Protein

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Genbank accession
ABD63794.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein host specificity
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,61
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MGGKYTLIINVLNKDLVPVTFIDNDIPGLPSYYKDTLIDYLSLGTASFEFTILKSKNNIIQDYSRFFNDETCFSFEKNGKQYAVFPAGSDGFYETDTEITYKCLSLDRELSLEYVDKFDNSSTHTLQWYIDYFELISNNQIEIGRNDVADYTRVIKYDSQDTKLNRLLSLINNFDAEFEFITKLTNNGAVDKIILNIVKKRDDSGKGGIGAIRDDVELVYGKNVKGIERTYNFEFFNASKVIGKDGTNWNSSEFSYINSDGVEEFYKRKNDDTAFAPLSAQKYPAHLRKDSSDIWLRKNFETEYTTPAQMWGYIVQQFKSYAYPQITYKIKTNSNLVSQALDGKLPIQIGDTVTIEDDNFSNEQGDFGLILRARATEIKSSDSNPETNEITFENFVELQNDLSDDLMTQVNQLVDAATPYRAELTTTNGTQFKNGTGSTTLSAHIFKGSATAETIADSYEWSKDGTIVAPTQTITVDASGVTDKAVYSFKATVAGKVVANQSVTITNVDDGTNGRSVTNVSQKWRLTTTTATPTQAWSDAGWLTTQPTTTATNKYLWSITRTTFNLAPLTQDVIEQKAVYGDKGDKGDTGNDGRAGKDGVGLRSTTVTYTISSSGTVTPTAGWNSQVPTLVKGQYLWTKTVWNYSDGTSESGYTVSYIAKDGNNGNDGIAGKDGVGITATTITYAQSTSGTIAPSSGWTSTVPTVAEGSYLWTKTVWTYSDSTSETGYSVAMNGKTPYFYTAWSYSADGTDGFTTVYPNLNLLVNSSAKTKDGFFKNFDKVEDGYGEVTLKGNNSYAGISMWDGFSIQPGDYKPGDTYTMSMDVMFTSWNFPAGVYLEEFWIGQRYTHNSDWSINSWKRICYIDLPKDPSKMLNQWIRITYTSTIPPHEDPSVHTESIFLTKFSGSGEASFTLRIRKPKQEPGSTATPHMPSASEVTTADWPSYIGQYTDFTQADSTKPSDYTWSLIRGNDGKDGANGKDGLAGKDGVGIKTTVITYAISISGTIAPTTGWTSSVPSLVKGQYLWTKTVWTYTDNSFETGYSVTYISKDGNNGNDGIAGKDGTGIKTTTITYAGSTSGTTAPTSGWTSTVPMVEAGSYLWTKTVWAYTDNTSETGYSVAKMGSDGAIGPQGPQGNTGPQGPAGSNGDPGKVVSDTEPTTRFKGLTWKYSGTSDLTASDGTVIHPNTEYYYNGTHWMINYLSANNLEANSITADLIDAKNLKITDGEFVSTTTNGLVTTSTEIKDNHIAISKKDGTVNTRNDIALDSEQGLAQKFTNINTGFYRTAGINYQGPFTSDSDGNYAQLTPQGTKLSTDVPWTKLSLMNNFNGNIEYAIINGTVYISASGVGVPAMTAGQWKQAAQLPTGSSAIPIRANRIAAGDSGDGLSWALLSNQAGGIFIRCSANKAPTPNLFNATLPYPIG
Physico‐chemical
properties
protein length:1421 AA
molecular weight: 155008,12290 Da
isoelectric point:4,88533
aromaticity:0,11189
hydropathy:-0,46242

Domains

Domains [InterPro]
DC_0690
STR
4–763
DC_0690 IPR054563 DC_1328 G3DSA:1.20.5.320
PTHR24637
Unmapped
577–1150
PTHR24637
DC_1151
STR
753–984
DC_1151 DC_1328
ABD63794.1
1 1421
Architecture
STR
STR 4-1405 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactococcus phage ul36.t1
[NCBI] 		374527 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Lactococcus lactis
[NCBI] 		1358 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ABD63794.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
