Protein

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Genbank accession
AIX29766.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MPAINVAKTDTFEKQRVKINEIGSQIFSISEGGSDLSTGNLKLGDGTKTVPSLAFTSDGSLGIFKPSSKSIGIVSGSKRILDFNEFGVFSFKDILLKKKSLTTELISIVSAGSQYDPGSFAALSLIGGTGLGATADITVDAFIGTTLTTGDDFAVGSFQSSLINGTGQDAEISFDVDGIQGSITQPGSGYAQNTYTNVSLTNVSGTGNGSTADITVTGDVVVSGNISNGGSGYSGPDQVYTNIELTGGSGTGLFADITLTAGVITSVVVTNGGSGYLASNVLGVDNADLSGDGGAPAGSGFAFTISSVVYNGVVTDISITGEGTGYDFGDVLSANQADLGNVGGSGFEFSVSSNPGVPYNIEFITKGSGYTVGDVLSLSGPVTGFATTLGGTIDNVAATVTSGSTTVVLASTTDIVAGMSVSGANSEFPESATVITVDSATDITVSDPSNISGSTTITFTSNTPFLEVVVSDASNISNGFLVSQSSGTGIIAPNTTVSNVDIGTNTITFDTQPTRAGSATLDFSPAYGNPTTNFTHRVDVLGAISLINIVDGGTGYDVGDELSVSPTDLTETISKSVTVIDVDTIFPVQAIPSNTYSVGDTISVDGGEGGPTNTAIREIVISGGNITALIVNAVGIPDGSTFDTSYTTDTGGFSGHRYLIDGNLSQNLTFYVGSTYKFDTTDATNGSHIFSLSKYRDGSFSPSFIGNINTVLDTNTANITIADTTGILEGMAVSVTSGVGTIPSEVKVLQVVDSTTLTLSLNPDTAGSAVLSFVGVEYTDNVTRDGNNALTIKITSSTPNLYYYCQNHQDMGGYDNQEALITIDPNNPKTFGSGLILSATDISETDIISGRVNDGTFNVVNSTGTSLDFDSGTVDDITSINTKTSTLTTTTIQSDANSFENKIDLNSGTSINIVAGDFNIGSTIQVSNLSGDITTSGTLKSTTKISSNDILEIIDNSISVVPGQDLVFEIPSASKQAKFTSTSAVVIPVGDTSQRPLAGDSVSGAIRFNTETNQYEGYSATSTSWSSLGGVRDLDGNTYILAEFTTGANDNTLWFYNDSINTLKVTPEFFDFRSVKTISSTKLGLPTYSEWNSNVPVNVGDYIKYRNNLYEVTGSGSTGSSGSEPTDTSGNAFANGTAQLTWSQTAVAPITFDGVEELRIGPNKNCSLVIGSELKFEDNTISTSVQDLVIQPNAGKQVIVNSNTHFRIPAGTNNEKSIAPAGPGSIRFNTEILQFEGYSGANWSSLGGVRDVDGNTYIIPETAPAANENILYFYNNNSNTLQLTETVLDFTNIDTITTSGGNSLALDTQVFTLNSNDTTIDNSSATRTFISTSKDYLDLGLSSGLNVDPVLRLDNQGDVYLNTTFGTGSFNGVKIFDGDLKEFELADYKISSATFVLDKGGLESSSVVLYDTGSKGCKVTVVSKSDSGKRSLTEYAVIDTGTDIFHNEYASLNSSLDQYTASFDFNINNEPRITITLTDDHDVADIINFTVLIQEIK
Physico‐chemical
properties
protein length:1497 AA
molecular weight: 155754,66300 Da
isoelectric point:4,07498
aromaticity:0,07749
hydropathy:-0,04796

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014e
[NCBI] 		1493510 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Chalconvirus > Chalconvirus acg2014e
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX29766.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019094 [NCBI]
CDS location
range 86970 -> 91463
strand +
CDS
