Protein

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Genbank accession
XUQ15609.1 [GenBank]
Protein name
autotransporter adhesin
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MPHLKAYDKYGNILAIGYNVELHEEVGSVIIPNLAPHTHYLQGEFYVSWEAEKYETDKVVVPGFTTLESSFKEITLYFKDHILVNAKSAYDVAVDNGFVGSEEEWVKSIKGEKGEEGEQGKQGLSAYEVAVNNGFTGSATDWLKTGKSPYVYSNEYIKQKDDTSDVQRLRRAIKDTSEGNTLHIPSSESPIKIDDTLIIDKNINIVSDAKIVYNGSKDKPAIKLDSLSYSNVTIKGIYDDSSYPTYGGGYHGFKSQNYIGLELVNCRNVNTNINEIIGFTVGNKHKATGGKGHWFNNTIINFFINNETHIELNTDGIGSNGEQSWMNSNYFYKSAFSYSGTEFNKHPNTYYNIKQTLTNGNTYGGNSNIFDSLKFETASTTSENYVMVYLKKAVGFIFKNYRFEFNNKATFAVVDLETQDMTKSYVTHSKDIKFIPEFVLGNGHKLTFTNNNTAKIPRSSIAKIVDEYKTTLLYKNNDFSKDYRRLGGNYHTVKNVFRKPLQSTSLTDEVSYDYSTTPSLVDNKGLLTFTGSYPMALYVNNVSVGDELIINKLSFIGNSSGIFIKCFDKDGNILDKISNNYDTILLDGYYNDKYKAFTFNNTQKDTFTVNSEDVKSIVILISGTMQGLLVASTNPSNIIKSSKDSSKNKTDVFYSHVKPSSVEDFKYDEKVYNNGTTQAYGWVLKGNDWKELGKDTNSKSKVIVNIEDYPRINDEDNDYPRFQRALDYLTSTKGGTLIVPKGNEDYLFKTKTPTVQNPSRVKVTGSNIYIKGEGNPTFIMSGITKNYLDSIDDVSSSGRDMFTGFSFINCDNILVEGLTFKGEWDGKGEFRYASPRSIGIAFKGSRNCKAYNVHGYNIMGNVVNAVNTMQAVDGVYGYSDNITIDSCSATQCLENGFNFMGGTKNGYYVNNISTGNGSSGFESGTENVIISNNIHTNNKYSGLSISGTNYTITSNVIYGNSNKGELSNKPSNGIAITGGSKGIISNNNLSGNEGYELYLYPGVNNIDIQNNVLKQDTTSLKTSIIYVSGTTSKPVSEINFKNNTLRSTNTSLDKAIFLNFVMDSTITNNDIKTDKGNDSLSVQGSCSNLFVLNNNMNKNLSISSNAFNVISKDNIAYNLPKVLNGTAIPTTGSWRLGDIVVNTSRTLTSGSPEKWRCTSDGVATNMKWTSNTDYTQGQIVYNGNYVYKAVASGTSGGTQPTHNNGVISDGSILWEFISTKANFEVVSQIGVTESINSTPLYKGQIAVVGSSVYIAKGTSSNTDWIILN
Physico‐chemical
properties
protein length:1268 AA
molecular weight: 140107,05280 Da
isoelectric point:6,20582
aromaticity:0,10962
hydropathy:-0,45915

Domains

Domains [InterPro]
DC_0876
STR
6–1067
DC_0876 DC_0276
IPR006626
Unmapped
545–566
IPR006626 IPR011050 G3DSA:2.10.10.20
IPR012334
STR
704–1052
IPR012334 IPR006626
IPR006626
Unmapped
810–844
IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626
IPR039448
ENZ
925–1048
IPR039448
XUQ15609.1
1 1268
Architecture
STR
RBD
ATT
RBD
STR 6-1097 | RBD 1098-1165 | ATT 1166-1224 | RBD 1225-1268
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XUQ15609.1
1 1268
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 166 166 0,9852
Central domain 167 486 321 0,9731
C-terminal 487 1268 781 0,2715
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-166
Central
