Protein

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Genbank accession
AHB80939.1 [GenBank]
Protein name
fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,84
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSPWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDADGNFSAGTVTATLIGNASTAARLASSRQITLGGDLDGSAIFDGSTNITISADLDLVPTLPHYDGTNTSSATYTKVVVDSKGRITNASSPTSLSEYGLDGTVEGQSAQAYDLDLAAIAGLTTTGIISRTSGGNMQTRTITGTATRISISQGAGISGNPTIDMITTAVTAGDYNTESLTSVSGAGSNSEPFGTETVNATKFTVDAYGRLTSSTNVPIATATEGSKYAAYAGGTTYVRYDIIEDSSRVYQSITGIAAGGGAPTHTDASDAGGWRYLGAAATEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAVGVDNTQLQNNRIGFADGNTVENFELDQELTATTGYRGFNYLNYFKVNDTSGNLLVGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDPDITLDGDVNQTLDKTGDGNLFLQLTQNSATARTFSILSTNSGSGAANIVVAATDLVDIQASDAAGKVYVEDARFQDNYIATANATLNLDPGDDRAVAGTVRVWGNLQVDGTTTTVNSSTLQVDDPIITLGGDTAPVADDNLDRGIEFRYYDTEARLGFYGWDTNYTDLAGHGGGYSFLHAATNTAEVFTGTASGIIAGNVKLTSGTASSSNTTGDLVVAGGVGIAGAVNIGGLLDVDSTFRANSTSRFDDNMVIQGASKTLQINNGSGTTKIEFQSTTGNAIIGGVTDVTGNFNVNTNKFNVVAASGNTSIAGTLGVTNIATFSNNIDANGDVAIAGNIHSESTNDITTAKNSETGVWEIQSSDYGSLRVDGGAYVAGSALIDGTLHVNGAIEVKDSATEAESRLNWLRVRYRGRFGDSYQATPSYASHNTTTLRAHGGAGIERTLHVGGTGSGEGLFVGKRYNSDTVKFSVLGASGDTEIQGTLLVEDNVNFNGRLDVDADFAVRNGTTDKFFVDNLTGNTDIQGTQGCQWCN
Physico‐chemical
properties
protein length:986 AA
molecular weight: 102365,83000 Da
isoelectric point:4,38424
aromaticity:0,07099
hydropathy:-0,24919

