPRNANNGDIINLVDLDKLNPLYHTIVKTYDDTTSIREAGVHVAEGRNTAEAFFVYDSANSLWRVWEGDQKSRLRIVRNDTDLRPNEEVLVFGTNNDTISTVNLTLPTDILSGDTVKISLNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSISLLQFPKRSEYPPDAQWVSVSELEFNGDTSYVPVLELAYIEDYSSETKYWVVQQNTVTVERVDASSNTTRARLGVIALASQAQANVDLENAPGKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTDFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEVATQDETNAGIDDTTIITPKKLDARQGSEVLSGIVKYTSTTGTTAATVRGNAGTNVYNKAVDNLTISPKALDQYKATPTQQGAVILAIESEVIAGESQTGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISSPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQDEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGDDTQGSTQDLNLYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSLQFIRRDIDQTVNGSLSLTKQTNLSAPLVSTSTASFGSEASVTRRLTLNDSSGSEIVFTKGTQSLSNKENFVVRAWGNSATDGARDTVFEAGDETGYHFYSQRASDNKVSFNINGTLYSTGIVSTNGLNVTGVSTFTGPISATGEIVSSSPIAFRAINGNYGVMLYNAGNSSYIALTNSGDQTGTFNNLRPITINNATGLVRLDNGVQITSGATITTGGLTVNNRIISNGVKTATVYTDKPTASTVGFWSIDINDSAVYSQFPGYWTRDNKGNRDQEIKYPGTLTQFGNSLDSLYQDWICYPTGANGGSIRYTRTWQKNKDAWTSFAMVFDSGNPPSPSDVGAIPSDNAVIGNLTIRDFLQLGNVRIVPDPVNKTVKFIWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1277 AA
molecular weight: 138612,22660 Da
isoelectric point:5,09291
aromaticity:0,07596
hydropathy:-0,34283

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–126
DC_1986 DC_1209
IPR048390
ATT
969–1089
IPR048390 IPR048391
XLQ29186.1
1 1277
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-126 | STR 343-968 | ATT 969-1089 | STR 1090-1135 | ATT 1136-1225 | STR 1226-1261 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage CAU_ECP01
[NCBI] 		3384776 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XLQ29186.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ572755 [NCBI]
CDS location
range 161439 -> 165272
strand -
CDS
ATGGTTGACATCAAACGTAAGTTCAGGGCCGAAGATGGTCTTGACGCAGGCGGTGATAAGATAGTTAACGTTGCGCTTGCTGACCGCACAGTTGGCACCGATGGCGTGAACGTTGACTTTTTGGTGCAAGAAAACACCGTACAGAATTATGACGATACGCGCGCGTATACAAAAGATTTTATTGTTCTTTATGATAATCGTTTTTATCAAGCTTTAAGCGATATTCCAGCTCCGGCAGGCCCTTTCTCTTTGGCTAAATGGAAGGCAACTCGTACAGATGCAGAATGGATTACAGTTCAAGGCGGAGATTTCCAATTATCAGTAGGTAACTCTATTGCGGTTGATACTTCAGCTGGCACTGATATTAATTTCACTTTGCCTAAAAATCCTTTAAATGGCGATACAGTTATTTTGTCTGATATTGGCGGTAGAGTAGGCTATGTAAAAGTTCAAATTACTGCAGAGGCTCAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGACAACAGGTTCGTTCAGTTTTAATGACGCACCCAAAATCTAAAATGGTCTTCATTTTTAGCAACCGCCTATGGCAAACGTATGTTTCTGATTACGAACGTAATGCAGTCACAGTAACTCCTGCTAAGCCATATCAGGCGCAACCTAACGATTTTATCATTCGACGTTTTACATCAGCCGCTCCTATTAATATTACATTGCCTCGCAATGCTAATAATGGCGATATTATTAATTTAGTTGATTTAGACAAATTAAACCCGTTATATCACACAATTGTCAAAACTTACGATGATACAACTTCTATACGAGAAGCCGGTGTTCATGTAGCAGAAGGACGTAATACTGCGGAAGCATTCTTTGTTTATGATTCTGCTAATAGCTTATGGCGTGTTTGGGAAGGTGACCAGAAATCTCGTTTACGTATAGTTCGTAATGATACTGATTTACGCCCTAATGAAGAAGTTCTTGTTTTTGGAACTAATAATGATACAATCTCGACGGTAAATCTTACTTTGCCTACAGATATTTTGTCTGGTGATACTGTTAAAATATCGTTGAATTATATGCGTAAAGGGCAAACTGTAAAAATTAAAGCTGCTGAAGGCGATACAATTGCTAGCAGTATTTCTTTATTACAGTTCCCAAAACGTTCAGAGTATCCACCTGATGCACAATGGGTTTCTGTTAGTGAGCTGGAATTTAATGGCGATACTTCGTATGTACCTGTACTTGAGTTAGCTTATATAGAAGATTATTCATCTGAAACAAAATATTGGGTAGTTCAACAAAACACTGTAACCGTCGAACGAGTCGATGCATCGAGCAATACAACTCGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTTCTCAAGCGCAAGCAAATGTCGATTTAGAAAATGCTCCTGGTAAAGAACTTGCTATTACTCCGGAAACATTAGCAAATCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCAACAACTGCACAAGTTAACCAGAATACCGATTTTGCATTCCAAGACGACTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTGAACGAACGTACAGCAACTGAAACCCGTAGAGGTGTTGCTGAAGTTGCAACTCAGGATGAAACTAATGCTGGCATAGATGATACCACTATTATTACTCCTAAGAAATTGGATGCCCGTCAAGGTTCTGAAGTTTTATCTGGTATTGTAAAATACACATCTACGACTGGTACTACAGCGGCTACTGTTCGTGGTAATGCTGGGACTAACGTTTATAACAAAGCCGTAGATAATTTAACTATTTCTCCAAAGGCTCTTGACCAGTATAAAGCTACCCCTACTCAACAGGGCGCAGTAATTCTTGCTATTGAAAGTGAAGTTATCGCTGGTGAATCACAAACCGGTTGGGCTAATGCTGTAGTGACCCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAACACTGGAACTGATTATACTAGAGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGACGATACTCGTATCTCGTCTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACTCAGGCAGAATCTAATGCCGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAACTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTGATTAAGGTTGCTACTCAGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCGCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGGATGAACCAACATGGGCTGCTACTACGGCAATTCGTGGATTCGTTAAAACTTCATCTGGTTCTATTACATTCGTTGGTGACGATACTCAAGGTAGTACCCAGGACCTGAATCTTTACGAGAAAAATAGTTATGCTATTTCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTATTTGCCATTGAAAGCTAAAGCCGTAGATAGTAATCTGTTAGATGGTCTAGATTCTCTTCAGTTCATCCGTAGAGACATCGACCAGACGGTTAATGGTTCTTTAAGTCTTACTAAACAGACCAACCTGAGTGCTCCTTTAGTATCTACAAGCACTGCTTCTTTTGGTTCCGAAGCATCTGTTACTCGTAGATTAACTCTTAATGACTCTAGCGGTTCCGAAATAGTTTTCACTAAAGGAACTCAATCTCTTAGTAATAAAGAGAATTTCGTTGTTAGAGCATGGGGTAATAGCGCTACAGATGGTGCCCGTGATACAGTATTTGAAGCGGGTGACGAAACTGGATACCATTTCTATTCTCAGCGCGCTTCTGATAATAAAGTATCATTTAATATTAATGGAACACTTTATTCAACAGGCATTGTTTCTACAAATGGATTAAACGTTACAGGTGTTTCTACCTTTACCGGGCCTATTAGTGCTACAGGCGAAATTGTTTCTAGTTCTCCTATTGCATTCAGAGCTATTAACGGTAACTATGGTGTTATGCTTTATAATGCTGGTAACAGTTCTTATATTGCATTAACTAACTCAGGTGACCAGACCGGGACGTTTAATAACTTACGCCCGATCACGATTAACAATGCCACAGGCCTAGTTCGTCTTGACAACGGTGTTCAAATCACAAGTGGTGCAACAATAACTACCGGTGGGTTAACTGTAAATAACAGGATTATTTCTAACGGCGTTAAAACTGCCACGGTTTATACCGATAAACCAACAGCTTCTACTGTAGGTTTTTGGTCTATTGACATTAACGATTCTGCTGTATATAGCCAATTCCCTGGATACTGGACGCGTGATAACAAAGGTAACCGTGACCAAGAAATTAAATATCCTGGTACTTTGACTCAATTTGGTAATAGCTTAGATTCGCTTTATCAGGATTGGATTTGTTATCCTACAGGTGCAAATGGTGGTAGTATTCGTTATACTCGTACCTGGCAGAAAAATAAAGATGCTTGGACTTCATTTGCAATGGTATTTGATAGTGGCAACCCACCTTCACCTAGCGATGTCGGTGCTATCCCGTCTGATAATGCTGTTATTGGAAACCTTACTATTCGAGACTTCTTACAATTAGGAAATGTGAGAATTGTTCCAGACCCGGTTAACAAAACAGTTAAATTTATATGGGTTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
e592b161a14634063b3177c7a19212f2077141bae413d90e2b9fb95de5c93423
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2762
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50