Protein

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Genbank accession
QBQ74980.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVTPWNSLRYERPIESTSNTANTLVQRDADGNFAAGTITASVIGNASTASRLAAQRQISLGTDLTASGVFDGSQNLTLQAQLQLIPTLPHYDNTDTSTGTYTKVVVDAKGRIINASNPTTLADYNLNGNVEGSSAQPYDLDLAGIAGLTTTGYITRVSAGNIQTRTIVGSATRISIQEGKGLGGDTVIDMITTTVDAGNYNTESLTSVSANGPSGEPFGTETVNAVKFTVDEYGRLQSATNVPIATAREGSKYATYSAGATYSRYDIIEEGGNVYQAIQDISAGGGAPAHTDSSDTGGWRFLAAAATEQKGLASFAQEDFDVDNNGHVTIAAQGVDNTQLQNNRISFADGNSKEDFELDQELTGSTGYRGFNYLNYIKVNDTSGNLLVGANNTGDGGSGELDVNVRTLISDPNIDLDGAVDQIVSKIADGHLTISTVQSSATPRNFNILASNAGSGTSNIVITSEDTVQISASDAAGKVWVEDARFQDNYIATTNSTLHLDPGDDRAVAGTVRIWGDLQVDGVTTTVNSTVMTVDDPIITLGGDTAPTADDNKDRGVEFRYYDTAAKVGFYGYDDNYTDLGGHVGGYVFLYDAANSSEVFSGTDAGLLAGNLKLTTNTNSTANTNGDLVVAGGVGIGQDVNIGGLVDIDSTLRVHSTSRFDDSMVIQGASKTLQLNNGSGTTRIELQSTTGNADFYGIVNITNDLNINTNKFNVASATGNTLIAGTLGVTGATTLTGALDLNNTLNVSGLVYLENVDEPTVALNGSSGLYEIQSSDYGALRVDGGGYIEGDTLFNSDVYINGQIIQKEDATANFSRQNYLEVRYRQIIGTRSQLTPSYASDNTSNLRIYGGMGIATDLHIGDDLFIGKLNSSDTIEFQVLGENGNTTIGRSGAGTASVGTLTVHGDVTFNRDLFVNGNITLGNSVADNLVVTANTEFNAFVNIDSDFAVRTSGSVDKFTVASASGNTDIQGTLDVNGATQITNTLNVTNGVDFDQTLNVDGAVDFNSTLVVDGQTTIYDSLILQSNNEILSIRNGSAVEKFSVDFDNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGASGIVTFTNNTDQTLTGLYAADGAVRMTGGLGVQRNLAVGGNMRLYGDAEITGATTQTGNLGVVGRVSITNTSDASTFGDTAVALTTDGGFRASGNAWVGGDFYVWDNANSRNAFVVDVSTGNASLHNTLTVGGDLIVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPTSNDAKDRGVEFRYYDSTAKTGFFGLDRSSLEYVFLADTTNASEVITGTDGNLRAGGLHLTGAGTILDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGPALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASAATPTTVVNRDSNGDFAANQITVNNGIGVLAGIQGNATTADALRTARTITIDGVVDGSVSFDGSANVTISTVYNDADITALAAMAGTGFVSRTAANTYAQRTLQVTASSGITLTNADGVAGNPTINVASASTNASNNLVLRDGSGNFAANVITADLVGDVTGQVSSIANHSTTNLTEGTNLYFTNERVDDRVAALISAGTGISATYNDAGNILSLSAVPADFDTDDIAEGSTNLYYTAGRAEASFDGKMALATTTDLAEGTNLYFTNARADARADARIAAATTDDLTEGVANLYYTDARADARVAAATGVNLDLTNQTTTDLTEGTNLYFTNTRADARIAAASVTDLTDVDQALATTDDVVFNSVEANLRATGTAPTTATDPGTAGDIRYDANYIYICVAANTWQRAAHATW
Physico‐chemical
properties
protein length:1804 AA
molecular weight: 187489,73050 Da
isoelectric point:4,16297
aromaticity:0,06430
