Protein

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Genbank accession
AXH71556.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MANSFVRYTGNNSTTSYSIPFSYRATSDLTVTLSGVVTTAYTLNSAGTTLTFNTAPAQDVAIEIRRRTSQGTKLVDYASGSVLTENDLDTDSDQAFFMSQEAIDDAGDVIKVSNTNFQWDVQNKRLTNVANPVNDTDAVNKQFISTNLPNITTVAGISADVTTVAGISSNVTTVANDTTNIGTVATNMPSITTVATNINDVIKVADDLNEAISEVETVANDLNEATSEIEVVANNIVNVNTVGTINADVTTVANNETDIQTLADLEDGTVTTNGLSTLAGLNTEIQGVYNIRTNVTNVDTNSANVNLVAGQISPTNNVSAVSAVATEIGTLGALGTEITNLNNIRTDITGVNNIAPAVTAVNNNSANINTVAGLDTEITALGASGTVASINTVASNLASVNNFGEVYRISATAPTTSLDNGDMWFDTTAGKLKIWNGSSFDLAGSSINGTSARFKYTATASQTTFTGADDNGNTLAYDSGFTDVYLNGVKLVNGSDYTATDGSNVVLTTGASVNDILEIVGFGTFSVADFDASGLTGTINIARLADNSVTNAKLANQSITINGSAVNLGGSVTVGETKPTISSISPSTITNAQTSITITGSNFTSVPQVEFLNPSTGIWYVADTVTYNNSTSLTVNATLGVDGTYKIRIENPDGNAVISSTNILTVSDAPTWTTASGTLGTFAGDFSGTLATVVATSDSAVTFSEVGSNLATANVTLSSGGVLSTTDFGGSSTTATTYNFTIRATDAENQTADRNFSLTSSFGATGGGQFN
Physico‐chemical
properties
protein length:771 AA
molecular weight: 79384,47870 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,05966
hydropathy:-0,00778

Domains

Domains [InterPro]
IPR005604
ATT
3–115
IPR005604 DC_0265 DC_0265
DC_0265
STR
28–146
DC_0265 Coil IPR013783
IPR014756
STR
578–656
IPR014756
AXH71556.1
1 771
Architecture
ATT
STR
STR
ATT 3-115 | STR 116-232 | STR 315-771
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage HTVC201P
[NCBI] 		2283024 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Candidatus Pelagibacter sp. FZCC0015
[NCBI] 		2268451 Pseudomonadota > Alphaproteobacteria > Candidatus Pelagibacterales > Candidatus Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AXH71556.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH598802.1 [NCBI]
CDS location
range 31225 -> 33540
strand +
CDS
ATGGCAAATAGTTTTGTACGTTATACAGGTAATAACAGTACAACATCATATTCTATACCTTTTAGTTATAGAGCCACAAGTGACCTTACAGTTACATTATCAGGGGTAGTAACTACAGCTTACACTTTAAATAGTGCAGGAACTACACTAACTTTTAATACTGCACCTGCTCAAGATGTAGCCATAGAAATTAGAAGAAGAACCTCACAAGGTACTAAATTAGTAGATTATGCTTCTGGTTCTGTACTTACAGAAAATGATTTAGATACCGATAGTGACCAAGCGTTCTTTATGTCTCAAGAGGCTATTGATGATGCAGGAGACGTTATCAAAGTCTCTAATACAAACTTTCAATGGGACGTACAAAATAAAAGATTAACAAATGTTGCAAACCCAGTTAATGATACTGACGCAGTAAACAAACAGTTTATTTCTACAAATTTACCCAACATCACTACAGTTGCAGGTATTAGTGCTGATGTCACAACAGTAGCAGGAATATCTAGTAATGTAACAACAGTTGCAAATGATACTACGAATATTGGTACTGTGGCAACCAACATGCCATCAATTACTACAGTTGCCACAAACATCAATGATGTAATTAAAGTAGCTGATGATTTAAACGAAGCTATCTCTGAAGTAGAAACTGTTGCAAATGATTTAAACGAAGCAACTTCTGAAATAGAAGTAGTTGCTAATAATATAGTTAATGTAAATACTGTTGGAACTATTAATGCTGATGTTACTACAGTTGCTAACAACGAAACAGATATTCAAACTTTAGCTGACCTAGAAGATGGTACAGTTACTACAAATGGATTAAGTACACTTGCAGGTCTAAATACAGAAATTCAAGGTGTCTATAATATTAGAACCAATGTTACTAATGTTGATACTAATTCAGCTAATGTAAATTTAGTTGCAGGACAAATTTCACCTACTAATAATGTTTCAGCAGTAAGTGCTGTTGCAACAGAAATTGGAACATTAGGTGCATTAGGAACAGAAATTACAAACCTAAATAATATTAGAACAGATATTACTGGAGTAAATAATATTGCACCTGCTGTTACTGCTGTAAATAATAATTCAGCTAACATTAATACTGTTGCAGGATTAGATACAGAGATTACAGCTTTAGGTGCTTCAGGCACAGTAGCTTCTATTAATACAGTAGCTAGTAATTTAGCTTCAGTAAATAACTTCGGTGAAGTTTATAGAATATCAGCTACAGCACCTACCACATCTTTAGACAATGGAGATATGTGGTTTGATACTACGGCAGGAAAATTAAAAATATGGAATGGCTCGTCATTTGATTTAGCAGGTTCAAGTATTAATGGTACTTCGGCAAGATTTAAATACACAGCTACAGCAAGTCAGACAACATTTACTGGTGCTGATGATAATGGAAATACTTTAGCCTACGATAGTGGATTTACTGATGTATATTTGAATGGAGTAAAATTAGTTAATGGCTCGGATTACACAGCAACAGATGGAAGTAATGTAGTCTTAACAACAGGTGCTAGTGTAAATGATATTTTAGAAATTGTTGGTTTCGGAACATTTTCAGTAGCAGATTTTGATGCTTCTGGTTTAACTGGAACAATTAATATTGCAAGATTAGCAGATAATTCAGTTACTAATGCTAAGTTAGCTAATCAATCTATTACTATAAATGGTTCAGCAGTTAATTTAGGTGGAAGTGTTACAGTAGGAGAAACTAAACCTACAATCTCAAGCATTTCACCATCTACAATAACTAATGCTCAAACATCAATTACTATTACTGGAAGTAATTTTACATCAGTTCCACAAGTAGAATTTTTAAATCCATCTACAGGTATATGGTATGTTGCTGATACAGTAACTTACAATAACTCCACATCTTTAACAGTTAATGCTACTTTAGGAGTAGATGGTACATACAAAATAAGAATAGAAAACCCAGATGGTAACGCAGTTATTTCATCTACAAATATTTTAACAGTTTCAGACGCACCTACTTGGACAACTGCATCTGGTACTCTAGGTACTTTTGCAGGAGACTTTTCAGGAACTTTAGCAACAGTAGTTGCAACATCTGATAGTGCAGTAACATTTTCTGAAGTAGGAAGTAATTTAGCTACAGCAAATGTAACTTTATCATCAGGTGGAGTTTTAAGTACAACAGATTTCGGCGGTAGTAGCACTACAGCGACTACCTATAATTTTACAATCAGAGCAACAGATGCAGAAAATCAAACAGCAGATAGAAACTTTAGTTTGACATCTTCATTTGGTGCAACAGGAGGCGGACAGTTTAACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
8b86654999e05aa8f6e6f8e8a1b1e5d941279d4f173d40a55345298e856424ef
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7694
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50