Protein

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Genbank accession
XYM58461.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,85
Protein sequence
MAILRNVAKSDTFERQRQTINQIAQDIYNLGGGGSDLSTGLLRLGDGTRTTPSLSFANDTSVGIYRPDTKQLAFVNDGKKLHQLQNEASFYYRNLILQKNILETDGLSITDEGQNYDPGQYQDIAAVGGTGQAGTLDLTVSAFSGTTTPGSGYVYPSTGAIGGGGSQQFSNVKLTGGNGSDIEVSITFDNGGFSETDITEYGSGYQINDVLSLPVQSTGNQGTATLDESTIVMSSNAGIFTGWTFTQTGGTAVFETPTDIDGNPIAIEVQSVDSLGGTDISLNTVATTAGTVTFTITPPWGTNGNGYQYTIDTLGIVTSVAVNQAGEGYSVGDTLSVFNLDLTAAIVYTFTTEGLVQPSFTTTVPSGTFVVGQQYVFQQEDALNPGTFNSITMLCEEVYDNGSEILVVTFSEVTENETIGQGDTISGLEIDEIENPNRYLVDFDDPEGGNAPTRYPDMTLFVNNKYSMDYSNANNHPVRFSIHPGGTHNKYEEAGVTVTEGSNQFTVADASGILIGMEVTTGEGGDINDTGSIGSVAFVTAVNGNTITMDVTAAVTGTLPLLIQGVEYTGQEVVKNDDNTVIAPNASTPTTLYYYCENHPNMGGLVNNAAEITIDPNNTKVFGSGFEITVTSIVSTDNVTLDVSSGGGTFLQVTSDNVTSDTATIETINTTDIIVDTENGKVSTEYVLAPSSLKIETTGLLSPLSLKTAKVSFVTPGQTEDTNIEIFTDTGDVITSGQFKTTGVFNSSDLLKIEDNKVEAQGTSDLLLNPAPNRVTIIGGTQALQIPAGNTAARPAAGLTNDGAIRYNTQTTQYEGYSSATNSWSSLGGIRDLDGNTYVTAEESVGANDDTFYFYNGNINTIRITPNKLRFEELKAIASLNTSAPVYTEWFSNTPVTLGQYLKYRNNIYEVTGAGVTATDGSAPTHTSGAQPNNTCELTFYSTAVGNLLFQEIDEVQVDPFGDTYLTISGDLRLRNNVVGTDINDLILRPNAGKKVKVDGTSTLVLPVGNENERGAAETGSIRFNTDSLQYEGYDGTNWGSLGGVKDVDQNTYIIPETSPGANENILYFYNNGVNTMQLSTSSLDLTNIDTFTSINNTSLTLEFKTFTLDTGATVIDNTAVDTTFLYNTKQFFKFGMSAGLTVDPLLILEDTGDIFYNTGFGTGSETKLKLLNDELTDFEIRDYKVQTSSLELIRGTTDVGSALLYNTTTQKGCKVMVILDNTVSNKSSFMEFNVVDDGTEVYYNEYAGVNTSEDAATVVFDIDVDNNARITFTLTSDHAVNDNIKITVVAQILK
Physico‐chemical
properties
protein length:1295 AA
molecular weight: 138265,08640 Da
isoelectric point:4,08652
aromaticity:0,08417
hydropathy:-0,21344

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Sf-FP1
[NCBI] 		3413217 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM58461.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340854 [NCBI]
CDS location
range 89430 -> 93317
strand +
CDS
