Protein

View in Explore
Genbank accession
AOO19013.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGATAWNTLRYERPVESNTNTPNSLVQRDADGSFSAGTITSTLIGNASTSTRLEQTRQIQLSNDVTATGNFDGSQNLNLSTALSLINTLPHYLEGGVSSTTRTFTEVTVDQKGRVVNARTPSQLNLTDYGLDGSATSDTTLAQPWNANLEAISDETGTGLYSKTAAGVVETRLITGAAGQIVITDGGGISGNPLVSLSIQANVVPGDYNTESLTSVSQAGSGGEPFGTETVNASKFSVDDKGRLTTVTNVPIATATEGSKYAAYAAGTTYVRYDIIEDSSRVYQAITGIAAGGGAPTHTDGSDAGGWRYLAAAAVEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAVGVDNTQLQNNRIGFADGNTVENFELDQELTATTGYRGFNYLNYLKVNDTSGNLLVGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDPDITLDGDVNQTLDKTGDGELTFQLTQNTATNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTVQISASEATGKVHVEDAKFQDNYIATTNATMNLDPGDDRAVTGLVRVWGNLQIDGTTTTINSTQLTVDDVTILLGGDTVPTTDDNLDRGIEFNYYDTEARLGFYGWDTNYSDLGGHAGGYRFLHAATNTNEVFTGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTSNTTGDLVVAGGVGITQDVNIGGLLDVDSTLRVTSTSRFDDNVVLQGASKTLQLNNGSGTTKIEFQSTTGNGSLAGILDVTGNFNINTDKFNVVATSGNTSIAGTLGVTNIATFSNDIDANANMTLAGDLHMESTNDITVAKNVGTGVWEIQSNDYGALRLDGGAYVAGDALIDGTLHVNGAIEVQDSATETESRLNWLRVRYRGRFGDTYQATPSYASHNTTTIRAHGGAGIERTLHVGGTGSGEGLFVGKRYSGDTVKFSVLGATGNTDIQGTFDVAGNSEFNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSVRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTFGASGIVTLTNNTEQTLTGSYGADGALRLTGGAAVQRNLAVGGAARVYGNTELTGTLDLNNSADISGALVTHDNVTITADNKTFAIQNASAANKFTVDTDNGNTDLRGTLDIGGDVTAESNLTVTGNLTINGTTTTVNSTVTTIDDPIITVGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDSSAKIGFFGYDRSANQFAFVVDATNSSEVLSGTDGNLRAGSLNLTGAGTALDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGAALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASAATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNALTADTLKTARNITVAGVVSGDAEFNGSGDITITTTYVDADITALAAMAGTGFVSRTAANTYAQRTLAVTASSGITLTNADGVSGNPTINVASTASNSANNLVLRDASGDFAAGTITAALVGNVTGQTSDISNHDTGDLSEGSNLYFTNERVDDRVNALIVAGTGVTKAYNDSAGTYTLTVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIELSGAGALSVTQADIDTDNVTEGSTNIFYTEARFNTSLATKDTDNVSEGSSNLYFTNTRADTRADLRVAAATGANLDLSSKSTTNLSEGTNQYYTEARVQDKLDNAFAQLSAMLNNLATATTLVLNLSGDPTPGDVTAFNNGTLSGGTLYNTGTAVATTSSGSGTGLTVDITASGGAITAVAINAAGSGYVVGETITISTGGGDATINVSAVTEMAIGDTVTGSTSGTTGVITAVGATSVTVDTVNGFFKKTETVSAGDVSTLTITSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:1907 AA
molecular weight: 196065,25890 Da
isoelectric point:4,18610
aromaticity:0,05873
hydropathy:-0,16597

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–202
SSF69349 DC_1607 DC_1607 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352 DC_1607
AOO19013.1
1 1907
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 4-43 | STR 44-202 | STR 347-1580 | RBD 1657-1907
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM12_W1_24_0910
[NCBI] 		2928618 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus
[NCBI] 		1129 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO19013.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349325 [NCBI]
CDS location
range 87972 -> 93695