Domains

Domains [InterPro]
DC_1619
ATT
1–449
DC_1619
SSF69349
STR
4–242
SSF69349 DC_1607
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352
AHB80939.1
1 986
Architecture
ATT
STR
ATT 1-449 | STR 450-942 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-MbCM100
[NCBI] 		1340812 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Acionnavirus > Acionnavirus monteraybay
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AHB80939.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KF156340 [NCBI]
CDS location
range 85401 -> 88361
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGGAGGGGTGGTGCTCAGGAATGGGCGAACGCGAACCCAACTCTCGCTCAAGGCGAATTGGGAATCGAACTTGATACTGGACGTTTCAAGATTGGCGATGGCGTTTCTCCCTGGAATACATTACGATATGAACGTCCTGTTGAATCTACTTCAAACACAGCAAACACTCTTGTGCAAAGAGATGCTGATGGTAATTTTTCAGCAGGTACAGTTACTGCAACATTAATTGGTAATGCTTCAACTGCTGCTCGTCTTGCATCATCTAGACAGATTACTCTTGGTGGTGACCTTGACGGATCTGCTATCTTTGATGGTTCAACAAACATCACGATTTCAGCAGATTTAGATTTAGTACCAACACTTCCACATTATGATGGTACTAACACGTCAAGTGCAACATATACAAAAGTTGTAGTTGATTCTAAAGGTAGAATTACTAATGCATCTTCACCAACCAGTCTTTCAGAATATGGTCTGGATGGAACAGTAGAAGGTCAATCAGCACAGGCATATGATCTTGACCTGGCAGCAATTGCAGGTCTTACCACCACGGGTATTATTTCCAGAACTTCTGGCGGTAATATGCAAACCAGAACTATTACTGGTACTGCAACTAGAATTTCTATCAGTCAAGGTGCTGGTATTAGTGGCAACCCAACCATTGATATGATCACTACAGCAGTAACTGCTGGAGATTATAATACAGAATCACTAACATCAGTTTCTGGTGCTGGATCTAACTCAGAACCATTTGGTACAGAAACTGTAAATGCTACAAAATTTACAGTAGATGCCTATGGCAGACTGACAAGTTCAACAAACGTACCTATTGCTACTGCTACCGAAGGTAGTAAGTATGCGGCATATGCAGGAGGTACAACATATGTTAGATATGATATTATTGAAGATAGTAGTAGAGTATATCAATCAATTACAGGAATCGCTGCAGGTGGTGGTGCTCCAACTCACACTGATGCTTCAGATGCTGGTGGGTGGAGATATCTCGGTGCAGCAGCAACAGAGCAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGATGCCAACGGACATGTAACTATTGCTGCTGTTGGTGTAGATAATACACAATTACAAAATAATCGTATTGGTTTCGCTGACGGTAATACCGTAGAAAATTTTGAACTGGATCAGGAACTTACTGCAACCACTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATTTTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTATTTCTCTGACCCTGATATTACTCTTGACGGCGATGTTAATCAGACACTGGATAAAACTGGGGATGGTAACCTTTTCCTTCAACTAACTCAGAATAGTGCAACTGCTAGAACCTTCAGCATTCTTTCTACAAATTCTGGTTCTGGTGCAGCAAACATTGTTGTTGCTGCAACTGATTTAGTTGATATTCAGGCAAGCGATGCAGCAGGTAAGGTATATGTAGAAGATGCAAGATTTCAAGATAACTATATTGCTACAGCAAACGCGACATTAAACCTTGATCCTGGTGATGACCGTGCTGTAGCTGGTACTGTTCGTGTCTGGGGTAACCTCCAGGTTGATGGAACTACTACAACAGTAAATTCATCGACTCTACAAGTTGATGACCCTATCATTACTCTTGGTGGTGATACTGCTCCAGTTGCTGACGATAATCTAGATCGTGGTATTGAATTTAGATATTACGATACCGAAGCACGTCTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTATACCGACTTAGCTGGTCATGGTGGTGGTTATAGTTTCCTCCATGCTGCTACAAATACTGCTGAAGTTTTTACTGGTACTGCTTCTGGTATCATTGCAGGTAACGTAAAACTTACATCTGGCACTGCATCTTCTTCCAATACAACTGGCGATCTGGTTGTTGCTGGTGGTGTTGGAATCGCGGGTGCAGTTAATATTGGTGGTCTATTAGATGTAGATAGTACATTCCGAGCAAACAGCACCTCTCGCTTTGATGACAACATGGTCATCCAAGGTGCTTCTAAGACTTTACAAATTAATAATGGTTCTGGAACTACGAAGATTGAGTTTCAATCAACAACTGGTAATGCAATTATCGGTGGTGTAACTGATGTAACTGGCAACTTCAACGTCAATACTAACAAGTTCAACGTTGTTGCTGCTTCTGGTAACACTTCTATTGCTGGCACATTAGGTGTTACAAACATCGCTACCTTCTCTAATAATATTGATGCTAACGGTGATGTTGCAATTGCAGGTAACATTCACTCTGAAAGCACTAACGATATTACCACTGCTAAGAACTCAGAAACAGGTGTATGGGAGATTCAGTCTAGTGACTATGGATCTCTGAGAGTTGATGGTGGTGCATATGTTGCAGGATCTGCTCTAATTGATGGCACACTACACGTTAATGGTGCGATTGAAGTTAAGGATAGCGCGACAGAGGCAGAATCGAGACTGAACTGGTTGCGTGTCAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGATTCTTATCAGGCAACTCCCTCCTATGCATCTCACAACACTACAACTCTGAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACCCTTCATGTTGGTGGTACGGGATCTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACAATAGTGATACTGTTAAGTTCTCTGTTCTGGGTGCATCTGGTGATACAGAAATCCAAGGTACGTTGCTTGTCGAAGATAATGTAAATTTCAACGGCAGACTGGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTCAGAAACGGCACGACGGATAAATTCTTCGTTGATAATTTAACTGGCAATACCGATATCCAAGGCACACAGGGATGTCAATGGTGCAACTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a52f04ddfe3bc5565ac4cee747692bf021003ce175d92236d2fa823c5b0f3c45
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2896
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50