Protein

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Genbank accession
YP_009618487.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,78
Protein sequence
MTDLIIREPVLDGQQLGPVTIQVEGSPNSATIEDSLLNGSGSEILVTVDEGLQVVGLESLVELQAQLGAIEGRVNAALLTIEGAVESANDIVDQLNQASADLLALVVRAETAANNAGASEVAAEAAKVAAKASELAAASSQAAAAASATNSANSATAANNSKNAAASSAAAALASQNAAKISETNSKTSETNAANSASAANSSKNAAATSATNASNSAADALASKDAAATSATSAANSATAANNSKDAAASSASAAATSASEANTSKNAAASSATNAANSATAANNSKNAAATSEANSAANAASATAAKNLAQKYATAPENEVVESGRFSAFHWAEKAKQFAQQTFVSAGTYNPTTANPYPSVVGVTRDTMWLVKLTDVSGRFTYTTGALAGTTVTNGDFLFYDTPSNTWEHIPVGIAGVLEVNGKSGQSVTITAQDVGALPITGGTVSGSIGSKGLAAHETGTIGLGIGRSASFGWIAPILSNGSYDYANQLAFNPTTGYWTSQGHKIYTAGQKPKFEDLLDSVFWLAPNAGRIRVGGNTDLVAGRDDKGFLPRKEGVGAAAVSYLGTADWWFGESWVNIYKGGAVDVSQYIKAPRLIVKDWGFRQHSNGNLELRHGTTDDLSLYIQDDNKDAYFFGALYEQGNTRVYSPNNKPAVADVTGLQASLDSKYSATNKPTLDVLTGKAADAAKLNGRSDYYHPGNKPTAADVGALTEALGDARYTKKVDSFSGNYNDLSNKPAIPATASDVGAVSKSGDTMTGALRVNKGTATVPGLFVGSSTYKAVIGTSSTVNEVLFGVSANAETLSSYLRIGGTLDSLKFSPDAVTQYVVYHAGNKPTATDIGALPSNGKAADADKLDGYNSSLSADANTVAVRDGSGDIAVRLIRSEYPTQSEIGSADAGIAFRIASGSSGSSDNYTRFVNKSGLVNWLGRVNDSTLFLGKTLDTVKSETRAGLVVDTVTVNGKRLNANVTITAADVGLGNVPNYAATNSYSGTSTSLLATQKAAYDAAAAPLLEAERKRKITYGTAAPSAATGADGDVFFVI
Physico‐chemical
properties
protein length:1045 AA
molecular weight: 106566,73190 Da
isoelectric point:5,13173
aromaticity:0,06507
hydropathy:-0,16019