hydropathy:-0,15998

Domains

Domains [InterPro]
DC_1619
ATT
1–463
DC_1619 DC_1607 DC_0520
SSF69349
STR
4–242
SSF69349 DC_1607
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352
QBQ74980.1
1 1804
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 1-463 | STR 464-943 | STR 1076-1587 | RBD 1620-1804
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM4
[NCBI] 		2530169 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus
[NCBI] 		1129 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBQ74980.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK493321 [NCBI]
CDS location
range 85497 -> 90911
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAACTAAGAAGAGGTGGCGCTCAGGAATGGGCAAACGCAAACCCCACACTTGCTCAAGGCGAATTAGGAATCGAGCTAGATACGGGTCGCTTTAAGATCGGTGATGGTGTTACGCCATGGAACTCTCTTAGATATGAGAGACCTATTGAGTCAACATCCAACACTGCAAATACTCTTGTGCAGCGTGATGCTGATGGCAACTTTGCCGCTGGCACAATTACAGCATCTGTTATTGGTAATGCTTCTACTGCTTCTAGACTTGCTGCACAAAGACAAATTTCTCTGGGCACAGACTTAACTGCATCTGGTGTTTTTGACGGATCTCAAAACCTCACTCTGCAGGCACAGTTGCAGTTAATTCCAACACTACCTCACTACGACAACACCGACACTTCAACTGGCACATATACCAAAGTTGTAGTTGATGCTAAAGGTAGGATCATTAATGCTTCAAACCCAACAACTCTTGCTGACTACAATCTCAATGGTAATGTTGAGGGATCTTCTGCACAACCATATGACTTAGACCTTGCTGGTATTGCGGGACTAACAACTACTGGATATATTACCAGAGTCAGTGCTGGTAACATCCAAACAAGGACTATTGTAGGATCCGCAACCAGAATTTCTATTCAAGAAGGTAAGGGTCTTGGTGGTGATACAGTCATTGATATGATTACCACTACAGTCGATGCAGGTAACTATAACACCGAATCTCTAACGTCGGTATCTGCTAACGGTCCTTCTGGAGAACCATTCGGCACCGAGACTGTAAACGCAGTTAAATTTACCGTTGATGAATACGGTCGTTTACAAAGTGCCACAAACGTACCTATTGCTACTGCTCGTGAAGGCAGTAAGTATGCTACATATAGTGCTGGGGCAACTTATTCCCGATATGACATCATCGAAGAAGGTGGCAATGTCTATCAAGCCATTCAAGATATTTCTGCGGGTGGTGGTGCCCCAGCTCATACTGATAGCAGCGATACTGGAGGATGGCGGTTCCTCGCGGCTGCGGCAACAGAGCAGAAGGGATTGGCTTCCTTTGCACAGGAAGATTTCGACGTTGACAACAACGGGCATGTAACTATTGCCGCTCAAGGTGTAGATAATACACAATTACAAAATAATCGCATTTCCTTTGCTGATGGAAATTCAAAAGAAGATTTTGAGCTTGATCAGGAGCTTACTGGATCCACTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATATTAAAGTTAATGACACGAGCGGCAATCTACTTGTTGGCGCTAATAATACAGGTGACGGCGGAAGTGGGGAATTGGATGTCAACGTCCGTACCCTTATATCTGATCCTAATATTGATCTTGATGGAGCAGTTGATCAGATTGTTAGTAAGATCGCTGATGGGCACCTAACAATCAGTACAGTACAGTCTTCTGCAACTCCTCGTAATTTCAATATTCTTGCATCTAATGCTGGATCAGGCACTAGCAATATCGTAATTACTTCCGAAGATACTGTCCAAATCAGTGCTTCTGATGCTGCTGGTAAAGTCTGGGTTGAGGATGCAAGATTCCAAGACAATTATATTGCTACAACTAACTCTACTCTGCACCTTGATCCTGGTGATGATCGTGCTGTTGCAGGCACCGTCCGTATTTGGGGTGACCTTCAAGTTGACGGTGTAACAACTACTGTAAACTCGACCGTCATGACGGTTGATGATCCTATCATCACTCTGGGTGGTGACACTGCGCCTACAGCAGATGACAATAAGGATCGTGGTGTTGAATTCAGATACTATGATACTGCTGCCAAAGTTGGTTTCTATGGTTACGATGACAACTATACTGATCTAGGTGGTCATGTTGGTGGTTACGTTTTCCTTTACGATGCTGCTAATTCTTCCGAAGTATTCAGCGGCACCGACGCTGGTCTTCTTGCAGGTAACTTAAAACTTACAACGAATACCAATTCAACCGCAAATACAAACGGTGATCTAGTTGTTGCTGGCGGTGTTGGTATTGGTCAGGACGTTAACATTGGTGGTCTAGTTGATATTGATAGCACCCTGCGCGTCCACAGCACCTCTCGCTTTGATGACAGCATGGTCATTCAAGGTGCTTCTAAGACACTGCAACTGAATAATGGTAGTGGCACAACTCGTATTGAGTTGCAATCTACAACTGGTAATGCTGATTTCTATGGTATCGTCAATATTACCAATGACCTTAACATCAACACTAATAAATTTAATGTTGCTTCTGCAACTGGTAACACTCTCATTGCAGGCACACTTGGAGTAACTGGTGCTACAACTCTAACGGGTGCTCTGGATCTCAACAACACTCTGAATGTTTCTGGTCTTGTTTACCTTGAGAATGTTGATGAGCCAACTGTTGCTCTGAATGGCAGCTCTGGTCTTTATGAGATTCAGTCTTCAGACTATGGTGCTCTTCGTGTTGATGGCGGCGGTTATATTGAAGGCGACACACTCTTCAATAGCGACGTTTATATCAACGGTCAGATCATTCAGAAAGAAGATGCGACGGCAAACTTCTCTAGACAAAACTACCTGGAAGTCCGTTATCGTCAAATCATTGGTACTAGAAGTCAACTGACTCCTTCTTATGCTTCGGATAATACATCTAACTTAAGAATCTATGGTGGTATGGGTATTGCCACCGATCTTCACATCGGTGATGACCTCTTTATTGGTAAACTCAATAGTAGCGATACTATTGAATTCCAAGTCCTCGGTGAAAATGGTAATACCACAATCGGTCGCTCTGGCGCTGGCACTGCATCGGTAGGCACACTGACTGTCCATGGTGATGTTACTTTCAATAGAGATCTATTTGTTAACGGCAATATTACTCTTGGAAATTCTGTTGCTGACAATCTCGTAGTCACAGCAAACACCGAATTCAACGCTTTTGTTAATATTGATAGCGATTTTGCTGTTAGGACATCTGGATCTGTTGATAAATTTACTGTTGCTTCCGCATCTGGTAACACTGACATTCAAGGCACTCTAGACGTTAATGGCGCAACACAAATCACAAACACCCTCAACGTCACAAATGGGGTTGACTTTGATCAAACTCTCAATGTTGATGGTGCCGTTGATTTCAATAGCACTCTGGTTGTTGACGGTCAAACAACTATCTACGACTCTCTGATTCTTCAGAGTAACAATGAAATACTTTCTATTAGAAATGGATCTGCTGTCGAGAAGTTTAGTGTTGACTTCGATAATGGCAACACAAACATTATCGGCACATTAACCGTTGGTGATGCAACTCAGATCAATGATACTCTAGGTGCATCTGGTATCGTCACCTTTACAAACAACACGGATCAGACACTTACAGGACTCTATGCCGCCGATGGCGCTGTAAGGATGACTGGTGGTCTTGGTGTCCAGAGAAACCTTGCTGTAGGCGGTAATATGCGTCTCTACGGTGATGCTGAAATCACAGGTGCAACTACTCAGACTGGTAACCTTGGCGTTGTTGGTAGAGTTAGCATTACTAATACTTCTGATGCATCTACTTTTGGTGATACTGCTGTTGCTCTTACAACCGATGGCGGTTTCAGAGCAAGTGGAAATGCATGGGTTGGTGGTGACTTCTATGTTTGGGATAACGCAAACTCTAGAAATGCATTCGTTGTTGATGTAAGCACTGGTAACGCATCCTTACATAATACACTTACTGTTGGTGGAGACTTAATTGTAAATGGCACAACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTTTGGGTGGTGACACAGCACCAACGTCTAACGACGCTAAGGATCGTGGTGTTGAATTCCGTTATTACGACTCTACAGCGAAAACTGGTTTCTTCGGACTTGACAGATCGTCGTTAGAATACGTCTTCCTAGCAGATACAACCAATGCTAGTGAGGTTATTACTGGCACCGATGGTAATCTGCGTGCTGGTGGTTTACATCTAACTGGTGCTGGCACTATTCTGGATGTTGATGCTAACGCTAATATCGATGGCACTCTGACTGTAGATGGTCAAATCATCTCTCAGGTTTCTTCTGGTCCTGCTCTGGTCATTCCTAACACCACCAAGATCAACAATCTGAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTGCAGCAACACCTACAACCGTTGTTAATAGGGACTCCAATGGAGACTTCGCCGCTAATCAAATTACAGTTAATAATGGCATTGGCGTTCTTGCTGGTATTCAAGGCAATGCTACTACTGCTGATGCACTCAGAACCGCAAGGACAATCACAATCGACGGCGTTGTCGATGGTAGCGTCTCCTTCGATGGATCTGCAAATGTAACTATCAGCACCGTCTATAACGATGCAGACATCACTGCACTCGCTGCAATGGCAGGCACTGGTTTTGTTTCTAGGACTGCTGCTAATACCTATGCACAACGCACTCTGCAGGTTACAGCATCGTCTGGTATCACCCTAACCAATGCTGATGGTGTTGCAGGCAATCCAACGATTAACGTTGCGTCTGCAAGCACAAACGCATCTAACAACCTCGTCCTTCGTGATGGATCTGGTAACTTTGCTGCTAACGTCATCACTGCTGATTTGGTTGGCGATGTAACTGGTCAAGTTTCCAGTATTGCAAATCACAGCACAACCAATCTAACTGAGGGCACCAACCTCTACTTCACCAATGAGCGTGTTGATGATCGTGTCGCTGCTCTGATTTCTGCTGGCACAGGTATTTCTGCCACCTACAACGATGCAGGTAACATTCTGTCTCTGAGTGCAGTCCCTGCTGACTTTGACACTGATGACATTGCTGAGGGTAGCACAAATCTTTACTATACTGCTGGTCGTGCTGAAGCATCGTTTGATGGCAAAATGGCACTTGCAACCACAACAGATTTGGCAGAAGGGACTAACCTCTACTTCACTAATGCCCGTGCCGATGCTCGCGCTGATGCAAGAATTGCTGCTGCAACTACTGATGATCTGACGGAAGGTGTTGCCAACCTTTATTACACTGATGCTCGTGCTGACGCTAGAGTTGCAGCTGCTACTGGTGTAAACCTTGATCTCACCAATCAAACTACCACCGACCTGACTGAGGGCACCAACCTCTACTTTACGAATACTCGTGCTGATGCTCGTATTGCTGCTGCATCTGTAACTGATCTGACTGATGTTGATCAGGCACTTGCAACTACAGATGATGTTGTATTCAACAGTGTTGAAGCAAACCTGAGAGCAACTGGCACTGCTCCCACTACTGCAACCGATCCTGGCACTGCAGGTGATATTCGTTATGATGCAAATTACATTTATATCTGTGTTGCCGCTAACACCTGGCAACGTGCCGCCCACGCTACTTGGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
1d0c8b780161e24a9aa12b1e098808a475e74fc91f2e6abe79f96473a3f03c84
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5640
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Diversity in Cyanophage Genomes from Southern New England Coastal Waters Marston,M.F. 2013-04-03 — GenBank