167-486
C-terminal
487-1268

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage St1.CM
[NCBI] 		3423646 Viruses >
Host Staphylococcus aureus
[NCBI] 		1280 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XUQ15609.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV641623 [NCBI]
CDS location
range 111862 -> 115668
strand -
CDS
ATGCCTCATTTAAAAGCATATGATAAATACGGTAATATATTGGCAATAGGTTACAATGTAGAGTTACATGAAGAAGTAGGGTCTGTAATCATACCTAACTTAGCTCCTCACACACATTACCTTCAAGGTGAGTTCTATGTATCATGGGAAGCTGAAAAATATGAAACCGATAAAGTAGTAGTTCCTGGTTTTACAACCCTAGAATCATCGTTCAAAGAAATAACATTATATTTTAAAGACCATATACTTGTAAATGCTAAATCTGCTTATGATGTAGCGGTAGATAATGGTTTTGTCGGTTCTGAAGAAGAATGGGTTAAGTCTATTAAAGGAGAAAAAGGGGAGGAAGGGGAACAAGGTAAGCAAGGTTTAAGTGCTTATGAAGTAGCTGTAAATAACGGTTTTACAGGTTCAGCTACAGATTGGCTTAAAACAGGTAAAAGTCCTTATGTATACTCTAACGAGTATATAAAGCAAAAAGATGATACTTCGGATGTTCAAAGGTTAAGACGTGCTATTAAAGATACAAGTGAAGGTAATACCCTACACATTCCTTCTAGTGAATCACCTATTAAAATAGATGATACTTTGATAATAGATAAGAATATTAATATTGTATCTGATGCTAAGATTGTTTATAATGGTAGTAAGGATAAACCAGCTATTAAACTAGATAGTTTATCATATTCTAATGTTACAATTAAAGGTATTTATGATGATAGTTCTTATCCAACTTATGGTGGAGGCTATCATGGTTTTAAGAGTCAAAACTATATAGGACTAGAATTAGTTAACTGTAGAAATGTTAATACTAATATTAATGAAATTATTGGTTTTACAGTCGGTAATAAACATAAAGCTACTGGTGGTAAAGGTCATTGGTTTAATAATACTATTATTAATTTCTTTATTAATAATGAAACACATATAGAATTAAATACAGATGGTATAGGTTCTAATGGTGAGCAATCTTGGATGAATAGTAATTACTTCTATAAATCAGCTTTTTCATATAGTGGCACCGAGTTTAATAAACACCCTAACACATACTATAACATCAAACAAACTCTAACAAATGGTAATACCTATGGAGGAAATAGCAATATATTCGATTCACTTAAATTTGAAACTGCTTCCACAACATCTGAAAATTATGTTATGGTTTATCTTAAGAAAGCAGTAGGATTTATATTTAAGAATTACAGATTTGAATTTAATAACAAAGCTACTTTTGCGGTTGTTGATTTAGAAACTCAAGATATGACAAAATCTTATGTAACACATAGTAAAGATATTAAGTTTATTCCTGAATTTGTTTTAGGTAATGGACATAAATTAACTTTTACAAATAATAATACTGCTAAAATACCTAGAAGTAGTATTGCTAAAATAGTAGACGAATACAAAACAACATTATTGTATAAAAATAATGATTTTAGCAAAGACTATAGAAGATTAGGAGGTAACTATCACACAGTCAAAAATGTATTTAGAAAACCATTACAGTCAACTTCTCTAACAGATGAAGTATCTTATGACTACAGTACTACACCTAGTTTAGTAGATAATAAAGGATTACTTACCTTTACAGGCTCGTACCCTATGGCTTTATATGTTAATAATGTTAGTGTTGGTGACGAGTTAATTATTAACAAGTTATCATTTATAGGTAATTCTAGTGGTATATTTATTAAATGTTTTGATAAAGACGGTAATATATTAGACAAAATATCTAATAATTATGATACAATATTACTGGATGGTTATTATAACGATAAATATAAAGCGTTCACTTTCAATAACACCCAAAAAGATACTTTTACTGTTAATAGTGAAGATGTTAAGTCTATCGTTATTTTAATATCTGGAACTATGCAAGGTTTACTTGTAGCTTCAACTAATCCATCTAATATTATTAAGTCTTCAAAAGATAGTAGCAAGAATAAAACTGATGTTTTTTATTCTCATGTTAAACCTTCTAGTGTTGAAGATTTTAAATATGATGAAAAGGTATATAACAATGGTACAACACAAGCATATGGTTGGGTACTAAAAGGTAATGATTGGAAAGAACTAGGTAAAGATACTAATTCTAAGAGTAAAGTAATAGTTAATATAGAAGATTACCCAAGAATTAATGATGAAGATAATGACTACCCTAGATTCCAAAGAGCTTTAGATTATTTAACAAGTACTAAAGGTGGTACTCTTATAGTACCTAAAGGAAATGAAGATTATTTATTCAAAACTAAGACACCTACTGTACAAAACCCATCACGTGTAAAAGTAACAGGAAGTAATATATACATTAAAGGTGAAGGTAATCCTACATTTATTATGTCAGGAATCACTAAAAACTATCTAGACTCTATAGATGATGTTTCTTCTAGTGGTAGAGATATGTTTACAGGATTCTCATTTATCAACTGTGATAACATTCTTGTAGAAGGATTAACATTTAAAGGGGAATGGGATGGTAAAGGTGAATTTAGATATGCGTCACCTCGTTCTATTGGAATAGCATTTAAAGGAAGTAGAAACTGTAAAGCATATAATGTACATGGTTATAATATTATGGGTAACGTTGTAAATGCAGTAAACACTATGCAAGCGGTAGATGGTGTTTATGGTTACTCAGATAACATTACTATAGACAGTTGCTCAGCTACACAATGTTTAGAGAATGGTTTTAACTTTATGGGTGGTACTAAAAATGGATATTATGTTAATAATATATCTACAGGAAATGGTTCAAGTGGATTCGAATCAGGAACAGAAAATGTTATTATAAGTAATAACATACACACAAATAATAAGTACTCAGGACTGAGCATATCAGGTACTAATTATACAATTACTAGTAACGTAATTTATGGTAATAGTAATAAAGGAGAGTTAAGTAATAAACCATCTAATGGTATTGCTATTACAGGAGGCAGTAAAGGTATTATAAGTAATAATAACTTATCAGGTAATGAGGGTTACGAGTTGTACCTTTATCCAGGAGTTAATAACATAGATATACAAAATAATGTATTAAAACAAGATACAACAAGTTTAAAAACAAGTATTATTTATGTTTCAGGAACAACTAGTAAACCTGTGTCAGAAATTAACTTTAAAAATAATACATTAAGAAGTACAAATACTTCTTTGGATAAAGCTATATTCTTAAATTTTGTTATGGATAGTACAATTACTAATAATGATATAAAAACAGATAAAGGTAATGATTCATTAAGTGTTCAAGGTTCTTGTAGTAATTTATTCGTATTAAATAACAATATGAATAAAAACTTAAGTATTTCTAGTAATGCATTTAATGTTATAAGTAAGGATAACATAGCTTATAATTTACCTAAAGTACTGAACGGTACTGCAATACCAACGACAGGAAGTTGGAGACTGGGAGATATTGTTGTTAATACTAGTAGAACCCTAACATCAGGTAGTCCTGAGAAATGGAGATGTACTAGTGATGGAGTTGCTACTAATATGAAGTGGACATCTAACACGGATTATACACAAGGTCAAATTGTTTATAATGGGAATTATGTATATAAAGCAGTAGCTTCAGGTACAAGTGGTGGAACACAACCTACTCATAATAACGGTGTTATATCAGATGGTTCTATACTTTGGGAATTTATATCTACAAAAGCTAATTTTGAAGTTGTAAGTCAAATAGGAGTAACAGAAAGTATTAACAGCACACCTTTATATAAAGGTCAAATTGCTGTAGTAGGCTCATCTGTATATATAGCTAAAGGTACATCAAGCAATACTGATTGGATAATTTTAAATTAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
d5a9cf04cfdba78271d79b994232f731bd81399ef7353b7315200f7cb5741ae9
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6989
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Lytic bacteriophages against diabetic foot ulcer origin Staphylococcus aureus effectively control the infection murine model Akram,S. and Abbas,Z. 2026-01-08 — GenBank