Protein

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Genbank accession
XOT52719.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MALDSNISRIKFMRSKTAGAVPSPTLLDEGELAINLVDRTIFSKNGANTVELGFGKGGTVAGPINVTGGNAVTAAQFNGALNGNAATASRLLTGRKINDVVFDGTKDITIEDSTKLYKSDVLTSSGSSRVIRDAATIRAAAIAKGAVVIHLPKRANSVNTMMKLCIQGFDYVAGRATQSNWSVDISGYNYTGAAWHSYQAISTGGPAPFDTVRWGQADNHQVIILGEAGASPSSWSYYNISIEKIYLTNSTEAYDDPNDPIYMAIEADISNYVINATLPLEGVAMAKRLEIGRTFTFTGDARGSLSFDGTANVSTALTINSATTGQAGLVKLNNTLTSTSVTEALTANMGKILGDAVNTKVDKINPTSSGTLTHTGEASTSGLLNAAGGISTSSLAISTGTISKTDGTGYLSFLQGSAALGINIGDLLVSNSYSDRSKIPVNGAYLKGGLDSDNVIRGATGTAYSSLTAIGVGTSIPFKLKDTNIGTSYGFVPGFGMNVQTSGGYRQVVSIGAYRPGSNWTDSGVYIATGATNDGYSSEAFLLKSGRTISNTAGPINLIGNADTASNIDASSGSLVGDSSAGWRKLGRATVPQNGRAMMLQIFGGTGFNAGVPTQAMCTEIVLKGGNSGPSSINMVVHVPDSSNILANLGKGVANACFVPVTGDDYDIYINCVGYLRAGIVAIKGALTDWALNFDVAGVSTKPTGAVDAAIYTKAYTTSNVASATKLQNPRTINGVNFDGTANIKIQQESVAIPANANLTDYTNEGFYVCEANATAVTIKGTPFNPSGTSSSALAFSLLVEKSAGVKQTYTSYASGATRTWVRGIYQGSPSAWREVAFCNSPTFVDTATFNGPIVASSTLNVTGTAGFNSVSVNNLSASTTISAGTSLGIANTVATTKYGLSLYGGASAGKPSYGVLFTGTSNSDTGKHGDINGQWSVYFTCATSGSEKRGWVFQRSSGGTGVQNVASISTDGNMVIDGNFDTASDNTMIRVGNNNDLAMIKKAGSGAFIAVGTNTAFRVLKSPIATVDPTQSYVNLMTVTTSGDLDLAGNNILIGSGTNNNTYQTIQFGNYTKSSSGGGFSVLQTAPVGGSQGRVLQLANYTQAGTIDSALHVNNSGTYQTIGTATLKLATISDNVASATRLQTARTFQITGGITTDAVSFDGQQNVTLTASNVDGSKVTGKVPAAAQADNATNAVLSQRTTSVDVNGQPGARLAAMWSGTTWNKNFTRDAVYSSASSITIEIGDSGDQATDDRMNNIKVGSLLHLMFAVSTGGIWSGQLSTGTITAVSINRSTKSIILTVNIPHSISPGNKTSARILGITYNAIGCKYVGCVTLFAKGDIGDSEFSQLLQLDAPVNNAVMTTSVSGDVSRYHNLFPYGAFLSHRNGVSMSATMVNNTMANFICTDNDNDVPASVGMANIQIWDVV
Physico‐chemical
properties
protein length:1427 AA
molecular weight: 147590,78860 Da
isoelectric point:6,83923
aromaticity:0,07218
hydropathy:-0,02663

Domains

Domains [InterPro]
DC_0964
STR
18–631
DC_0964 cd19958 DC_0339
IPR054500
STR
334–364
IPR054500 DC_0113
XOT52719.1
1 1427
Architecture
STR
STR
STR 18-895 | STR 1044-1427
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XOT52719.1
1 1427
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 217 217 0,2345
Central domain 218 426 210 0,3782
C-terminal 427 1427 1000 0,6502
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-217
Central
218-426
C-terminal
427-1427

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter phage vB_AbaSI_3
[NCBI] 		3400156 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Acinetobacter baumannii
[NCBI] 		470 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Moraxellales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XOT52719.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ382034.1 [NCBI]
CDS location
range 154343 -> 158626
strand +
CDS
ATGGCATTAGACTCAAATATCAGTAGAATTAAATTTATGAGATCTAAGACAGCGGGTGCAGTGCCAAGCCCTACTCTCTTGGACGAAGGCGAATTGGCCATTAACTTGGTTGATCGTACAATATTTTCAAAAAATGGCGCAAACACGGTTGAACTCGGTTTTGGTAAAGGCGGAACAGTAGCTGGACCAATTAATGTTACAGGTGGTAATGCTGTAACTGCTGCGCAATTCAATGGTGCCTTAAATGGCAATGCTGCAACTGCATCAAGACTTCTTACAGGAAGAAAAATTAATGATGTAGTTTTTGATGGTACTAAAGATATTACCATTGAAGATTCTACTAAATTATACAAATCTGATGTGCTAACTTCATCTGGCAGTTCTCGTGTTATTCGTGATGCAGCAACAATTCGTGCAGCGGCTATTGCTAAAGGAGCAGTAGTAATTCATTTACCGAAAAGGGCAAATTCAGTTAACACAATGATGAAATTGTGCATTCAAGGATTTGATTATGTTGCTGGGCGAGCTACTCAAAGTAACTGGTCTGTAGATATTAGTGGATATAATTACACCGGTGCAGCTTGGCACTCATACCAGGCAATTTCAACAGGCGGTCCAGCGCCATTCGATACTGTTCGTTGGGGGCAAGCCGACAATCACCAGGTTATTATTTTAGGCGAAGCCGGTGCATCACCTTCTTCATGGTCATATTACAATATTAGCATTGAGAAAATTTATTTAACTAATAGTACAGAAGCATATGATGACCCTAATGATCCAATTTATATGGCAATTGAAGCCGATATATCTAATTATGTGATAAATGCCACTTTGCCACTTGAAGGCGTTGCAATGGCTAAACGTTTAGAAATAGGCCGTACATTTACTTTCACTGGTGACGCTAGAGGTTCATTGTCATTTGACGGTACTGCAAACGTTTCTACTGCATTAACAATTAATTCTGCAACTACAGGCCAAGCCGGTTTAGTTAAATTAAACAATACATTAACTTCTACATCTGTCACAGAAGCGTTAACTGCTAATATGGGTAAAATATTAGGTGATGCAGTTAATACAAAAGTTGATAAGATCAATCCAACTTCTTCTGGCACATTAACACATACCGGCGAAGCTAGTACATCTGGTCTATTAAATGCGGCAGGTGGTATTAGTACATCTAGCTTAGCAATTTCTACTGGTACTATTTCAAAAACTGATGGTACTGGTTACTTATCATTTTTACAAGGTAGTGCAGCTTTAGGTATCAATATTGGTGATTTACTTGTTTCTAATTCATATTCTGATAGATCAAAAATCCCAGTAAATGGTGCATATCTTAAAGGTGGGTTGGACTCAGATAACGTTATCCGTGGCGCAACTGGTACTGCTTATAGTTCATTAACTGCAATTGGTGTAGGTACATCAATTCCATTTAAATTAAAAGACACCAATATTGGTACATCTTACGGATTTGTTCCTGGCTTTGGCATGAACGTCCAAACATCTGGAGGTTATCGTCAAGTAGTTTCAATTGGTGCATATCGCCCTGGTAGTAACTGGACAGATTCTGGAGTTTATATTGCTACGGGTGCAACCAATGATGGTTATTCATCTGAAGCATTTTTGTTAAAATCTGGTCGTACTATTTCTAATACAGCTGGGCCAATTAACTTAATTGGTAATGCTGATACTGCATCTAATATTGATGCATCATCTGGTTCACTAGTTGGTGATTCGTCTGCGGGTTGGCGTAAACTTGGTCGAGCAACTGTCCCGCAAAACGGACGTGCAATGATGCTTCAAATTTTTGGCGGTACTGGTTTTAATGCTGGTGTGCCAACGCAAGCAATGTGTACTGAAATTGTATTAAAAGGCGGTAACAGTGGACCATCCAGCATTAATATGGTTGTACATGTACCAGACTCAAGCAATATATTGGCCAACTTGGGTAAAGGCGTTGCAAATGCTTGTTTTGTTCCAGTAACTGGTGATGATTATGATATCTATATCAATTGTGTTGGGTATTTACGAGCAGGTATTGTCGCAATAAAAGGCGCATTAACTGATTGGGCCCTTAACTTTGATGTAGCTGGTGTTTCAACTAAACCTACTGGCGCAGTTGACGCAGCAATTTATACCAAAGCATATACAACATCTAATGTAGCATCAGCAACCAAATTACAGAATCCAAGAACAATTAACGGTGTTAATTTTGACGGTACAGCTAATATCAAAATTCAACAAGAATCTGTCGCAATTCCAGCTAATGCGAACTTGACTGATTATACTAATGAAGGTTTTTATGTATGCGAGGCTAATGCAACAGCAGTTACAATAAAAGGTACACCGTTCAATCCATCTGGAACTTCATCTTCTGCATTGGCATTCAGTTTACTTGTTGAAAAATCTGCTGGTGTTAAACAAACTTACACGTCATATGCATCAGGCGCTACACGTACATGGGTTCGAGGAATTTATCAAGGATCACCATCTGCATGGCGTGAAGTAGCTTTTTGTAATTCTCCAACATTTGTAGATACTGCTACGTTTAATGGTCCGATTGTTGCATCAAGCACGTTAAACGTAACTGGTACCGCAGGATTCAATAGCGTATCTGTGAATAATTTGTCAGCATCTACAACAATTAGTGCTGGAACTAGTCTTGGAATTGCTAACACAGTTGCAACTACCAAATATGGTCTAAGTCTTTATGGCGGGGCATCTGCAGGTAAACCAAGTTATGGGGTATTGTTTACTGGCACCTCAAATAGCGACACTGGTAAGCACGGTGATATTAACGGCCAATGGAGTGTTTACTTTACTTGTGCAACATCGGGTTCAGAAAAACGAGGTTGGGTATTCCAGCGTTCATCTGGTGGAACTGGTGTTCAAAACGTAGCATCTATTTCAACTGACGGTAACATGGTTATCGATGGTAATTTTGATACTGCTTCTGATAACACAATGATTCGTGTTGGTAACAATAACGATCTTGCTATGATTAAAAAAGCGGGCTCGGGTGCATTTATTGCAGTTGGGACTAATACTGCATTCAGAGTGTTAAAATCTCCAATTGCAACTGTTGACCCGACACAATCTTATGTTAATTTGATGACAGTAACAACATCAGGAGATTTAGATTTAGCTGGCAATAATATTCTTATTGGTTCAGGTACTAATAACAATACATATCAAACTATTCAGTTTGGTAATTATACTAAATCATCATCTGGCGGCGGATTCTCCGTTTTACAAACAGCTCCTGTGGGCGGTTCACAAGGTCGAGTTTTGCAATTAGCGAACTATACCCAAGCTGGTACTATTGATAGTGCATTACACGTAAATAATTCTGGAACTTATCAAACAATAGGAACAGCGACATTAAAATTAGCTACTATTAGTGATAATGTTGCTTCTGCAACTCGTTTGCAAACTGCAAGAACTTTCCAAATTACTGGTGGCATCACAACAGATGCAGTATCATTTGACGGACAACAAAACGTTACATTGACCGCATCTAATGTCGATGGTTCTAAAGTTACAGGCAAAGTTCCTGCAGCTGCACAAGCGGATAATGCAACAAATGCCGTGTTATCACAACGTACTACAAGTGTAGATGTTAATGGGCAACCAGGTGCAAGACTTGCTGCTATGTGGTCTGGTACTACTTGGAATAAAAATTTCACCCGTGATGCGGTCTATTCATCAGCATCTTCAATAACTATTGAGATAGGTGATAGCGGTGATCAAGCAACTGATGATAGAATGAATAACATTAAAGTTGGAAGTTTATTGCATCTTATGTTTGCGGTTTCTACGGGAGGTATTTGGTCTGGGCAGTTATCTACAGGAACAATTACCGCTGTATCGATAAATAGAAGCACCAAATCTATTATTTTAACAGTTAATATTCCACATAGTATAAGCCCAGGAAATAAAACATCTGCTCGTATTCTTGGTATAACTTATAACGCTATTGGATGTAAATATGTTGGATGTGTTACATTATTTGCTAAAGGCGATATAGGCGATTCGGAATTCTCTCAACTGTTGCAATTAGATGCTCCGGTAAATAATGCAGTTATGACAACTAGTGTCTCCGGAGATGTTTCGAGATATCATAATTTATTTCCATATGGGGCCTTTCTTTCACATCGAAATGGGGTATCTATGTCAGCGACAATGGTTAATAATACTATGGCTAATTTTATCTGTACAGATAATGATAATGACGTACCTGCATCAGTAGGTATGGCAAATATACAAATCTGGGATGTCGTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f79479c59eb86a65073a5d774315826851e19a7454d0d4815338ac141c3bdd27
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4456
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50