Domains

Domains [InterPro]
DC_1669
ATT
2–173
DC_1669 DC_1608 DC_1142 DC_0836
DC_1142
STR
738–883
DC_1142
YP_009618487.1
1 1045
Architecture
ATT
STR
STR
STR
ATT 2-173 | STR 243-658 | STR 677-883 | STR 957-1040 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage JSF10
[NCBI] 		1983593 Uroviricota > Caudoviricetes > Demerecviridae > Jesfedecavirus > Jesfedecavirus JSF10
Host Vibrio cholerae
[NCBI] 		666 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Vibrionales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009618487.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_042074.1 [NCBI]
CDS location
range 60327 -> 63464
strand -
CDS
ATGACAGATTTAATCATACGTGAGCCTGTCCTTGATGGGCAACAACTTGGCCCAGTAACTATCCAAGTTGAGGGCAGCCCTAACTCAGCTACTATTGAGGATAGTCTTCTAAATGGAAGTGGTTCAGAGATACTGGTTACAGTAGACGAAGGATTACAAGTAGTAGGTCTAGAGTCCCTAGTTGAGCTTCAGGCACAGTTAGGGGCTATAGAGGGTAGAGTTAACGCTGCCCTATTAACTATAGAAGGAGCGGTAGAGTCTGCTAATGACATAGTAGACCAATTAAACCAAGCTTCTGCTGACTTACTGGCTTTGGTAGTTAGGGCTGAAACAGCAGCTAATAACGCTGGTGCTTCAGAAGTAGCTGCGGAAGCAGCTAAGGTTGCTGCAAAAGCTTCCGAGCTGGCTGCAGCTTCAAGTCAAGCCGCTGCGGCTGCATCTGCTACTAACTCAGCTAACTCTGCTACAGCAGCAAATAATAGCAAGAATGCCGCTGCTTCAAGTGCTGCTGCTGCTCTAGCTAGCCAAAATGCTGCTAAGATTTCTGAGACAAACTCTAAAACTTCAGAAACTAATGCAGCAAACTCTGCTAGTGCTGCTAACTCTAGTAAAAACGCTGCTGCGACTAGTGCTACAAACGCATCTAATTCAGCAGCAGATGCCCTAGCTAGCAAAGATGCAGCCGCTACTTCAGCTACTAGTGCTGCTAACTCTGCTACTGCTGCTAACAACAGTAAAGATGCTGCTGCTAGTTCTGCTAGTGCAGCAGCTACTTCTGCTTCTGAGGCCAATACTAGTAAAAATGCTGCCGCTAGTTCGGCTACTAATGCTGCTAACTCTGCTACTGCTGCTAACAATAGTAAGAACGCAGCCGCTACCTCAGAAGCGAACTCAGCTGCTAATGCTGCCTCAGCAACAGCAGCTAAGAACTTAGCTCAAAAATACGCTACAGCCCCAGAGAATGAGGTTGTAGAATCTGGTAGATTCTCAGCCTTCCACTGGGCTGAGAAAGCTAAGCAGTTTGCTCAGCAGACTTTCGTATCCGCTGGTACATACAACCCTACTACCGCCAACCCATACCCTTCCGTAGTTGGAGTTACCCGTGACACGATGTGGCTAGTTAAGCTTACTGACGTCTCAGGCAGGTTTACATACACTACAGGTGCTCTTGCAGGTACAACAGTAACTAACGGAGATTTCCTATTTTATGACACCCCGTCAAATACTTGGGAACATATACCAGTAGGTATTGCTGGTGTCCTAGAAGTGAACGGTAAATCTGGGCAGTCGGTTACTATTACAGCGCAGGATGTAGGTGCTCTTCCTATTACTGGTGGTACTGTTTCTGGTTCAATAGGTTCTAAAGGCCTAGCCGCCCATGAGACTGGCACTATTGGCTTAGGGATTGGTAGAAGCGCTAGTTTTGGCTGGATAGCTCCTATCCTATCGAATGGTAGTTATGATTACGCTAACCAATTAGCGTTCAACCCTACTACAGGGTACTGGACTTCCCAAGGCCACAAGATTTATACAGCAGGTCAAAAACCAAAATTTGAGGACTTATTAGACTCAGTATTTTGGTTGGCACCAAATGCTGGAAGGATAAGGGTTGGCGGCAACACTGACTTGGTGGCTGGTAGGGATGATAAAGGCTTTCTACCTAGAAAGGAGGGAGTTGGGGCTGCAGCAGTAAGTTACCTAGGAACTGCTGATTGGTGGTTTGGGGAGTCTTGGGTCAACATCTATAAAGGCGGCGCTGTTGATGTATCTCAATACATTAAAGCTCCTAGATTGATTGTTAAGGACTGGGGATTCCGTCAGCATTCTAACGGTAACCTTGAGCTTCGTCATGGGACTACAGATGATTTATCTCTGTACATTCAGGATGACAACAAGGATGCTTACTTCTTTGGTGCTCTTTATGAACAAGGTAATACACGTGTATATTCACCCAACAACAAACCTGCCGTAGCTGATGTAACAGGGCTTCAGGCTTCTCTGGATAGTAAATATTCAGCAACTAACAAACCTACCCTTGATGTCCTCACAGGTAAAGCTGCTGATGCCGCTAAACTCAATGGGCGCTCAGATTATTACCATCCGGGTAATAAACCAACGGCTGCTGATGTAGGAGCTTTAACGGAAGCCCTAGGTGATGCTCGTTATACTAAGAAAGTAGATTCTTTCTCAGGTAACTATAACGACCTAAGTAATAAACCTGCTATACCTGCTACTGCCTCTGATGTAGGTGCTGTTAGTAAATCCGGGGATACCATGACAGGGGCTCTACGGGTTAACAAAGGTACCGCGACTGTTCCGGGATTATTTGTAGGTTCATCTACATATAAAGCTGTTATAGGTACAAGTTCAACAGTTAATGAAGTATTATTTGGTGTTTCTGCCAATGCTGAAACATTATCTTCATATTTAAGGATAGGTGGTACCTTAGATAGCTTGAAGTTTTCACCTGATGCAGTGACTCAGTATGTTGTGTATCATGCAGGTAACAAACCTACAGCTACTGACATAGGTGCCCTACCTTCTAACGGTAAAGCTGCTGATGCTGATAAACTGGATGGTTACAACTCATCTTTAAGTGCAGATGCTAATACAGTAGCTGTACGGGATGGTTCAGGTGATATTGCTGTTCGATTGATTCGTTCAGAGTACCCTACACAATCCGAGATTGGTTCTGCTGATGCAGGTATTGCCTTCCGTATTGCCTCAGGGTCCTCAGGTTCTAGTGACAACTACACTCGTTTCGTCAACAAATCTGGCTTGGTGAACTGGCTTGGTCGTGTTAATGACTCAACCTTATTCCTCGGTAAAACCTTGGATACCGTCAAGTCAGAGACTCGTGCTGGTCTGGTAGTCGATACGGTAACTGTAAACGGTAAACGTCTGAATGCTAACGTGACTATCACGGCTGCCGATGTGGGCCTAGGTAACGTACCTAACTACGCTGCAACAAACAGCTATTCAGGTACTTCCACATCATTACTGGCTACTCAAAAGGCTGCCTATGATGCTGCTGCGGCTCCACTTCTGGAAGCTGAACGTAAACGTAAGATTACCTACGGTACCGCAGCCCCTTCGGCTGCCACAGGTGCTGATGGTGATGTTTTCTTTGTGATTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
74e62ed638279b9570b21d2ad68c002fc1458aba030679b82fffa34ccfb7b8c9
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5245
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50