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATACAGTTAAGACGCGGTGGTGCTCAGGAATGGGCAAACGCGAATCCAACTCTTGCACAGGGTGAACTTGGAATTGAACTTGATACTGGTCGGTTCAAAATCGGTGATGGTGCAACGGCATGGAACACGCTGAGATATGAGCGTCCTGTAGAGTCCAACACTAATACTCCAAACAGTCTTGTACAGAGAGACGCAGATGGAAGTTTTTCTGCAGGTACTATTACATCAACTCTTATTGGTAATGCTTCAACATCAACTAGACTTGAACAGACTAGACAGATTCAGTTATCTAATGATGTAACAGCGACTGGTAACTTTGATGGTTCCCAAAACTTAAATTTAAGTACTGCTTTATCACTGATCAATACTCTTCCCCATTACTTGGAAGGTGGTGTAAGTAGTACTACTAGAACTTTTACTGAGGTTACTGTTGACCAGAAGGGTAGAGTTGTAAATGCTAGAACTCCTTCTCAACTAAATCTTACTGATTATGGTCTTGATGGTTCTGCAACTAGTGACACAACTTTAGCACAACCTTGGAATGCAAACTTAGAAGCAATTTCAGACGAAACTGGTACTGGTTTATATTCAAAAACTGCAGCGGGTGTTGTTGAGACCAGACTTATTACTGGTGCTGCTGGTCAAATTGTTATCACTGACGGTGGTGGTATTAGTGGCAATCCTCTTGTCTCATTGTCGATTCAAGCAAACGTTGTTCCTGGAGACTATAATACAGAATCTCTCACTTCAGTATCTCAAGCTGGTAGTGGTGGAGAACCTTTTGGTACAGAGACTGTTAATGCTTCTAAGTTCTCTGTTGACGATAAAGGACGTTTAACAACCGTAACGAATGTACCTATTGCTACTGCTACCGAGGGTAGTAAGTATGCGGCATATGCAGCAGGTACAACATATGTTAGATATGATATCATTGAAGATAGTAGTAGAGTATATCAAGCAATTACAGGAATTGCTGCAGGTGGCGGCGCTCCAACTCATACTGATGGTTCAGATGCTGGTGGGTGGAGATATCTTGCTGCTGCAGCAGTAGAGCAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGATGCCAACGGACATGTAACTATTGCTGCTGTTGGTGTAGATAATACACAACTCCAAAACAATCGTATTGGTTTCGCTGACGGTAATACCGTAGAAAATTTTGAACTGGATCAAGAACTTACTGCAACCACTGGATACCGAGGATTCAATTATCTTAACTATCTTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTACTTCTCTGACCCTGATATTACTCTTGATGGCGATGTTAATCAGACACTGGATAAAACTGGGGATGGTGAGCTTACCTTCCAGTTAACTCAGAATACTGCTACGAATAGAAACTTTAATATTCTGACAACTAATGCTGGGTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACCGCTGAAGATACTGTACAGATTAGTGCATCGGAAGCAACTGGTAAGGTCCATGTAGAGGATGCAAAATTCCAAGATAATTACATCGCCACAACCAATGCGACGATGAACCTCGACCCTGGTGATGACCGTGCAGTCACTGGTTTAGTTCGTGTCTGGGGTAACCTTCAGATTGATGGCACAACAACTACAATTAATTCCACACAATTGACTGTAGATGATGTCACCATTCTACTTGGTGGTGATACTGTTCCTACAACTGATGATAATCTGGATCGTGGTATTGAATTCAACTATTATGACACTGAAGCACGCTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACCAATTATTCTGATTTAGGTGGTCATGCAGGCGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCCACAAATACCAACGAAGTCTTTACGGGTACTGATTCTGGTATTATTGCAGGTAATGTAAAACTGACAACTGGTACTAACTCAACCTCTAATACAACTGGTGACCTTGTAGTTGCTGGTGGTGTTGGTATTACTCAGGATGTAAATATCGGTGGTCTTCTAGATGTTGATAGTACATTGCGTGTTACTAGCACCTCTCGTTTCGACGATAATGTAGTTCTGCAGGGTGCTTCTAAGACACTGCAACTGAATAATGGTAGTGGTACAACTAAGATTGAATTCCAATCTACAACTGGTAACGGTTCTCTTGCTGGTATTCTGGATGTAACTGGAAACTTCAATATTAATACTGATAAGTTTAATGTTGTTGCTACTTCTGGCAATACCTCCATTGCTGGCACATTGGGTGTTACAAACATTGCAACATTCTCTAACGACATTGATGCTAACGCCAACATGACATTGGCTGGTGACCTCCACATGGAGAGCACTAATGACATTACGGTTGCTAAGAATGTTGGCACTGGTGTTTGGGAGATTCAATCTAACGACTATGGTGCTCTCCGTCTTGATGGGGGCGCATATGTTGCTGGTGATGCACTGATTGATGGCACCCTACACGTTAACGGTGCTATTGAAGTTCAAGATAGTGCAACAGAGACTGAATCTAGACTGAACTGGTTGAGAGTTAGGTATAGAGGTCGTTTCGGTGACACTTATCAGGCAACTCCTTCCTATGCATCTCACAATACTACAACTATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACTCTACATGTTGGTGGCACAGGATCTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACTCTGGTGATACAGTTAAGTTTAGCGTTTTAGGTGCAACTGGTAATACTGACATTCAAGGCACATTCGATGTTGCTGGTAACTCCGAGTTCAATGGCACAGTTGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTAAGAAATGGCACAACGGATAAATTCTTTGTTGATAATGTAACTGGCAACACCGATATCCAAGGCACTCTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAATACTCTGGATGTTAGCAACGCTGTTACATTCGACCAGACACTGTTAGTCCAAGGCAACTCTGAGTTTAACGGTACTGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCTGTAAGAAGTGGTAGCACGGATAAGATGACCGTTGCTTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACCATTAACGATTCACTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTCTTCTCTGTCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGCGTTGATGCTGATAACGGTAATACAAATATCATCGGCACACTGACCGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGACACCTTCGGTGCATCTGGTATTGTCACACTTACCAATAATACTGAGCAAACTCTGACAGGTAGTTATGGTGCTGATGGTGCTCTAAGACTTACTGGTGGTGCTGCTGTCCAAAGAAACCTCGCTGTTGGTGGTGCTGCAAGAGTCTACGGCAACACTGAACTGACTGGTACTCTCGACCTTAACAATAGTGCAGACATCTCTGGTGCTTTAGTAACACATGATAATGTTACGATTACTGCAGACAATAAGACATTTGCAATTCAGAATGCATCTGCTGCTAATAAATTTACGGTAGATACCGATAATGGAAACACTGATCTTCGTGGCACCTTAGACATCGGTGGTGATGTAACTGCTGAGTCCAATCTTACTGTTACTGGAAATCTTACTATCAATGGAACGACAACTACTGTCAACTCTACGGTCACAACTATCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGACGGTAAGGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACAGCTCTGCGAAAATTGGTTTCTTCGGATACGATAGATCCGCCAACCAATTCGCATTCGTAGTAGACGCAACTAATTCATCAGAAGTTCTTTCTGGTACTGACGGTAACCTTCGTGCTGGTAGTCTTAATCTTACTGGTGCTGGCACTGCACTCGATGTTGATGCAAATGCAAATATTGATGGCACTCTGACTGTAGATGGTCAAATCATCTCTCAGGTTTCTTCTGGTGCTGCTCTGGTCATTCCTAACACAACCAAGATTAACAACCTCAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTGCAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCCGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCTCTTACTGCAGATACACTTAAAACGGCAAGAAACATCACAGTTGCTGGTGTTGTTTCTGGAGATGCTGAGTTTAATGGTTCTGGTGATATTACAATCACTACAACATATGTTGATGCAGACATCACTGCACTTGCTGCAATGGCAGGAACTGGTTTTGTTTCCAGAACTGCTGCCAATACATATGCTCAACGCACACTCGCTGTCACAGCATCTTCTGGTATTACACTGACAAATGCTGATGGTGTTTCTGGCAATCCAACCATTAATGTCGCTTCTACAGCAAGTAACTCAGCAAACAACCTCGTCCTTCGTGATGCATCTGGTGACTTTGCTGCTGGGACTATTACTGCAGCATTAGTTGGTAATGTTACTGGTCAAACATCTGATATTAGTAATCACGATACTGGAGACCTTTCTGAGGGATCCAATCTATACTTTACTAATGAGCGTGTTGATGACAGAGTTAATGCTCTGATTGTTGCGGGTACAGGTGTCACTAAGGCATATAACGATTCTGCAGGCACCTATACGCTTACTGTAACGCAGGCAGACATCGATACCGACAATGTAACCGAAGGTTCCACAAACCTCTTTACAACCGCTGCTAGGACCCGTACACACTTCACATATGGTACAGGTATTGAACTTAGCGGTGCAGGTGCTCTAAGTGTCACTCAGGCAGACATTGATACTGATAATGTAACTGAAGGTTCTACTAATATCTTCTACACTGAGGCACGCTTTAATACAAGTCTTGCAACTAAAGATACTGATAATGTGAGTGAAGGTTCTTCCAATCTATACTTCACTAATACTCGTGCAGATACCCGTGCTGATTTGAGAGTTGCAGCAGCAACTGGTGCAAACCTAGATCTTTCTAGTAAGTCTACCACCAATCTTTCTGAGGGTACAAATCAGTACTACACTGAAGCAAGAGTTCAAGATAAACTCGATAATGCGTTTGCTCAACTTAGTGCAATGCTCAATAATCTTGCAACCGCCACTACTTTGGTATTAAATCTATCTGGTGATCCTACACCTGGTGACGTAACTGCTTTTAATAATGGCACATTATCTGGTGGTACATTGTATAACACTGGAACTGCAGTTGCTACCACCTCTAGCGGTAGTGGCACTGGATTAACAGTAGATATCACCGCATCTGGTGGTGCTATCACTGCAGTTGCTATCAACGCAGCAGGTTCTGGTTATGTAGTTGGTGAGACAATTACAATCTCTACTGGTGGTGGAGATGCCACAATAAATGTCTCTGCTGTTACTGAAATGGCAATTGGTGATACTGTCACAGGCAGTACATCAGGCACCACAGGTGTTATCACTGCTGTTGGTGCAACTTCAGTTACTGTTGACACTGTTAATGGATTCTTTAAGAAGACTGAGACAGTATCTGCTGGAGATGTTTCTACATTAACAATCACTTCATTCGCCTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
c2eee2aeb13598dec889201c1d9b8b9b109c97796cf07169713556472f92b012
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4914
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50