DQ394808.1 [NCBI]
CDS location
range 29418 -> 33683
strand +
CDS
ATGGGAGGAAAATATACTTTGATTATTAATGTTTTAAATAAAGACTTAGTTCCAGTAACTTTCATTGATAATGATATTCCCGGTTTACCAAGTTATTACAAAGATACTTTGATTGATTATCTAAGTCTAGGTACAGCATCATTTGAATTTACGATATTAAAATCCAAAAACAACATCATTCAAGACTACTCCAGATTTTTTAATGATGAGACATGCTTCTCTTTCGAGAAAAATGGTAAACAATATGCAGTTTTTCCTGCTGGTTCAGATGGGTTCTATGAAACAGACACAGAAATAACGTATAAATGTTTATCACTAGACCGTGAATTGTCTTTAGAATATGTTGATAAGTTTGATAATTCATCAACTCATACTCTGCAATGGTATATCGATTATTTTGAATTAATTTCAAACAATCAAATTGAAATTGGAAGGAATGATGTTGCTGATTATACAAGAGTCATAAAATATGATTCCCAAGATACAAAACTAAATCGCCTTTTATCTTTAATTAACAACTTTGATGCCGAGTTTGAGTTTATTACAAAACTAACCAATAATGGCGCGGTTGATAAAATAATTTTAAATATCGTTAAAAAACGCGATGATTCAGGCAAAGGTGGTATAGGGGCAATCAGGGATGATGTTGAGCTTGTATATGGAAAGAACGTTAAGGGGATTGAGAGAACTTATAATTTTGAGTTCTTTAATGCGTCTAAAGTTATAGGTAAAGATGGAACTAATTGGAATTCAAGTGAATTTTCCTATATTAATTCAGATGGAGTTGAGGAGTTTTATAAAAGAAAAAATGACGATACAGCATTTGCTCCACTTTCTGCTCAGAAATATCCAGCTCATCTTAGAAAAGACTCTTCAGATATATGGCTTAGGAAAAATTTTGAAACCGAGTATACTACTCCTGCTCAAATGTGGGGATATATTGTTCAACAATTTAAGTCATACGCTTATCCTCAGATTACTTATAAAATCAAAACAAATAGCAATTTAGTATCGCAAGCTCTCGATGGAAAACTTCCTATTCAGATTGGTGATACAGTAACCATTGAAGATGATAATTTTTCAAATGAGCAAGGTGATTTCGGATTAATTTTAAGAGCGAGAGCAACTGAAATTAAATCATCCGATAGTAATCCAGAAACAAACGAAATCACCTTTGAAAATTTCGTTGAATTGCAAAATGATTTATCAGATGACCTAATGACACAAGTCAATCAGTTAGTTGATGCAGCTACTCCATACCGAGCAGAGCTTACAACCACAAACGGCACACAGTTCAAAAATGGCACTGGTTCAACAACTTTATCAGCTCATATTTTCAAAGGTTCTGCAACGGCTGAAACAATCGCAGACAGTTACGAATGGTCGAAAGATGGGACTATTGTCGCTCCAACTCAGACTATCACAGTTGATGCCAGCGGAGTAACTGATAAGGCAGTTTATAGTTTTAAAGCAACGGTTGCGGGTAAAGTAGTCGCAAATCAGTCGGTTACCATCACTAATGTAGATGATGGAACAAATGGACGTTCTGTTACAAACGTTTCTCAAAAGTGGCGTTTGACAACGACTACTGCAACACCAACGCAAGCTTGGTCAGACGCAGGTTGGCTCACTACTCAACCAACAACGACAGCTACTAATAAATATCTATGGTCTATCACTCGAACAACTTTCAATTTAGCACCTTTAACGCAAGATGTTATTGAACAAAAAGCAGTTTATGGTGATAAAGGCGATAAGGGAGATACTGGAAATGATGGGAGAGCAGGTAAGGACGGTGTTGGACTACGTTCAACCACAGTTACATATACTATATCTTCAAGCGGAACAGTTACCCCAACGGCTGGATGGAATTCACAAGTCCCTACTTTAGTCAAAGGGCAATATCTCTGGACGAAAACAGTTTGGAATTACTCAGACGGAACGAGTGAATCGGGATATACAGTCTCTTACATTGCGAAAGACGGGAACAACGGTAATGATGGAATTGCTGGTAAAGATGGAGTAGGAATTACAGCAACTACAATAACTTATGCACAATCAACAAGCGGAACGATAGCACCAAGCAGTGGCTGGACTTCCACAGTTCCAACAGTTGCAGAAGGTAGTTATCTGTGGACTAAGACTGTCTGGACCTATTCTGACAGTACGAGTGAAACAGGCTATTCTGTTGCAATGAACGGTAAGACTCCATATTTTTACACAGCATGGTCTTACAGCGCAGACGGTACGGACGGTTTCACGACTGTTTATCCGAATTTGAATTTGTTAGTTAATAGTTCAGCCAAAACCAAAGATGGGTTCTTTAAAAACTTCGACAAAGTAGAAGATGGCTATGGTGAAGTAACACTAAAGGGAAATAATTCATATGCTGGCATAAGTATGTGGGATGGTTTCTCTATTCAACCTGGAGATTACAAACCCGGTGATACATATACAATGAGCATGGATGTTATGTTTACAAGTTGGAATTTCCCTGCTGGAGTATATCTGGAAGAATTTTGGATTGGGCAGAGATACACTCACAACTCAGATTGGTCAATAAACTCATGGAAGAGAATATGTTACATTGATTTACCTAAAGACCCTAGTAAAATGCTAAACCAATGGATAAGAATAACATATACCTCAACAATACCGCCGCATGAAGACCCTTCTGTTCATACAGAGTCAATCTTTTTAACTAAATTCTCAGGTTCAGGTGAAGCTAGTTTTACGCTTAGAATTAGAAAACCAAAACAAGAGCCAGGTTCAACCGCCACTCCACACATGCCATCAGCTAGCGAAGTAACAACCGCTGACTGGCCTAGCTACATCGGTCAGTACACAGACTTTACGCAAGCTGACAGCACTAAGCCATCTGATTATACTTGGAGTCTGATACGAGGGAATGACGGTAAAGATGGAGCAAATGGTAAAGACGGATTAGCAGGTAAGGACGGGGTTGGAATAAAAACCACTGTTATCACATACGCTATTTCAATAAGCGGAACGATAGCGCCGACTACTGGCTGGACAAGTTCGGTTCCTAGTCTTGTAAAAGGTCAGTATCTCTGGACTAAAACAGTATGGACATACACGGACAACTCATTTGAAACAGGTTACTCAGTAACTTATATTTCTAAAGACGGAAATAACGGTAATGACGGAATTGCTGGTAAAGATGGTACTGGTATCAAAACTACGACCATTACATACGCAGGATCAACAAGTGGAACAACGGCACCGACTAGCGGTTGGACTTCCACAGTTCCGATGGTTGAAGCAGGTAGTTATCTGTGGACTAAGACCGTTTGGGCTTATACGGACAATACCAGCGAAACAGGATATTCCGTTGCGAAAATGGGAAGCGATGGAGCAATAGGGCCGCAAGGTCCTCAGGGGAATACTGGACCACAAGGCCCTGCTGGAAGTAATGGTGACCCAGGTAAAGTTGTTTCTGATACTGAGCCGACCACTCGATTCAAAGGTTTGACTTGGAAATATTCAGGCACCTCTGACCTTACAGCGAGTGATGGAACAGTTATCCATCCTAACACTGAGTACTACTACAATGGCACTCACTGGATGATTAACTATTTAAGTGCGAATAATCTTGAAGCTAACTCAATAACCGCTGACTTAATTGATGCAAAAAATTTAAAAATTACTGATGGTGAGTTCGTAAGTACAACAACTAATGGTCTAGTTACAACCTCTACAGAAATTAAAGATAATCATATTGCAATTTCAAAGAAAGATGGAACTGTTAATACTAGAAATGATATAGCACTTGATTCTGAACAAGGATTAGCTCAGAAATTTACGAACATTAATACAGGATTCTACAGAACAGCTGGGATTAATTATCAAGGACCATTCACAAGCGACTCAGATGGAAACTATGCTCAACTTACACCTCAAGGCACGAAGTTATCAACTGATGTTCCTTGGACCAAGCTTAGTTTAATGAATAATTTTAATGGAAATATTGAGTATGCGATTATCAATGGGACTGTCTATATATCAGCATCAGGAGTTGGCGTACCAGCAATGACTGCTGGTCAATGGAAGCAAGCGGCTCAATTGCCAACAGGAAGTTCAGCAATTCCAATTAGAGCAAATCGAATTGCAGCAGGAGATAGCGGAGATGGTCTAAGTTGGGCATTGCTTTCTAATCAGGCTGGAGGAATATTCATTCGATGCAGTGCTAATAAAGCACCAACACCTAACTTATTCAATGCCACATTACCATATCCAATAGGATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
c563f1167dc8df6a670fe5aba50c8e843fa0e4e90656249316c0a4ead115c022
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7498
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50