ATGGCAATTCTTAGAAACGTAGCTAAATCCGATACCTTTGAACGTCAAAGGCAAACTATCAACCAGATTGCTCAAGATATTTACAATCTTGGTGGTGGTGGATCTGATTTGTCTACTGGTCTTCTAAGACTTGGAGATGGAACAAGAACAACACCTTCTCTATCGTTTGCAAATGATACTTCGGTTGGTATCTACAGACCTGATACTAAACAACTAGCATTTGTAAATGATGGTAAGAAACTCCATCAACTTCAGAATGAAGCATCATTCTATTATAGAAATCTAATTCTCCAGAAAAATATTCTGGAAACAGACGGTCTTAGTATTACAGACGAAGGTCAAAATTATGACCCTGGACAATATCAAGACATCGCTGCTGTAGGTGGTACAGGTCAGGCAGGTACACTAGATCTAACAGTTTCTGCTTTTTCTGGAACAACGACTCCTGGTAGTGGATATGTCTATCCATCTACTGGTGCAATTGGAGGCGGTGGATCTCAACAATTCTCAAATGTAAAATTAACTGGTGGTAATGGTTCTGACATTGAAGTAAGCATTACTTTTGATAATGGTGGATTTAGTGAGACAGACATTACTGAATATGGATCTGGATATCAAATTAACGATGTCCTATCACTACCTGTACAGTCTACTGGCAACCAAGGTACTGCTACTTTAGACGAAAGTACAATTGTAATGTCATCCAATGCTGGTATTTTTACTGGATGGACCTTTACCCAGACAGGTGGAACAGCAGTATTCGAGACTCCTACTGATATCGATGGCAATCCTATTGCCATTGAAGTCCAATCGGTTGATTCTTTGGGTGGTACAGATATTTCCTTAAACACGGTAGCAACTACTGCTGGTACAGTTACATTCACCATCACCCCACCATGGGGAACTAATGGTAATGGATATCAGTATACTATTGATACTCTCGGCATCGTTACATCTGTTGCAGTAAATCAAGCTGGTGAGGGTTATTCTGTTGGTGACACCCTAAGTGTCTTTAATCTCGATCTAACAGCAGCAATTGTCTATACATTTACTACCGAAGGTCTTGTTCAACCAAGTTTCACTACAACTGTACCTAGTGGTACATTTGTTGTTGGTCAGCAATATGTCTTCCAGCAAGAAGATGCATTGAATCCTGGTACATTTAACTCCATTACAATGCTTTGTGAAGAAGTATATGACAATGGTAGTGAAATTTTAGTTGTTACATTTAGTGAAGTAACCGAGAATGAAACTATTGGTCAGGGAGATACTATTAGCGGTCTAGAGATTGATGAAATTGAAAATCCAAACAGATATCTAGTAGATTTTGATGACCCTGAGGGTGGTAATGCACCAACTAGATATCCTGACATGACGTTGTTTGTTAACAACAAATATAGCATGGACTATTCCAATGCTAACAATCACCCAGTTAGATTCTCTATTCACCCTGGTGGTACACATAACAAATATGAAGAAGCTGGTGTAACTGTAACCGAAGGTAGCAATCAATTTACAGTTGCTGATGCATCTGGTATTTTAATTGGTATGGAAGTTACCACTGGAGAGGGTGGGGATATTAATGATACTGGTAGTATCGGTTCAGTTGCATTTGTTACTGCAGTTAATGGTAATACTATTACCATGGATGTAACTGCAGCAGTTACTGGTACTCTTCCTCTATTGATTCAAGGTGTAGAGTACACTGGTCAGGAAGTAGTTAAGAACGATGATAACACTGTCATTGCTCCTAATGCATCAACACCAACTACGCTCTATTATTATTGCGAGAATCATCCTAATATGGGTGGTCTGGTAAACAATGCTGCTGAAATTACTATTGATCCAAACAACACCAAAGTTTTTGGTAGTGGTTTTGAAATTACTGTAACTTCTATTGTTTCTACCGATAATGTAACTCTAGACGTAAGCAGCGGCGGTGGCACATTCCTGCAAGTTACTAGTGATAATGTTACATCAGATACAGCAACTATTGAAACTATCAATACGACTGATATTATTGTTGATACAGAAAATGGTAAAGTTAGTACCGAGTATGTCCTAGCACCATCTTCATTGAAGATTGAGACTACTGGTCTACTGAGTCCATTGTCTCTCAAAACCGCTAAGGTAAGTTTCGTTACTCCAGGTCAGACTGAAGATACTAATATCGAAATCTTTACTGATACAGGAGATGTTATTACATCAGGTCAGTTCAAGACAACTGGTGTATTCAACTCTAGTGATCTACTCAAGATTGAAGATAATAAAGTTGAAGCACAAGGCACCAGCGATCTTCTTTTAAATCCTGCGCCAAATAGAGTTACTATTATTGGTGGTACACAAGCACTACAAATTCCTGCTGGCAATACTGCTGCTAGACCAGCAGCTGGACTTACAAATGATGGTGCTATTAGATATAACACTCAGACTACTCAGTATGAGGGTTATAGTTCTGCAACCAACTCTTGGTCTTCTCTAGGTGGTATTAGAGACCTAGATGGTAATACATATGTCACCGCAGAAGAATCTGTTGGTGCTAATGATGATACCTTCTACTTTTATAATGGTAACATCAATACCATCAGAATTACACCAAACAAGTTGAGATTTGAGGAACTAAAAGCAATTGCTTCCCTCAATACATCTGCTCCAGTTTATACTGAATGGTTCTCTAATACACCAGTAACTCTTGGTCAGTATCTCAAGTATAGAAATAATATTTACGAAGTAACTGGTGCTGGTGTTACGGCTACTGATGGCAGTGCTCCTACTCATACGTCAGGTGCTCAACCAAACAATACATGCGAACTGACTTTCTATAGCACTGCTGTAGGAAATCTGTTGTTCCAAGAAATTGATGAAGTACAGGTTGACCCATTTGGTGATACGTATTTAACTATATCTGGTGATCTCAGACTTAGAAACAATGTTGTTGGTACAGATATCAATGACTTGATTCTGAGACCTAATGCTGGTAAGAAAGTCAAGGTCGATGGAACTAGTACGCTTGTACTCCCTGTAGGTAATGAAAATGAGAGAGGTGCTGCTGAAACAGGTTCTATTAGATTCAATACCGACTCACTGCAGTATGAAGGTTATGATGGTACTAACTGGGGTTCTCTAGGTGGCGTCAAGGACGTTGATCAAAACACCTACATCATTCCTGAGACTTCTCCAGGTGCTAACGAGAACATTCTTTACTTCTATAACAACGGCGTCAACACGATGCAGTTAAGCACATCGTCTCTTGACCTGACTAATATTGATACATTTACTTCTATCAATAATACTTCTCTCACACTAGAGTTTAAGACATTCACACTTGACACTGGTGCTACGGTTATTGACAATACTGCTGTAGATACCACCTTCTTGTATAACACCAAACAGTTCTTTAAGTTTGGCATGTCGGCAGGTCTAACTGTCGATCCTCTGCTTATTCTAGAAGACACAGGTGATATCTTCTACAACACAGGATTTGGAACTGGCAGTGAAACAAAACTAAAACTTCTGAATGATGAACTTACCGATTTTGAAATTAGAGATTATAAGGTACAGACATCATCTCTAGAACTTATTAGAGGAACTACTGACGTTGGTTCTGCACTTCTTTACAATACTACAACCCAAAAAGGTTGTAAAGTAATGGTAATTCTGGATAACACTGTTTCTAATAAGTCCTCCTTCATGGAGTTCAATGTAGTTGATGATGGTACGGAAGTCTACTATAACGAATATGCTGGTGTAAATACCAGCGAGGATGCTGCTACAGTAGTGTTCGACATTGATGTAGATAACAACGCTAGAATTACATTTACACTGACAAGTGATCATGCTGTTAATGACAATATTAAAATCACCGTCGTTGCTCAAATTCTAAAGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
0487a8ab51cd05e22bb0868dd92d2e72285765ce04f759ac43a7c8aca8b4c6b0
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8203
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50