ATGCCCGCAATTAATGTCGCTAAAACTGATACCTTTGAAAAACAAAGGGTCAAAATTAATGAAATTGGATCTCAGATTTTTTCAATTTCTGAAGGTGGAAGTGATCTATCTACGGGAAATTTAAAACTTGGAGATGGTACTAAAACAGTTCCGTCTTTGGCTTTTACTAGTGATGGATCTTTAGGTATTTTCAAACCATCTTCTAAATCTATTGGAATAGTTAGCGGATCAAAAAGAATTTTAGACTTCAATGAATTTGGAGTATTTTCTTTTAAAGATATTCTTTTAAAGAAAAAATCGTTAACTACAGAACTGATTTCCATAGTATCTGCTGGATCACAATATGATCCAGGTTCTTTTGCTGCTTTAAGTTTAATTGGAGGAACTGGACTAGGAGCAACTGCAGATATTACAGTTGATGCTTTTATTGGAACAACTTTAACAACAGGTGATGATTTTGCAGTTGGTTCATTCCAATCTTCATTAATAAATGGAACTGGTCAAGATGCAGAAATTTCTTTTGATGTTGATGGCATCCAAGGGTCAATTACACAACCTGGATCTGGATATGCACAAAATACTTATACTAATGTATCTTTAACAAATGTTTCGGGAACTGGCAATGGATCTACCGCAGACATCACTGTTACTGGTGATGTAGTTGTTTCTGGAAATATTAGTAATGGTGGTAGTGGATATTCTGGTCCAGATCAAGTATATACTAACATAGAATTAACGGGTGGTTCTGGAACTGGTTTATTTGCAGATATAACTCTCACCGCAGGAGTTATTACTTCTGTAGTAGTTACTAATGGTGGATCTGGATATTTAGCAAGTAATGTTCTTGGAGTAGACAATGCAGATCTTTCTGGAGATGGTGGCGCACCTGCTGGTTCAGGATTTGCTTTTACTATTTCTTCCGTCGTATATAATGGCGTAGTTACTGATATATCTATTACTGGAGAAGGAACAGGTTATGATTTTGGAGATGTATTATCTGCTAATCAGGCAGATTTAGGAAATGTTGGTGGAAGTGGATTTGAATTTAGCGTTTCATCAAATCCTGGTGTTCCATACAATATCGAATTTATCACTAAAGGATCTGGATATACAGTTGGTGATGTGTTGTCTTTATCTGGTCCAGTTACTGGATTTGCTACAACTCTTGGAGGAACAATTGACAATGTTGCGGCAACAGTAACATCTGGATCTACAACTGTCGTTCTCGCATCCACTACAGACATTGTAGCAGGAATGTCAGTATCTGGTGCTAATTCAGAATTCCCAGAAAGCGCAACAGTAATTACTGTTGATAGCGCAACAGATATCACTGTTTCTGATCCTTCTAATATATCTGGTTCAACAACTATTACTTTTACTTCCAATACACCCTTTTTGGAAGTTGTTGTTTCGGATGCTTCCAACATTTCTAATGGATTTTTAGTTTCACAATCTTCTGGTACAGGTATTATCGCCCCTAATACAACGGTATCTAATGTAGATATTGGAACAAACACAATTACTTTTGACACACAACCAACTAGAGCTGGATCTGCTACTCTTGATTTTAGTCCAGCATATGGAAATCCTACTACTAATTTTACTCACAGAGTAGATGTATTAGGAGCAATTTCTTTAATTAATATTGTAGATGGTGGCACTGGATATGATGTTGGAGATGAATTATCAGTATCTCCAACAGATCTCACAGAAACTATCAGTAAATCAGTAACTGTAATAGATGTAGATACAATTTTTCCCGTACAAGCAATTCCATCCAACACATACTCAGTTGGTGATACGATTAGTGTCGATGGTGGAGAAGGAGGACCCACAAATACTGCGATTAGAGAAATTGTAATTTCTGGTGGAAATATTACAGCACTTATTGTAAACGCAGTAGGAATTCCAGATGGATCTACTTTTGATACATCATATACAACAGATACAGGTGGATTTTCTGGTCATAGATATCTTATTGATGGAAATCTTTCCCAAAATTTAACATTTTATGTTGGTAGTACTTACAAATTTGATACAACAGATGCTACTAATGGTAGTCATATATTTTCTTTAAGTAAATATAGAGACGGAAGTTTTTCCCCAAGTTTTATTGGAAATATTAATACAGTATTAGATACTAATACTGCAAATATTACTATAGCAGATACAACTGGAATTCTTGAAGGAATGGCAGTTTCTGTTACGTCTGGTGTTGGCACAATTCCATCAGAAGTTAAAGTTTTACAAGTAGTTGATTCTACTACATTAACTCTGAGTCTAAATCCAGATACAGCAGGGTCTGCTGTCTTATCATTTGTTGGAGTTGAATACACAGATAATGTTACTAGAGATGGTAATAATGCATTAACTATAAAAATTACAAGTTCAACACCAAATTTATATTATTATTGTCAGAACCACCAAGATATGGGAGGTTATGATAATCAAGAAGCACTAATTACCATCGATCCAAATAACCCAAAAACTTTTGGATCAGGATTAATTCTTTCTGCTACAGACATTTCAGAAACAGATATTATTTCTGGAAGAGTTAATGATGGTACTTTTAATGTTGTAAATTCTACTGGTACATCATTAGATTTTGATAGTGGAACAGTTGATGATATTACTTCTATTAATACAAAAACATCTACTTTAACAACGACAACAATTCAATCAGATGCTAATTCATTTGAAAATAAAATTGATTTAAATTCTGGGACATCTATTAATATTGTAGCGGGTGATTTTAATATCGGTTCTACTATTCAAGTATCTAATTTATCTGGTGATATAACCACTTCGGGAACATTAAAGTCAACAACAAAAATTAGTTCTAATGATATTTTAGAAATTATTGATAATTCAATTTCTGTAGTACCAGGACAAGATTTAGTTTTTGAGATTCCTAGCGCATCAAAACAAGCAAAATTTACATCAACATCAGCAGTTGTTATTCCGGTTGGCGATACATCACAAAGACCTCTTGCTGGTGATTCTGTCAGTGGAGCAATCAGATTTAATACAGAAACAAATCAATATGAAGGATATAGTGCTACATCTACTTCGTGGTCTTCATTAGGTGGTGTTCGTGATTTAGATGGAAACACATATATTTTAGCAGAATTTACTACTGGAGCAAATGACAATACATTATGGTTCTACAATGATTCAATTAATACTCTAAAAGTAACTCCAGAATTTTTTGATTTCAGATCTGTCAAAACAATATCATCTACAAAATTAGGACTTCCAACATATTCAGAGTGGAACTCAAATGTTCCTGTTAATGTGGGAGATTATATTAAGTATAGAAATAATCTTTATGAAGTAACTGGTTCTGGTTCTACGGGTTCATCTGGAAGTGAACCAACAGATACGTCAGGAAATGCTTTTGCGAATGGCACTGCACAATTAACTTGGAGTCAAACTGCTGTTGCTCCAATAACATTTGATGGTGTAGAAGAATTAAGAATTGGTCCAAACAAAAATTGTTCTTTAGTTATTGGATCAGAATTAAAATTTGAAGATAATACTATTTCGACTAGTGTGCAAGATTTAGTTATTCAACCAAATGCTGGCAAACAAGTAATTGTTAATTCAAATACACATTTCAGAATTCCTGCTGGTACTAATAACGAAAAATCAATCGCACCAGCTGGACCTGGTTCTATTAGATTCAATACAGAAATTTTACAATTTGAAGGATATAGTGGTGCTAACTGGTCTTCTCTTGGTGGAGTAAGAGATGTTGATGGCAATACGTATATTATTCCAGAAACTGCACCAGCAGCAAACGAAAATATTCTCTACTTTTACAACAATAATTCAAATACATTACAGTTAACAGAAACTGTCCTTGATTTTACTAACATTGATACTATCACTACTTCTGGTGGTAATAGTCTGGCATTAGACACTCAAGTATTTACATTAAATTCTAACGATACTACTATTGATAATAGCAGCGCAACTAGAACTTTTATTAGTACATCTAAAGATTATCTAGATTTAGGATTATCTAGTGGATTGAATGTAGATCCAGTTCTTAGATTAGATAATCAAGGTGATGTTTATTTAAACACTACATTTGGAACTGGAAGTTTTAACGGAGTTAAAATTTTTGATGGCGATTTGAAAGAATTTGAATTAGCAGACTACAAAATTTCTTCCGCTACATTTGTTTTAGACAAAGGAGGACTTGAATCTTCTTCTGTGGTTCTTTATGACACAGGATCAAAAGGATGCAAAGTAACTGTTGTGTCTAAATCAGATTCTGGAAAAAGATCTTTAACAGAATATGCAGTTATAGATACTGGTACGGATATTTTCCACAATGAATATGCGTCATTGAATTCTTCACTCGATCAATATACAGCATCATTTGATTTTAATATCAATAATGAACCAAGAATCACAATAACTTTGACTGATGATCATGATGTAGCTGACATTATTAACTTTACCGTACTAATTCAGGAAATTAAGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
040277eec8e42a28a823e7a71541b43b59f2c7ba2a655c1b3c8a181cbda9d3a6
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7955
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank